Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_039043
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:12818757-12819642[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence TAGAGTTGTGGAAGCTAAGGCCCCTATGACAATTGTGATCCCTGTAAGGGGATCAACACCAATAAAAGGACTGCGTGCTGATGATCTGTCCTGGGAAGATGATGGGCCCATGGCTTGTTTATGCCTCTTTACTGAATGGAGCTTCCATGGCTCTTTATAATGGCTCCCTGAATAGTTCAGGCTTTGCAAAGTTTGTACAG
Tissues root
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TAGAGTTGTGGAAGCTAAGGCCCCTATGACAATTGTGATCCCTGTAAGGGGATCAACACCAATAAAAGGACTGCGTGCTGATGATCTGTCCTGGGAAGATTTTCTTGCAAAAGTTAACCATGCCAAGTAAGTTTGCTACATTCTGATCATGGTTTCCTTTTTTTGGTAAAATGGCCGGTGGCTGCACGTGGAATGACTGGTGTATCTGCAAATTTTTGTCACATTGGATATGCCGTTACTGCCTAAATTGTGGAGCAGTCGCCAAAATTTTCCAGTGCAGCACGTTCATAATGTGTGGTGTGCAAACTCCAGAAAATTTCTGGGTAGTTAGCTTGGAAATAATTTACACTACCTCTCAGAAATACATGTTTCTTGAATTAAGTATGTATTACTATATTATGCAATAATGTGACAAAATTGCAGGGCTGATAATTATACCGCTGTTGAGCAACCTGCCTATGCCTTCACCAATATCTTGTTTTCGTCAGGGACTACAGGTGAGCACTAGTCTAGATAACATGTCTGTTTTGTGACTTTTGTGTGCTCTACCTTAACCATTCACAAATATTTGTTGTAATATTGTGCATCACAATCATGTCATAGTAGATCCTCCTTATGATTATGAGTTCCAATATTGTTCAAAATCTGATAGTTGTCATATTCAGGGGAGCCAAAAGCAATTCCATGGACACACTTAACACCTCTGAAGTCAGCTGCTGATGGATGGTGTCACATGGATATTCGCAGAGGTGATGTTGTTGCATGGCCTACTAACCTCGGTTGGATGATGGGCCCATGGCTTGTTTATGCCTCTTTACTGAATGGAGCTTCCATGGCTCTTTATAATGGCTCCCTGAATAGTTCAGGCTTTGCAAAGTTTGTACAG