ncRNA ID |
osa_circ_040297 |
Species |
Oryza sativa |
Class |
circRNA |
Genome position |
Sy:269995-270313[-] |
Reference genome |
RGAPv7 |
Source |
PlantcircBase
|
Method |
circseq_cup |
Type |
exonic |
Splice junction sequence |
TCGTAGTCGAGGCTCTCGATGGGGCAGACGTTGGCGCCGACGATGGCGATCTGAGAGGTGGTGTTCATGGTGCGCTTCCGCAGCAGCGGCTGGCGCGGGCGGCGGAGGGGGCTGGTGGTGTGAACGCGGCGAGGGGTGGCCGTCCATCTTTGTCGCCCGAGTGGGGTTGGCCTCGCTGATCCTGCCTCGTCCTCTGCCCC |
Tissues |
root |
Exon boundary |
Yes-No |
Splicing signals |
AC-CT |
circRNA sequence |
TCGTAGTCGAGGCTCTCGATGGGGCAGACGTTGGCGCCGACGATGGCGATCTGAGAGGTGGTGTTCATGGTGCGCTTCCGCAGCAGCGGCTGGCGCGGGCCGCCGCCGGCCTCGTCGTCGTACCGCAGCAGCACCTCCGACGACTCGTACCGCCCTCGCCACGCGCCGCCGCCGCCGTCCATGCTCTCTATGTCGTAGTTGAAGCTGCCGTCCCGCTCTGGCGGAGGGGGCTGGTGGTGTGAACGCGGCGAGGGGTGGCCGTCCATCTTTGTCGCCCGAGTGGGGTTGGCCTCGCTGATCCTGCCTCGTCCTCTGCCCC |
Genomic sequence |
TCGTAGTCGAGGCTCTCGATGGGGCAGACGTTGGCGCCGACGATGGCGATCTGAGAGGTGGTGTTCATGGTGCGCTTCCGCAGCAGCGGCTGGCGCGGGCCGCCGCCGGCCTCGTCGTCGTACCGCAGCAGCACCTCCGACGACTCGTACCGCCCTCGCCACGCGCCGCCGCCGCCGTCCATGCTCTCTATGTCGTAGTTGAAGCTGCCGTCCCGCTCTGGCGGAGGGGGCTGGTGGTGTGAACGCGGCGAGGGGTGGCCGTCCATCTTTGTCGCCCGAGTGGGGTTGGCCTCGCTGATCCTGCCTCGTCCTCTGCCCC |