Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR2860
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr19:7196868-7197033 [-]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR1451663
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 143 - UGUUUUGGAUUUGUUAGGUUUUGA - 166
Stem-loop(if miRNA) --U    UG     G  A     U   AU          -----------  C       UUUGUU      A    GG  UUGAUU   A
   GUUU  GAUUU UU GGUUU GAG  CUGAAUUGUU           UC GCAUGUU      ACAGAU UGGG  GU      GUG U
   ||||  ||||| || ||||| |||  ||||||||||           || |||||||      |||||| ||||  ||      ||| U
   UAAG  UUGAA GA CUAAA CUU  GGCUUAGCGG           AG UGUAUAG      UGUUUA ACUC  CG      CAC C
UAG    GU     G  A     -   --          AAAACCAUUUU  U       UUUGCU      G    AU  ---UUU   U
Stem-loop sequence UGUUUUGGAUUUGUUAGGUUUUGAGAUCUGAAUUGUUUCCGCAUGUUUUUGUUACAGAUAUGGGGGGUUUGAUUGUGAUUCUCACUUUGCUACUCAGAUUUGUUCGUUUGAUAUGUUGAUUUUACCAAAAGGCGAUUCGGUUCAAAUCAAGGAAGUUUGGAAUGAU