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BaseInfo

ncRNA ID zma_circ_000117
Species Zea mays
Class circRNA
Genome position 10:76416646-76417746[+]
Reference genome AGPv3.22
Source PlantcircBase
Method SMALT and Segemehl
Type exonic
Splice junction sequence GCAAAGACCTTGCCTGAGAGCACGAGCAATGAGAACAAGCTGATCCTCTACGGGCTCTACAAGCAAGCCACGGTTGGAGATGTGAATACCGGTTAGTATGTGTGCTTACATGTTTGTTCGTTAATAAACTTTTGAAGATCGTCCGGGCATATTCTACCAAAAGGACAGGGCCAAGTGGGATGCCTGGAAGGCTGTTGAAG
Tissues shoot
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GCAAAGACCTTGCCTGAGAGCACGAGCAATGAGAACAAGCTGATCCTCTACGGGCTCTACAAGCAAGCCACGGTTGGAGATGTGAATACCGGTTAGTATGTAATCACGCAGCTAATTTTGTTCTCTTCTTTTCAGTTCCCTTTCTAAGTTTGGTGTGTGGATGAAGCTCTTGGTTTGCAGAAACCTAATTCAATTTAAGTGTCATGGCTCAAAACTATTCCTAGCATGGATAGTGTTTAATAACTTTATGTGTCATAATACGAATTCCCTGAAAGGTTGACGATTTGCTTCCTCTGTATAAATTAAACAGCAGGGCCTGCTAGTTTGCTTTTGAAGTTTAACGATTTAATTTAGAAATCTGAACAGTGGTGAATATGTATTGTGAATCCGTGATAAAATATAAAATAGGGGGAAATCCTAAGAATATAAAATGCGGGCAAAATCCTAGTAAGCAAACAAGACGGTATTATAAAGAATAAGATGAACATATTTACTGTAATATCTTTTTATTTCTTCCCAAGTTTGGACAACAAATTTTGACCATGATTCTAGGGCTTGTTTATGTAGTACATAGCAACAGAAGTTCAGCAGTAATGGAACAGGGATGTATTAGATGTTGACCAACCTCTTGGGGTTCAACTAATACTGAATTGTAGATTTCTATGCTCTGTCCTGCAACATCTATTTACTGATGAAATTTGCTGCACCGAGATGCAGTTGAATGGTAAATTCAGGTTCATAGGGTTTGGCTGAGTAACTTAACATAGAGTTAAAAAAATGTAATGTTCATATCATTATATAGTTCAAAACACTCAAATGTGTTTTTTCTTCCATATGTCAGTTGTAACCAAGTCATGATTATGCTCTGTTTGCGTTGTACTAAATGAACCTCTAGTCTGTTCGACCAGTTGCCATTAACTCATGGGACCATGATAGTGTCTGTTGAAAAACTTATCTGCGCATCTTTTCTGTTTACAATAGTATATATTTTTTAACACAGCTGTGCTTACATGTTTGTTCGTTAATAAACTTTTGAAGATCGTCCGGGCATATTCTACCAAAAGGACAGGGCCAAGTGGGATGCCTGGAAGGCTGTTGAAG