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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039179
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:14536231-14539854[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence TTCAGATAATTGACACGAGAATCAAAGTAGCATATGCTCTTGCAAGGCAATGGTTTGGCATATACACAAATGCAGAGGAGGCAACCGATGGTAAGTCAGCTGGGTATTGCAGTATGGATGCACCTTTACTGTGGATCAGAGTGGACCCAGAAATGGAGTATCTCGCTGAGATACATTTTCACCAGCCTGTGCAGATGTGG
Tissues root
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TTCAGATAATTGACACGAGAATCAAAGTAGCATATGCTCTTGCAAGGCAATGGTTTGGCATATACACAAATGCAGAGGAGGCAACCGATGGTAAGTCAGCTCTGCGGCTCTGCTTATAATATATACCTATAGTATTCGCAACTAGATAAAATGCATCTGACGGTTTAATGTTTTTTTTTTGTGCAGAGTGGTTATTGGATGGTTTGGCTGGTTTTCTCACTGAGCATTTTGTCAAGCGTTATCTTGGCAATAATGAGGCACGATATAGGCGTTTCAAGGTTGGTTTGTATTTTTTGCTAAAGTCAGATTCTTCTTGCCATCAAGTAGTTAGCTTAATTCATACATAAATTATGAATGAGAATATATACTCAATTCTAAGTTTGTACAGGTATATTAGATTAATCAAATCAAAAGGTAGACAAAATAAAACATGATCATTGATTGGAAAATAATTTATAGTTGGATTGGAATATAATATAATTTTCTTTTCCTGCAAATCCCTCAAAGTAAAAGTTGTAGTAATGCTATAATGCTGACGTGTCTAGGTCCATAATGCTAAAATGTTGCCTGAAACGAATGCTATCACATGCTATTTTTGTTATTAGAATATTTTATATAGTTTGTCTTTGTTAGTTCTTGCATTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTGTAAATGTATGTTTATTATTATCATTGATCTGCTGTTACAAACAGTCTATGATAGATCTCATTAGGAGTTGAATTAAGTACATCAGAATAGATATGCCTACTAGTACACACTTCTATTAAGGTATACCTTTTCTGTTGTCTCTGGTACTTTCTACCTGACAAACGGAACAGGAAAAATGGGCATCTTTCATGTTTCTTAGAAGTGCGGTGTCATGTTTAAACAAAATGTTCCTAGTTAATTAGAACACTTAAAAAGAATCTTTCAGTTGTAATTGGTATAGCTATGTGTCATTTCTTTTATTTCTATATCATAATATGTGTAGGATGTTGCTGCTGATTTGACCATATTTACTTTGCTTTTGAAACCAGTGCACGAGAGTTATGTTGCACACAGTTTTGGTGTTGATTCACATATTAACTTGTCATTCACCTTCCAACCAAATTCACTGGCAAATTATGTGTTTGCTTCTTGTCTTGCATTCATTCACCTTAATCTTAACGGTTGGTGTCGGGCGGTAAAAGGGATTTACTGGCACAGTTATTTTTCTTGGAACATTATTTATATCTTAATTTTGTCTTTCCAGCTTGTTAATTATCAATCTGTACTTGTAATAGGCCAATTGCATTGTGTGTGAGTTTGATGTCAGTGGTGCAACTGCTTTGAGCTCTCCTTCAGCTTCAAGTGATTTATTTGGAACTCAAACAATCGGTTCATATGGGAAAATTCGTTCTTTGAAGGCAGTAAGTTTTTGGCCTTTTGAATTACAAGTTTACAGTTGACATAAATGTATTACTCCCTCACTTTTTTTCTTTTAAACAGGTATCTGTTCTTCAAATGTTGGAGAAACAGATGGGGCCAGACTCTTTTCGGAAGGTTAGCAATTGCATCTTCTTTATATGTACTTATTACAATTTGCTGTATTAAATGAATGCAACAGTTTGCTCAAGCAATTGATATTACTTCTGAATGTGTACCTCTAACCTCTTGCGAAGTAATATGTCTATGATACATATGAACAGCTGCAAGAACTACATGACCATTCTTGAACACCATTGGCTGAACTGTAGATGCTAATGCTTTTTATGCATTTTTTTCTTAAGTTTCTTAATGTGGTCTGGTATTCATTTTCTTCATTTTGAGTAAACTATCCCTATCTACATGTACTCTCTGTGTTACGTGTTTTCCTATTGGCCATCTTGTACTTAGCCATGCTGACAGGCTGTAACCATTCCTGATTTCAGATTCTGCAGATGATAGTTGCTCCAACTCGTGCCTCAAGAACACTAAGTACAAAAGAGGTACATCAGTACATGGCTTTCAACTATGCAGTTTTGCAGTGTGCCTTTACTAATTGCATCAATCTGGTTATTTTCTGGTCTTTCCTGCTTGTTCATCATCTTGAGTTAGCTACAAAGTCCCTAGCCCTTTCTTGTATCCATTTTCCTCCGTCATGAAGAAAAACTTTCACAATGAGTGAAGTAATTTGTTATATTCTGCAAATGTTTATGCTGATGCTTCATGGGAAGTTTGGTTTGAGGAATCAAACCTTCCAAGGATGAGTTGGTACTTCTTGGAGGCATCCCACTATTCCATATATTTGCACTACTATCCAAATACCAGTCCATTGCAATGGACTTCAAAGAAGCATATCATATATTCATATGTTGTAAACTCGAAAAGCCCTATACACTATACAATTTTCCAATAGACGTCAATGCACTATTCATCTTATTAGAAGTCACATGTGCAAATGATTTTAGTTATCTGCAAATGATACTACAAACTCAAGAAATGGTGGAGGGTTGACAGACTCACCACCACCAACAACAAAAGCTTCCATTGTATAGTTTATATTATCGAAGAACATGAACTTTTAAAGGATGAGTTGGTGATGGACCAACGTATTCCATTCTTCATAAAAACAAGTGGTGACATTCTGAGTTAGGATGAGATGATCTGTTTGCTGTTCTAATTCCTCTAGTCAAACAGCGAAATAGTCAAATTACTTACCTTGTGCTCCATTTTTGGCAAAAGTTGCTATTATTACTGATATGTGAAAGTAATCACTATCAAGTGCTAATAACTATAGTTTCAATGTTTGGTCTCAATGTGATGGTAAAATGGTCAGGATGTGTAACATTATCTGTTTGGATGTTTTCTACACTGTTATATTATTAGTTTAGTCCTGTATAGTGCAACCACTGTGGTCATCTTTGTTAGCAACTGAGTTTCTTTCTATAAATTTCGTTTATTCAGTTCAGGCATCTTGCAAACAAGGTCGGTAATCTTGAACGGCCATTCCTGAAAGAATTCTTCCCAAGGTGGGTTGAATCTTCTGGATGCCCAGTTATGAGGTAAATGAACCTTCTTAGTGCTTGTTCGTGTTGAGTTTTCCCCTGTACGCTATCTCCATATACTTACTCATATGTGTATTCCTTCTGCTTGTAAAGATTGGGAATCTCCTATAGCAAGAGGAGAAACTTGGTTGAATTAGCTGTTTCACGTGGTTGCACCACAAAAGTTGATCCTGGTCCTGATATTCGCACGAATGGTGATTCTCGAGAAGGTGATACTGGATGGCCAGGAATGATGAGCGTACGTGTCCATGAAACTGATGGAGTGTACGATCATCCAATTGTACCCATGGCTGGTGAAGCTTTGCAGGTGGTGGAAATACAATGTCATTCCAAAGTAGCAGCAAAGCGCTTTCAGAAAACTAAAAAAGGCTCAAAGCCTGATGGTTCTGATGAAAACATAGATGCTTCAAATCAAGATAACCGTGCGAGGTCAGTTTCCAAGTAACTACTTTTTTTTGCCCTGCCATTTCTCACTGGTCACTTATTGCAATTTCTGGGTATTGCAGTATGGATGCACCTTTACTGTGGATCAGAGTGGACCCAGAAATGGAGTATCTCGCTGAGATACATTTTCACCAGCCTGTGCAGATGTGG