Search result

BaseInfo

ncRNA ID	osa_circ_039186
Species	Oryza sativa
Class	circRNA
Genome position	9:14553762-14556740[+]
Reference genome	RGAPv7
Source	PlantcircBase
Method	find_circ
Type	exonic
Splice junction sequence	GGCACTCCATCTAACGCAAAATTTTTCCCACTCCGAGCTGTTTTCTTACCTATACTTTTGCTTCAAGTGACTACTGTATCGTTTGCTATTTGGATATTCTCTTTTTCTATATAAATACAGGAACAGATCCTATGTCGGATATGCTTTGAGAGAGACATTTGCATAGTTCTGCTTCCATGCCGCCATTATGTTCTTTGCGA
Tissues	root
Exon boundary	No-Yes
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	GGCACTCCATCTAACGCAAAATTTTTCCCACTCCGAGCTGTTTTCTTACCTATACTTTTGCTTCAAGTGACTACTGTATCGTTTGCTATTTGGATATTCTTTGAAAGGCTTGTTACAAAATTACGAGCTAAAAAGATCACTGACGGATATATTTCTTTCTCATCAAAGATTGATGAATTGTTTATGATGATGCAACATGGTTCAAGGTTTTATTGCTATCCAGTATCACTTTAGTAGTTCAGGGCTCAGGCCAATTGCACATCTATTACAATACATAAAAGCTGGACATGGAATTCTCATTTGATGATTTTATTGCTGGGCAGGCTCATCGCTTGGTGGTCTATTGATGAAGATAGCAAAGAGGAGCAAGCTCATTTATGCTATGCAAATAATTCTGGGTAGGCTCTTCTAAATTTTTCCTAATTGCATCTTGCTTACGCTTATCATGACAGTACCCATATTCTTTCTTGACAGACATTTTTGTCGTTTCTTGAATGCTGTTGTTACTACTAGAAAGTGTAGGTTCTTGAAACTCAGTCTACCAAAAATTTTGAAGATTAGGAAGGAAACTATCAGCTTACTGAGGCTAGCCAAAAGTTGCTGTGGTGATGAATTGCAGCACATTCTAACTGTGCTCTGCTGAATAACAATCCCCCAACCACGGGACTCATCCACATGTTGCTGATAAAACTCTAGGCTAGTATGGAATTTTTTAATTATTTAAACCATTTTATTTTAATATTTTATAAATAAATTCTCTAAAATTTTATTTTTATAAATGAACCTTTTGGCCATGCCAGTTTTTACTGGCGTGACGTCCGAATACTGTCACGACATCTTCGCGGGTGTGATAGCGCTGCCAGCGTGGCATGAATGACATCAACAAGCTGCCACGCCATGGATGTTGGTGTGGCTGGTGCATGTTGCAACGCCTAGAGTGTTGGTGTGACGAACCTTGAGTTGGCTGGGACAACTTGCTGAGAGTGCAGCTCATAAAAATGTCTCATAAAAAGATGTGCAGCTCTTGTTTGCATTAACAAAATAGATCGCAACTTGCATGAAGATCCTAATGTTATAAGTAACTGAATTATATTAGTTGTGATTCACTCCACAAGATAGCACTTACAAAACTATGAATCAGCGTAGTACAGATGATTACCAAATCCATTCCAAAACTCAAAAAAGTGATTATCAAACAATCTGAACACACTACCATGACGACGGAATTCCATTCATGGCGATAGGAAACCACCAAATTAAGAAAATATAGAACATTGTTATTTTGTAGATTAGTGTGGATATCTGTTTTATATATGTTGTGCATGCAGGGATATTGGGACTTGCCGTCCACATTATACGTGCATGTAAATAGTAACTTTGTATAATTGTGTATTAGTGCAATCTTGTCATTAACTAATTACGCATAGACCAAACAATGCATCAGGGGTTCACGCCAGCCAACGCCTAGTCTCGTCACACCAATGCTGTAGGCGTTGCAACATGCACCAGTCACGCCAACATCACTGGTGTGGCAGCTTTGCTGATGTGGCACTCATGCCGCGCTGGCTAGTGCTGTCACGCCAATAAGGATGGCGTGGCAGTATTTAGACGCCACGCCAATATTACTGGCGTGGCTAAAAGGTTCATTTTTAAAAATAAAATTGTAAAGAGTTTATTTTTAAAATATTAAAATAAAATGGTTTAAATAATAAAAAAAGTTCGTAGTATGCTACACACTTGCTTCTTCTGAGGACCATAGTTCCCTCCTGGACTGCCCAAAGGATCTTATCGTGGGATGTACTATGAATAGCTAGAGAACATAAGATGTTTGAGTCCAATGCTATATGGACACATGAAGTAAACTACCAACTCAACATCATGTTAACATCTATTTTGCCATATTGGTTTTGTGTTTCTTTCTTCGTTTGGTAGGGCAATGGGCTCAAATATTCCAGGAAATAACATCGTGGGGAAACAGATGGTTTTTGTCTCAGAGATTGAAGAGAAAAATGGCAAGAGTAAAGTTTAGAAGAACTTGTCATGTAGATCCGCATTAATCAAATTTGGGAGATCCCACATAACGTCAACTGCTCCAAAATATAGAAAGACTACTAAACTAAAACAAGTTTCTAGATACAACACAGTTTAATGTTAACCTTCCAGAGTTGCTAGGTCTTTCTTCATTACGAAAAAGTAACTTTTTTTGCATTTGCATTTAAAAGTACTGTGTACTTCAGTAACAAGGTAGCTTATCATTCATCATTCAACAAGCTATGCTTATCGCTTTAGATTAGAAGCACTAAGATAGGTAATCACTCAGGAATCAACAAGGTATGCCAATTACATTGGACGCACTGCAAATGCTTCCACGGTAGCTGAATTGTTTTATTACTTGGTCTTATCCATGCAGGTATAGTACCTTTTGCAGCTATCCACCAGAGATGGTAAAAGAGATGCCGAAGAAAGTTCTTGTCAAAGAGGTTGTTTTACTGTACATACAGTAACAGTTTCTTTATTTGCATTGGGCTAATTAACCACTTGCACTTTCAGGTACAGAGACTTCAATTAGCTTTGGGGGAGCAAACCAAAATGGCTAAGCTTAGTCAACAGCAGTGTGATAAGCTAAAAAATGTACTACTCATTTCCATTCTCACTTCTCAGACAAAGCATTCTACAATGTCCAATTTCAAATAGAGTGATACACAAGGCTCTAGGTTGATTTGGTTCTGTGCTGCACCTATATAATATTATTTCTAGTATTGCAGTTTGGAGTTTATTTTCTTTTAATATTGAATCATTATCATGAGTGGTAGGCTGTTAAATCTCATCCATAAAAGAGTTGATGTGCTTTTTCGATTTCAATTACTTTTAACAAGAACCTTTTTCTATATAAATACAGGAACAGATCCTATGTCGGATATGCTTTGAGAGAGACATTTGCATAGTTCTGCTTCCATGCCGCCATTATGTTCTTTGCGA