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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039065
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:13140829-13144220[-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TTTCTTCATGAGACTTATTTTTATTATCAACATAATGTGGCATACACTATACTCTAATGGCTCAAGAAATCGTTAAAGACCATGCAAGAGTATCAGAGCAGAACTTACACATGGGAATTTTTTGTATATACGTAATTTAAGTAGATAAACCGAACTGAAATACCTATGTTCAAAGGTTTAGAGCTTTATCTAACACATAC
Tissues root
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AT-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TTTCTTCATGAGACTTATTTTTATTATCAACATAATGTGGCATACACTATACTCTAATGGCTCAAGAAATCGTTAAAGACCATGCAAGAGTATCAGAGCAACTTTACATATTGCCATTACTGTGCAAATGGAAAAAATACCGTTGCTTAAAGTGCTGAAAATATCTGTGCATTGTGATATAAAAATCAATTAAAAGTACAAAGGCACTCACTATTAGAGTTCAATATTTTATCTCCAAGATTCAGTCTCAATGCACTTCACAATGGTATTGCACTCCCAAACACTTTGCGTTGTTGAGGAAGGAAGATAATTTAGTAGTAACTCTTTCAATTATTAGAAGCATTAATCAGTTAACATAAGAGGACAAATTGGACCGCATCGTTTTCAGGCTATGTAGAGTTATTCAAACGAATGAGCAATTATGCTATTTCCTTTAGTTTCCCAACATGGATAGGACTGCCATGCAGACAGTTTTGACAAATATTTACATGTTGGGTGTATGGAATGGATACTGCACTGAGCAATTCCTAAATATCTCTCTTAAGACCTTACACTTTTGGACGCACCTGGACCTGCTGCAAACAATTGTTAATGGGCTATTTCTGCTGATTTATTTTAGAACCCCATGCATTTTATTAAGTATACATAACTAGATACATATCACATGAGTTATTCCCAAGGGAGAGTCAACTGCACGTGCAGGCAGTTTTGCAAAGAGGCCCCTTGAACAGCCAGTACAACTGCCGCTGTTAGATTTTGCTGTTAGAATTTGTGTTTCTTTGCAGTTCAAATCTAGTTTCAGCTGCTGTGTACTGGTTAGAATGTTAGATTCAGGCTGGTTTCAGCTTCTGTGTACTGGCTGGTTTCTGATGGTTTATGTAAATTATATCACCATATATCTCTTTAAAAACACATATGCAGCTAAAAGACCTAAAATATCAAGAGAAATAAATAACAGTCCCAATAATTACAGAGTATATGTAGTTTTTGTGCTTTTAACTTTTGATAGATTATAAAATAATATTATGAAACACCATTTGGATATTAAAGTTGACTATATTCTTTAGAAAAAAAAAGACAATTAATTTGTAGATTCCAATCAACTAGGTGCCAAAACGAGAATAAACTATGTAATCAAACCTGTCTCATGCATCCTATATGCATGCACATATTAGTTCTATGTATATATCCATGTATTAAACAGGTGAATCTATTATTTTCATTTATTAGATTAGATCTATTAAAGTAATTAATCTCTCTCTCCTAATTTCCCACGTATTTGCAGGAGAAAAATAAATATGTACTGTTCTTCCGAAAAACGCATACGTATGTATATATGCATGTACAAGAGACTACTACTTGCCAAAAAAACACATAGACGTATTTGGATCTAGAAAAAAAAACTATTAACAATTTCCTCCTAACCCTTAAATTAGAACTAAAACGTTGTCATGTTTGTATATATGTACATATGATCAGTCTACCCCTCTAATGTGACTCATTTCATCGCATTTATTTCTTAGGGTAGTTCACTAGGATATATCTATATTTTAAGAGTTCAAAGGCGGACTGACTATACTTCATACGACATAAAACTAATGTTAAAACATTCAGATTTCATATATTACAATTAAAAACAGATCGCTAAGGCTACAACCAAACAAAACACAACATAATTTACTAATATGATGCTGCAAACTTTTAAAAAATAACTTGTTTAAAATAAAATGCAATTTTCAGCCAATAGTGAACCAGACGTTATAATAGTGCTTCACACTGGTCTTGAGGGCACGGCTATGTCGATATGGGACCCATGTATCAAGGCATAAGAGAAGAAAACCTTCGTGGCTAAGGTCGGCTTCACCCGTTAGAGGAGCATTTATATCTAATTTTTAATGATTTTCTCCCATGAATTGGTAGAAGCGATACATTAAAATATTTTTATATATACTGATTACTGAAACACAAATGAAACATGAACACTTTGGTTTGAAGTGAAGATGAACTTTTTTTACAGTATTATTGATGTATTAGGGTTTTTTTTGGTATGGATGCAATTCCTTCTATTAAAAAGGCACCCAACTTTCAAGACAAAATAATAAATAGTGGTGATAGTCGTGTTTACATATCACAGGACAAAAAACCGGGACAATTAATTTCTTATTGAATATGAGAGATATTATTATCATTTGGTATATCAAAACATGTGGTCTAAATTTTTCTTTGTATTTAATTATAAGGTAATCTACGATTGTTATAGTGAATATGGTGCAATAGGATTTCTTTAGCATTATTTTAATAAATACTCCCTCCGTCCCATAATAATTGCATTTCTAGGGAATTAGAGACATTAACAACAAACACAATTTACCACAATAACCCTATTTAATAACTACATTGCATGCACATATTCCATATATATACTTTGTTAAAAGGAAGGTTGAGGCACACATTCCATATGTAAACTTAATTAAAAGGAAGGTTGGGATAGAAATTCCATTTGTTGGGTCTCATCTTATCAGAAATACAATTTTTGTGGGACAAAATTTGAAGGGTAGAAATACAATTATTATGGGACGGAGGTAGTAATAAATATGAGGTTCTTATACTTAGTATGGACTTCTTTTAGCAATCTTTTATAATAAATAATCTGTGCATTTGCGTGGGCTTCCTTTCCAGTTTTAAGTTAAAGTCACCCCCACATATTTCCAGTAATAAAAGTTACATACATAAATAAGATTCCCACGCAAAAGCATGGGCTACCTTCCTGGATAACTAACTATATCTATAAGTTTTGAACTTATAATACTTCTGAAATTTTGAACTTCTGTAAATTGAAGCGAATTTTGAACTTCTGTAAATTGAAGCGGTGACTAATTATATCAATTATATCTTATCTGCAGGTATTTGAGAGAGTCATAAAGATGTAGAAAACTCTAGAATCAAGTTAGCGAAGGAACTATCAACTAAGTCAGGTTCTATGACTTTTGACTTTGATGTTATGGTGTGATTGGGATTTGTAATATCATGCAGTACCACACATTTATCACAGTTACGCCGTAACCTTCTGAGTTTTATACCAGTCACCGCAATATCGTGAAAACCCTGGGTGTGATGTTATATACTCCTTTGATATCTCGCTACATGTTTTTTCCAAACCTATTTAAGCAATACTAAATTCCCAATTATGTTGCTTTGGTTATAAGCGTGGTCTTAAAAATACAATGTTGACCACTAATGTCAATCATAGCATGTTTATTTGATCGATCTGAAAAACTTATAACTCCTAACCGAACTTACACATGGGAATTTTTTGTATATACGTAATTTAAGTAGATAAACCGAACTGAAATACCTATGTTCAAAGGTTTAGAGCTTTATCTAACACATAC