ncRNA ID | novel_gma_miR2652 |
Species | Glycine max |
Class | miRNA |
Genome position | Chr20:39654527-39654727 [-] |
Reference genome | Glycine_max_v2.0 |
Source | SRR1451660 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - UAAGAACUAAAAGAGAAUUAAAAU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--       ACA       CU       AA        UAAA    --           A           -UG      -U  UU     UU  A     -  U   UUUAAUU   UUUUAGU  UUAUUAU  AAAAUAUA    AAUA  AUUAAUUAUAA UUAAUUAUAAA   AUUAAU  AU  UUUAA  AU AAUUU UC U   |||||||   |||||||  |||||||  ||||||||    ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||  ||  |||||  || ||||| ||   AAAUUAA   AAAAUCA  AAUAAUA  UUUUAUAU    UUAU  UAGUUAAUAUU AAUUGAUGUUU   UAAUUG  UA  AAAUU  UA UUAAA AG G UA       GAG       AG       -G        -UCA    AA           -           UUA      UU  UU     -U  A     U  C |
Stem-loop sequence | UUUAAUUACAUUUUAGUCUUUAUUAUAAAAAAUAUAUAAAAAUAAUUAAUUAUAAAUUAAUUAUAAAUGAUUAAUUAUUUUUUAAUUAUAAAUUUUCUUGCGAUAAAUUAAUUUUAAAUUAUUUGUUAAUAUUUUUGUAGUUAAUUAUAAUUGAUAAUAUUACUUAUAUUUUGAUAAUAAGAACUAAAAGAGAAUUAAAAU |