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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039742
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:19623827-19624966[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence AGAGATGAAGATTAAGAAGCTAATGCCCATGGATACTGAGTCGAGGAGGTTGATTGATTGGATGGAAAAAGGTGAAAATATGTCCTGTTTTACGTGTTAATATCCTGACATGATCATATGGTTCCCAATCAGGAGCTCTGCTTGTAAGATGATAAGAACACTGGTTTCACTTATGAGGACCTTGGACCAAATGCCAGAGG
Tissues seed
Exon boundary No-No
Splicing signals GC-AG
circRNA sequence NA
Genomic sequence AGAGATGAAGATTAAGAAGCTAATGCCCATGGATACTGAGTCGAGGAGGTTGATTGATTGGATGGAAAAAGGTGAAAATATGTCCTGTTTTACGTGTTAAATCTTTTTAATTTTCCAATTTGTTCATTTAATCCATTTTTGTGATAAATTTTAGGTGTCTATGATGCACTACAGAAGAAATATCTCAAGACCCTTCTCTTCTGCATCTGTGAGAAGGAGGAAGGCCCAATGATTGAGGAGTATGCATGTGAGTATTACCATGTGAAATATGGCTAACTTCTAGCATACAAAGTTGGTTTTACATCAGTGATTGTGGGTCATATGTCAAACATTTTCTTATTCTGTGTCAAACTCCCCTGCAGTCTCATTTAGCTACCCCAACACGAGCGGTGATGAAGTTGCAATGAACTTGAGCCGCACAGGGAGCAAGAAAAACAGTGCTACATTTAAATCAAATGCAGCAGAAGTCACTCCTGATCAGATGAGGTTCTCTCATACATATCCCTTTTAAAGGCTATGATTCATTCTAGACTTCTAGTTAGTTATCCATGCTGCTTAGCTAAATGCTACGATTTAATGGTTAATTTTTCATATTGCTTAGCATTATACATTTTGGAGAGTGTTTGTTTAATGAAGTTGCAGTCCCAACATAACAATAGTTTAAAATTTTATGATTTCAAAGAAGTAGGAGCAAATTGATGACTAAAAGGAGTTCAGATTTTCTTTTTCTATGTAAGGAATGTGGTGAAAAAGTGAGGTACATAGATTCCAGTAACTTTGTAAATTTAGGTACATAGGACTGTGAGGTGGCAATAAATGATGTAAATCCTTTTTAAAAACATAGTTGGGCTTATAATTTTGAGTCCAACTTTTCTGCGAGTTGTTCTTAAATATTCTTCCACAACTTGCAGAATTCTAGTTCTGAAGGTATGGTTTCAATTTAGTCCTTTAGATAAGCTCATTAATGGTTGTTTATTGGTTTTTATATGTGTATGGCAATTGCAAAGTAATTATTGTAAGCTTTAACTAGTCACTGCTGATATCCTGACATGATCATATGGTTCCCAATCAGGAGCTCTGCTTGTAAGATGATAAGAACACTGGTTTCACTTATGAGGACCTTGGACCAAATGCCAGAGG