Search result

BaseInfo

ncRNA ID	osa_circ_039292
Species	Oryza sativa
Class	circRNA
Genome position	9:16051358-16054448[+]
Reference genome	RGAPv7
Source	PlantcircBase
Method	find_circ
Type	exonic
Splice junction sequence	GGCGAACGAGACTGTTTGCATGCACGGGTACAATTATGGAGTATGGACCATCTAAAATGAGCATTCTGACTTCCGCTAGTTTGGTTAGATGCACTAAAGAAGGAGAGTTGTTCAGCCATGGCTTGGCCTGAGGATTGGATCACTGAAACATGAAAAACTGGATATCCGTGAACAAATACATGGAAGCTTCTCCAACACAG
Tissues	root
Exon boundary	Yes-No
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	GGCGAACGAGACTGTTTGCATGCACGGGTACAATTATGGAGTATGGACCATCTAAAATGAGCATTCTGACTTCCGCTAGTTTGGTTAGATGCACTAAAGATGAAAACAAGACAGATGAAAAATTAAAGGTCAGCATTCAGCCATATTTTCTCTTCTGTTACTTCTTTATGGTCTTAGCTTCATGAGATGATATTGTTGTCACTTGGTTGTAGATTAAGGTGCGCCTACCCAATGGCAAGCTTACCGAAGGAAAACTGTGGAACTATGATTTATATTATAATATTGCTGTTGTCAAAATCAAGTATTTCCCAGAACTTAGTACAGCACAGATACATAATCAAGGGCAATCTAATGTTAAATTATCTCAAAGTAAACTGGTCGCTGTTGGACGTGGCTATGAATCTGGAGAACTAATGGCTACAGGTGGGACACTGCTGTACAAACCTAGCAAACTTGACTGCAAGGAACTCATGACCTCCACTTGTAAGATCACAAAGGTATTACCTCTCATTTATTTAGTACTATGGATAGATTATGATTGCGGTTGGTTTATATTGTTAATATGCATATTATTCACGTTGAACCGCCTTTTAAAAAAAGATCATATGGAAAGACATTAATAGTGCAGTTTAAAATGGAATCTGTTATGCAGCAGTTGTTCACCATCATTTTATTTTGTTACAGGCTGGGATTGGTGGTCCCCTTGTTGGGTTTGATGGAAACTTTGTTGGCATGAACTTTTGTGATAAGAAGGAAACTCCTTTCTTACCAATCAATATAATTCGGAAATGTTTAAAGCACTTTGATATGTTTGGGTATGTTTTCTAGTTCTTATTAATGTACTTCCAATAATCTTCACTTGCAATCATGTGTGCTAATGGACAAATTTGTTCTCCTTGACCGTCCACTCTTTGAACACTAGCTTGATTGTGGAGAGATTATGTCAGGACTCGTGATGGAAATACTTGTTGGCTTGTTTAGTTGATACTTAGACTGGTAGTTTATTGCTTAAATAATTTGGATAGGTCAAAACTCAAAACCAACATTCTAAGATGAGTCATCATATCCTGATCAATCAAATTTGCATTGCCATTTTCTTTTAAGCGAGTTGTAGTGAATGCAAAAAAATTGTATTGGATAAATGCTGTGAGCTCCTCAGTTTCCTTTCAACTGTCAGAACCATTTTTACTAAGCAAGAATTATGAATTACTATGCAGTATGACTCAAAAGCTGACCAACCTTAGTTTCATGGCTTCATCTTTCCCCTGAGATCCATCCACCCTTGAGTCATTGCCATCTGGCACTACTCAGTGCAATGTTTATGCCTATTATGAATTAGACCATTTTGGTTGGTACTTGGTCTGAAAGATGAAATATTTACAAATACCATCGCATGTGTCATTGACATGTGGGCCCTGGTCCAAAGTGTCATTCTCACATGCAATGGTATTTACATCTTTGTGATGGTACAAACCTATTTTTCTCAATGAATGATTTTCATAACATTTGGTATCTGAGCAGTTGATTCATGGCATTTGGTATCTGAGCAGTTGATCCTGCACGCCTTGTACTGCTAATTATCCCTTTGATAAAGCATTGGCTGTATGCAGAATACCCAAATGGCCGTGCCATTGCTGCCAATATGTTGGGATTTGAGGATTCCTGAGTTTGACTTATTGCATGTCTCGATTTCCTTTAACGTGCCAATAAGTTATATACAACATTAAGATGAATTTACACAATAGCATGAATAAACAAAGACAAGCTTCTATAAGTTTTGGCCACATATGGTCGAATTCGGCAACCAAAGTTTACATGTTTTCCTATATGTCATGGAATATGGTTCAGTATATTTTTCCTGTGAAATTCCTACTAAATGAAACCAATCAGGGCTTCAGGACTAATAGAAACCCCAAGTGTGTTACAGAAGAGCATGAATAAATAAATACAAATTTCTGTAAAATTTGGCCAGATATGGTCGAATTTGGCAACAAAGTTCATATGTTATCCTAGATGTCATGGTACACAGTTCACTATTTTTCTTTTTGTAAAGTTTCTACTAGTTGAAACCAATCAGGGTTTCAGGACTCAGAGAGTACTCCAGTGTGTTAAATCCTTCAGTAAGCTTTAAGCAAGTGAGATGTCTCATATTATTTCCTTTTTAACTTTGGCTAGAAATTCGATTTATCATGACAGGAGCTGATTTTTTTATCTTGTTTCATTGATTATCAAATGTATAAAATGTGATATTGCTTGTGCATTACATGCTTTCTCTGGTGGATGTACCAAGATTTTTTTTATGGTACAACTTTTGCATTGTTGCGGTGCAATTGTACAGCCCTGTGAGATGCCACCCCATGGTTTGACTTGGACAATGCTGTTCAGTGGTTCATTTGTTGGGTGTAAAATAGAATGGCTCAGTTAGTGATAGGTGATCCATCGCATCACAATTCACAACAAGCAGGACATATAGATATAATTTTCCTGCTACCTCAGTTTTCCCTTTGTGATGGCTGCTACCTCAGTTTTCCCTTTGTGATGGGATCTACATCCATAAACATCAGCAGCACACTGCTCTGCCACCTTCTCGGATGTTCAGCAGTGCCACAATCGCTGCATAGCAGGCTCGTTGGACTGCCAACTACTGAGAAGAGGACCGACAATACTCATAATCTCCATAATTACATTCTATTAATCTGAGCCGCCAGACTCAGCTGTTTCTCCAAGCCATTAGCAGTCATCAAGTGTAGTTGCAGTCCCCATACTGAGCAAATCACTGTTCCTCCAGCAGTCCGCTAGTCCCAAAACTGCTTAGCCTGGTTCTTTACTTATGCGGGTCATTTGCACAAAATCTATTTGATGTGTTGAACCTATATGCAATTTTGTATAGTTATGTTTTCTGTATTGCTAGTTTATTTTAAAATTATTCAATGTAGTCCGAGTGCCTCAGTCTAAATATTTCAATCATCTGCTAAATTTTGAGATATATGCAGGAGAGTTGTTCAGCCATGGCTTGGCCTGAGGATTGGATCACTGAAACATGAAAAACTGGATATCCGTGAACAAATACATGGAAGCTTCTCCAACACAG