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BaseInfo

ncRNA ID	osa_circ_039957
Species	Oryza sativa
Class	circRNA
Genome position	9:20858458-20864004[-/-]
Reference genome	RGAPv7
Source	PlantcircBase
Method	find_circ
Type	exonic
Splice junction sequence	CTTAGCATTCATGATGGTTGAGTTCACAACAGATGCTGCCAAGACATTGTCTGAGAAAAGTGCATAATGGTAGAGCTCTGGATTTTCCAAGTTCTCGCTCGGATGGTGGCCTTCCCAGGTGGGTTCAGCAAAAACCACATGTTCATGGCTCCAAAGTTCAACTTATCAGTCACAAGATGGAAAACATGCTTCTCAGGCTC
Tissues	root
Exon boundary	Yes-Yes
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CTTAGCATTCATGATGGTTGAGTTCACAACAGATGCTGCCAAGACATTGTCTGAGAAAAGTGCATAATGGTAGAGCTCTGGATTTTCCAAGTTCTCGCTCCTCGGGAACTTCCTTTTCTCCAACGGGAGGAGATAGTAATCTATTGTTAAGCGCATCGACAAACAATGAATGCTGTTTGGAATTGTCTTCGCAGCCAACTGGCTAAGAAATGTACTCTGCTTCTTCAAGCTCCTGACTTGTTCATCTGCTGACTGAAGCATAGCTCTAAGTCTCTGAGTAACCGCCTTGCAATCATACACATCTTCTCTAGCCTTGGATAGAAGTTGACCCATTACTCTGACTTTCTCAGGTGCACTGCAAAGTACATTATTTGTCATGATAGAGAACAAGATGAGATATAAAAATATGACGTGAAAATAGGCACAAACCTATGATGAAGGTCAGAATCAGCAGTAGCCTCTCCAACAGCCCGCTGGCTTTCCTTGATCCTGGTTTGCAGCTCTTGATAAAGATCATTCTTGTTCTTTGATTTAGCAAGCACAGAATAAACACGTGCCATAATAATCTGGTCTCTCATCAATCTAACTGTCAAATCTGAGTTCTCATTCTCATTCTCCTTTCTCCAAATGCTGTATTTCCCAAGGACAGCAGAATCTTTGATCGATCAATAGCAGCATTCTCCAGCTTAACACGTGCTTCATCATCTTTCCTTACAAATCCATTGCCCTCTTTTCACGCCTTTTCTCCCTTAGTTTCTTTAGTGACCAAACAGTATCAAGGGATGAATGATGTCATAATGCATACGATAGAAACAAATAACAATGCATCAATGTACATACAAGAAGATCAGCATTCTTACCCTTCGAACATTTTTTGCAGCCGTGTCGACTTGATGTTCATCTGCACAGACAAGAAGTTTATTTTCTTGCATACCTAATCAGACGATGTAAAAATTTAAAATGTGCTTTTTTTTAAAAAAAAGCATGGTTATTTTTGTACCAGTATCATCCTTGAGTGTTTTATCTGTAGAGCTGTTTGCAGATTTAACCTTGTCATCAATATCCAAACTCGCATTGCTCAGGTCATTGACTAGATCATCAGTTTTCCAAGAGGGAGATGCACGTTTTATGAAAAAATCAACACTCAAAGCACCTGCTTCTTGTTGACTAGAAGCTAAAGCATCAAACATCTGGAGACCAGAAGGCATGTATAAGACTAAAAGAACAGAAAAATTGAGGATACTTCTGAACAAGAAGACAGTTTCTTATGCAAATAACAGTAGATGGTAATTGAAAAATCAAAATGTCCGCAACAGAATTACAGAGCAGATAGGGGACACAGCATGCAAATCTACTTGGAACAACAGAGAGTAGCATGGTATTTAGAGAAAAGGCAATCAGTTGCAAGGACAAATCAGAGAGGATGACGTTGCGAAATTAGTAGCATAGCAAAGATGAGCACGTTGTTATGTACCCTTGTACATTTCCATGAAACCAAAAAAGAAAGATAAGAAATTATATTACTAAGTCGCGAGACAATTCTGACCTCCTTGGACAAAATAGATTTCAGGTTGTTCGTTGGCAGCTGTTTTTGCCATTCTGTTTCCTGCAAGAAAGCTTTAATGTGAGATGGATCCTCAAAATTTAGGCTAAGCAATTAACTAGCTCCCAGAATGGAAAAATACCTGAGTACCTTCCATATCCATGGGATCTGCAGGTAAACAAACTACAACATCACTTATCTATTTCAAATCAGTATAACAGTATTCAAATACTACAAAACATTGACAATGTTCCTACAGTTCTAATAAATGTAGTTTTCTTGTTTATAGGCTTTTGGCACTACAATTACATCCACAATTCACTTGTGCACCCTAGATTCTTAATAGCTAGGGCTTTCCCCACAATGTCACACATCTAACCTAGCAAAGGCACAAGTGACACTACAATAGATAGGAAAATGGTTTCCAAAATCACTTGAATCACAACTTCAACTGTCTGCTGTAAACTCATGATTCCTCCAAAGTGCGATGGATTAATTTTTTGTTTCCAAAACAGAGCATCATGATCCAATTATCTACGTTTTCTATCCAAAATCATAACCAAGCCTACTAATACAACTCATCAATTGAATTTAACAATAGTACCTAAACCACTGACATCTACTCGGATTCCATTCCGAGTAATATCCCTCAGACCAACGCTGGGAAACTAACCAAACCTGAACACATCACTCCCCAGTCCCCACCCCCACCTTAAAAAAAAAAAAACAATCTAGATGCTACATTCGCGACGGAGGATGCGATTAACAACCGACAGCGCCGCGCATCAGGAGGGGGGAGGGGGATGCAAACCGGAACCTGAGCCGACGTGGCCCCCATTGCACGCGACGAAGAAGATCGACGGCGCGAGAACGAAGAGGAACACGACGACCACCAGCGGCGCCACCACGCCGCGCCTCCCTCCTCCGCCGCCGCCGGCCGTGGAGTACGGGAGCCGCTTCGAGTTCGCCATCTCCAGCGAAGGGTAGGATCCGCGGGGGTCCACCTCGCCGGAGAGTGCACGTACGTCGCGCGCGGCGCGCTTCCCTCTCCGCCTCCTCCGCCGAGAGTGGGGTGGGGGGAGTGGCGTGGTGAGGGGAAGCCTGGAAAGGAAGGGGAAAGCACCCGAAGATGTGAGGCAACCGATGGTGGGCTATTTGGGCCTTTTTGAAAACCATCTAGGCTTCTGCCTTGTCTACGGCCCCGTTTAGATGGGCCAAATTAAGGCCCACCTATGTGTATGGGCTAGTATGAAACAAAGGTTAAAAAAAAAAGAGGTGGTCTAAAAGTGAAAATATTGGTTAAGGGTTCGTGGTGAAACTAGGGTAAAAATAATTAGTCCAATGTTAAATGAACTCTACTTTAATTAACTTATTTGGCCCTATTTAGCACAACTCCGGATTTAAGATTTCCTTTTTTTTAGTTATGTATTTTTAGCTCCACAAATGCATGAATCGAAATCTAAGGTTACATCAAAAATATCTAGATTAGTCATTTTGTTCTTAGTTTAGACTAAATATAATATTTGAAACCAATACAATTTAACATACATACTTCAAATCCAACGTAAAATTGGGAGCTAGAGTTCTGCCAAATAAATCCTTTATTTTGTCAACCAGTTCATAAAATCTTTGGTAACCTTAGAGTTTAGGAATTTAATAGTATAGGACCTCCATTTTGAAATATATGACGCCTTGACCTTTTAATTTTTGGATATAATGTTTCACAATTTGTCTTATTTAGAATACTATGCAAGTACTTCTTTTGTTTCATATTATAAGACATTTTGGGTTTCGAATAGATTTATGCATGGATCCATATATGTGCATCATATACGTGTCTAAATTCATATAGATGTTAGTTAATCTAGATGTGGGGTCGAGAGGCCAAAACGTCTTATAGCATGAAACAAAGGAGGTAACATTTATTTTGTATTTGATATGTTTTATCATTAAAGGTACTTTAACAATTATTGCAATAAATCTTTAAATAAAATGAATTGCTCAACATCATGTCTAAAAATTAATAGCATTATTACATATTTAAAAATATAGGGAGTAATGGATCGGACGAGATGAGTACATGTAGTGAGTGGTTCTCCGATTAGTTTTAGGGCTGGTTTTCATTACTTTTATTGCCTGGATCTCTTTTAATGATTTTCAGGCAATCAAAAAAATCTACCCCAAATTACAAAAATCAAACTTTGAATTCAAAAAACGCTTTAAATCTAAAGGAGTACCAAGCAGATCCATCTCGGCCACTCAATATGTTGGTCCATATCAAGCCAGTTAAGTTTCAACTAGAGAGATAGCATAGGTTACTTTCAGAAAAAACAAAAGGGGAAAAAACAGAGAGCATAAGAGTCGTTTTATAGCAGTAGAAAGAAGCAAGAGTTACACGCATCAAGGTGGTGTTTGGATCAGGGACTTTAGTCCTATATTTAGACACTAATTTAGAGTATAAAATATAGACTACTTACAAAACTAATTCAATAAATGAAAGCTAATTCGCGAGACAAATTTTTTAAACCTAATTAATTGATAATTAGAGAATGTTTACTGTAGCATCACATAAGCTAATCATGGATTAATTAGGCTCAATATATTCGTCTCGTGAATTAGTCCAAAATTATTGATGAGTTTTTATTAATAGTCTACGTTTAATATTTATAATTAGTGTCCAAACATCCAATGTGATAGGGACTTAAAAACAGGGCCCAAGCACACCATAGAAAAAAGACGCCCCACATCACGGTTGCAGACAAAGTTGCAGATTCCAGCAATGACGCAATTAAAACCGAAAATTATCTCTCAACCATCCATTCGATCCATCAACTCATGCGGTGATCGATCGATCAGCTGGAGAGAAAGTTCCAGTGACAGGTTCATCAAAATTAAGCCGGCAGGCAAGCCTGAAAGCTACCGTTAACGCATTTTATTTTTTTCAGAACAACTGACACCGGCCGTGTATTTACTCCACTTAATAGAAGCACCTCTGATCAGGCTGGGTGATCTTCTCCGTCAGCTTTTTACATCATATCTACTCCGCCAAGTTGCATCCACGGATGTAAGGGTGATCATACTTTATATACCTTGTCCAATATGGTCTGTACTTGGTCATTGCTAACTCCAGCCATGGCTTCATGTTACCGTTGTAATGAACAACAGCAGCATTATCTATCTCTGAGCGATCAATGCTTGGGTTGTATCCTAATCCAAGGACATGCCACGACTTGTCAAGGGGATGCGTCAACTTGTAGAAGGTTAAGAGGCCAGGTGGAAGCGTCCCAAGCTTCCAAAGAACCCGGTCTTCATTCTGTTAGAAGAAAAATAGCAAGAATAATGTTAGACTAAATCATGTTGCATTACAGTTTCTTCTCTAAATCAATGTGATCCAATAATGAAAGTAGTAGTCTCACCATGCTTTGCCACTTGTGGTAGATCCCAGTGA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