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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039533
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:18016281-18017419[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TGTGCGCTGCTCCAGGATCAAAGACCTTCCAGTTACTTGAGATGATCCATCAGTCTACAAAGCCTGGAATGCTTCCAAATGCCCTTGTATGTTTCACATTGTTTTATTGTTCAGGTATTGGTTTGCTTAAAGTGGGTGGAAGGATTGTTTACTCAACATGTTCAATGAATCCTGTTGAAAATGAAGCAGTTGTCGCGGAG
Tissues shoot
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TGTGCGCTGCTCCAGGATCAAAGACCTTCCAGTTACTTGAGATGATCCATCAGTCTACAAAGCCTGGAATGCTTCCAAATGCCCTTGTATGTTTCACATTCTATTACACATATCTATAGTTTCTGGTAACGATAGAAAAAAAAACTTTGAATCAAAACCTTTTTTCTGATTTTGTGTTTCATACTTTGTACTCAGGTGGTAGCTAATGATGTTGATGTGCAAAGATGCAATCTTCTTATTCATCAGACAAAGAGAATGTGCACAGCCAACTTGATTGTGACGAATCATGAAGCACAGAACTTTCCTGGCTGTAATCTTGCAAAGTTTAGTTCAGAAACATGCACGGATGAGTCCAAACTGCAGAGGTTGGAATTTGATCGTGTATTGTGTGATGTGCCTTGTAGTGGTGATGGAACTGTGCGTAAAGCTCCTGATATGTGGAGAAAGTGGTAAGTAGTGAAATTTTTTAGCCGTGGTGCTACTGTCATCGTCTTCCCTATTTCCTTATCAATTTTATTTGCCACTCAGGAATGCTGGTATGGGGAATGGACTCCATCGTCTCCAAGTAGAAATTGCAATGCGCGGTAATGATTTGAAGAGGCTAAAACTATCATATGTTCCAATGAACTGTTAACTTTTTTCGCTATGTTGGACTTTTGTTTCTTGAAATGTAAATGTAACTAACCATTGTAAAGCAATTTTTATGTAGTTTTCTCCTCCTTAGACTTGTGATTTTATCAATTCACTATCTATTATTATATTCCGTATTTTACTATGAACCAGGTCCTTGTAGCTGTGGTGTGTCATTAAATGTTCCATGAACTGAGATTGATAAAATAGCTAACTGGTTAGTCTTATAAGTTCATTTACATACATGATAGCAAGATATGTGCATCTGGTATGGATTCCTTTTCAATTACCGATCATGTGTAATCAAGTATTAAATCAGCACAAATTTGATACTTTGTAATGTGTAACATGATACGTTAGTTGCTAATTGCCATCAATGCTATGCTACCTCAAGAGATTAAGATTCTTTGTTTTATTGTTCAGGTATTGGTTTGCTTAAAGTGGGTGGAAGGATTGTTTACTCAACATGTTCAATGAATCCTGTTGAAAATGAAGCAGTTGTCGCGGAG