Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039141
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:14411216-14413110[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence GTTCACTGGCAAACAACTCTAAGAGGTCCTGTTGTAGGAATATTGACAACCCAGAGGGTAATGATAGCCTCTGCTGATCTTGACATACTTTCAAGCAGCTTCTTGAAAGATGAGTTCCTGCGTTCCAGAGATTATCCTCAATGCCCTCCAACTTCTCATCTGTTCCAGCGTTTCCGGGAGTTGGGATATGCATGCATAAA
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTTCACTGGCAAACAACTCTAAGAGGTCCTGTTGTAGGAATATTGACAACCCAGAGGGTAATGATAGCCTCTGCTGATCTTGACATACTTTCAAGCAGCTCAACAAAATATGACCGGGGTCTTCCATCAATATCCTTTGATCTCAGTCTAGCATCTACTTTTCGTGTACTCTTTTCCTATTTTGTTGTACAAATTCCGGGTATCATGGTATTAGCTGTTGCCAACTGTCATTTTTTGTTGATCACTTAACTACTTTGTACTATCGCTCAATGTTGTGGGTTGGACCAGCACTTATCTTCTCTAGTGCAACTGCAATAAGTATGCTTGGATGGGACAACAAAGTTCGATCTATCCTTTCTACTAGCTTCCCTCGTTCTGGTAAGATTATAATATATTCAATTAAAAAAGACTAACCTATAGTCCTTCTGATGCTCCCAGTTCCTTTAACATGCTTTGATACGCTGCTACTTCTTATTTTCATCAGTTTGTGCTGAACTAAACAATATGTGTTTTTATGCATGCAGTGTTGCTTGGTGCCTTGAACGACCGCCTGCTGCTTGTAAATCCAACAGATATAAATCCAAGACAGAAAAAGGGAGTGGAAATAAGAAGCTGTCTAATAGGGCTTCTTGAACCTCTTCTTATTGGATTTGCTACGATGCAGCAATACTTTGAGCAAAAACTTGATCTTTCAGAGGTGCTATATCAGATAACCTCAAGGTATTTTTCCTGTCCAATTTGTTTCATATCATTTCCATATGCAAGTTGTTGTAGTGTTCAATGCACACAAGTGTAGTCATCAACGTAGTCATAGTTCAGAGTTAGTGATTTTGTCTTTTACAAAGAAGATCTTGTAATTGATACATTGAACAACCTAGTCGCAATTATCAAGGCTCTTTACACAGTATCTAGACAGCAAAATATGATATTCAGTATTTCAGTGCATTACTCGATTAGTACAAGTCTTCATATTCTCAGTTTCATCTGCATTTGTTAGTGCTGCTGCTGCATTAGATCTTCCAGCAAATGATCAGGTTTTGCATCGTGTATTAGAATATATTGTCCTCACCCTCATCAGCTTCACTCCGAGCAAAATCATTTTTCATTCTCAGCTTTGTCATTGAAGTCGTACAACTTAATTCAATATGCTTATGACCTGCAGGAAGCCAAGAAGTTATGAATCACAGATTGAAGTTTGATAGGAAGCATGACGAGATTTCTCTCATAAATAAATACACTGCATGCTTCATTCAAACTCTTGGCTATAGTTTAAGCTTCAATACACCGTTTTATTCAATTTGGATGCACATCTCTTTGTGGAAAAATTCCTTTGATAGATCATTTAGAGGAATCACTTGATCTTCATGGAGAACTGGCTATGCAGTTCCTTGAGCTTTGCACCTTGTGACAAAATGATCATCATGCTCTGGCTTCTTGTCACCATTTTATTATTCTTTTTCTTCAAAGCATGTTGTTTCTTCCTACCTACTGCAGAAGGGTTAATAGATGGATCATCATATTCTGATGCTTGTATTGGTTTGCGTTTATACAGGTTTGATAGTTTACGTGTCACTCCAAGGTCACTGGACATATTAGCTAAAGGACCCCCTGTTTGTGGAGATCTTGCTGTATCACTATCCCAAGCAGGCCCTCAGTTTACCCAAGTAAGCTTAATCTGTGCTCATAATCATCCTTTTGTTCTCTTTTGCTTGATCTAATACTTTCTTCCATATTGTTTAGATCATGCGGTGCAATTACGCAATCAAAGCCCTCCGGTTCTCTACTGCTCTTTCGATCTTGAAAGATGAGTTCCTGCGTTCCAGAGATTATCCTCAATGCCCTCCAACTTCTCATCTGTTCCAGCGTTTCCGGGAGTTGGGATATGCATGCATAAA