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BaseInfo

ncRNA ID	zma_circ_000056
Species	Zea mays
Class	circRNA
Genome position	1:222600393-222602866[-]
Reference genome	AGPv3.22
Source	PlantcircBase
Method	SMALT and Segemehl
Type	exonic
Splice junction sequence	CTTGGCTGCTCCATAGTCCGCATCAGCTCTGCTCGCATTGCAGCAAAAAAACAAGAGAAAATGTTCAGATCGCAATAACATCAATAATACATGATCATCTTCACTGACCTGTGCGGGAATGTGGAGTACTTAGTTAGCGGCACTGTGACAAGGTTGCGCCGGCCGTTCATGGCGGCCTTGGTGATGGCCTCCGTGACCTC
Tissues	shoot
Exon boundary	No-No
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CTTGGCTGCTCCATAGTCCGCATCAGCTCTGCTCGCATTGCAGCAAAAAAACAAGAGAAAATGTTCAGATCGCAATAACATCAATAATACATGATCATCTTTTACAGTTGTATATAGACCCATCTACACCATAAAAAGGAGCCGGAAAAATCCTATCATTGCTTGGGGTCACAGAGGATTCACTAATTCATAACATGGCAAACATTCAAGGGGAATAGAAACTGTAAGAGTAATGTGTCCAAACAGATAAAAAAAGGAAATGGTAAAGTCAAGGGGCATAAAACTGCAATCGGTTGAGCCGAAACCCTAGAGCCAATTTACCAGAGAGATAAAAATGGTTAAAAGCACTTCCAGAGTCCAGACTTCAGTGGTGAGTAAAATGTTTGCCAAATTATGTCACGGACTCTTAACCAGAATGCACACTTAGTGAGGGATCCTATTAAATTACAAACATCAACTGACTTAAGTACAAGCTTCTAAGCCATTTGACAGTTGAACAGGATTATGAGAGTCTCTTTTGTTCGACCGGATATTCTAGTTTTTCGTGTCAGGCTAGCTCCTTTTCCGAAAAAACAAACCAGAAAAATTGAGCCAATGAATTCATTTGCCTGAATTTGATTTGCCAAATAGGTTCTAGATTACTCACAAATGTATTTGTGTCAAAAGCTTGTAAAAGTAATGCTTTGAGCAGATATAATTGATGCAACCTTGCAAATAGTACAAGTAATGCTTGAAAAAAAAAATCACGGCTCAGGAAACTAAATCAGATAGTTGCCATAAAAAGGTCAAAACTGACCCAAATTAGTACCACCAGAACAAAATACCAAAAACAGTGCACTAAATTGTCTAAAAACAATGATGTATGCACCATAACCAGGAGGAAAGGAAGTTAAAGGCAAGAACTATATAAACCTCAACTTTATTTCTCTGCATTAAAGTGTTAAGCTAAATTAAAATGATCGATTTTTTTAGTTCCAACCCTACAAATGTGCTAATATAAAACTAATGCCACCAATGGAAGCAACCTTCATGACACTATAATTATGATTAAGACAGCATGCTATTGGCGGGCCTGGGATTTGGAGGATGGGTATTCAAAAAAGAAAAATTAAACATGCAGGAGAGTTGTGTATCACTATATTAAGAAGAAAAAGGGCAAGAGTCCTTACAAAACACATATACACCACTCACATCAAAATTTCAAAGGCTAAAAAATGCTTTTCCTTACATCCTAAAGCCTGGTTTTTTGCATGTATAATTGATTGCAGCATCACATAGTACTAACTGTATAATAAATAACACAGAACTGAACATTATATCATAGATTCATAGACTTGATCATAAATTGAAATTGTTCAACATAAAGAAGTACTAGTTGTTTAGCAAAAATAACGGCTATTCAATCGAATACCCTTGACTTGAACCAGACCTGCCCCTTGCTAATTCGAATAAGGTCCCATTTGTTTCGTTGGAATTGAATTACATTCTAATAATTATAATTTAGACACAAACTAATTAAGTTAATATATTGATATATGTAATATATTTGTATATTATCCTAAATCATGAGAGAGATAGTTATACACTACATTTATGCTATAGAGAAGCAAGTAGAAGAGTGTGCTATAAGTTGTACATTAGAAAAAAAAAACATGTAAATCTATAGAATCAATTTCCATCACTCACCTCATTATTTGAGATAGGCTTATATATAAACTTTGGAAAGTTGTGTAATGTCACATTCTAATGAAAATAGTCTACTCCATTAGTTAGATTCCAATTCCTCCAAAATGAAGGGAAACAAACGGGGCCTAAGTGAATTACCATAGGCTTATCCACACAACAGGAAATTCATACCACAAGAAAGGAGACATAGCTACAGTATTGGGTCTACCTTCTAACATGGAGTTTGCTGTCAATGTAGAGAATTACAAATTCGTGAAGGAAAATTCGGATTGAGTTTACCATCAAACTTGATCAAACAAAAGATAAAAGACCATGACACTTCAGTGCCTCTGTCAAATAGGATCGTGCTAGTAGGGACAATTTCAAAAGTCATGTTAGCTTCAAAATAACACTAGGTCAAGAATAGTACCACAAGGACGAGACTTGATTTTGCAGCCACTAGCCTCATTCTTAAAACAGCTCACTATATGTTTTTCTTAGGCCTCAGTCAAGGTAGAAGAATAATGTAATATATTGAAAGCAAGTCTAAAACCAACTTTATTTCAATCATTTGGCAAGCACAATTAACCTTGACTGGTCAATACCAAGAGCATCTCACTAAATTCAACCTAACACAAGATTTCGATGTAGACTAATCATCTTGGAAGCAATTCAAGTACAAGCGAATCTTACGTAGTGCTGGACAAAGTCACTGACCTGTGCGGGAATGTGGAGTACTTAGTTAGCGGCACTGTGACAAGGTTGCGCCGGCCGTTCATGGCGGCCTTGGTGATGGCCTCCGTGACCTC