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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039311
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:16172247-16174789[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GGGAAGACTTTCTTCTGTTCGAACACAAATGCTACATCCAGTGATAGGAGCAGCGAGTCAGAAGCTAAGTAAGTTGTATTAAGTATTAACTCTGTGGGCTGTGACTTTTGTTGATAAGGATGGCGAGGAAAAGCTTGTTAAAGTACCTATAGGAATGTCAATGCTAGAGGCAGCACATGAGAATGACATAGAACTTGAAG
Tissues root/shoot, root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GGGAAGACTTTCTTCTGTTCGAACACAAATGCTACATCCAGTGATAGGAGCAGCGAGTCAGAAGCTAAGTAAGTTGTATTAAGTATTAACTCTGTGGGCTTGACCAGTGTAACTCGTTATCCATTTTAAGCTAGGCCCCATTCTTTTCAACTAATTCACAGGATTATTTCTGCAGATTATTTGCTCCATGCCTCTAAAAATATGTTTTCTCAAAAATATTTCTTCTACTGTGTGCCTAGACCACATGTTCTAAGCTATTTGTTAAGTTTATTTCTTGAAATATTTTAATTTATCCCTATAATCAAGTGGATAATCCAAGACAATAATGCAGTTAATAATCTGTTTCAAATGGGCCCTAAGGGTGTGTTAATTTCAATGTTTCAGCCAATTAACCGGGTTTCTTACCTGACAAGACACTCAATTAGATCATGATTAATTAATTAAGTATTAGCTATTATAAATTTGAAAAATATATTTATTTTAGATTTGTAGAAACTTCTAAATATTTTTTTTTTCAAAAATCACACTGTTTAGCAGCTTGGGAACCGTGCCAACGATAATCTAGTAGCTAGTAGCCAAAAAGAAATGAGCCTAAGTTAGATATATATCTAGGTTTGTGACAAAAAAGTTTGATATGCTATTTGTAGATTACTTTCTGGAACACAAATTTACTCTGGTGATGTCTGTAAATCTGGTAATTAACATGAACGGCATTCATGTTTATGAAGCTTTTGGGCCTTTGGGAATGCTTTTGGTTTGGAAGTTGGCAAACTTCAGATAAAACTTCTCCAAGATGAATAGTTAAGTACCACTCAAGAATAGGAGGCACTTAAAAACATTCCATTATCATTCAACTCTTTTAGTTTAGGGGCAATTTCGTTCTTTCCCCTACTTTGATGTCCAATATTGATTTTGCCCATGTTTTTAGGGTTTTCGTTTTTGCCCCTACGTTTTTGAAACGAAACAGCCATTTGCCCCTGTTCCGTTAGTTCTTGCTAATGGTGTTAAATGTGGGGTAAAAAGGACCAAGTATACCCTTAGATATTTCCGGTACTTTTGTACACCACTTTCAAATTTGATCCAAATCTTGGCAAACTTTCACAAATTGTTGACAAATTAAATTACTGATAGAGTATTGCATCAATAGATTTGTATTTTGATTATGTCAAAAGTACGGGAAAATATCTAAGGGTATACTTGTCTTTTTAACCCCCCCCTCCAAACACACACACACATTTAACACCGTTAGGAAGAATTAACGGAACAGGGGCAAACGGTTGTTTCGTTTCAAAAAAGTAGGGGTAAAAACGAAAACCCTAAAAAACAGGGGCAAAATCAATATTGGACATCAAAGTAGGGGCAAGAACGAAATTGTATAATCAATGGTAGTTTACTAGTTTAGTTAACTAGCCTTGGTCTTGTATTATCAGATCTCTTTAGAGGTAGAGCTTGTATAATTCTGCCCTTCTGCACATGAGTATCATCTTTGTCTATATTGGAGTTATGCAATTCTACTTTCTGTGTGTTGTCATAGAGGCAACTATTAGGGAGCAAAGAGAGTAGAAGAATGAGATGTTAAACATTATATGGGGGCTCAATTAGAAATATAAATAGGTGGGATTAACGGAATAAAACGGGTAATTGGGAGGCCCATATGGGTTTCCTGCTCCAAAATTGTTTCTCAAGTTCTTACATGATGCAGCATTGGTCAACCTAGAAGCCATCATCTTGCCTGGGTGATTCTACCACTTCCATTGGACTTGACATGGTTATGGGATTTCTCTGTATGATTTTCATGTTTACATATGCTGTCAACCTCAAAATGTGCTTAGCCTTGGTAATCGTCTCCTTTGATGCCCATCTTCCCGCAAGTTTTTTTTTTCTTTTCTCCTTTTATTTTGAAGCCAACTTTCCTCCAAAGATGCAGAGTGTGTTCACTTCATATTATTCTGAATATGAGTGTGGTTCATCCTCACTGAATAATGCAATTACTCTTACTCCATGCAACTGTGAATGTATGCTGTCTAAGTATAGATTGTGCTGTTGACCTTTTGAACACCAGCAAGGCCATTATGAGTGTCTATTCCATATCATGTATGGAATTTATCCTGAAGCTTGTGTCACAAACTTAATTTAGGTAAAAAGGTTTGCGATTTTTGCAGTTTTACTGGTCCATCTCTTTTTTGATGAGCATAGGGTATTCGTTTGAGGTCTACTTGCTTCACGTTGCTGCCTATTTGAATTTTTCTCAGCATGTCAACTTTCTGAATTTAAGTACATGACACATTACATGTTTTACAGTGAGCATAAATGTCATTCCAATGGGGCGCTACTGTTTTTTATCTGTTGGCTCATGTGTGATTTTGGTTATAAAGTCCATGTTGTTTTATTCTACAATTTGAACTTGAATATCAAATATTATAATTTAATTTGCAGGATATCTGTGACTTTTGTTGATAAGGATGGCGAGGAAAAGCTTGTTAAAGTACCTATAGGAATGTCAATGCTAGAGGCAGCACATGAGAATGACATAGAACTTGAAG