ncRNA ID |
zma_circ_000343 |
Species |
Zea mays |
Class |
circRNA |
Genome position |
6:108931714-108936811[NA] |
Reference genome |
AGPv3.22 |
Source |
PlantcircBase
|
Method |
SMALT and Segemehl |
Type |
intergenic |
Splice junction sequence |
ATCGTGATTCGTTTCTGAGCTTCGAGGAATCGACGGTCAAGCTTCAACGACCAAATGACCTAGTTCTTCGAGTTCCTCGAGATTGAAGACCCTGAACATACGCTCGACGGTCGTCCCCCAGAGCTTCCCCATGATGCGCGTCGTGAAGCCCCTCGACGAAGACCCTAGGAACACCTGCAGGGGTCGGCCATCGTGCACAG |
Tissues |
shoot |
Exon boundary |
No-No |
Splicing signals |
AG-GT |
circRNA sequence |
NA |
Genomic sequence |
ATCGTGATTCGTTTCTGAGCTTCGAGGAATCGACGGTCAAGCTTCAACGACCAAATGACCTAGTTCTTCGAGTTCCTCGAGATTGAAGACCCTGAACATATGTTTGGTGAAGGCAAGTGTCCCTTGACCTATCTCTGTCCTATACATTCTTTAATTCACCTCCCGCATTACACAGTTATACCTAAGGATTTACTAGCTTTTGTTATCCATGTCCTTGTTTACCTATCTGGGTTGGATTATTATTGTTTAGCTTTATGCTATTGCTCAGCTCTAATCAATGAACATGATGAGATTTATCAATGATACGTTGTTTCCCCCCCTTTATTATGATGTTATACTTGTGACCTTCAAGGGGGCTCGAGCGGTTTCTCGAGTGCCTCTCCGTAAGGACCTGTTCGTTGGATGACCGCCCAGAAAAACAGTGCAACCATGAGGGTGGAATGGGATGCCCTTAGCTAAATAATTAGAGGAACCGGGGTGTAGCTCGCTTAGCCATCGTGCCGTCAATGGGGCTCAGTGTATGCGGCTCGCTCTGCCAAGTTTGGGTTCGCCCCTTGGGGAGGAGTGCGGTGCATTTAGGAAACCTAACGGGTGGCTACAGCTCCGGGGAATCTTTGTAAAGGCTACGTAGTGATGCCCTGCTGGGTCACCTTGGTAGTGATCAATGGAGAGTCATGATCTCTGGGCAGAAAGGGAATCACGACTTGTGGGTAAAGTGCACAACCTCTGCAGAGCGTTTGAAAACTGATATATCAGCCGTGCTCACGGTTATGAGCGGCCAAGGGAGCTCCAGTGATTAGTGGTACTTGATCAGAGATGTTCGGATTGCAGGTGGCAATGAGATTGATGGTTCTTGGTATTGACACTGGTAATGGTAAGTGGTACTCTTTCCATTTGGAAAGGAGTACGTTTGGGTTAATAACGTGGGTTAAATCTAAAACTTGGCTTTCTCTACTAGTAATAATAATCTGACCAACTAAAAGCAACTGCTTGACTTACCCCCACATAAAAGCTAGTCCACTACAGCCAAACAGGATACTTGCTGAGTATGTTGATGTGTACTCACCCTTGCTCTACACACCAAACCCCCCCCATCCCCAGGTTGTCAGCATTGCAACCACTGCTCAGGAGAAAGATGAAGTCGTGGATAAGGATACTTTCAGGAGTTCCAAGACTACGACGAGTTCTAGGCGTGGGTTAGCGGCAACCCCCAGTCGGCTGCCTGTGAAGGCCGCGTTTATCTACTTTTCGTTTTCGCACTTTGATTATTTGTAAAGACTATGTGGATGTCTCAGACTTATGATGTAATCGACTATTATTCCCTTTTTAGTACTATTTGAGCACTGTGTGATGATGTCCATGTTATGTAACTGCTGTGTACGTGAATTGCTGATCCTGGCACGTACATGGTTCGCATTCGGTTTGCCTTCTAAAACCGGGTGTGACATAAGTGGTATCAAAGCCGTGCTGACTGTAGGACCGCTGACCTAGAGTAGCATTGGCCGTTTTAAGGACTTCTTGACTGTTACTTCACCTCATCCTTGATTCTGCTTCAAATTTTAGTCATCTCGACTAATTCTATGTTGTGCTCCTATATGCCCCCTTGTCAAAAAGTATTTTATTCTAGCATGGTCTATACTTCTCTCAGTCTATTAGAACTTACCTCACTCTTGTGCTTGCGACATCTTTGTAGATGCCCCCTGACCATAGCCTTTAGTCTTTTGGGACTCTTTCCTCGTCCATTTTTAAATTGCTACCATTTGACCATCTCTATTCCATTTTGTTATTGACATGCTCGTACCCTTGCATTTTTTTAATACCCTTATCCCTTAATCTAAAATACTTACCCTTGTACCTCTATTGCCTATTTAAATAGTTCAGTTTATGTGTCCATGACCTTCTTGTCTTCTGAGATCATTTCTTATTCTGTTGTTAAGTCGCTATCTCTCGGTAATTTCTGTGCCCTTGGTCTTAGTATGCTCGTATCCTTGGAATCTTGCATACTCTTATATTCTTATGTATGCTTATTTTCATACCCCAATAACCGTTCAAGACATTTCAGTTAACATGTCCTTGACCACCCCTGTTTCTTAACAGTCCATGAGCGATCATTTCATGTCGCCCATCCTTGGTGATCTCGTTGTTCCTTTATAACTTCTCTCGATAATGAGTTCTTACGTCAACCATAATATTGCACCCTCACCTATCTTACTGTTGATTGTTTTCTCCACTTCGCCACTACGTGAGTCTTCCCTTAACTCTATCATTTGTCATGACTTTTGTTATTATCACCTTCACCTTAGACATCTCTATATCTTACTTGAGGTTTATCTTATACCGGCATTTAAAATCTTCTCCTTTTTCCATCTCAATTTGAGCATCGTACTTTACCTACTTTTCCCTTGGTCGTATCCTCTTCTTTGTCACCTGCGAGTTGTTAACTCTATCCTTCGTTGTGTTTTTGATTGTTATTTCCTTTACCCTTCTCATCACTCTGTCCTGCCTTGTGATTACATTATGTTTGTTATCTAAAATCTCCAATCTCTTATCCTAAGTTGAGAGCAGTGTTTTACTTATCTCACCCTTGGTAATATCCTCTTCTTCACCGTGTGTAAGCCTTAACATAACTTCATTCTTTGTTGTACTTATACCACTAGCTCTTCAATGCCTTCGTTTTTTTCATGCCCTTGTATGTTGTCGCCTCTGACCCTTGTGATATTTATGTCTTCTACCTAAATTCTTACCTTAAACTTATCCTTTAAAAGCCTTCCCTTTCTTTCAACTCGGTTTGAGAGTTGCGGGTTACCTATCTCTCTCTTGATTTCTTTTCACTTCTTGTCGCCTTACAAGTTTTGTCTTAATTCCATCCGTTGATGTGTTTTATTTGCTATCACCATCACCTTGTCATCCATCCATCTTGCGTTGACACTCATCTTTATTCTGGATCCTTAAAAATCTCCTCTCTTCCACCTCCATTAGATAGTGGCTGCTTATCTATCTGGCCCTTGGACGTACCCTCTCCTTTTCCATTTGCAGGTCCTATCTTAACTCCATCATTTATGGTACTAATATCTTTTGTCTTATGCTTATTTACCTCCTCTCCTACATCTTTGTCCGTTATTACCTTCAAAACCCTTGTGATATCTATGTCCTTACCCTCCTACCTATCTCGAACATATCCTTTGAAGCCTCCTCTTTTCCATCCGTGTTTGAGGATAATGCCTCACCTATTCATCATTGACTGCTCCCCCTTCTCGACACCTTGCAAGTTTTGTCTAAAATAAATTTTTGGTTGGGTGTTTGTCCGTTATCACCTTAACCCTCGTCATCCCTTGATCTTTACCTTGATGCTTATCCCGTCCCTGCATTTTAAAGTCCCTCCCTCGTTCCAGTTCAAGAGTGTTGTCTTACCTACCTGCTCTTGGTCATTCCCTTTTCCTCTACAGCGTTGCCAGTCATAGCGTTTGTTTGATATACCCCTTACCCTTGTAATCACTAGATTTTGACTTGATACCTATCTAAGGTCTGCTTTTGGAAATCTCCCCTTTTCTATCTCAACCCGGGAGTGTTGTTCTACCCATTATGCCCTTGGTCGTATCCTTTCGTTGATCGCTTACAATGCTTGCTTTAACTCCATTCTTTATGGTGCTCGTGTCCCTATCCTACACGTCTTGTTCTTCTCCTTGTCCTTCAACAACCTTAGAGAGTAGTTATTCCCTTTTCATGAAAGACCACCATTTAATTAGAAGGAACATGTAGCAACAAAATGTTTGTTGTTGTATGCTTGTGCTATTTGTCTTTGTGTGATGACTGATTTGCTTCTTTGGAATGAGTGTTGATGTGTTGTGGCCCTTAATCCGCAATGACATCAGTTTACTAGGTGAATGCCATAGAGTTAAGTAGTTGGGTTCTCCCCCTGCTCTCTCTAATCCGTCTATACTTACCTTTTCTCGCTACCCTTTCCTCTTGCACCTGTCCATTTGGCAACCTCCAACTCCTCCAAATCAGTCAAGATCAGAGTCGGCAGCATCTTCACCAAGTGCATATCGACGCTCCTGTTAAGGGGGTTAGCCGCTAACTCAATGAAGACAATGTGATCAACATCAACAAACAAGATCAAAGTGAAGCAGCGGAAGCGTGTGTGGGTCCTAACCCACAAGTCCAAGGGATCCTCAAGAATTATATCGTCAATCAACCTCGAGCATCTGAAGGTCAAAGCAACCAGTCCGCAAGTTAAAGTTTCAAGAGTCAAAGTTGAGTCAGGAGAAGCTATGAAAGACCAATGAACCAATCTCATTTTCTTGCTAGCTTCTTCTTGAATCTCGAGGGCGAGATTCCTGTTAAGGGGGTTAGATCTGTAACACCTGGAATTTGGGGGTATAAAATTTCTTTCCTAATACCCACCAAATTCAGGTGTTACCCTAGCGAAACAAAACCTAGAAAGGGGGTCCTTGATTGTTGCATAGCATGTCGAGGCATGTTTTTTTCCTTTGTGATGGTGCATTTATTCAAACTTAGAAAGTATGTTTGAATTTGAATTCAAAACTAAAACATGTTTTCAAAAAGAACAAAAGGAAGAAAAAATAAATAAATAAAAGGAAAAACTCCCTCATCCCCTCCTCTCTCTCGGCGGCCCAACCCCCCAGCCCAACCCAGCTCGGCTTTTTCCGGCCGGCCCACGCCGCGAGCACCCCAGCCAGCCTCACGCGCCCCGCGCCCCAAAACCCTAGCGCCGCCTCCTGCGCGCGCTCGCCCAGCTGCCCAGCACCGTGCCCAGCCGCCGCGGCGCCTCGCCCACCACTCTCTCTCTCCCTCTCCCCCCTATTCCCCCACGACGTCGTGACTACCTCCACTACGATCCTTCCCCTGCTTATGGAGATGACAGTTCCAAGCATACTCCAACATCTCTCTCCCTACACGCACAACTAGCCATGGCCGCGCGGCCACTGCAACCCGTGCGAGCACACCCTGCGATGCACGAGTGTTGCTCTGCACAACCGCTCGACGGTCGTCCCCCAGAGCTTCCCCATGATGCGCGTCGTGAAGCCCCTCGACGAAGACCCTAGGAACACCTGCAGGGGTCGGCCATCGTGCACAG |