Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039924
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:20619376-20625432[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence ATATGCCTTCTGGAACAGGGAAATGGCCTCTTCCATGAATGAATGAGCCCCCTCTATAGCCATCACTTGAATGATCAGGTAGCATATTGATTATAAGTTTGATCATGGTTCCAGGGACGATGCAAAGGCAATGGAACATGTTTCACTGAGGTTCTCATTCAGGGCAAAGGGGAATTGCTCTTCGGAGCTATGTGAATTTG
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ATATGCCTTCTGGAACAGGGAAATGGCCTCTTCCATGAATGAATGAGCCCCCTCTATAGCCATCACTTGAATGATCAGGTAGCATATTGATTATAAGTTTGTTGATTTGAGGCTAGCAACTTTTTTACCAACATAGTAATTATCTTCCAGTTGCAGATGTCTTATGTTGCTGGTACTAACCAAAGTGCGATTCCACTTGGTGGGATGGCCAGATATTCAGTGGGCATGGACAGTGGAATCCATGGCGCTACAAGAACTGAATCAAGAACTCTCTATGTGGAAGGACTACCTTCGAACTGCACAAAGAGAGAGGTTGCACGTATCCTTTTCTATGCTTGTAAACTAAAATCACATTTTCCTAGCTATAATTAGTCTAGGTATCTTTTGCGACGTAATTCATATTACACCTCCTAGGTGCTTTTGCCCTTAACTCTTTCTTCTGCAGATATTTTTCGCCCCTTTTCTGGTTTTCGTGAGGTGAGATTGGTCAACAAGGAGTCTAGGCATGTAAGTTAAATGCTACCTGTGATCCAAATTTTCCCTGTTATTTTTTGCAAAGCCAAGCATGCTTACATGTCAAATCCCCTCTCTGTTTTGCAGGCTGGAAGCTGTAACCTCTTGTGTTTTGTTGATTTTTCATCTCCTCCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTCTGCAAGGTAATTATAACATCATATTTTCTGCATCCATATGCATTGTACTTATGTTGCCAATTTCGTTAGATAGTGCTTGCGCACAGTTTCATTCTTTTATGTTTGTGTGCCTTTAGTCTTTTTAAAAATCTGTTTATTTTTCTGAATATTTTTCCCTTTGTCCCACATCCAGTAGGTTTTAGTGTGATGACTGAACTAAAACTAAGATTGTTATTTCGAAATATCATATTTTTTCCTTGTTCCACTTTGAAACCAGCTTACTGTCATTCTATGTGTGCTATATCATATGTAATAATATTTGTGTGCACATCAACTTTAGTGCTTTCCATCATAAAACTAGACGTTTCATTGGTAGGGAGAGAATAAACTTTGAGCTTCTAATACTTGTTCAGGTTATAAGCTTGAATTTGGCTCTGAAATTATGACGTTTTACTTTGCAGGCTATAAGTTTGATGAACATGACCATGAGTCTTCCAACCTGCGCACACAATTCTCTCTCACTCCTCGCAGGAGGTCAATTGGTGGGCCTTGTGTTAGAAACTAAGTTTCTTGGGTGGAGTTGAATTAATAATGCAGAGCAAAATTTGTGGAGAATCTCTAGGGAGACTTGTATACAATGCTAGACCAAACTTGACTCTAGGGAAACAGCCTCTTCCACGAAGCAATGAGCCCCCATTATGTCCATCGCTTGAACAATCAGGTATTATATCAATTATAAGCTTGTTAATTTAAGGATAGCAACTTTCTTACTAACATAGTGCTGGTTGCAGATGTCCTATGCTGCTGGTGCTAACCAAAGTGCTATTCCACTTGGTGGGATGGCCACATATTCAGCGGGCATGGACAGTGGAAACCATGGCGCTACAAGGACCGAATAAAAAACTCTATGTGGAAGGACTACCTTCGAACTGCACAAAGAGAGAGGTTGCACATATCCTTTTTATGCCTGTAAACTAAAATCACATTTTCCTAGCTATAATTAGTCTAGGTATCTTTTGCGATGTAATTCATGTTACACCTCCTAGGTGCTTTTGCCCTTAACCCTGTCTTCTTCAGATATTCTTCGCCCCTTTCTGGTTTCTTTGAGGTGAGATTGGTCAACAAGGAGTCTAGATATGTAAGTTAAATGCTACTTATGAACCAAAACTTCCCTGTTCATATTTTGTAAAGCCTAGCATTGCTTATATTTTGTTCTCTTTTGCAGGTGGAAGGTATATAATCTCTTGTGTTTTGTTGATTTTGCAACTCCTTCTGAAGCTCGTGCTGCTCTGGAGACTCTGCAAGGTAATTACAACATCATTTTTACCTATGAAATTTATGATTGTCTGCATCCATATGCATTTTCTTATGCTGCCAATTTCTCTAGTTAATGTCTCTGCACCTGCATTAGATGCTTTTCTTTGCTGTGCTTTAACATGCATTGAAGTATAGCAGTTTAGTTTTCATAGGCACCCATTTCACCCGTCATACACTTTCAGCCAAAAATTGCCACAGTTGTGCCAGCCACACTTTTCATGGCAAAAAAGTGTGGCTGCCAACTAAAGTGCTATATACAATGATTAATGTATGCCATCTTCATTTGTGGTTAGTACATTTTTTTTCTGTCATTTTGTTTCACCCTATATAGACCATTGTTGCATGTCTACGACTATTAAAGGATATGCTTGCTATTCTGAACAACTTAGTAGCAAGCTCTTCTATCTTAAACCACATGCCAACAGGCTTATCTACTTTCACGATTTTTTGTGAAACCAGGCACTATTTTGTCATTTCAGTAATTCAGTTAAAATATAATTATACAATGTCAGTGCGCTTTTGGAGTTGCTATGGAAACCATTGTTGGAAACAGGCAGGGGCATATGTACAGTAGTATCACTGGTCTCAGATGGATGCCATCCAACCAATCCAGTGTATTGCTAGCATTTGTACGCATTTACGCACTTACCCCCGGCAGTGCAACTGTGCAAGCTTGTTGACCCCAGCCGCTAAATTGCAGCAGCTCAGAGGCTAAACAATATAGCTCCATCTTTGAAAACTTAAACAGTTTAACTGGTGTGGTAGGTGCTGGAGCCCGAATCTATTTTCCAACATCCTTCCTCTTTCATATTATAAGATGTTTTAGATTTTGAATAGATTCATTCATGCATCCATCATCCTTCCTCTTTCACATTATAAGATGTTTTAGATTTTGAATAGATTCATTCATGCATCCACATGCGCTACATATATATGCTCAACTTCATATGTATGTTAGTGAATTTAGACAAGAGATAAAAAGACCAAAACTTTTTATAATGTGAAACGGAGGGAGTATATGTTTTGGTACCATCAGCCACCACTAATGTCGCAGTTTAAAATATTTGATCTGTTGACTATAATTATTTCTTTTAGCTAATGTTTCTATCCATGTAATTAGGCCAATAATTCTATTATCAACTATTAAAAGTTAACCATATTTTTAGCTATTAGTAAAAACAACTTCAATAACTTGCTTGTCTGACCAAAAGAATAAAGGATTTGTATGTCTTATTAGGTTCTAACTCTCAAAGTATTGCTCAATACAGAATTAAGTCTAAAATTAAGTGATTCAAACCTTAAACTTTAATTAGTCTCAAATGAACATGCTCATTGAAACAACAGCAATATTCTACCGACAACTCTAGCTAAAAAGATCAGCTCAAGGACACCTTAGCTTAGAAATATTTAGAAATGGAGCCCTTCCAAACACCGCATAAGTATAAGTGAGTGGTGACACCGGTGCCCCAAAATCCTGGATACACCCCTGGTAACAGGGAAACCACCAAGTTTTGGTTGGATCGGTGTCTGCATGGCAAAACGATATTTGAATTAGCTCCAAACTTGTGCTAGCTGATCTCTAAGTGCACCTTTAAACAATGCACTGTGGCTCAAGCGCTGAATAACAGAAGATGGTTGGCTGCCACATGGTGCTTTTATTGTTCAAGTGCTTATTTCACTTGAGAAGGCATCTACATCAGGAAGTTGGCCTATAATGCTTATTTCATGTGGTCTATCAAGTTTGCTCCTTGGAAGTGAATTTGGAAAAGTTGGGCTAGCTTCGCTGCAAGTTATTCACTTGGTTAGCTGTTTAACAACTGGTGTTGGATGGTTGACAGGCTTGCTAAGCGAGGTTTATCGCACCCGAATGCTTGTCCCTTCTGCGACCAGGATGATGAATCTATTCGGCACTTTCTCATCTCATGTGTATTTCCCCGCCATGTCTGGACATGTATTCTACAGAAGCTGAATATGTTGGCCTCCGTGCCTCGGTCTACCGCGTGTCTCTCTAGTTGGTGGTAAGTTAACAGAGGTGTTCCTAAAGACCAAAGAAAGGGGCTCAACTCCTTGATCATTCTAGTAAGCTAGGAAATATAGAAGCACCGGAATGCATGTGTGTTTGAGGGAACAAAGCCCCAATGTTCAGGTGGTTCTGCATTCTATTGCGGAAGAGAGCAGCCTGTGGTGCTGGGCTGGCACCTCCGCACTTCGTGAGCTACTTGTTTGGTCGCTCACAATAGTCACCTAGTCCGTCCTTATGGTGTTATCCTCCTTTGATCTTGTTCCCATTGGCAATAGGCAATTGTTTTTAGTCCTTTTGATCTTGGGGGGGGGGGGGGGGAGAAGGGGGTTTATCCTCCTTTATAACTTTCTAAAACAATCGTCTAATTTGCATCTCATATTTCCCCAAAGGTACATCAACCATTTCTACGCATCAGTAAAATTTGTCAATTGGCCGTTGAAATGGCAAAATTACTACTACATTTTTCTATTTTGTTACTAAATTATACATTCAATACCCTTTAAATTCTACAACAACCTGTAACCCCTTCCAACCGTTTGTAAGTCAGCAGGGTCTAGATTTGTTTTTGTTTTTTTTGGCCCCCATGGTATATTTCTGTTAAAAAAAGATAAAAGTAATAACCTTTTTTTAAAAAATCTTAGTTCTGTCACTTGTTCCCATTGGCATTGACTGTATACAGCTTCTACCAATGCATTTGTGTTTTGAGGAACTGCTAATTAAAGTACTGGAGTTTTTTATGTGGTAGCACGCCCTTAGTAGTATTGCAAACTTGCGATTCTTGGTGAGTAGAAGCATGATGTTGTTACATAGGCTCATATCAGTTGCTGGTGTGATTAGACAAATCATGCTCTTTGACATGAATGAACCTATCCTAATTTATCCTTTGAGCTTCATTACCAGGAACAGTAGTTGGTTGTGCTGTATACTTTTAATCTTGCGTGGATATTCACCTAGTCTCAATGTTTCATGAACGTGAGAACCACATATGGCTGCCAAAACATGCAAGCGTGATTCCAGTTTATTGAATCGTGCATGCTAGATAAAGGGCCTAATTACCTTTATAGATGTGTTGGCAAGCAGGAGTAGAAATCAGTGTGGTTGTGTGAGTTTAATGATCTTTTGTATTTTACTATTGCAATAAATTGAAAGTTTAAGTTGGGAAGAAAGGCCGTTCTGAACATTGTTGTTAGAGGTTTAAACAAACGAGATGGTATTAGAAAGGGGGTCCTGGTTATCCTGCAACCTTAACCACCTTTACCACCTGTTATCATTATCCATTACTTGGCTGTATCTTCGTAGGCTGATGCTAGGTTATTCAACCTCTGGCTGTTTGTAGCAACAGGGTAATAGAACATTTATTGATTTATACTCACTGACTAATAAATGAAACGCCGGTTTCCTTCTTTGTCAAGAGAGAAGAATTTTGTCCTTCCTATTAGACAAGATAAACACGGCATATTACTTTTCTAGCAATTAACTGTGGGTAGTGATCGTTTCTTCTTTCTGATTGTCGAAATGGCCATTGCCATCCAGCTTTCCACCATAAATAAACTGACATGGATATTGCGGTAAAAGAACTGCCATTGATAGCAAAATTCTAAAATCTATCCTGCAACATTAATTTCTGACTAGAAGAATAAGGCAAATTTATTTTTTTGCTCCTGCTGCATTATTTGCTTCTTCAAGTTCCAGCATGACAATATAAATTCATTCGACTAGACAAACTTGAAATGTTTAATGGACGTAGTGTAATAATAGTACTACCATTTATAGCACAGTTTTGTCACTACCTGCAGCAATTTTGAAAAAAAATCAACACTAATGTGGTTGTAACTATCAGACATGTTGATACGAAATCTATTCATAGGATGTGACCTCAACTTCTGCCTGATACGCTCAAAGGTCTGTGTGTTTTGCAGTGATCACCAGTTACTACTAAGGAAAGGTGTTCGGTGATGCCACTAAGATCATGGTTCCAGGGACGATGCAAAGGCAATGGAACATGTTTCACTGAGGTTCTCATTCAGGGCAAAGGGGAATTGCTCTTCGGAGCTATGTGAATTTG