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BaseInfo

ncRNA ID	osa_circ_040005
Species	Oryza sativa
Class	circRNA
Genome position	9:20962582-20967388[-]
Reference genome	RGAPv7
Source	PlantcircBase
Method	SMALT and Segemehl
Type	exonic
Splice junction sequence	CTCGGACATGGTGGGGCGCTCCTTGGCGTTCTTGAGGAGGCAGGACTCGGCGAGCTTGGCGATGTCGCGGGCGGCCTTGACGGAGTACTCGCCGCGGAGCCCTCACCGCCCCGGAGTCGTCCGACCTGCTCGTGCTCACCGCCGACACCGTCGTCGTCGTCGAGCCCCGCCTCCCCGACGATTCCTTGCTCTTGGACGAC
Tissues	leaf
Exon boundary	No-No
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CTCGGACATGGTGGGGCGCTCCTTGGCGTTCTTGAGGAGGCAGGACTCGGCGAGCTTGGCGATGTCGCGGGCGGCCTTGACGGAGTACTCGCCGCGGAGCCTGGGATCCATGATCATGCGGAAGTTGCGGCTGTCGGGGGCGAACTGGGCGACCCACTCCAGCAGCTTCTGCTCCCCCTGCGGCCGGTGGCGGTCCAGCGTCCGCCGCCCCGTCAGGATCTCGTACAGCACCACCCCGAAGCTCCACACGTCGCTCTTCACCGTCAGGTGCCCCGTCTCTATGTAGTCCGGCGCCGCGTACCCGTGCGTCCCAACCACCTGCCACACATCATCATCATCATCATCATACACCATCTTGAGCTCAGCTATGTATGTATCATATAGTAAGAACATGAAAAAGAAAAATTCAAACCTCTGATCGATTGGACTACGACAAGAAAAATAAACGAAGCAACTAAGACCGATTTATGGATAAGACATGTTTTTAGCGAACCGTTCAAAAGCCAAAATGACATCAAATAGGGTACATGAAGGTAAAAACAAAAAAAAAACAATTTAAAACTAAGCAACTACAAATAGTTTATAGATAAAACCTTTATATATGTGTGTGTTATTAGTGGTTTAAAGCTAAGGCTATTAAGGGGGTGTTTGGATACCCTGACTAAACTTTAGTCCCTGGTACATCGGATGTTTGGACACTAATTTAGAGTATTAAATATAAACTAATTATAAAACTAATTACACGGTGGAGGTTAATTTGCGAGACGAATATATTAAGCCTAATTAGTCCATGATTTGATAATATAGTGCTACAGTAAATATGTGCTAATCATGGATTAATTAGGCTTAAATAGATTTGTCTCGCGAATTAGCCTCTATTTGTGTAATTAGTTTTATAAGTAGTCTATGTTTAATACTCCAAATTAGTGTCCAAATATCCGATGTAACAGGGACTAAAGTTTAGTCAGTGTATCCAAACAACCCCTAAATAGACTATGATGAAAAGACCCAAAATCAACTTTAGAATTATGTTTTAGAATTCAAATTTTTTGTTGTGGCTAATAAGCCAATAAGCAGACAATTATAGCATTGATCCATTTCCTAAGGATAATAACATAGCTCAAAGCTCCTTCGCAATGCAGGAATTTCATGGAAATCTTCTAAAATTCCTATGTTCCAAAGGTCTGGTATGGTATGCCATAGAGCAGTTCTGCGTCAATGCTGACACAAGGTGCAAAATTCAGGGGGAGAAGAGTGATGCATGCGTGGCATGTGTGCATATGTAAGGAAGTGGTGGCAACTTGGTCCATGGCATTGACTTGCTGGATTGCGGTCAAGATTGTCAGGTACACATCAAACAGGTGCACTGGACTGCTTGCCTACTTCAGTCAACGATGCTTTAAAGGCTGTAGTATATAAGTTGCTTTCAGTGCCTGATGGATCAGACAATGCAGTTGCGAGAAGGCTATGGTTTTGTTTGTAATTCTAATAGCAGGTTCAGATGGAGACATACCGCTGTTGAGACGTGAGTGTTTGCTCCTGTTGGTCCCTCCCTTGCTAGCCCGAAGTCCGACAGCTTTGCTCTGAAGTCTTTGTCCAACAAAATGTTAGATGCTTTGAAGTCCCGGTAGATTACCTATCAAAATTGAGCAAATCAGATGAGGATCTTCCCTTTTGTACAAAATGGAAATGTCGTAACCAAAGAAGAAGAAAAGCTGAAGTAACTTTGTATACTAAGCAGCAGTACGCAATTAGCACTGTAAATTATGACGATGACCTGAAAAAATGTGATAGGTTTAGCCTTCCCTAACAGCCTGTATATCTTGATGCTCACCAGCTATAGAGCCTTCTTGCCTAAGTCCTTAATTGTTTTCTAGATTGGAATACTTGGTTCTACAGCTAAACTAGAACATAGAGAGGACAAATCGTATACGTTGGTTGCAACTAGGAGTAGTTAGTACTGATTATGCTTTCAGAAAGTGTCAATGAAATTTGGTGCCTGGAATCTTACAGGAAAGTAATGGAGATGGAGATGGAATTGAACAAACCACTTTTGCCTCTTTTTCATCTAGCTCATCAATTCGTGGTCCTTATTTTCTCATTGACTTTACACTGGAATACTGGATTCACTGCACCTCTATTGCACTACCTCTAGTTACTATGGATGCACGGTCAAAAGAACCTATTAAAACGTTGGTGCTGTCTCTCATCATATATTTTTATTGCCAAACTTTCTCCCACAAAAAACGAAATCACCTATTTGATAAAGATATATCTTTTCAGAGAAGTTGAAAGCATGTGGGCAATGTATGTCTGAAGTATACCTGAACTTGCCCTTCATGCAGGTAAGCTAATCCTTCTGCAGCACCCAAGATTATTTGAAGCCTTCTATTCCATGAGAGAGGAGGATAAGCTCGGACGAATAAGTGATCTTCCAGGCTCTTATTAGGCATATACTCATACACCAATAATCTTTGTGGCCCCCTTTCACCATCAACGGCACAATATCCAAGAAGCTTTACAAGGTTTGGGTGCTCAAGAACCCCAAGGAACTGTACTTCCGCCAACCACTGCTTATGTCCCTGGGAGCAAAATTAAAAGAAACTGCAAAATATTAGGAACAGAAGACAGGATTACTCATTAGAGGGATAGCATAGGAGATCAACCGCATTTGTTTTAGTAGCATTATAGCACAAAGCAAATATAGGAAACCAACAGACCTAATGCTGCCTTACAAGTAGTTTATTCATAACATCACTATAATTAGCGTGCATCCTAAATTCCTAATATACATCAACTGGTCAAGAAAAGACATCATAACTGAGTCAGTAAAATATCATCTAATTCGAGTAGAGAAACTTGGAAAAATCCTTATATTTTTAGCAGACACCACTTAGAGAAAATGAAGCTTATGCTTGGGTATTCTATTAAGTTCAGGACTTGAAATTAATTATTTCCTGTACTCCACTAAACGATATATTCACTACCGGTTTGTCAGTCTTTAGACATCACTTGCATAAATTCAGAATGGATATAGAGTCGCAAAGCACATGGAAATTGAAGTTTCTAGCTGACTTTTGTTCTATATGTTCACGCACCAAAATTTTTCCTCCTAGTGAGTGAATAATAGTCAAATAAGACTAGCAACATGGTTGTGCAGGTTGCCCAGAAACGTAATCTATTCTATCCATTAGTCTTCTTTGATTGAGCAAATTAGCTAACGGAATATTGATTTAGAGTGAAAGGTTGGTTCGCATCATTTTCTAGGAGACATATTTCTACTGTAAGCATTCAGAGAAGACATGGTCTACTATTAATATTGATTGCCATTTGTTTTATGATGACCATGAATGAATATTCAACTTCCAAGTTTGAGGAAGTAAGGTTCCTAGATACTTGAAAAGTTCATTGCCGTTCAAATTCTATCCTGTATTTCCCCTCCATTTTGCTTTATTATGAATAAACAGTTGCCACGTGTGCCCATTGGTCCTATATTTAACCACATCTCCACGCCCAGCACCTCAACTAGTAATAGTTTATGCAGACCAGTAACTTCTATAGTCAACTGACAATGGACTGAAGTAATCCAATGCAATAGATTGACCCCATAAAATATACTATCAAAATTGTAAAATAACAGTAACAGGCAATATCTCATCCTTGAAAGTTCTGCATTTTGATCCTGTCTTCCTGTCAAGATTGTCTACACAGAGAGAGATTTTTAACATACTGATAATAGATAACCAAACCAATTTCAACATTTAGCAAGCCAGGAATATTTCCAATATTCCGGCAAACTAGAAAATGACTTGTGTCCATGGACTTCCTATGGATCAGAACAACATACTTGTCAGTTTATCCAGAGACCAATTCAAGATCAGCTAACACCAAGCACAGAATCCATTAACTTTACTCCCCATAATGAATCTTCCCATAACAGTCGTTAATCTAATCTAGTGGTCACTACTGATGATTTTCATCAAATTTGGCAGAACTACACATTAAAAACAAAAACTCGCTAAGTTGCCTGAAAGCATTCTTCTGCATTCTATGCCAGGATCTTGGCGAAGAGAAGTATCAAGAACAACAAAAATGGCATCATTTGGGATCTCCCTTAAAAAAACACTTCCCTTATCTACCAGCACTAATTTCTGACAATACTGAACATAAGAGAGCAAACCTTAAACTAACAAAACTCATTCCCCAATTCTCCTATTCCCAAATTCCTATTCACCCCTAGTTATCAAACCGGAAATCAATCGCGCAGAATCACAAAGGGGGGAATACTACTCCTGGATCGGAATGGAGGATTCGTTCCCGGGTGACAACTGACAAGACATGATTGATGGTGTCCAAGAAAAGTCAAGAGGAGGGGGTGCAGACTGCAAAGAGAGACAGAGACAGGGGAACGAGAAGGAGGAGGAGAGCACGCAAACAAGCGAGTACCTGGAGACCCCGCTGGTTCAGGCACTTGACGGCGACGGCGAGGCGATCGGCGGCCTTGCCGTCGGCGGGGGAGGAGCGGACGAAGCCCTTGTAGACGCTGCCGAAGCCGCCCTCGCCGAGCTTCTGGGCGCGGCTGAAGCCGTTGGTGGCGGCCTGGAGCTCGTCGTAGTCGAAGTCCCGGAGCTGGCCGTGGCCGCGCTCCTCGTACAGCGACGAGATGCTCCGGTGCGACGACGTCGACCCCGTCGACTTGCTCGCCGGCCTCACCGCCCCGGAGTCGTCCGACCTGCTCGTGCTCACCGCCGACACCGTCGTCGTCGTCGAGCCCCGCCTCCCCGACGATTCCTTGCTCTTGGACGAC