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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_040127
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:21808753-21818755[-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence CGGCCTTTGATTTTTAACCATGCAAAGGAAATGCATAGGACAACCAAAATACTGCTTAACACTGCTAGAACAATCTTGACCGCATTGCTCTTCCTCCTATAGCAATGTCCTCAAATCTTACAAATGGGAGTTCAAAATCTTGGACAGTGCTTCCTTCGCCATCAAAAATTAGCTTTCTGTGCTTTTCCTGGTTTGTTTTC
Tissues root
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CGGCCTTTGATTTTTAACCATGCAAAGGAAATGCATAGGACAACCAAAATACTGCTTAACACTGCTAGAACAATCTTGACCGCATTGCTCTTCCTCCTATGACCTGTGCAACAAACACAAGGGTGTAAACTTTTACAATCCAACTAGTAAACACATTTTTAAAAAATAGGAAGTAGCAAATCTATCTATCTATCTATCTATCTATTATATTATTAAAACAGCTTTGAAAGGAGGCACCACGTTCGCTGTGGGGGCTAGAAATTCCCACATTAATCGAAGAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAGAGTCCGAGTAGAAATACAATCTAAAAATAGCTAAAATTCGGAATTAAAAAATAAGCAATATTGAAAGAAGTTTCTATATAAGAACCAATATGAGATTAATCAAAATTTGAAATAAAAATAAAATAAAATTCAAAATTAGAAAAAAAAGAGTCCCAGTAGAAATACAATTTAAAAATAGCTGAAATTCAGGATTAAAAATAAGCAATATTGAAAGAAGTTTCCATATAAGAACTCAATATGAGATTAATCAAAATTCGAAATAAAAATTAAATAAAATCCAAAATTATAAAAGAAAATGATAGTCCAAGTAGGAATAACAATTTTAAAATAGTTAAAATTTAGAATTAAAAATAAAGAATATTAAAAGAAGAGTCCATATAAGAACCCAATATGAGCGCGATTAATTAAAATTGGGAATAAAAATAAAAATAAAATCCAAAATTAGAAAAAAAAAATAAAAGAAGAGTTCAAGTAGGAATACAATTTAAAATTAGCTAAAATTCGAAATTAAAAATAAACAATATTGAAAGCAGAATCCATATAAGAACCCAATACGAGATTAATTAAAATTTAGAATAAAAATAAAATAATATCCAAATTAGACAAATTAAAAGAGAGTTCAAGTAGAAATACAATTTTGAAACAACTGAAATTAAAAATAAATCTATTATATTATTATTATGGTTGAGATCTATGCACAGATTAGATGATACCAGAGTTGTAAAGCTAATAAAAGTCTACGACTTAAAATATAGAATATATAGGACACAATTTATATATAAAAAATCAAAACGTATTAGGAAAGAAAACTAGATGTATTAGGACAGAAATAAGGATAAGAAGCCGCTTCATTGAGTTTCGGGGGAAAAAAACTGGTCCGATTCAATAGAACTTTCAACGATCCAGGCAAAGGATGGACTGCCAGACTGAAAGCTTTCTAACCTGCTATCAGCTAACAAGCGGAAGCTATGGGTAAGCCAAAATTTTGATGATTTGAGCATCGGCTATAGTTTTTGAAGCATGACAAATAACATAGCTTAATATTTATAGTTTGCAATACCTAGATGTCATTTATTATTCCTTATTAATCATGCCATACATATAATCAATATTTACATGAAAGCTTAAAATTCAAGTATAAACATATTAAAACTTTTTTTAAAGCAATGACATAGATTAAAATATTATAATGTGAATACATCACATGTTTTTTATTAGATTGAATTTGGACATGAAATTTTGCAACAACGTAAGCCGTATAAGAAAGAGCAAATGCATAATAATACCAATTAGTTCCAAATTACCATGATCGGTATTTTTATATACTTCAAAATTATTAAGACAACTTTGAAAGAAGACATCACGTACACTCTGGGGTCTAGAAATTTTCATATTAACCGAAGAAAAAAAATCTACACAGTTAGATCATGAATCAGACACGTGAAAGAGCATGGACTAGAATTTGATGTGTGCTACGCAATAGCAATTGAAATCAAAATTGGATTAGGAAACTTAATTTACTACACGAGACAATCATGTCCTGTCCGTGTAGCTAAATTAGAAATCGTATATAGGCACAATTGACACGTCCTGTACAAAATCATGTGCAGGGGAGGCAAACCAGCTGGGCATCCAAACTCCTTCAACCACATTCAAGTTTTGCACTATCGCATAATCTCTAGAGGCAGCAGTATGCTTTTCTTTTTTAAAAACAATCCTAAGTAACAAGATTCCCTAATAGTTTTCTACATATTTACGGTCCATATGTTATAGCTCATACTCCGATGATGGGGCAGAGCTGAGAAGCGGCGAAAATTACCACATTAATCATAAAAAGTGAAATATTTAAAGGATCTAGATTTTAACGGTTTATATTGATCAGTATAGTTTTATATAAATAAAATACATCAAAGTAATGTAAAAGGAAGCCTCTACGTTTGCTCTCAAGGTTTTGATCGTGGTCATGCCTATAAAGTAGATGGTGATGGTTGATAGGGCATCTAAAAATTATAAACAAAACCCAAATAGAATCCCAATGACGATTAAGAGGAGGAATGACGGACAGGCCGTTAAGAAGCACGGTCACAACGGTTGGCGGGACTTTTAGAAAATAAAAAATGAATTCCAACGATAGTTATGTTCGATTTTTAGAATCACAATGAAATAAAGAGTAGGCAGCGGACGGGCTGTAGAGGAGCATAGTGGCATCGTTTGACGAGACTTCTAAAAATTATAAAAAATAAAACCCAACAAGACAATAAACCCTAAAAACTACAAGGTCCAATTTTTAAAGGTTAAGAACTTCTAAAAAGTAAAAAAAACAATGATAATCATGTTCGATTTTAAAATCTCAATAATAATAAAGAAGGGAGGCAACGGGCGAGCCGTAGAGAAGTACAATGGAAAAGCCGCTGACGGTTTGGTGGGACTTCTAGAAAGTAAAAATGAATCCAAACGATAATTATGTTCAATTTTTAAAATCTCAATGACAATAAAGAGAAGATATAGTGGACGGGCCATAGAGAATTATAATGATAATGTTTGACGGGACGTCTAGAAATTATAAAAACGAAACCCAACATGACAATAAACTCTACAAACTATAAGATCCAATTTTTAAAGGTTGCAGGAGAATGAATAGAAATAATGGTAGATCGAGCAAGCAAATAAAGAAGGAGATGACATAAGGGGTAGCAACTGGTGTGATTTTTAAAAAACTATATAATTAAAAACATGGGGGAATGATAAGGTTTGATCTTTCGATGTCTTAGTACAATGATATAGCTATTTAATAAATTTTAAGTAAAATCATACTAAAAATATATGATTTTATTTTGGTGCTAGCCGCGCAATTGCGTGGGCCACCCAGCTAGTTATATTATTAAAACAGCTTTGAAAGGAGGCACTACGTTCGCTGTGGGGGCTAGAAATTCCCACATTAATCGGAGAAAAAGAAAAGGAGAGTCTAAATAGAAATACAATTCAAAAATAGTTGAAATTCGGAATTAAAAATAAGCAATATTGAAATAAGTGTCTATATAAGAACCCAATACGAGATTAATCAAAATTTGAAATAAAAATAAAAAAAAATCCAAAATTAGAAAACAAAAGGGGAGTCCAAGTAGGAATATAATTTAAAAATAACTGAAATTCGGAATTAAAAATAAGGAATATTGAGATAAGAGTCCATATAAGAACCCAATACGAGATTAGTTAATATTCGGAATAAAAATAAAAATAAAATCTGAATAGCAAAAAGAAAAAGAAAAGTTCAAGTAGGAATATAATTTAAAATTAACTGAAATTCGGAATTAAAAATAAGCAGTATTGAAAGAAAAAAATTATATAAGAACCCAATATGAGATTAATTAAAATTCAGAATAAAAAAATAAAAAAATATCTAAAACTAGAAAAATTAAAAGAGAGTTCAAGTAGGAATACAAATTTTGAAACAACTGAAATTCAAAAATAAAAAATAAAAATATTAAAAGAACACTATACGTGACTTCTAGAAAGTAAAAAAAATAAACCACATTGATAATCATATTCGATTTTTAAAATCTCAATGACAATAAAAAGGAGAAGCAGCATGCGGGGTATATAGGAGTATAGTTGCAGAGCCGCTGACGGTTGGCGAGACTTCTAGAAAATAAAAAATGTATTCCAACGATAATTATGTTTGGTTTTTAGAATCCCAATGACAATAAAGAGTAGGCGACGGATGGATCGTAGAGGAGTATAGTGGCATCGTTTGATGTGACTTCTAAAAATTATAAAAAATGAAACCCAACAAGACAATAATTTCTAAAAACTATAAGGTCCAATTTTTAAAGGTTCGGAACTTCTAAAAAGTAAAAAAACAACCAATGATAATCCTGTTCGATTTTAAAATCTCAATGGCAATAAAGAAGGGAGGCAGCGGGCGAGCAATAAAGGAGTACAATGGCAAAGCCGCTGACGGTTTGGCGGGACTTATAAAAAGTAAAAAATGAACTCAAACGATAATTATGTTCGATTTGTAAAATCCTAATTACAATAAAGAGAAAAGACATTGGACGGGCCGTAGAGGAATATAATGGCAGCGTTTGACGGGACTTCGAGAAATTATAAAAAGAAACCCAACGAGATAATAAACTCAAAAAACTATAAGATCCAATTTTTTAAGGTTTAAAGGAGAATGAATAAAAATAGTGATAGACCGAGCAAGTAAATAAAAAAGGATACGACAGAAGTAAGGGGTAGAGTGACTTTTAAAAACTATATAATTATAAATACGGGGATGATACGGGGATAGCTATTTAATAAATTTTAGGTAAAATCATACTGAAAAATATATGATTTTGTTTAGGTGCTAGCCGCGCAATTGCGCGGGCCACCCAGCTAGTTGTAAGAAAAAGTAGCTTGAAGGGCCTCCTAGAGTCCTAGACGGCCTCCAACTAGTACTACGAGGGTTCTTGTGGTACCATCACTCAATCCTACCAGGTATTAAGACAGTATAATGGTATTTTCGCATGTCTGGTCATGAGAGATACTTGGGTTGTGTTCGGCATTCCCTCTTATCATCTTCTACTCTCTCTTTTTTTTATGAGCACGCTTTCTAATGCGTTCTTCTATTTTTTGCAAAAAAATATCTTTATAGAAAAGTTGTTTTCAAAAATTATATTAACTATTTAAAAAAATAGCTAATACTTAATTAAT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