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BaseInfo

ncRNA ID	zma_circ_000332
Species	Zea mays
Class	circRNA
Genome position	6:30249469-30254877[-/-]
Reference genome	AGPv3.22
Source	PlantcircBase
Method	SMALT and Segemehl
Type	exonic
Splice junction sequence	CCTGGTGAGATGAGCCGGGGTAGCCTGCAGGAGGATATCCACCTTGAGTTGGGTAGCCACCCGGCTGAGGGTACCCATATTGTGGTGGGTATGCGCCGGGTGTGCTCCATAAGCGGCAGCGGCCGCGGCAGCACCTCCCGCTAGCATTGCCCCCGTCCCCATGTGGCCCCCGTGGCCCCCGCCGTGGCTGCTCCCATAAC
Tissues	shoot
Exon boundary	Yes-Yes
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CCTGGTGAGATGAGCCGGGGTAGCCTGCAGGAGGATATCCACCTTGAGTTGGGTAGCCACCCGGCTGAGGGTACCCATATTGTGGTGGGTATGCGCCGGGTGGAGGAGGATACGCCCCTGGGGGAGGTGGGTATGCTCCTGGTTGCGGTGGGTAGCCCTGCGGAGGGTATCCCTGCGGGGGGTACCCATGGCCACCGGCAACGCCGTGCATCAAGTTTGAGAAGAGCCCCTTGTCGCTCTCGTCATGCTTGTCTTTCCCTCCTCCCATTGCTCCCCCAAGTTTACCTAAAGAAAGAACGAGCAGAGTATATATCAAACTGTGAGCCAGCTTAAGTGTAGACAGACAGAATATGAATGTAGATTGTAACAGGTTGAAGAATGCGGTGATCAAAAATCAAATCTGACATAATCCCTCTGTCCCAGTATTATAAGGCGTAAACATTTGTTGGGCACCAAATTGAGCTGCGGACGGTCCGGCCCTAAGGTCGGACGGTCCGCGCCTGTAGCCCGGACGGTCCACACGTGCACAGAACAGATTAGGGTTCCGAGTTTTGTGCAACGGTTGTTAGCTAGATTCGCGGAATTAGCTCGGAAATTAGTTTGTAAAGGGTCTAGCCCCCTCCTCTATCTCACATTTATTTCCTGTACAATTAGGAGTAGTTTTAGTTTAGTTCTAGTTTAGCTTCTCAATCCCCAAATTCTCCGCTTCTCTTCGACTCTACGTTGATTAGAGGAGTCTAGGTCGGTCTGCTCGAGCCTAGACATCACCTAGGATCTCTCCTCCCAGACAGGGTCCCTCCCAGGAGCGAGATCCAGGCACCGCCGGCGATCTTCCGCCGCCCCTGCGCACGCGCGGACCGTCCGGTCCTAGGGCGCGGACCGTCCGGCCGTCAGGCAGGAAACCCTTGCCCCGCGCCAGGCCGCGGACCGTCCGGCCCCTGGCCGCGGACCGTCCGCCCCTGTGCAGAGAGCACTATCGCTGGTTCGTGTTGAGTGATTGGCGCCCCAAAAAAGTGTCAACAATATCTCTAGTTCAAAGGCCAAAAAATGTATTAATTCTCTCTATGCTATTGCGTCGATGTATACATGTCTAGATAGAGCACATCTTATATTATAGGACTAGAATAAAAAATGGTTAAACTTTATATTCTGGGATGGAGAGTGTGTCTGCAAAAGAATGCACGGTAATGGAACAGGTGATGCAGGCACAAAAGTGGTCTAGCTTCAGTATGGATGTAGCAGTGTACCGAGCAAATTGAATGGTATATATTGGAACAGGATGAATGCAATAGTGTGAGAGCTTTTTTTTTCTAGATGAAGGAAGCTTTATTAATAACAAAGTTCTGGCTTTCCCTCTCCGTAAGAACATTTTCTATCCATAAACTACATAATGGCTAAACATAGGTATCCCTCTCTGAATGTTTGCTTCTACTTCCCTCTCCTTACACAACTACTGACCCAATCTTACATGATCCACTGCAGGATCAGAAGAATGCTAAAACAGAGCAGCTAAAAGAAGATTGCTGTGTACTTGCCGAAGGAAGAAAAAAAATGATTTGTTTGATCTAAGAGATGGTAGTTAATTGCTCATTGCAACTCAGAAAAAAATGATTTATCTGATCTAAGAGATGATAATTAATTGTGCATTGCAACACGGACTACATGACGAGGCAATCGATCCTTAGGCCCCTTTGGTTAGGCTTTTCAAACTGCTTTGGCTTTTAAAAAAGCAAAAAAAGCCAACCAAAGAGGTTGGCTCCCATCTAAAGCCAAAGCAAAAGGCAGCTTTTAGCTAATACATGTACAACTTTCATAACAGACTTCCACTTCTTTCATTGACTGTGAAGTTGGGAAAATACGTAAAATTACTCACGACAACGATTAATGTGCAATCAGGCCTCATGTGCAAGCGAAATGTGCAATCAGGCCTCATGTGCAAGCGTGCAAGCGTGCAAGTAAGACCTAATTGCACAGTAGTCGTTGCCATTACTCACTGCCAATAGTTATGAAGATAATGATTCATTTTACCTACACACATCTATTCTTCATGCAACCAAGCTCCTCGTCTAGCGCTCCACCACCTCGGTTGGTCGCCAAGGGCGAGCATGACCTCTGCCACAGCAGGCGAGCTTGGGTCCACCATCGCGAGAAAGCACGACCTTGGTCAAGGATCCATCCGGAGGAAGAAGACAAGACAGACAGGGTCCACTTGTCACTGAGTGAAGCTAACGGCAGTTTTTTAGAAGCCACAACTATTGAACCAAACGATTCTTAACTTTCGCACATTCCATAACCCACGGCTACTTTTCCACCCGTGGAAGAGTGGAAGACCCAGAAATCTTCAAAAGCCTAAGAAAATATAATACTCATACTATAAAGATATCGTCTTGCCCAGTTTTTGCCTATGTTTAGTTGCATTTTATTGCTTGGTACACATATATAAGTCTATTTGCACTAATGGATGAGCCTAGGCAAGTGCCCACGCTCGCTAGGCCATGAGTCCGCCCTTGTTTTCCACAATCCACAACTCACAACAACCTTTTCAAAATCCACAAGACCCTTAGGCTATTCTCATTGGTTCTCAGTGGGTAGGTATCATATTTGTATTTCTAAGATGCCATGTAAACAAGAAAGGAATGAAATCTTTGTTAAAATAGTCTCTCGCAATAGAGAGTTTCTTTCCGTGCGATTTCATATATAGACAATATGTCTAGATAATAGTGTAGACATAGCTTCATCACATGAAACTCATTTCATCTCTTTCTTCATTAATTGTTTTACCACATCATCTAGATCACTGATATGCCACATCATTCAATGAGAATGAAAAAAGTTATGTGATGTAGGCAGTTGGAATGATATGCAGTAGGAAACTGAAAAGATACCCGTATAACGGTGGAGGATCATTCCAATTTCCTACTGCACATCACTTGAACATGCTAGCATCGGCCATACGTATAACTGATTGCATATGTTATACTCCTCTCCTTGTTATCATATATAATAAATAGTTCACCCTAACCGCTACACTTCTCTCCCCACCCCCCCACCCGGCCACCCCCCACAAAAAAAAGGTAGGGTCTACTGGCCACCCAAATTACAGCGATAAAACATTTTAATTTACAATTAATCATCCACCCTAATCATTGCTTGACCCCATAAAAATCCTGTACGCACGGTAAATTTCCCCTCCACCATCACACAGTCGATCAAACAGGGGAGCGTTAATTCGGAACATCCTCACAAGTGCAGCCACGAACTTCAGACCGGCAGATCACACACCATCCACAGAACTCTACTACGTGGTGACGAGCAAAAACCAACGATCTACACGCACCGGACCGGATGCACCCCTAAACCCGTGGAACCAAAAACAATAAATCTAACCGAATTATGCGAAGGTATTTATATAGATACTAGAGAGACAACAAAGGTGGGAGTATAGTATAGATGACCAACGTGGGAGGAGAGTTGAGCATACCGAACGACGAGCCGACGACGCGAACTCCGGCGCCCAGAAGCAGAACAGGTATGCAGCCGATCTCGGGCGGCGATGTTCCTGTGGGCGGCGGGTGCTGGTTTGGCCGTTCTCCTTCCCCCAGGCTGGCGGCTATATAGCCGAGGAGACGGCGACAAGGAAGGAGCCAGGATGGTGGCCGGAGGAGCAAACGCGTGGCGCCGAGTCAGGCCGCCATGCGGGCTCGGGGCGCGTTACGGTTGCTGCGACCTGCGACTTGCGCGTCGCGAGCGCGTGCCGGCGACCGGCGTGCGTGGGAGGGGAAGGGGAGGAAAGGAAGAAAGCAACGCGACGAAGAACCGAACCGAGCCCCACATCACCAGCCGGGCCTACAGCGCAGTGACCCGGATCGAAACATGTAATTCTTGTGCCATTTATTGTCTTAGGAGAAAACATATTTATGCTTCATCACAATATCAATATGGGAAGCGATTTTACGAAAATACTTCTGCCCTCAAAGTCACACCTCACAGCAGTGCGGCCAACGGCCGCATCTGTTCGGCTGCATAGCTGCGATTTATGGACTGTGGAAGAGCTACGACATGTGAAAAAACTGATGCGGGCTGTTAAAAAGCTAAAATCGTTTGGTGGAAACCATTAAAAATCGTTAAATGTTTTTTGATATATATTTCACGGTTCCATCCAAAAGCCACTAAAATCAGGTCTATAGGTGCTTTAAATTTTGCACTACGAGAAAGTCAGCTTTTAAAAAAAAACTCTTTATTGTATTCAATCCTTTGGTTTGACTTTTAGCTTTTAGGGAGCAAAAACCAAAATTAAAAGCTAAACCAAACATACCCTTAGACTACTATAATTGTAATTGATAAAGACAAAATATTGTAGTAACCACAGCGAACATGGCTCCCATGAATTTCATGCGCGATGCAGCTTTCGTTCTCTATAAATTATTGATTGGTTTGTATTATGATAGGATAGAGCTATTTTGTCCTCAATTTAGTATTGTTTGAATTGATTATATATGAAACTTAAAAAATAAAAATTATGCTTAAATATTGAACCATCTTTTCAAAATATCCTGGACAGAACCACTCCAATTGACTCTGAAACCAAATGCTACCTAAACTATGCTCATACTCACTACCTAAACTATGCTCATACCCACTCCATGATTTCATTATAAGAACAGAATTTAGAGAACCAAACTCTACCTAAACTATGCTCATACCCACTGCATGATTTTCATTATAAGAACAGAATTTAGAGACATGACTCGATCTACTATTTCAGCCTCAGAGCCTCAGGCAAGCAGGGAAACGGTTGATGTCATCAGATCAACACGTCTTTTCAGACACCAGCAACAACGTACCGAAATCGATTGGTCAGATAAAGCCACGATTTATTACTGGCAATGGATATAATCTTCAGAGCGCTCCATCCACAAGACCAACATATACAGCATATCAGCAAATGGTTATTTATGTCACTTATTAGCATTATGTCACTCGCCACAAGC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