Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039655
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:18845747-18847244[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence GATGAGGTGCTTCAAAGCATGCAGCAGAAGCTTGATGATCTGTTTGACGAGATGAACTCCCTGCAACAGCAGTATGTCAAGTGCAACACCTTCATTTCCTAGACTTTAAAAGGACTAGACGGCAAAGCCAGCAAGACTCAAGGAACAGAGCTACAAAGAGATGGATGTAGAGTTTAGACTGCAGTTATTACCAATTACAG
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GATGAGGTGCTTCAAAGCATGCAGCAGAAGCTTGATGATCTGTTTGACGAGATGAACTCCCTGCAACAGCAGTATGTCAAGTGCAACACCTTCATTTCCTCGGAGCAGGGAAAATCTGAGTTGGTGGGTAGCAAGAAGGTAGGAGATTATGACGGAGCTAGATGCTGTGCGTGTGCAAAGCCAGAGATTGCTGCTACTCCTCACAAGACAAAGGTATTATGTCTTTACAGAGAGCTTGTTCCATGAGGTATTTTCATCTCACTTCCTTTTCATATGGTGGACGAGTGCAGGATATCTGTGGAATGGACGATGCAAAATCTGATGTTGTTGATAGGTCCAGCGTGAGTCATATGGACCATGAAGAGCGCCGAATGTCAGACCTCTCAGACTTTTGCTGGAGTGTTGTGTCATCGGTGGATAATCATGTAAATGGGGACAATCAGGTAAATCCTACTCCATTCTGTGGTGAAAGCATCTTATTTATGCGCAACGTCATCATTGTTAATTGTTCATGTACAGTTTTTTTTTCAATGTACGAATTATTGATCAACATTTCAGTATTACCTTCATTATGGAGCGGAGTGCTTTGATAAAATCTGAACATTTCTCGTGCTTTAAATGTTGCTGACTGGTGACACTCTGGTCAATTGCATCCAGCTAAGTTCCCTGGCGGCAGAACAGGAATTGTACAACCTTCAGAAAGAATGCGAAGAGAAGGATGCAATCATAAAGGAACTGGCTGCAACTGCACATACATCTAGCACTGCTGATGCCAAGGTACAAATTGTCGTGGTGGTATGCCAACCATGTGAATTATATATACTTATGTTATCCATCTGTCTATATGCAGAGAATAGCAGAGCTGCAAGAAATTCTTAAAAGAAAAAACATGGTGATATCTAAACTGAAGAAGGACATGTCAGCTTTAAAGCAGATGGTATGTGGTCCATTGCTACTTACATCTTGTGATTTTTCTTTGTGTGTTCTGGTAAAGTTGTAACATGTCTTGTTTCAATGTTTCATACTCAAGGTTGTTGAATTAACAAGGGCTAAAAGAACATCTTCTGTCAATTTAAGTACTAGCTGCTCTGAACTGCCAGTGATGTCAAGTAATGTTCTTTATGATATGAGCAGCACTAGCCCATCATCATCGGATTCTGAGTCTCCTGTAGCACCAAGAGAATACCTTGATGATCATCTTAAGGTTGATGATGGCATTGCTGGAGACTCTGAATACAAGGGTAGTTCTAGATTCTCAATGGAAAGCGCATGTTTTCCCACAAAAAACTCATCAGCTGGCAAGCTTCGGTCGACTAGTCCATTAAAAGAGAACCGTATAGATCCGAATGTTGAAACAAGTTTGGTCGGTAGACAGAAGCAACGTATATCCACCAATGGAGACTTTAAAAGGACTAGACGGCAAAGCCAGCAAGACTCAAGGAACAGAGCTACAAAGAGATGGATGTAGAGTTTAGACTGCAGTTATTACCAATTACAG