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BaseInfo

ncRNA ID zma_circ_000169
Species Zea mays
Class circRNA
Genome position 2:199222272-199225401[+]
Reference genome AGPv3.22
Source PlantcircBase
Method SMALT and Segemehl
Type exonic
Splice junction sequence TTATCAGAGCACCCGGAATGGACACGCTGAAGATACCTCTAGCAGCGGAACACACCACAATCGATGATGTCTCTGTGTGGGAGTGGTCTGGCTCTGCGTATACACCCAGAGGGTGGAGCCCAAGCTTGCTCTGGTCCAGGTGGAGTTGCCGCCGGAGGCCTTCGCTGAGAACTGGCAGCCCACGCCCGACGACCACCTGG
Tissues shoot
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TTATCAGAGCACCCGGAATGGACACGCTGAAGATACCTCTAGCAGCGGAACACACCACAATCGATGATGTCTCTGTGTGGGAGTGGTCTGGCTCTGCGTACGATGAAGGGGCTGAAGTGTCTGAGTGGTTCTCCACTTACTTTGGGAAGCCAAGTCGACTAGTGCGCTTCAAAGAAGGTTCAGGCATTTACATTTCCCTTGGAATAGGTTTTGCACGGCTAGATGATCTTCTCTATTGCTTATGGACAACGCTTGCTTTGCTGCATTTTTTACAGCATCCGAAACTAGGCCAACTGATCCATATTACGGCCAAGGCCAAGGTTACAAGATCATGTTCACCGATCGCTTCCCATTTCTGATAGCCTCTCAGGTCACTTCATACTTCTATTCAGTTTTGAGACAAATGCCCTGTGTCAATGTTGCCATACACAAAACTAGCACCCTCGTAATGCACATTTAGTTGCACTGCAGGGTTCATTGGACGCACTAAATGAGATTCTTAAAGAACCTGTACCAATGAACCGCTTCAGACCAAAGTGAGCATCACGCTTGTGCGCTTGTAGTTATATTCTGAGTAGATTTTTTTTTTCTTTTGGTTGGTTTATTCTATTGAGGCTGACAGTTAGCTGCTTGCTAGTTGTGTCTTTATCTTCTTATTAAGCTGATCCCTTTTGACAGTATTTTAGTGGATGGATGCAACCCATACTCAGAGGACCTGTGGAAAACCATAAAGATAAGGAACAATTGGATCTATACCATTAAAAGATCCAAACTTTAGATATATACCATGGACCCCACATGTCATTGACTCATGTGGACCCACATGTAAGTGAGATAGTAATGGTATAAATCTAAAGTGGTGATCTTTTAATGGTATGGATCCAAATTTCCCTTGATTATTTGTGGACTTGAATTGACCATCTTAAAAACGAGAAATAATTCCTTGTATGGACAAACTAGATACGAATTATACAATGGTGTACGTGTTTACTTCAGCAAGCCAATACATATAAGATTATCGTTTGTTTAGTTACTGTGTTGATTAATTCAGGTGCCAAGCATTAATCAAGAGGATGGAATACCTGGCACTGAACCAAATGAAACTCTACAGACATTTCGGTCCGACCAAGTGCTTCGTCCAAGCCACAAAAATAAACGACAGGTATTTGCCTTATGCAGCCTATCTTCCTCATATTATCTGCTTCGTTTGTTAAGGAATTGTCTGTGGCCTACTGGCCTTGCAAGTTGCTAAGGTCATCAGGATCACTGGCAATGACAATGGAACACTTTAATCGATTTTTATAGGTGTACTTTGGGGTGAATTTAGTCTGCAAGGAATCTCTATCAGGAAAGGACGAAGGAAAGATCATCAAGGTTGGCGATCCAGTTTATGTTGTGCAGGCATTCGATTCTTCTAATGAAGCCCTAGTCTGATTCAGGGTTAAAAATAGTGACAGTGTGTTCAAAAATCAAAATAAGTGAGTTTGTTATGCGCACTGGAGAAACAAAAATCAGCGGGCTGTTAAAACTGTTAATGAGACAATAAAACTCCTGCTGCTGGACAGTAATTATGAGTTAGATGTACCTTCATCAGGGGTTTATTTACCTCTATGATATTACATAGTATACCTTGTACATCAGAATGATACAAAACAATAAGTCCCAAAAAGGAAGGTGAGTTAGACGACTTTGTCTAGATAGGATGGAATGGATGGCTGATGGAGTCTCTTGTGCCCTATACAAAATCAGTGACCCACTGCAAGTTCCTTCAGTTACATCAGAAATTCAGAATAGCATGTGTACCTCTAGTTTCAAGGATCTTCCAAAGCCATTCAGGGACTATATCAAAACCATATCAGTAACTTAGTGGTTATTAGTCAAGGCTTAAAAGCTCAAAGACTCGTAGTATTACATTTTTTTTATATAACAACAATTGATTGCTAGAATTTAAAGATATCACTTGGTGTGCAATGCAATCGAGGGTGGATCATGCTAAGGCATGTTCTAAACCTCTAAACTTAATAGTTAGCGGCTAAAATTAGTTGAGAGATTTTAAACGCACTAATTATTAGTTATATCTTTTAAATAGCTATTAGTTGTTAGCCGCTTCAATCTAATTAAAACTAGTTAATTTATAATTTATTTGACTTTTTTACCTAAGTTTACTAGCTCATCTTATTCAAAAGATTTCATAATTGTTATTAATTTTTACTAGGTTATCTTTTAAGATATAATATAATATACTTTAAATGTGGCTTTGAATTTTTTTTGTTTTTCCCGTAAAAATGAGTAAGACAAGCGTGATAAAAAAAGTTAAATAAATTATAAATCAGAATTCATGAATCATTAGCTAACTAATATTTAGCTTTAGAGGTTTAACGGAGGACTTCATACAATCATACGTCGTCGTTGTAGAAAAATGCTACACGTTTTACGTTTTTATCGTGTAGCCGAGCAAAACAAATACTAAATGCCGCCACCGCCCACCGCCGTATCATCCTGCTGGCGCGGCACAAGACGCCACCGAGCCAAGAATTTGCATCCTCATCCTGCGGCTGTCAGTGTCAAGCAGCCAGGCTCAGGGGTAAGGTTTCAGCAATTCAGCTCCCTCGCCTCCGCCGCGGCACCGGCACTACGAGTGCTTCGCTACCAGCCAGCCAGCACACTCTACGAGTCGCCATCTTCCACTCCACCGAGGCAGCTCCAAGCCATGGCCATGGAGAAGGCCGCCTCCTTCCTCTCCTCCCTCTTAGGCGGCGGCGGCGGGGAGCCGGCGGCGACTGTGAAATCTATCTTCATATACCCTATCAAGTCCTGCAGGGGTCTTGCCGTGTCACAGGCGCCCATCACCTCCACTGGTGCCGTACCGTGCCCTCCCTCCGCTAGCTGCTCTGCTCCATTCTCCATCTTCCATCCATGGCTTGCGTTCTCTTCCTCCTCTAGGACGATGCCCGTGTCTAATTTGGTGTTCCGTCTGCAGGGTTCCGGTGGGATCGGCAGTGGGTGGTGGTGAACGCCAAAGGGCGAGCATACACCCAGAGGGTGGAGCCCAAGCTTGCTCTGGTCCAGGTGGAGTTGCCGCCGGAGGCCTTCGCTGAGAACTGGCAGCCCACGCCCGACGACCACCTGG