Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR1489
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr1:33951771-33951914 [+]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR1294480
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - GUUAUGAGGUGACAGUCGGAGUGC - 24
Stem-loop(if miRNA) --  U    G    C  U       C  CAUC       C UU    GG    C   U  UC    C  CAC
  GU AUGA GUGA AG CGGAGUG CA    AUCAUGC U  UCAU  ACAC UCA UG  AUAU AU   C
  || |||| |||| || ||||||| ||    ||||||| |  ||||  |||| ||| ||  |||| ||
  CA UACU CACU UC GCUUCAC GU    UAGUGCG G  AGUG  UGUG AGU AC  UGUA UA   U
UU  C    G    C  U       A  ACAA       A UU    AA    U   U  GA    A  ACU
Stem-loop sequence GUUAUGAGGUGACAGUCGGAGUGCCACAUCAUCAUGCCUUUUCAUGGACACCUCAUUGUCAUAUCAUCACCUUCAAUAAUGUAGCAUUGAUGUGUAAGUGAUUGAGCGUGAUAACAUGACACUUCGUCUCUCACGUCAUCACUU