Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_040159
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:21967550-21974954[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence GAACCATGGCTCAGCTGTTTGATGTTGGTCAAGAGGAATGCTCAGTGATCTTCTTGTGGACTTACCTGATTGCTGCCATTGCACTCACGACGTGGTCGACGTTGTCCATGCTGCCTATGGGGTTGGATTATTGCCACACGATCCATTGTACCGCTACGTGCTGATGATGCTGTTCGCACTGCCACCTGCAATGAACATCG
Tissues root
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GAACCATGGCTCAGCTGTTTGATGTTGGTCAAGAGGAATGCTCAGTGATCTTCTTGTGGACTTACCTGATTGCTGCCATTGCACTCACGACGTGGTCGACGATATTCATGTCCATCCTGTCTTGAGGTTGAGGGTGACAAGAAGAACCAACTTTGTGGCAATATTGGTTTAGCTGGAATGATTCAGCTCACGGATAAAATGTAAAGAAGCCGGAGACAATGAGCCTCTCCGAAAGAGCCGAAACTGAGGCTTGCCCATGAGCACCACACGTCCACACGTGTATAGAAATTGAAGCAGTATTTTTTTAGATAATGAAAAATAGCATGGTGGCCCGCGTAGATAACTATAATTTTTTTAACATATTAAAAAATATTTTTATTTTTTTCAGTTATTTCAAAATTGTATTTTTTATATGGACTCTATACTCTACTCCCAATCATCCTCACTTTATTAAATTTCTAATTTTGTAGTTCGAAATTTTGTTATTTCTAAATTATACTCTTCTTATATGGACTTAATAGTCTATCGTCTTCTCTAAATATTCTTTTTTTATTTGAAATTTTACTTATTTCTAAACTGTACTCCTATATGGACTTAGACTGGTGTAACGCACATCAGTCGTGGCGTTGGTAGGAAATACTTAACAATTCAATAAAAACCCTAATTTTCGAAACTCGTTCTTTGGTTGTGGTCCTGTTGTGTCTGTGTGCGCCAAGATCTCACTCTCTATCTCTCTATCCCAATTCCGAATCCGAAATCAAATCCTACTCTATAAACCCTCCAAATCAAATTTTCCTTGTAAAAGTCTATTACACCCCTTCTTGGTCATTGGGCCGAATCTCCCTTGCTCGGCCCATTTTTCCCTTTCGGCCTATTCCCCTCACGTTCCCGCTCGAAGGGAGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCCGCGCGTTGCCGCCGGTGCCTTTTTTATTTTTCGCCGTCGCCGCTGACTCCCGCGCGTGAGCGTCGTGGCCGACCGCCCGGTCGCCGCCGCCGCCGTATGTCTCCGCTCGGCACCGAGCCAGCCACCCTCCCTTTTGCCATCATCACTTGCATCATCTACCCGGCCCCGCACTCTGCCGCATCCATCCAAAAAAACGGGAGTAGCAGCCACAGCTCTCCACCTCCTCCTCCTCCCTCTCCCTTTTCCCCAATATGGCAAGGGACCAAGCTGCTTTCCCTCGGATGCAACTAGAGATCGGGCGCCCGATTTTTTGGCAAAAATCGGGCGCTGTTCTACCAAGTAGATCGGAAATATTTCACTAAGTAGATCGAAGATGTTTCAATCTTGTAAAAACTGAAACACAACCAAATCATCTCATTAAACATTTTGCTACAACGTATGAAACAACGGTTTCCAAAAAAAATCGGGCGTTGTTTCACCCTATATAAAAACAATGTTTCAGCAAATAACGAAAGGATGTTTCAATTCACTGCAACATTTGATCCATACATACTGAAATATCACAAGTACATTTATTGAAACATTGTTGGTGGTACAAAAAATAAAACGGATTTCCTTAATAAAGCGCTTCCGTAATATGCGGGTGATTCGTTGCAACGACACGTGTGGTGGGGCGCGTGGTGGGGATGGCGCGGGAGCGCGCGGGCGCCAGACGCGAAGAAATTTCGCTTTCCCTCACCGTCTCCTTTTCCTTTTCCTGACTACTGCTCGCGTCACCTCTATCACTCTTGGCTCCTAGCGCCAACGTGCCGCGCGCCTCCACCGCCTATCTACGAACTGTCGTCCCCGTTCCACCGTCATACAACGCCTATAAAACCCACGCCTCTCCTCTCGTTCGGCCGCTTCCCTTTTCGCAGCCGAGCTCCAGCACCAAAATCCGCCGCCGTCACTCCCACGCCGTCGTCCGCCATCGTCAAGTGCGCCGGAGGAGCCAATGCTCTTGGAGGCGCTTGACACGGACTTCGGCCACTCCTCTCCTTCCCCTTCCCTGACCCGAGGCCGAGGCGATCACACCCCGCGCCTTCAGCCCTCTTCGCAGCGCCACCCCTCTCGGTACCCCTCGCCGCTCCGACTCCCTTTTCCCTCTCTCCTTTAGGTGTTAATTAGCCCACCGCCGGCCGCCGCAGCTCGCCGTTGCTAGCCTCCCTTGGCGCCACGTCTCTCCCCGCGATTAGCCGCCCTCGGTCCTCGGTCATGGGTGGATGTGAGGTGATTCCTTAGCGTAGTTTTGATTCGATTACTGCTTGTGAAATTGCTATGGTGTGCTGGAACACGTTGCTTTTGACTGTGGCTGATGTGATCAGCTGGGCCAGGGAGGCCATCCAAATCGTTTGGCTGGGGGCCAACTCTTGATCTGTTAAAGATTGATACATTGTACTAGTCCGACCGGGCATGGTGCACTGTCGTGTCCGCGTTGTTGAGAAGCACTCTCTTAGAAACATTTGAAAAAGTTTTAAACAAAATCGTATGCAAAAACAAACAATCTTTCTATGAAGCTTGCAATAAACACTTAATTTCGATGACTTGCTGAGTATACCCTGTACTCACCCTTGCTCTACATAAATAATCCGGTTCTTCCAGGAGCAGTCTGGCTTCAAGCAATTTTGACGAGGTGTTCCCAAGTCATGCTTGTGGCCGTGGGGCAGTCTTCATTTCCGCTTTCTCTTTTGTAATACACTTGTGAGCTCGAGGTCTACCCGTAGCCTCAACATGACTGTAAAACTACTCTTAATTAAGAGACCACTGATGTTGTGATATTCTATCTTCCTATGATACCAGCGTGGTTTTTTGGGACTGGTATTGGCTTACCGGTTAATTTGGAGCTTCTCACGGTAGTTCCCGTCTGGAGCTAGTTTGGGGCGTGACAATTCGACTTTTAGAATTTTATACCTACACAGACTCTTGTCTACTCTTTCAATTTTTTATTTCTTAATTCTGATTTTCTGTTATTTCTTATTGTATTTTTATATGAACTCTAAAACTTATCTTTAAATATATATTTTTTAATTTTAAATTTTAGTTATTTCTAAATTGTACTCCTAATCATATATGGACTCTTAACTCTTCTTTGCAATATTCATTTTTCTATTTCGAATTTTAGTTATTTCTAAATTATATTTCTGTATGGACTCTAACCTCTAGTTTTTTCATGTTTTTTAATTCCGAATTTCACTTAGTTCTAAATTGTATTCAGACTCTATTTTTCTCTTCCAATATTCTTTTTTTTTAATTTTGAATTTCTGTTAATTCTAATTGGTTTTTTTATATAGACTCTAGCTCATCTTTTAATATTTCTTTTTAATTCCGTATTTAAGTTATTTATGGACTCTAAACTCTTCTTCCAATATTTTTTATTTTGAATTTTAGTTATTTCGAAATTATATTTTTATATGAACTCTAAACTCTAGTTTTAGTTTTTCTTTTTTTAATTCCGAATTTTAGTTAGTTCTAAATTATATTCTTGTATGGACTCTATTTTCCTCTTCCAATAATTCTTTTTTTATTTCCGGATTTCAGCTATTTTAAAATTATATTTGTACATGGACTCTTATTTTTCTTTTTCTCCGATTAATATGAAAATTTCTAGGTGCTGAGAGCGAACATGGAGGCTTCTTTTTCTATTGCTTTAATAATATAATAAATAGATAGATTCAAGGATTATAGACTGGGCATAGGTCCTCATACACACAAAAAGAAAAGATTGGGTACATGATTATTTATGTATCCCAAGTTTTTGGTCCATTTGGTTTGCAACTGAAAATACAAGTGGCAAAACCATAGGAACAGTAAAGCAGCAATTCGTGTCAGTCTCCCACTCCAGCGTGCGCATGCTTTCGTCGGCGGCCGGCCGCGCGCGGGTCTTGTTGGCAAGCGGGAGGAGCGGCGACGCCGCGGCCAGGCACCCACGCGCGTCGCCCCGTGGTACAGCCTCCGGCGACTCCGACGATGATGCCGCTCCTCCCCATCCGCTCCGGCGCCGCCTCCTATGCCGCTGCTGAACGGGGTAGGTTGACACGGCGGAGGTGGCGCGGCGCTGGCGTTCGTGGTGGCGAGCCTCGGGAAGGGCGGGTGGCGGCGCTGTTCCGGCGGGGGTTGGCGGAGTGGTCGTCGCTGCGTCGGGTGTTCGGTGTCGATGCCGTCGAGAGCGACAGCTTCCCCTTCCGCCTCCGCGACGTCTGCGCAGCCACGTGCTCGGGCGGACGGCCGCACAGCCATCACCGCGGCTTCCGGCAGGGTGGCGGCCATGGGCAACTCCACCGATGACCCACATGCTCCACAACAAGCAGGAGTTCCCCCTTGCCACTGGCGCCGTACGTCGTCGATTCGGATTCGGATTCGGTGAGCACCGCGCATTCATGATTATAACAGGCTCACAGCATATAGAAATACACTCAAAAGTCTAGTAAAATTTTAAGTACAAAGACTGTAAACAGCTAGACTTAAAAGCAAAGCACTAGAAGGAAGATCGAAGAGCTTGTTTCGGCATAACATACACAGTATCACAGATTTTAACAGCACCCAAGCTACTATCTCAGATGATTTCACACATACCCTTTATTCAATTCCTGCCATCCCTTTATTCACAATAAAAGCACACAAATAGATCACTTCTTATTACTAACCGATATGTTAAATAGCACTATTTGCTACTCCCTCCGTTTCATAATATTTGACACCGTTGACTTTTTAGCACGTGTTTAACCGTTCGTCTTATTAAAAAAAATTGTGAAATATGTAAAACTGTATGTGTACATGAAAGCATATTTAACAATGAATCAAATGATATGAAAAAAATAGATAATTACTTAAATTTTTTGAATAAGACGAATGGTCAAACACGTACTAAAAATTCAACGGTGTCAAATATTTTAAAATAGAGGGAGTACTTAACAATCGATTACATAGGGATGTATGGAAATGTATGCCAGATAAATGGCACTGTTTAGTAATTGCTTGGAGGGTTTTCTAGATCACGCGTTTCGGTTGGGGCAGTGATCAGAAGCGATCCCTTCGAGCTTCTGGCTAGCTTCACAAGTTAGTGGGCTAGCCGGTCTGAATTTGAAGCCTCACTGCTTCTTTTTATTTGATATTAGATTTTTCCCTAATATTCGTGTTTTTAGCTGAGCACGGCCGCACAAGAGATGACAGGTGATGAGGGACTTCAACTTCTTGAAACTGTCCCAAATGTGAACCTTATATCCCTCTTTGTCACCAAGCATCCTGAATTCCTCCTCGATATCATTTATGTAACGCAGTCGGATGTCGTCAGGTACCTTAAATTTCTGGAAGTAGGCCTGCTGGAAGTACTCAGGTACATCTAATTTGTCAACTATGTTCATAAAATCCTGAATATATCTCTCCTCCATATCTTGCAGTGCCTTTGTCTTCTTCGCTGCCCGTTTATCAGCCATCATCTCAATCCGAAACTGCTGTGTTTTCTCCCAAGCCCGGATCTTGAGTTGCATTTCGTGGTTACGCATCTCGAATTTCTCCTCGACATCATTCCTGAACTTAAGTAGGGTATCTTCATGTAACTTACAATCCGTGAGGTAGTACTCCTGGATATGCTCAGGTATGCCTTTCCTGGCATAACCAAGCTTGATAAATTGTTGCTTGAACCTCTCTTCCATATCTTGTAGGGCTTGTGTCTTCTTCTCCGTTGCCGCCTCCTCAATCCAAAACTTCTCTGCTTCTTTCCGAGCCTGGACCTTAAGCTCCCCCTTGTGATCAAGTATCCTGGAATTTCCCTTGAAAACGGCAGTTATGAACTTGACCCGGAGATTGTCAGGCACCTTGTAGTCATTGCAGTGTTGCTCCTGGGAGACCCAGCCTGATGTGCTCAGGTAGGTCATAACACTTGAGAATCCTTGCAGTCTGTTGGTTGAATTTGTACTCCAAATCTTGTAAGGCCTGCGCCTTCAACTTGTTGTAATCCTCCGAAATGTAACCCTTAGGTGGTTCCTCTTCATCATCAGGCATCCTCCTGAATTTAATCTCCACATGGTTTATGTAACGCAGCCGGAGATCATCAGGTACCTTGTATTTCTGGAAGTAGGCCTGTTGGACGTAGTCAGGTATGTCTATTTTGTCTAATATGTTCATGAAACGCTGAATGTGTGCCTTTTCCAGATCTTGCAAGGCGTGCAGCTTCTTCGCTGCCCAATAATCGGCCATTGTCTTGATCCGAAACTGCTGCGATTCCTCCCAAGCTCGGACCCGGAGTCTTGTTTCGTGATTACATATCCCGAATTTCTTCTCCACATGGTTCTTGAACATCAGCTCCTCGTCATCTAGCTTGATTTCCCTGATGTAGGCCTCCTTGATGCGCTCAGGTATGCCTTCTATGTCAAAAGCATGATTAACAAGTAATTGCATGTACCACTCTTTCATGTCTTGCAGGGCTTGCGCCTTGTTCGCCGCCCCCGCCGCCTCCGTCCAAAACTTGTCTGCTTCTTTGCGAGCCTGGGCCTTGAGCTTCTCTTCGTGATCAAGCATCCTGGGATTGCCCTCGAAAACGGCATTCACGAACTTGAGCCTGAGATCGTCAGGCACCATGTAGTCATTGCGGTGCTGCTCATGGAGATCCAGCCTGAGGTGCTTAGGTAGTTGGTAACAGGTGAGAATCTTTGCAGTTTGTTGGTTGAATTCCTCCTCCAAATCTTGCAGTGCCTGAGCCTTCTCCAGCGCCCACTTGTCGGCCACCATCTCCACCGCCCGCAACTCGATCGCTCAAGATTTTTCCAAGATTGCGGTGGGAAGCTGTGCCAATGTGAAGACCGACCAGCTTTAAATCAGGGGGGAACCGTGGAGAGCGCTTCCGAAGCGAAACGGAGACGGAAACCAACCAACCTGATGATCCTCGCTCGCTCCTCCCCTCTTGCGCGCGCGGTTGCTCCCCGAATCCGAATCAACGATGGGATCGGTCCAAAGCCACCGCCGCCGGGGGAATGTATCCGCAACTAGAATATGCATTCTTCATTTTCAGCTGTTAAGTTGGATTTTTTTTTCCTCGAACGATTTTCAGCTGCTGGATTAAACGTGGACGAACGGGATTGATCGCTACAGTAATCAACAGTAAATCAATGCCATAAAATGTCGCATCGAATGTTTGACACACAGATGTAGTATTAAATATAGAAAAAAACTAATTACACAGAATGCGTGTAAATTGCGAGACGAATTTTTTAAGCCTAATTAGTACATGATTTGACAATGTGGTGCTATAATGAACATGTGCATGCAGGGCTGAAGCGTACGGTGATCATCACGATCGTCTGCATCCGCTACGTGATCCAACCCTTGATCGGGATGGCGGTTGTCCATGCTGCCTATGGGGTTGGATTATTGCCACACGATCCATTGTACCGCTACGTGCTGATGATGCTGTTCGCACTGCCACCTGCAATGAACATCG