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BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR2805
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr9:15715017-15715169 [-]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR1451662;SRR1451610;SRR1451616;SRR1451623
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 130 - AAGAGUAGUCUCUGAGCUUGCACC - 153
Stem-loop(if miRNA) --      AG           G  -  A   GG   -AGA  AUU    GAGAA        AAUUGU    AUU    A   G
  AAGAGU  UCUCUGAGCUU CA CC CCA  UCC    GG   UGCU     GAUUCAUC      UGGU   GGGC AUU U
  ||||||  ||||||||||| || || |||  |||    ||   ||||     ||||||||      ||||   |||| |||
  UUCUCG  GGAGAUUCGAA GU GG GGU  AGG    CC   AUGG     CUGAGUAG      ACCA   CCUG UAG A
AG      --           G  C  C   AG   GAUA  --G    --AGG        ------    -CU    C   G
Stem-loop sequence AAGAGUAGUCUCUGAGCUUGCACCACCAGGUCCAGAGGAUUUGCUGAGAAGAUUCAUCAAUUGUUGGUAUUGGGCAAUUGUAGGAUCGUCCUCACCAGAUGAGUCGGAGGUAGCCAUAGGGAGAUGGCGGCUGGAAGCUUAGAGGGCUCUUGA