Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_040232
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:22649903-22650939[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence ATGGACCAGCAGAGGATTTGTATGGCCTTTTCATCAATAGAGTTCGGCGTGAGCGGCCACCTGAGTTGCTTGAAGAAATCAAGGGGTGAGAGCGATTTACACAATGTGAAGGTAAGATAAAGACAGTAGCTCTGACAAACTTCGATACAGACAGGCTGCAGATAATTCTAGAAAATGGTATCCCAATTGTCAGCAACCAG
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ATGGACCAGCAGAGGATTTGTATGGCCTTTTCATCAATAGAGTTCGGCGTGAGCGGCCACCTGAGTTGCTTGAAGAAATCAAGGGGTGAGAGCGATTTACCATGGTCTTTATGCCACTCGGAGGTGTGTATAGCTGTTTTTCCGCTGCTTCTAATTGTTATTTTATTAATCTCCGCAGGCTAACAAAGTGGGTACCACCTCCGGTTAAAATGACCAGAAGTTATGTTGAGGATAATATTAACAGATCTCGAAAGAGAATGGATGTTTCTGCCTTGGACATGCTGCAGTTCCATTGGTATGTTTCTGTGGATTTGTGTGCTACTTATTAGTTATAGTAACATTTGGATGCCATTTGGTTTATTGCTCAGTTTTATTACATTTACTGCTAATCGCAAATTAACTACATTCTTAGAATGTTGAACTGTTTTGTTGCTAAACAATAAGGAACCTCCTGTCTCAAGTGACTTTTATATCACAGTTTCTTGTACGTTTGCACAATCAAGTTTCTGGTGATCTATCATCCAGAAAAGATTGTGTCCTTCCATTGACCATTGCTCTTAGCTTCGTAGTTATGCTGCAGTAGAGACCAGTTTAGAGTACTACAGATTTTTAGTTTTGAGTGTACTGTGGAAAGTCCTAAACTTGAGAGGTGTTATGATAAAAACCTGCGGTATGTGTAATCAGTCGAGGAAATGCAGCAATGTTTTATACTATAACTACTGCCATAATTTGTAATTCAGCTGACCTTTTATCATAATATAGGTGGGATTATGCAAACCCTGGATATCTGGATGCACTAAAACACATCACAGACCTAAAGGAGGAAGGTAGTATTTTGAACTTGGATCAGATTTTTAGTCTACTTATGTGTTTCCTTTCGCATGTCATGGTTTTTCAGTACTGACGGATTCTCGCTTCATGCCTTGTTTTGTTATGTACAATGTGAAGGTAAGATAAAGACAGTAGCTCTGACAAACTTCGATACAGACAGGCTGCAGATAATTCTAGAAAATGGTATCCCAATTGTCAGCAACCAG