Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_040150
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:21920720-21921757[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence CTGTTGGAGATTGCTCAAGTCCCTGATGAGCATGTATGTACCCTCCACTATATCGTTTTATTTGGATTAATGAGCGGCAAGTGCTGATGATTATTTTTCTCAATTTCCTGGCCCGGTTTAAGTCAATCCCCAGCATTGTCGAGCTTGACACCTTGAAGGTCTCTGGTGATGTCTGGTTCGGCTCTGGAGTTACACTCAAG
Tissues root/root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTGTTGGAGATTGCTCAAGTCCCTGATGAGCATGTATGTACCCTCCACTATATCGTTTTATTTGGATTAATGAGCGGCAAGTGCTGATGATTATTTTTCTTGTCTTCTTTTTTCCCAGGTGAATGAATTCAAGTCAATTGAGAAGTTCAAGATCTTCAATACCAACAACCTGTAAGGAAGTTATGCTGTCTGTCTATCTGTCTTTGATTAGGAATTTCTCGCTTGCTAACAGCTTCTGGTAACAGGTGGGTGAACTTGAAGGCCATCAAGAGGCTGGTAGAAGCTGAAGCACTTAAGATGGAAATCATTCCTAACCCTAAGGTATGCCATCTATGGTTCTGCGTGTATCTGCCCCGTTCTATTCTGTCCATTGGCATTTACCAAAGCAGTTGGTATTCACAGGAAGTTGATGGTGTGAAAGTTCTGCAACTCGAAACTGCAGCTGGAGCAGCCATTCGGGTATTTAACTCTTCTAGAAACATGATGGGTTGCTGCTCCATTTTTGTATCATTTAAATGCTGTGCTCTAACACCTTTGCTTTATCTAGTTCTTTGAAAAAGCAATTGGCATTAATGTTCCCCGCTCGAGATTTCTGCCAGTCAAGGCTACATCTGATTTGTTGCTTGTACAGGTATATCTAAATTCCTCACCATGCTTTTGTTGATTTGATGTCATGATTCAGCTGTGCTAAGCTCATTTTCGTCCTCCAGTCTGATTTGTACACCTTGGTCGATGGCTTTGTCATCCGCAACCCAGCCAGAACAAACCCATCAAACCCTTCGATTGAGCTTGGACCTGAGTTCAAGAAGGTAAATCAGTTTGTATTCGAAACTTTTAAGGCAGCATTAACTAGAAAAGAAAAGCAAATCAGGAAAGCAGTGACTAGTGAAAGCTGAGTTGTGATCATAACTTTCCTGTTCTGGATGACTATAGGTTGCCAATTTCCTGGCCCGGTTTAAGTCAATCCCCAGCATTGTCGAGCTTGACACCTTGAAGGTCTCTGGTGATGTCTGGTTCGGCTCTGGAGTTACACTCAAG