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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039971
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:20899415-20908255[+/+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GTTCTCTCCCCACACTGGAAGAACTAAAAGGGTTTCTTAAAGAGAGTAGAACGTCAGAGAATAATTGGGTTCCTCTCAAGGGCACATCAGCCAGATCTATTTGTCAACATCACACAACCAATTTTTGAAGGAAAAATTACCGATGAACACACCTCTTGCTGCCCCGTCTTTACCTGCTCTGAACATAGAGATAGAGACAG
Tissues root/shoot, seed
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTCTCTCCCCACACTGGAAGAACTAAAAGGGTTTCTTAAAGAGAGTAGAACGTCAGAGAATAATTGGGTTCCTCTCAAGGGCACATCAGCCAGATCTATTCTTAAAAAGACTCTCAGCCAGATAAATGTCAAAACCGGTGTTGCATCAAGTGGCAGCGATGGAGGAGAGGATACCACTGCATATTATGCTATGTCAGGGAGGAAGATCCAAAATTCAATGTTCACATCAGAAAGCTCAACAGAAGTTAGAGGTGGAACGGAAATCACTTTGGATGCTTTAGCTGCATACCTGAAATACCTAGAAGGAACAGGGAAGGCTAGTTGGCAAGAGTACGTCGCACCACTTCTTTTTAAAATCTAATTACATTCAGCACTATTGGTATGTTTGTAACTTTGTATTTGAAAATGTTGCCTAGCTCATAAGGTAAATGCAGTCTATGATGTCATATCAGTCATCAATGATTTTTCTGATAACAGGCTTTGTTTAAATTTCATATCCAGGTTGCATGATAAAGTACGGTTAACTGAAACTAGAGATGGTGCCTCGTTTTGCACTTTGTTTGGTCCTGCACTTCAGCTTGGAGTTATATCCAAGAGGAGAGTTTACCATGAAACTATTCAGTATGAGAGAGACCGGAATGCTGGATTTATATCACCATTTGGATACTCAACACCTACAGTGACAGCAGCAGTAGATGCTATCTGTTCAATGGAGGTACTTTTGTAACTGTCCTGTTCTCAAAACCATTCGTCCATACCTTTTCCTCCTCTTTTCGGTGATCTTGTTTTCCTCTAACAATGTCTTTCTGAACATGAAAGTGGTATTGGCTCTTGGCCTTGAAATCCCAAGTATGCATTGAAGGAAATTACCCTGTCAGAATCTGGAGATGGAAAGGTCATCTTATACAGGTACTATTAGTTAACTTCAAGATCCACACTCTCTATCTCTACTGCATCAGAAACCATAACTTATCTATGTAACAGGAATCATGTCAAATGCAAGTAGTCCTAGAATTGGATATAATTACAATCAGCAATGTTAGTCGTTAAAATGAATTGTGATGGCTTGGTCAACCACTAAAAAGGACCAATGTATTATCCTCTGAACTATTCATCTTTGCACTTGGATCCTTCCACCTTCTGGTTGCCGATACAGACCCCTAGATAGGTAAGCATAAAACATTTTCTTCTATCCCATATTAGTATCTCTGAAACTAACTAGGATTTCAGCTGAACCATTTAAAAGTTCCATCCAGCAGGGCAGCAGCTCTTCTTCCAAGCCCATATTTTTTACTGTAGAAAGTTGGAAAATCTTGTGTCCCGGTTCCCATGTTTTTGTTTTATTTGATTGCCAGGCCTTGACAAAGTTCTGCTTTGTATGGACTGTATATCGGTATTAGCGTTGTGTTTCTATATAATTAACACAGTTTTTGTTGTTAGTCTATTGCATGAATGCTATCAAATATCAATATACACAACACCTAATATGCTAGTATAGACCCCTGTTTCTGATGACATCATATTGTTTTTATGATTTTTTTAGTTCTATGTAATGCATCATGTATTCAATGTACTTGTTTTCCGCTTCCTGTATTTCCTGTGCAGCTAAGTTCCTAATTTAATTGTTTTGAAACATGTATTGGCAGTATACCTCTGTTGGTCATGAGGGTCCTTCGGTTCTTCTTGTGCATGGATTTGGAGCTTCCCTACAGCATTTTCGTGATAATATAGGTGCCATTGCTGATCAGGGATGCCAAGTTTGGGCAATTACCCTTCTTGGCTTCGGGAAATCAGAGAAACCAAATATCAACTATTCAGAACTTTTATGGTCGGAATTACTGAGAGACTTCATTGTTGATGTTGTGAAGGAGCCTGTTCATCTTGTTGGTAACTCAATCGGAGGTATATTTTGATTTATAAATCTTTCGACGTTTCTGGGGGTGATGGGCAACACATCGTTTACCCAAAACAACCTTAATTAATTCATTTCTTCATAATATTGTCAGGTTATATCTGTTCTATTACTGCCAGCTTATGGCCTTCTCTTGCAAGGTCTCTGATCCTTTTGAATACAGCTGGTTCAGTTGTGCCAAGTTACTCTTTTATTCCATTAAGTGAAGTAAGGCGACCAGCATTCACTGAAACTGTTCTACATTTGAATTATTTTAGCTAGTACATCTTATCTGAATGATACTCATAGGTCAAAGACTTACTAATATTGCATTAGTAACAGTGGCACTGGTTAGTGGCTATATGCTTGTTATAAAAAAAATGAGTGGAAATATTGTATCTTATTAAATGTCTGAGGCATTGTATTCACATGGGCTCTTTCTCATACATTTTCGTGTTACTTTAGACTTAGGACGATTGAAAATATGCACACTAAAATCTCAGCAGTTCTTTTTGGCTAACCTAGCGCAAGCTCCTCTCTTGTAGAAACTGTTGTATCATTCAAATGCAATGTGCATGTTATTTCTAGTTTGTTGGAATTATTAAAGCATTTAAAACTCTGAATAGTAGCATAGATAAGGCTAACAATTTAATGTTTCAGATACATATCTTTTGTGCTTATATCAACCAGTGTTTGTGGAATGATAATCTGACAGCAGCAAAAATAAATCGTACTATTTAGGATCGAATTTTTAGCACTGGAACTATATTACTTCCGCTACAAATTAACTCAATGCTACTGAATGAAAAATACAAACAGGAAGGACGGACTTCATGGCTTTCCAGTTTGCAGGCACGCCTCCTTCTGCTCTTCTTGAGGTCAAGAGCAGGAGGCATTCTTAAGGAATACTATCCTACAGTACGTGTATGATGTGGTTATTGCTTCCTCAAATATTTAAATAATACATGGTTACTAAGCAATACCGAAAAATTCCTGTGCAGAGAACTGAACGGGTTGACAAGCCACTTGTGGATGAGATAATAAGAGCTGTATCCTCAGATCACAAAGTATATTTATCATAGACTTAACCGTTGATATATGCAGTATAGCCTGCAATTCTTTTTCCTTGACAGACAAATTCAGTCATATGATCCTGGCGCAGCAACCGTTATTGAGAGCATATTCAGTTTCAATCTTTCCATTCCTCTCAACTTTTTATTTGATTCTTTTGGTGGAAAAATCTTAATTGTTCAGGTATTTTCTGATATAAAAAAATGGTGTGGATTCATACCGGTACCTAATTTAGTTACTGCAACATGCGGATAGCTAATACTACCTTCATGTGCTTTTTTTGGGGAAACAAGGGAATGAAAGATCCACTTACAAAATCCAAGTCATTTGTTTCCATGCTTAGGGAGCATTGCAGCAAGGTCCATATTAGAGAGCTAGATGCAGGTGAATCTCTCTCTCTCTCCTGTGCGCAAGTTCTCATTCATGAACGTCTTCAGGGGTTAGGGGTTACTGATGTTAGTTTTTTTCTTCTCATACTGAAATGTGTCAGGTCATGCTCCACATGATGAAGTTCCTGATGAAGTGAACTCCTTGCTGTGCGAATGGATCAAAGAGACTGGCGCTTAGCCAGCAATGGAGTTCCATCCTACTTAGATGTCTGGTAACCTTATCCATTAACTGACTTCTCGATTATACTAACTTGATCGTTGGAAGCATTTTTTTCTAAGAACTTGATCCCAATGTGCCCGTTGACACTTCTGTACTTTTTTTGCTTCATGTCTTAGGTGGCAAAAAGGAGATGAATATTGAACACTGTACAGAATTGTATGTGTAGATTACTTATTTACTCTTAATCTTCATATCATTTTCTGGAATTTCAAAATGAAATGCAATATATGTTGAATGAAAGGAAAAACAGCATCGAGCAGGTTTGATAGCAAGTCGGCACAAGAAGATGAGATGCAATTCGCACTCCTGATGAACTTTCTGGTGGTTCTTAAAGCTGTTTTTGTTTATGGACCTAGCTCAAAATCAACCTTGAACCCTACATTACAAGAGTTGTCTAAATCTAATCATACAAACTTTTGACCCCATCGTGCAAGTAATGTCTAATCGTGCCACATTTGTACTCTCTTGTAGTCTTGTTTTATATGGCTCGACATAGATAGAAGTACAAAATGAACTAATATTTCATGCCAATTGGGTGCATTCTTTCATCTGTTCCAAATTGTTTTTCAAGCCAGTGGCTAACACCCTACTAAACTATTCTCCAGCAAAATGAATTAATATAACTTTCCATCGAAGGAATTTCTTTAGATGTATTCTTGATGGTGAGGCCATGGAATCCTGAGTGCCTCGCTTGGGTTAAATTTTTGGGTGTAGTAGGGGTTCAATAAACGCTGAACTGGAGTGCATGCATTCTGGTGTATGTTCTTCAGTTTTTTTTTTGAGGGTAGTCATGTCAAATTTTCTGGCTAAAAATGATGTGTGGTTTGAGATATTGCCGAGTTCCTTTGAGCTTCTTTCTTTTCCCAATTTGTATACCATAACAAACTCCATAGTTTTCACTGTACTGCCTGTTTGGACTCGTAATGTGCTGTGGAATTGTAGGAACAGTTTAAAACTCGTGGGCTACTAGCTAATATGTTCGGGTATTTTACTTTTATTTTCCCTCTTATAGTATAGCGAATGCAACCGAATCTTTTTTTCAAAAATGTATTTCACTTTTCTTTGAATCAAATCAATCCATCTCTTTTCCTTGTGATCAGATTTCTTGTGCTATTGAAGCCTCTAAATGCACACACAACACACCGTGTCAAACTTAAACGAAATCCTGTTTAGCTACACATACAAAAACATCCTCCTTAGCAATAGCATGGTTTAATCTCATCATCCTGAGTATGCATTACATCAGTGCTGCGTACAAGTTCGATTCAACGCAAGCTGCCAATCACCAGAGCCTTTGGAAAGGCCATGAAACGGCCCTGTCAGTTTGATTAATCGATTAATATGATATTTTAAATAACTTTCATATAGATTTTGAAATAACAATTTAAAAATCGTGCACGCGGAACATGAGGAAGATGTGTTAATACA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