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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039577
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:18303864-18318382[-/-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTTGATAAATGACCATTCTTTTGGGGTGCACAGATTGTGATGCCCTTCTGACTCCACGAAGAAAGCAGCTGGTGGCCTTGGCTCAATGTTATAACTTTTTTCCATTCATCAAATCCTTTATGCTTTAGTTTAATTTCTTCAGGAATTTTTCCTGACATGACAGCCGAATCAATTCTCTCTCTCATTTCTTCATACAGGTT
Tissues shoot, anther
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTTGATAAATGACCATTCTTTTGGGGTGCACAGATTGTGATGCCCTTCTGACTCCACGAAGAAAGCAGCTGGTGGCCTTGGCTCAATGTTATAACTTTTTGCAGAATGGTAGCCAGTGCTTTGCAAACACGGAGGCCTCCCATAGAGCATAGAAAGTAAGAATTGAACCTCCATCATCAGAAAGGTACACTCTTAATTTTTTTGACGGGTAATTGTATGCCATGACTGATACGACGGTAGATATGACAAGACTTGGTGGTTCTGAGTGTGGGTCTGCCGTGCATACAAAGATATCCAGCTTTTTTTTCATGCATGCTCCAAATGACATGTTAAATGTGTTTAGGCTTATTGTGGTAAATAGCTGTTTGAATGTTGGCTCGTGTGTAAAACAATAGAACACATTTTAAAGAGATCTTCCCTTCAATGATTTAAGCTAGCTAAACTGGTCTACCTTTACCTTCCTTTAGTTTACCATCTTCAATTTTTTGAGATCAATATACTAGAAACAAACCGGACATGTTCTGAAGTCCTTTTGCTAAATTCAAAGCATAAATCATCAATTTTTTGTTGTGTACTGTTAGAGTATACCGATAGGATTCTAGAGGATTCAATTGTTACGGTAGGATAGGATTGGTTTCCATTTCATCTCTGAGATTCCTTGATATACCGACCTGGGAGGCTAAATACAACGAACCCATATTACACAATACATCTCTTTCTGTACACACTTTCATGTACAAAAGATAGTTCTGTTCCTTTTGCAGCCATTTTTAGTAAAGCTGAGATAAGAAATGTTGATCTTTTAGATTATTGTATATATTTTGCTAACAGAATCTATATACTCCTATTATACTACCTCCGGTTTTAAATATATGGTACCTTTGATTTTTTTTAATTTGTTTGACTTTTTTGTCCTTTCTAGAAATGTTTGTGCAAATAGACAAATATACAAGGCACACTTAAGTACTTGGATAGATCTAGGGGGTACTCTTTTCACTTTACTTATAACTAAGTAATTGAATAAATATTGCTGTTCAAAGTTTGAGGAGAAAGTAATGGTGTCGTATATTAAAAGAACAGAGGGAATACCATTATATGCACGAAATATTTTGAGCCCTGAAACTCTAAGCTGCAATAGTTTTTTTATTATTTTCTTGGTGCATTAATATGCGAGTTCCTACCCGTTGTAGTTATAACTTAGGCCCTTAAAAAAAGTTATGACTTATGATATGAGAAGTTGAGAGAAAAAATGATGTTGTAAGAAAAAAAAACTGCTGTCCTGGTTGTCCAGTCATGAGATTTCTTTGTTGCAATGTTTTTTTTTAAGAATTAACATAAGATTTGCGCATGTGTATAAACATATGGAGAATACGGTATAAGATTTGCATATCTTTGTATTAAGACATGAAGGATACATATAAGATTTGTGCATCTTGATCTTTGTTGAAAGGCTCGTTACATCAGTTTTTTGAAATCCAAATTTGGTCGGTCAACTGACATTTCAAACACTGTAAGCGAGACACCGTTAGGTTGCCTTCGTAGGAAGGAGATGAGAACCAATCTCTTGTGCACGGAAAACGGAGCGATCCATTAGCGCGTGATTAATTAAGTACTCCCTCCGTCAAAAAGACTCAATTCTTGGGTTTCCGTGTCCAACGTTTGAACGTCCGTCTTATATAAAATTTTTATGATTAGTATTTTTATTACTGTTAGATGATAAAACATGAATAATACTTTATATATGACTTATCTTTTTAAATTTTTTCATATTTTTTTTAAATAAGACGGACAATCAAACGTTAGACATGGAAACCTAGGAATTAAGTTTTTTTTGGGATGGAGAGAGTATTAGCTAATTTTTTTCAAAGAGTAAAGTGTATTGGTGGTCCTCAAACTTGTAGGGTTGTGTCATATAGGTTCCTAAACTCTCAAAATGCATATTCAGGTCCCAGAACTTGTCAAAGTGTATCTGTCCTAAATCGACACATCCCCTCTAGGATCCTACGTGACGCTGATGTGGCATGCCACATGGACATGACATGCCCTTTTTTTTTCTTCGTTTCTTTTTTTTCCTTTTTCGTTTTCTTTTCATTATTCTTTTTTTCCATTCTTCTGCTTGGGTTACAGAGAAAGGAGAAGAAAGGGAGAAAAAGAGAATAAAAAAGAAAATGGAAAAACTTTAAATGGGTCCCATTTGTCAGTCAAAATGATGCCACATTATGTCCGTGTGGCATGCCACATCAACGCCACGTAGGATCCCAAAGGGGTTATGGCGATTTGGTACCTAGATGACACACTATGACAAGTTCTGGGACTTGGATATGTATTTTGAGAGTTTAGGGACCTAGATGACATACCCCTACAAGTTTAAGGACCGCCCGTATACTTTACTCTTTTTCAAAAATAAATTAATATGATTTTTAAACTGCTTTTGTATAGAAACTTTTTGTAAAAAATACACTGTTTAGCAGTTTGAAAAGCGTGTGCATGTAATACGAGGGAGAGGAGTTGGGAATATGTGGTGCCGAACATACCCTTAGTGTGGAGTTGTAGACGAGCAGTAATATACATGTCTTTTTTTATTTTACAAAATTTAATATACTATCTCCATTTATTTTTATATTTTAAGTCATTTTACAATTGTACTAAGTCAAACATGTTCAAGTTTGACCAAATTTATAAAAAAACAGAGCAACAATTTCAACACAAAATAAAGATACTACAAAATCCCAATGCAACTCTGTTTCATAAAAAAAAAAGCCAATTTCTATGGATGAAAACATGCACGGTTCAGATTCATCTCCCTACAGTGTCTTTCTTTAGACGGAAGGAGTATATATATAGGGCCTGTTTAGATCCCCTCGCAAGTTTTTTCACCTGTTACATCGAATGTTTGGACGCATGCATGAAGTATTAGATATCGATAAAAAAACTAATTACACAGATTACGTGTAAATTGCAAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTTTATGATTTGACAATGTTGTGCTACATGAAACATTTGCTAATGATGGATTAATTAGGCTTAATAAATTCATCTCGCAGTTTAGAGGTGGAATTTGGAATTTGTTTTGTTATTAGACTACGTTTAATACTTCCAATATGTGTCTGTATATCTGATGTGACACGGCAACATTTTTCACCATTGAATCTAAACACAGGCATAGTCTTGTAATATGAAAGAGAGAGACCAAGTTCTTGACCGTTCGATTTATGTGTTAGGATTGATGGTCATTCATGTCAAAATTTATGCGTGTACGAGGATCCAATTTGAAGAGAGAGACAGTTGTAACGCACAAAAGTGACCAACCTCTCGGCGAGCCTGTCCTTGAACGTGCGGCGGCGGACGGGGCACACCACCGGACGGCCTACCTGCGTGACGACCCAGTAAACGGTGTACCGTGTACATGACCTCCGCCGCCTCCATCCCTACCCACGCCGCCCTCCCCTCGCCGCCGGCCGGCATGTGCGTCGCCCTGTAGTACAGCACCAGCAGTTTCCCGGCGGCCACCGTCGCCGCCTGGAATGGAATCTGTACACCGCCCTGCCGCCCATATTCTCCTTCGCCAACAGCCGCCGTCGTCGTCTACATCGCCGGCCGATCAGCTGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCAAATTAAGCTGCTTATATGCGTTTTCTCTACAGTGAGCACTTGGCTAACATATATATAGCTCTCGATCACTAGCTCATACGAATCATTTGACTATGCATATCTGATGCAGGAACTATAGTAAACGTGTAATGTCATGCTACCTCTTATCTGCATGTAGGAACATAATACCCGAAGTTATATGTCACAGGTCATAATACCTGATCACATGTTCCCAAAAAAGAAGTTCCTCTGAATTATATTTTTGAGGAAGAGGGAGATGCCTCTCCCTTCCTGTGAATTATATGTTCTTTTTTTCCTGAACTTCTGTTCTAGGCATCTATATGCTGATGATCATTAACATGTGTGAAATATTCAAGAGAATTTCATGAAATGGCAATGCAATTTATTTTCATGATCATCATCAGAAACACCCAATGTTTTATAAGGCATCAAATCCCATTTTAGGGACCTCAAACTATTGGTACTAGGAATGCCAACATTACAAAGCCAATTGAAGCTAGTGTGACTGCTGTTGGTATTCTCCCATTGTCCTTTCTTAGGAACATTGCCTCATAAATTGGCATATTAATGATTACTATCATTCCACAGAGGATGGCCTGGGGTAAAAACACATTCCATGGCATATTCCAGACACCTGCCATTATTTGACTTAACCCTCCAACTAGGCAGACGAAGTTCAGTAATGCGACGGTTGCGATGATCACATATTCAGGAGACGATGACCCAAATTCTAGGATTTCTTGCTCATACCTCTTTGCTTCATCGTGACCGCTTACCTTTGCTGTAACTTCAAATGACATCTTTGACATTCCTACACATTTTCGGATGGTGTCAATGAAGCCATATAGATATGAGGTAATGCTTTTCACCATCCACATCCTTTGTCCATTCCACCATCCTTTCAATGTATCCCCAGATAATAATGCCTCATAAAGACCGTAGAGGGTCTTCACACAAAATACATATATGAAGGGTGTAGCCCATGGACTCATAATCTAAATGACATATAAGTGTAGTGTTAGTTTCAATAATAAACAATAAGTTCTAATGATAGAAATGAATCAAAGTACTCCCTTCGTACTCGTAAAGGAAGTTGTTTTGGACAGCGACATGGTCTCCCAAACATAACTTTGACTTCTGATATATGTATATTTTTATGAAAGCATTTTTCAAGACAAATCTATTCATATAATTTTTACATTTTCAAACTCAACAACTTAAGAGTTATTCATGATTTATATTCCCAAAGTTTGACTTAAACATTGTCCTAAACGACTTCCTTTACGAGTACGGAGGGAGTATGGTTTAGCAATTAGCATTAGTTTAATAGTACCTGT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