Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR2652
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr20:39654527-39654727 [-]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR1451660
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - UAAGAACUAAAAGAGAAUUAAAAU - 24
Stem-loop(if miRNA) --       ACA       CU       AA        UAAA    --           A           -UG      -U  UU     UU  A     -  U
  UUUAAUU   UUUUAGU  UUAUUAU  AAAAUAUA    AAUA  AUUAAUUAUAA UUAAUUAUAAA   AUUAAU  AU  UUUAA  AU AAUUU UC U
  |||||||   |||||||  |||||||  ||||||||    ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||  ||  |||||  || ||||| ||
  AAAUUAA   AAAAUCA  AAUAAUA  UUUUAUAU    UUAU  UAGUUAAUAUU AAUUGAUGUUU   UAAUUG  UA  AAAUU  UA UUAAA AG G
UA       GAG       AG       -G        -UCA    AA           -           UUA      UU  UU     -U  A     U  C
Stem-loop sequence UUUAAUUACAUUUUAGUCUUUAUUAUAAAAAAUAUAUAAAAAUAAUUAAUUAUAAAUUAAUUAUAAAUGAUUAAUUAUUUUUUAAUUAUAAAUUUUCUUGCGAUAAAUUAAUUUUAAAUUAUUUGUUAAUAUUUUUGUAGUUAAUUAUAAUUGAUAAUAUUACUUAUAUUUUGAUAAUAAGAACUAAAAGAGAAUUAAAAU