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BaseInfo

ncRNA ID	osa_circ_039471
Species	Oryza sativa
Class	circRNA
Genome position	9:17408320-17412993[+]
Reference genome	RGAPv7
Source	PlantcircBase
Method	find_circ
Type	exonic
Splice junction sequence	ATTGTATCCAAATCCTTGTTAGAGCCAATTCGCTCACACAAAGATCTTGATAAAGACTCAGCTCCACTTTATGATAAAGCTGTCAAGTTCTATGATCAGAATGATGTGAGCTTCCAGGTCTTCATGGACCATCTCATGCGGCTAGCAGTCCAATAGGATATGAATAATTTTGTACGATCAGTAATTTCTTCTGCTGTGCA
Tissues	root
Exon boundary	Yes-No
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	ATTGTATCCAAATCCTTGTTAGAGCCAATTCGCTCACACAAAGATCTTGATAAAGACTCAGCTCCACTTTATGATAAAGCTGTCAAGTTCTATGATCAGATTGCAAAGCAACTTGTGCACCAGGGGCATGTTCTGGATGTGTTTGCTTGTGCAGTTGACCAGGTATGTTGCTTATTTATTTTTAACATGAGGCCATAAATACCTTTTTACAGACAAAATGCAACCTGCTCGATGCTTTCTCAGACAACATCACAGTATCTCTATTATGTGGATTGAAATGAATGGTTATCTTATTTGGACTATTTATTGTTTGTCTTTAATTTTCCCAGGTTGGTGTTGCTGAAATGAAGGTTGCAATTGAGAAGACTGGAGGAATTGTTGTCCTTGCGGAAAGTTTTGGTCACTCTGTTTTCAAAGACTCGCTTCTTCGCATTTTTCAGTCATCAGACAACGATCTTGGATTATCATTCAAGTAAAATCCTTTTACCTAGCCTGAGTTATTTTGAGTCATTCCAGTGTTTTCTAACTTTGTTTAGTTATATATTTGTAAGATTAAAGACAAGGATTTTATTCAAGTTACCTTCCATATTGAACTTTTCGCATGCAAGCGAACTTATCCATAGGCAAACTACTGTTTCTTTATACCCTTTTCTTTCACAATTATTAGTTGGATTAGTTTTCACTACCTCCTTTTCAAAGTTAAAACACTTGGTCACATCTCATTAGTATTGTACATACCATGCACTGAAAACGCACATGCCCAGATATAGTTCTCAAGGTAGCCCAGCCGTTCTGCGTACAAAGACCATTAACCTGCATGTGTTACTAAAAGTCACTAGTGGTTTTTCCGAACATTGCATCTAGTGCGCCAATTTCAATTTCACCATATGTTTACAAACTAAAAATCTGCTTTCCAGCATAGAATAGGACTTATTTTTATTTCAAACTCAAACAATTCTCATAGTAATTTTTATTTACCATTATTTCCTTGAAATTAGGAGACCTGTTTAATGCTGTTTCTTTTTATCGTGTTTTTTCCTCATGAACAGTTATACCGGGCTGCACTGGAACTCATACTTGAGACTTTTTTAATATTTTACATTGATTTTTTTGAAAAAAAAGGGTAGTATTTTAATTCATATAATATGTTTACATTTCCTGTACAGTGGTATTCTTGAGATTAACTGCTCAAAAGATGTCAAGATCCAAGGCATTATTGGACCTTGTGCTTCCCTGGAGAAGGTATATTATCTATTTTATTCAATACTACTCCCTCCGTCCCAAAATATAGTTACGTTTGAGATTCAAATTTGTGCCAATTTTAGCTACCTAGGATTGTAAAAGGTGATTTTTTTTTTTGCACTTACTTTCCCATCCTACCCCTAGCAATGTACTACTATATCACACGAAATACCTAGCCCTAGACTATAACGAGAGGTATTTTTGACCTTGCACCATAATCTTTAATACCTCCAAAAACTTCCTAGGTAGCTGTATTTTGGGAAGGAGGGAGTACTAGCTAAATACCCTGAGAGTTGCACCAATTCCAAATAAATATATCAGCTAAACATATGTAATTTGCAATTTGCAACTAAACATCAATTCAGAAATAAAATCTTATTACAATTTACAAGCCAGATGTGCAAAAGATATAGTTATCCACCGAAAATTCCACCAACTTCTATCACCACCACAAGTTCATTTATATACTAGAGATTGTAGCTTATAGAATCAGAGTAATTTTGTTGTTTCTAACACTGCAGTTTTCACATGCAGAAAAGCCCTCTATCATCAGACACCGTTATTGGTCAGGGAAATACTAGTGCTTGGAAGATGTGTGGCCTTGACAAGAAAACATCACTCTGCTTAGTATATGATATTGCAAAGAAAGATGGATCAAATACAATTGGCCAAGCAGCAAGTAACCAGTTCTACTTTCAATTCTTAACCTAGTAAGAAACTGTTTTCCCTTTAGCTTTTGCTAAGCAGCTTACTCTGTTTAAGATGTATTTACCTGACTAAGTTGGAAACACATCATCAGTTATCAGCATCATGAGGGACAAATGAGATTACGAGCTACTACGATCTCCAGAAGATGGGTTTCTGGTTCTGATAGTGTGCAGGCAAGTTTTTATTGTCTTTAACCCATGAATTCCCATTCATTTTTCCTTTTGCCAGATGTAGTTGATTTCATTGATACGAACAAGTTTCACTTGCTCAAAATAAAGGTGCAGGGACTAATGCTTATTCATTCCCAATGTGTTTCACTGCGTGTATGTGTTTTAATTTAAAAGTGCAGTCATTTGTCCTTAATAAACTTTGTATGCTTTAGGAGCTTATAGGTGGCTTTGACCAAGAAGCTGCAGCTGCTGTCATGGCACGCTTGGTCTCATTTAAGATGGAAACTGAGGTACTTATGAGTCTGACTATATCTGCCATAGCAATTATGCAAAATTCAAATATGTTATACTTCTTAGCTTCTTTTTGCAGCACAAACTGAACCAACTTGTTATTTTGATCACATGGCTTATTTTACTTTGTTTTGTGTATTTGAGGTACCTCACCTAATTTCAATGCTCTTATACAGGACATTAGGGATGAGAACAAATTGTGATGTACGGTGGGGGTCAAAGGGCTTAGTAGCATTTGGCCATAAAGTTTTTTTGGGTCGCTGCTCGTAGTTTCATTTCTTTTAGTGTCATTGTACTAACCTTAAGGGTTTGTATGAGTCTCCTTAGATTCTTTTCTTCTTAATATAATGAAGCACAACTCTCTGGCGTGTTCAAGAAAAAAAATAGACTTTGGTCTCGCCTTGTGTTGCTTTATACAAATTTGTGTAGGTTTAAACACAAACAGCAATAAAGGATACCAATTTTTTTCAGACTTCGAAAGCTTATTACAATTAAATGCCGTTGTGCTCACATGTTCTTCTGGCCTGTTCTGTACAATTCCCATACAACCATGTGATACATAAGTTTTAGGGACTGAGTGCGTTCAGGAGAGAAGGTTGGGAACTCCTCTCCCGCGCACACAAATCAGGGTGGCTCGTTAGTGTCTGATTAATTTAAGTATTTTAGCAATAAAAAACATGAAAAATGGAAATATGATATTTTAAAGCAACTTTCCTATATGATTTTTGTTTGCAAAAAAACACACCGTTTAGCAATTTAGGAAGCGTGCACTTAGAAAACAAGAGAGCATAAGTCTGGAATTATTTGTGGTCATATGGCTTCCTGACCTCAACAATACTTGTAAGCAGTTTCTCTGGATGCCAGTTGCGCCATAGTTTCTCTGTAGTACTCCCTCCGTCCCTAAATATAAGGGATTTTGGTCAGTTTCTGTCCAAATTCGTTGTACTAGGATGTGTCACATCACACCAAAATCCCTTATATTTAGGGACGGAGGGAGTATAGATTTTAGATCATTCTTAATCCAAACAATTGTTCATTTTGTGTAACACTATCTCGTTCTGGATTCTTTTCAGGCTGATTTTGATCCTATAAGATGGCTTGATCGAGCTTTGATACGTCTATGTTCCAAATTTGGTGACTATCAGAAGGAAAACCCTTCATCCTTTAGTTTGTCCCCGCGTATATCAATATTTCCCCAATTTGTTTTTAATTTGAGGCGTTCTCAGTTTGTTCAGGTAGGGAGCTCGCCTTTGTTCATTAAGAAAAGAATGTGACATGTATGGGAGATTCATACCTTTGCTTACTAAATATTTGTTTTCTATGCAGGTTTTTAACAATAGTCCTGATGAAACTGCATATTTTAGGATGGTATTGGACAGGGAAGATGTAACCAATGCAGTCGTGATGATTCAGCCTTCACTTATATCCTATTCATTTCAATCTGGGCCAGAGCCAGTTCTCTTAGATGTAACTGCAATTGCAGCTGACAAGATTCTTTTATTGGATTCTTATTTTACTGTTGTTATCTTCCATGGGATAACGATTGCACAGTGGCGAAATGCTGGTTACCAAGATCAACAAGACCACGAGGTAATAGCGTGTCAACTATGGCTGTATGGCAGCTCGATTCTTGTTTGCAGAGATTATTTATCAAATACTACATCTTATAGTCTGCTTTAGTGAGATTATTTATCAAATACATCTTATAATCTGCTTTAGTGTAATATCTCACCTTCCTATCGATATACCTTTCTTCATATATTAGGGGCTAACACAGATTTTTATCTAAGCTGCATTTAAAGTGCAGTAGTGCATTGCCATCCAGTGCTGAACCTTTCATGATATTCAGGTATTTGCCCAATTGTTAAAATCTCCACATGAGGAAGCTGATACTATAATCAGGGAGCGGTTTCCTGTACCCCGTTTGGTCGTCTGTGATCAGTATGGGTCTCAGGTATAACTTTTGTTCTGTACTATTTGCAGTTGATCTGGAATTCTGGATGGGTTTGATAGTTCTTGGCTATTTAATGAACACGTTCAAAAATCAATTTATATATTACTTTTCTCTAAAATTTCAGGCTCGATTTTTACTGGCAAAGCTTAATCCATCTGTCACATATAATTCTGATAATTCTTCTCATGGAGGAGACGTCATATTCACAGATGATGTGAGCTTCCAGGTCTTCATGGACCATCTCATGCGGCTAGCAGTCCAATAGGATATGAATAATTTTGTACGATCAGTAATTTCTTCTGCTGTGCA