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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_040195
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:22293736-22312802[+/+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence GTTTAACAATTGGAGTTGGAATTGGTAGTGGTGCCGGCCTTTTTATCCTGGCACTTGGTGCTGTCTTTTTAACACGTAGGATTAAACAACGGAGAGCAAGGGCGAGTGCACCAACACGCCGGGAGCCTTCTTGTGCAGATGCCCGCACGGTGCCCGTGGTAACTACAGCATTCCAAATGGCTGCACCAAATCCAATCTAG
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTTAACAATTGGAGTTGGAATTGGTAGTGGTGCCGGCCTTTTTATCCTGGCACTTGGTGCTGTCTTTTTAACACGTAGGATTAAACAACGGAGAGCAAGAACACTGAGACAGAAGTTCTTCAAACAGAACCGTGGCCATTTGTTGCAACAATTGGTATCTCAAAAGGCCGACATTGCGGAAAGAATGATCATCCCCTTGGCAGAACTAGAAAAGGCCACAAACAACTTTGACGAATCGCGTGAGCTTGGAGGAGGAGGACATGGCACCGTATACAAAGGTATTCTCTCAAACCTTCATGTTGTCGCAATCAAGAAATCAAATGTGACAGTCCAAAGGGAGATTGATGAGTTCATAAACGAGGTAGCCATTCTATCATAAATCAACCACCGTAATGTGGTGAAACTTTTTGGATGTTGTCTTGAGACCGAAGTGCCATTGTTGGTTTATGAATTCATATCAAATGGTACACTTTATCATCATCTTCATGTTGAAGGACCAACATCGTTGCCATGGGAAGATAGGCTCAGAATTGCTACTGAAACAGCTAGATCCCTCACTTACCTTCACTCTGCCGTGTCATTTCCTATAATCCATAGGGATATCAAGTCCCATAATATCCTATTGGATGGCTCACTAACAGCAAAAGTCTCAGACTTTGGAGCTTCAAGGTGCATCCCAACTGAACAAAATGGGGTTACAACTGCTATTCAAGGAACACTAGGATACCTAGACCCCATATATTACTACACAGGACGTCTCACAGATAAGAGTGATATTTATAGCTTCGGCGTTGTTTTAATGGAGTTGCTTACTAGGAAAAAACCATATTCATACAGATCGGCTGAGGATGAGAGCCTTGTTGCACATTTCAGTACCCTACATGCACAGGGCAACTTGGGTGACATACTTGATGCGCAGGTTATAGAGGAGGGAACAAAGGAAGTTAATGATGTAGCCACATTAGCTGTGGCATGTGCCAAGTTGAAAGCAGAAGAGCGACCGACTATGAGACAGGTGGAAATGACACTCGAGAGCATTCGGCAAGAAGTACTGCATAGTGTGAGCACAAAGAAATCTAAGGAGCTTCACGTCTCATGGAACCATGCAATAAGTGAGGGTACAAACTTGGAGACAACTAGGCAATATAGTCTTGAAGAAGAGTACTTGTTATCATCGAGGTACCCCCGGTAGCAGTTTTTCCATTTTTCTTGTGTGAGTTTGGATCAATATAGAAGGCTCGTGTTGTCCCCAATGTACAAGGTCTCCATGGGTTTTTTTTTATTTATCCATGTATGATATGCATGTAGTATTTCATAGCTAAATGTAACATCTTATTTTTATTGTTCTTCATCTGAATGTGTATTTTTTTCTGTTTGATTTCATCCAAGTAAAGGTCAAGATATCCTTTGTATTGTATTCAGTTATGATACTGAACTAACTATGTTTTCGGGCTACTAAACATCATCTGCTTAATACTCGCTATGTTTCACTTTATAAATCATTTTGATTTTTTTTACTAGTCAAACTTATTTAAGTTGACCAATTTTATAGTAAAGTTTAGTAACATTTACAACGCCAAATTACGCCAAATTACTTTCGCTAAAACTAATATTTAATGTATTTTGATAATACATTTGTTTTGTGTTGAAAATATTGCTATATATTTCTATAAATTTAATTAAAATTAAAAAAAGTTAACTTAAAAAAAATTAAAATGACAGGGAGTATCTTCTACCAAGCTGTCGACACTTCAATTGTAATAGTTAGCGATGTTGGTTCCAGCGATAACTTGTGCGACGGCGCTGTGATCGGCAGAAACAGATTTCCGGGGACGCAATGCCGGCAGTGATGATCGGTAGAAACGGTCAACCATCCAGTCCAGTCCGCACCTACCTGATCGATCGGTCAACGCGGATACAACAACGCAGCATATGCGTGTTCGTCTTTTAAGTAATTATTAATTTTTTTCTATCATTTAATTTATTATTAAATATATTACTACTCAAGTTTTTAATAATATTTATATTATAAAAGTTTTTGAATAAAACGAACGGTCAAACATATATAAAAAAGTCAATGATATTAAATATTTAGAGACGGAGGGAGTACATTACAGTACAGTCCACCCAAATTGGTGCTATTGATCATGAGTTGAGTGTTCAATCTGACAGTGGGCCGTTGTTTTCAACTCCGAACCTCGATCATTGACACGATGATTTTCAGTTAGGATCGATCCTGCATTCCTGCTTTTTTTTTTCCTTCTGAAACGCCAATCCTGCATTCCTGCCGAGGTGAGCTACCCATGCAACACTGCAACGTGATCTGAGGCTCTGAGTTGCACAACGGTCCGCACGAGATCCCGAGGGGTTCGGAGTTTTCTTCTCCGAACCACCTCGCCACGTCCGCCGACTCATATGCCACGCCTCTGCCTCGCCCCGCATCCTGGCGGCTCCTCCGTGCTTCCGCCCTTCGTCTCTGGCGGTCGCACGCGCGCTGCCGCTGCCACCTCCTCGATCTCTGGCGTACGGCAAGAAGCACCTTGGCTAGTATGGCACTGCCCACTCGATGAGCTCACATCGTGTATCTGTGTCCTTTCGCGCAAGGGACGGAGCTAGAACAAAATATAAAGAGGTTCCACTCACCAAGCCGACGGGCATGGGGCCAGCGGCCGCGGAGCCAACAGGTGCAGAGCCAGCGGGTGGCGCAGGGCCGGCACGGAGCTGACGGAAGCGGAGCGAGCGGTCGTCGAGCCGACGGGTGTGGTGCCGGCACAAGGTCAGTGGGCGTCGACGGCGCGGGTCTTGAGGAGGAGGCTTGACGGAGACGCCTCGCCCTCCCCTCCTTCACCTCCTTTCCTCCTCCGGCCAGGCGAAGGACGATGGCTACGATGGATGAGGACTTCGCGCGCGCAGTGGAGGACGGCCTCAAGCTGTCCAAGCGCCTCGTCCTCCCCGGCAGAGCGCCCCCGCCCGCCCCGTCGAGGGGATGGACCGGGCGTCGGGGGTGCCCGACACGGCCTCCTCGCTGCTGCCGTTCGCGCCCATGGCGTACGCCGTCGTCGTCGACAGCCCCGACCAGCCGCCCGTCTACGGCCACCTCGACCCGCCCGCGCTCATCCCGCTCCACATGCGCGAGTTCACCTCGTTGGAGGCCGGAGAGGGAGAAGAAGGAGAGGGGAGGGGCTGACGGGTGGAGTCCACGTTGCTTTTCACGTGGGCATACCACGATGGCACGTCACATGGACAAAAGTGGCAAATAGTTAAGAAATCATCTTTCTCTAGTGGCAAATTATTAAGCGCGAATCTAAGGGAGGTATTTGGATAATTGCCAAATCTAAAAATGGTAAACAGTTAAATTGCCGGCAGCTAGCGCCACATGCAGGCCGTGACCTCATTCATGCCGAGCCGAGTTGCCTAGTTACTTTTGGCGCCGCTGCAGCAGCGCGCCGCACCGTCTGCAGTAACATCGCTCTGCGTCCACACCGCTCTCACCTCGTCGTGCCGGCGACGACAGGGACGCTTCAGTGTTGTGGTTATAGTGTGAACGAGATGAAAAACTGTATCCGCCGCTGCCGCCATTGATGACGACGACTTGGGTCGTTGTTATCTATCTCTATCTATACGACACACGCCGGAGCTCTCGCCGAGGCTGTCCTTTGCAAGCAGCTACTTTCTTTATGTAACGCCCCGACATTCGTTAGCCATAAACACAGCTAACTCACACCGGGGTGTTATGCATTACCTGTGATATAGTACCAGTCCCAGGATACACTAGCTGGTACACACAGAATAAATGTGGAATCAAAGTAAACTGCTTTATTATATCACTGGGTAGTAGTCCTTACAAATGTTGCTATCATGGACAGGCCCATAGATGAGCAACACAACAGCACAGAAAAACATAAAAGTGACGGCGTAGAAGCGAACAACGCGGAGAACTAAGCGACTACGCACTAGGCAAAGAACCTAGGCAACTAACTTATTCCACAGGCGAGGCTTGGGGCTAGGCACGAAACATCTAAAAGTCTTCATACTCGGCTTGCTCCTAGAGATACTCCTCGGCGGTTGGGTCGACATCTTCATCTTCAAACTCTATATATTATTATAAGGGGCAAGGGTGAGTACTTAACGTACTCAGTAAGCCGGGGAAAAGAATGACATGACGGTTTAACAAGGAGGCTACGGTTTTATTTGCGAAGGCTGCCATTTTGGCAAAATGATTTATTTCACAAAACTCCTAGTGAGTGAGTCAAGTTTTAGTTGTCGGGAGGAGGCTCATGCCTCAACCCATTCCACAAGTTGCTTTGCAACAACTTGTCACGATTAACGAACAACAAATATTTTATCTCCTGTATTAGTTCCTTTTCACTTTCACTACAACACTAATCCACACAAATCTCCTGGTTATCCCAGCACATCAACGCCATCATGGCCATAACAATACCTCGGTGTCGGACGACACCCCAGGTCACACAGACCCGTTCCTAACCACAAAGGTTAGTCGTCTGCCACATAGGCAGACTCTGGTAACATCCCTTTTCAGTAACCACTTTTCCACAAAACCTTTGTCAAACAAATCTACGCTATGAGAAACACCTTACACTCGCCCTTGACCGTGGGCACGGCTGTTCGAACAGTTCATTAATCTCTGTAGAGGTTGCACGCTTTACCCACACGACACGAAACTTACACCGGTACTGGCCGGTACCGGAAGTTCGTGATAAGGCCTTTTCCAAAGCTAACCCATGAAAATCGCATGCCACCTAGTTGGGCTAAGATCCATAGCTGAGTATCAGGCAAAGACAGCCGTCATCCACTCAGGAAATACCGAGGATGCTTCCTACTCCTACTGGTACCATGCCACAATAGAGGCAAAAAGACACCCATGATGGGCAATAAATGTGTAACACTTCGTCTCCTCATCCTCGACATTCCACAACCATTGGCACACCAACTCCCATGTGATAACAATTTACTTAGCCAGAGGCATCCCATAACA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