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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_040297
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position Sy:269995-270313[-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method circseq_cup
Type exonic
Splice junction sequence TCGTAGTCGAGGCTCTCGATGGGGCAGACGTTGGCGCCGACGATGGCGATCTGAGAGGTGGTGTTCATGGTGCGCTTCCGCAGCAGCGGCTGGCGCGGGCGGCGGAGGGGGCTGGTGGTGTGAACGCGGCGAGGGGTGGCCGTCCATCTTTGTCGCCCGAGTGGGGTTGGCCTCGCTGATCCTGCCTCGTCCTCTGCCCC
Tissues root
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence TCGTAGTCGAGGCTCTCGATGGGGCAGACGTTGGCGCCGACGATGGCGATCTGAGAGGTGGTGTTCATGGTGCGCTTCCGCAGCAGCGGCTGGCGCGGGCCGCCGCCGGCCTCGTCGTCGTACCGCAGCAGCACCTCCGACGACTCGTACCGCCCTCGCCACGCGCCGCCGCCGCCGTCCATGCTCTCTATGTCGTAGTTGAAGCTGCCGTCCCGCTCTGGCGGAGGGGGCTGGTGGTGTGAACGCGGCGAGGGGTGGCCGTCCATCTTTGTCGCCCGAGTGGGGTTGGCCTCGCTGATCCTGCCTCGTCCTCTGCCCC
Genomic sequence TCGTAGTCGAGGCTCTCGATGGGGCAGACGTTGGCGCCGACGATGGCGATCTGAGAGGTGGTGTTCATGGTGCGCTTCCGCAGCAGCGGCTGGCGCGGGCCGCCGCCGGCCTCGTCGTCGTACCGCAGCAGCACCTCCGACGACTCGTACCGCCCTCGCCACGCGCCGCCGCCGCCGTCCATGCTCTCTATGTCGTAGTTGAAGCTGCCGTCCCGCTCTGGCGGAGGGGGCTGGTGGTGTGAACGCGGCGAGGGGTGGCCGTCCATCTTTGTCGCCCGAGTGGGGTTGGCCTCGCTGATCCTGCCTCGTCCTCTGCCCC