Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039960
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:20860004-20865325[-/-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence CTCCTTGGACAAAATAGATTTCAGGTTGTTCGTTGGCAGCTGTTTTTGCCATTCTGTTTCCTGCAAGAAAGCTTTAATGTGAGATGGATCCTCAAAATTTCTAGATCATCAGTTTTCCAAGAGGGAGATGCACGTTTTCTGAAAAAATCAACACTCAAAGTGCCTGCTTCTTGTTGACTAGAAGCTAAAGCATCGATCAT
Tissues root/anther, seed
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTCCTTGGACAAAATAGATTTCAGGTTGTTCGTTGGCAGCTGTTTTTGCCATTCTGTTTCCTGCAAGAAAGCTTTAATGTGAGATGGATCCTCAAAATTTAGGCTAAGCAATTAACTAGCTCCCAGAATGGAAAAATACCTGAGTACCTTCCATATCCATGGGATCTGCAGGTAAACAAACTACAACATCACTTATCTATTTCAAATCAGTATAACAGTATTCAAATACTACAAAACATTGACAATGTTCCTACAGTTCTAATAAATGTAGTTTTCTTGTTTATAGGCTTTTGGCACTACAATTACATCCACAATTCACTTGTGCACCCTAGATTCTTAATAGCTAGGGCTTTCCCCACAATGTCACACATCTAACCTAGCAAAGGCACAAGTGACACTACAATAGATAGGAAAATGGTTTCCAAAATCACTTGAATCACAACTTCAACTGTCTGCTGTAAACTCATGATTCCTCCAAAGTGCGATGGATTAATTTTTTGTTTCCAAAACAGAGCATCATGATCCAATTATCTACGTTTTCTATCCAAAATCATAACCAAGCCTACTAATACAACTCATCAATTGAATTTAACAATAGTACCTAAACCACTGACATCTACTCGGATTCCATTCCGAGTAATATCCCTCAGACCAACGCTGGGAAACTAACCAAACCTGAACACATCACTCCCCAGTCCCCACCCCCACCTTAAAAAAAAAAAAACAATCTAGATGCTACATTCGCGACGGAGGATGCGATTAACAACCGACAGCGCCGCGCATCAGGAGGGGGGAGGGGGATGCAAACCGGAACCTGAGCCGACGTGGCCCCCATTGCACGCGACGAAGAAGATCGACGGCGCGAGAACGAAGAGGAACACGACGACCACCAGCGGCGCCACCACGCCGCGCCTCCCTCCTCCGCCGCCGCCGGCCGTGGAGTACGGGAGCCGCTTCGAGTTCGCCATCTCCAGCGAAGGGTAGGATCCGCGGGGGTCCACCTCGCCGGAGAGTGCACGTACGTCGCGCGCGGCGCGCTTCCCTCTCCGCCTCCTCCGCCGAGAGTGGGGTGGGGGGAGTGGCGTGGTGAGGGGAAGCCTGGAAAGGAAGGGGAAAGCACCCGAAGATGTGAGGCAACCGATGGTGGGCTATTTGGGCCTTTTTGAAAACCATCTAGGCTTCTGCCTTGTCTACGGCCCCGTTTAGATGGGCCAAATTAAGGCCCACCTATGTGTATGGGCTAGTATGAAACAAAGGTTAAAAAAAAAAGAGGTGGTCTAAAAGTGAAAATATTGGTTAAGGGTTCGTGGTGAAACTAGGGTAAAAATAATTAGTCCAATGTTAAATGAACTCTACTTTAATTAACTTATTTGGCCCTATTTAGCACAACTCCGGATTTAAGATTTCCTTTTTTTTAGTTATGTATTTTTAGCTCCACAAATGCATGAATCGAAATCTAAGGTTACATCAAAAATATCTAGATTAGTCATTTTGTTCTTAGTTTAGACTAAATATAATATTTGAAACCAATACAATTTAACATACATACTTCAAATCCAACGTAAAATTGGGAGCTAGAGTTCTGCCAAATAAATCCTTTATTTTGTCAACCAGTTCATAAAATCTTTGGTAACCTTAGAGTTTAGGAATTTAATAGTATAGGACCTCCATTTTGAAATATATGACGCCTTGACCTTTTAATTTTTGGATATAATGTTTCACAATTTGTCTTATTTAGAATACTATGCAAGTACTTCTTTTGTTTCATATTATAAGACATTTTGGGTTTCGAATAGATTTATGCATGGATCCATATATGTGCATCATATACGTGTCTAAATTCATATAGATGTTAGTTAATCTAGATGTGGGGTCGAGAGGCCAAAACGTCTTATAGCATGAAACAAAGGAGGTAACATTTATTTTGTATTTGATATGTTTTATCATTAAAGGTACTTTAACAATTATTGCAATAAATCTTTAAATAAAATGAATTGCTCAACATCATGTCTAAAAATTAATAGCATTATTACATATTTAAAAATATAGGGAGTAATGGATCGGACGAGATGAGTACATGTAGTGAGTGGTTCTCCGATTAGTTTTAGGGCTGGTTTTCATTACTTTTATTGCCTGGATCTCTTTTAATGATTTTCAGGCAATCAAAAAAATCTACCCCAAATTACAAAAATCAAACTTTGAATTCAAAAAACGCTTTAAATCTAAAGGAGTACCAAGCAGATCCATCTCGGCCACTCAATATGTTGGTCCATATCAAGCCAGTTAAGTTTCAACTAGAGAGATAGCATAGGTTACTTTCAGAAAAAACAAAAGGGGAAAAAACAGAGAGCATAAGAGTCGTTTTATAGCAGTAGAAAGAAGCAAGAGTTACACGCATCAAGGTGGTGTTTGGATCAGGGACTTTAGTCCTATATTTAGACACTAATTTAGAGTATAAAATATAGACTACTTACAAAACTAATTCAATAAATGAAAGCTAATTCGCGAGACAAATTTTTTAAACCTAATTAATTGATAATTAGAGAATGTTTACTGTAGCATCACATAAGCTAATCATGGATTAATTAGGCTCAATATATTCGTCTCGTGAATTAGTCCAAAATTATTGATGAGTTTTTATTAATAGTCTACGTTTAATATTTATAATTAGTGTCCAAACATCCAATGTGATAGGGACTTAAAAACAGGGCCCAAGCACACCATAGAAAAAAGACGCCCCACATCACGGTTGCAGACAAAGTTGCAGATTCCAGCAATGACGCAATTAAAACCGAAAATTATCTCTCAACCATCCATTCGATCCATCAACTCATGCGGTGATCGATCGATCAGCTGGAGAGAAAGTTCCAGTGACAGGTTCATCAAAATTAAGCCGGCAGGCAAGCCTGAAAGCTACCGTTAACGCATTTTATTTTTTTCAGAACAACTGACACCGGCCGTGTATTTACTCCACTTAATAGAAGCACCTCTGATCAGGCTGGGTGATCTTCTCCGTCAGCTTTTTACATCATATCTACTCCGCCAAGTTGCATCCACGGATGTAAGGGTGATCATACTTTATATACCTTGTCCAATATGGTCTGTACTTGGTCATTGCTAACTCCAGCCATGGCTTCATGTTACCGTTGTAATGAACAACAGCAGCATTATCTATCTCTGAGCGATCAATGCTTGGGTTGTATCCTAATCCAAGGACATGCCACGACTTGTCAAGGGGATGCGTCAACTTGTAGAAGGTTAAGAGGCCAGGTGGAAGCGTCCCAAGCTTCCAAAGAACCCGGTCTTCATTCTGTTAGAAGAAAAATAGCAAGAATAATGTTAGACTAAATCATGTTGCATTACAGTTTCTTCTCTAAATCAATGTGATCCAATAATGAAAGTAGTAGTCTCACCATGCTTTGCCACTTGTGGTAGATCCCAGTGATATCTTTCTTCTTCCACTCCTTCAGATCAAAGATGTTCATTCCATAAGCCCAGCCACATGCATTTGGATCAAAGTTCCGAGCAATATGTGGATTGGAAAAGTTAAGGTACTTGTCAAAACGATGGAAACTCTCCCCACAGGTCTCCACTGCACCATTGACCTTCCCATTAAGATCAACGTCCCATAATCCTGTCAAATCTTTCTGCACGACTATGTCATCATCAAGGAAAAGTATCTTATCCAACTTTGGATAGACCTGTGGGAGATAAAATCTCAAGTGGTTCAGCATGGAGAGGTACTTGGGGTTACGATACTTTAGGTTTGAAGAACCCGCAGAGAGAGTGGTGGGGCGGTCAGCCTTGAAATAATACTCTTTCATGGCTGCAGACTCAAGTTGTCGTAAAACAGGACAGTACGATGAGTTCAACCACTTAAATTCATCTACGTTCTCAACATGGATGGTGGCCTTCCCAGGTGGGTTCAGCAAAAACCACATGTTCATGGCTCCAAAGTTCAACTTATCAGTCACAAGATGGAAAACATGCTTCTCAGGCTCCTGAAAAGGTTATGCCATACATAGTTGTCAGAACACTTATCACTTATCACAGTTTGCATTTGATTAAAGAGGAAGACAGAAACTACCTTAGCATTCATTATGGTTGAGTTCACAACAACAGATGCTGCCAAGACATTGTCTGAGAAAAGTGCATAGTGGTAGAGCTCTGGATTTTCCAAGTTCTCGCTCCTCGGGAACTTCCTTTTCTCCAACGGGAGGAGATAGTAATCTATTGTTAAGCGCATCGACAAACAATGAATGCTGTTTGGAATTGTCTTCGCAGCCAACTGGCTAAGAAATGTACTCTGCTTCTTCAAGCTCCTGACTTGTTCATCTGCTGACTGAAGCATAGCTCTAAGTCTCTGAGTAACCGCCTTGCAATCATACACATCTTCTCTAGCCTTGGATAGAAGTTGACCCATTACTCTGACTTTCTCAGGTGCACTGCAAAGTACATTATTTGTCACGATGGAGAACAAGATAAGATATCAGATATGAAGTGAAAATAGATAAGATATCAGATCACAGATATAACACCTATGATGAAGGTCAGAATCAGCAGTAGCCTCTCCAACAGCCCTCTGGCTTTCCTTGATCCTGGTTTGCAGCTCTTGATAAAGATCATTCTTGTTCTTTGATTTAGCAAGCACAGAATAAACACGTGCCATGATAATCTGGTCTCTCATCAATCTAACTGTTGAATCTGAGTTCTCATTCTCATTCTCTTTTCTCCAAATGCTGTATTTCCCAAGGACAGCAGAATCTACAGCCTTTGATCGTTCAATAGCAGCATTCTCCAGCTTAACACGTGCTTCATCATCTTTCCTTACCAAATCCATTGCCCTCTTTTCACGCCTTTTCTCCCTTAGTTTCTTTAGCGACCAAAACATATCAAGGGAAGTATTAGGTCATAAGAAATGGATATCGATAGAAACAAACAACAATGTATCAATGTACATACAAGAAGACCAGCATGCTTACCCTTCGAGCATTTTTTGCAGGTGCATCGACTTGATGTTCAGCTGCACAGAAAAGAAGTATATTTTCTTGAGTACCTAATCGGATTGTGTGAAATGTGCTTTTCAAAAAAAGTCATGGTTATTTTTATACCAGTATCATCCTTGGGTGTTTTATCTGTCAGTGATAACTCATGTTCTGCAGAACTGTTTTCAGATTTAACCTTGTCATCAACATCCAAACTAGCATTGCTCAGGTCATTGACTAGATCATCAGTTTTCCAAGAGGGAGATGCACGTTTTCTGAAAAAATCAACACTCAAAGTGCCTGCTTCTTGTTGACTAGAAGCTAAAGCATCGATCAT