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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_040138
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:21857629-21858222[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence GTGAGTTTCTCACTTCCCCTTATTTGAACTGTTCCATGTGCATTTGCGCTAATTGGTCGCGAATTGAGGAGTTGCTCGGTTTCTCTGATGCCGTGTCTCGGAACAGTGGTTTCATCATTTGTGCTGATTTGTTGTCTCTGTCGTTTGTTGTGAATGCTCTGTTAGTGTTTCAGTCCACCTTGTGCTTTGTTTAGCTCTTA
Tissues shoot, root
Exon boundary Yes-No
Splicing signals CT-CA
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTGAGTTTCTCACTTCCCCTTATTTGAACTGTTCCATGTGCATTTGCGCTAATTGGTCGCGAATTGAGGAGTTGCTCGGTTTCTCTGATGCCGTGTCTCGTTCTAGATCCGTTTACTCTTGTGATGCCAGTGTTGTCCATGTCTCTGTATTGCTCGTATGGATCTAATTGTTGCTGAGGATTAATTTTAGCCTGCTTACTTGTATCACTGTTGCTGGTTCAACTTCAAATATGTGGGGGAAAATGCACTTAAATTTGTTTGCTCATGGGTAAATTCAGATTAGGGGTTATGTCGTAGTTGCTGTGCCTTGTAAGGTCGGTCATACATGTTCACCAAGTTGAAATTGCTCCTCGTTCCAATCCTACAAATAGATCTGTAAATTACTGCCCTACCTTACTTGGTTAATGTTAAGTCAGAATGTTCACCGCGAAGTCAAATTCTAGTAAAATTTTGTGGCCATATGTACTCAACCGCGATGTTTAGGCTTGTATTTGGAACAGTGGTTTCATCATTTGTGCTGATTTGTTGTCTCTGTCGTTTGTTGTGAATGCTCTGTTAGTGTTTCAGTCCACCTTGTGCTTTGTTTAGCTCTTA