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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038973
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:11850536-11864467[+/+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GAAAACTGGGATCGTATCTCGGAGGCATTTTCAGGAAGTTCCCTCATATCGGATTTCATAAGATCTATTGTTACACTGGTATTACTCATCTGCATTCTCTATTTGCTTATCTTGCTTGTCAGGTGCGCAATCAAGATGCATATCTTGTCCTTCGAAGTGTTATTATTGACGCACGTGAAACTGCATGGTCCTGGTTGAAG
Tissues root/anther, seed, pistil
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GAAAACTGGGATCGTATCTCGGAGGCATTTTCAGGAAGTTCCCTCATATCGGATTTCATAAGATCTATTGTTACACTGGTATTACTCATCTGCATTCTCTGTTCAATTCCGCACGAGTTATCTCTCATCATGCCATTTGCTGAAACATGCTGCTTCTTTGTTTGCCGGTAGTTCACCTCGAAAGAGAAGGAAGCAGAGATCTCCCAGTTCTTCGCGACCCGCACTAAGCCCGGGTACGAGAGGACACTGAAGCAGAGCCTCGAGAGGGTGCTGATCAACGCCAGGTGGATCGAAGGCATCAGGGGTGAAGCTAAGCTTGCTCAGACTGTCCATGAGCTTCTTCACAAACCCTGATCTGTATCCGGTGTGATCCCTCCCCCCCGGGAGCTGCATTCCCTGCTATGAAGTGCCAACTTTAGGCGAAGCATTTGTCGTAGCAGCAGCATCCCAGCACATTGTTGCTCTCTGTTTATAAGTCATGAAGCATAGGCTGCATACGAGGCAAAGGGATATATAGTGCTTACCGTTTCTCTTCATAGGTTGTGTACAGCTTGTGCCCAGGAGCCATGCATATGATTCAAGAGTTGTCGCACAATTCTACTGTAGCTTTGAAGTGTCCGAGTGAATAAGATTTTACCTTTCAGCATTCTGTATCAGACCGAGCTCAACTATTTGTCGGGCGATTGTTCTCCTTGGCCATGATAACTTAGGCTGTGTTCTTCTCCCCCATTTTCCCAACCCACCTCTCGTTTTCCGCGCGCACGTTTTTCAAACTGCTAAACGGTGTGATTTATGTAAAAACTTTCTATATGAAAGTTGTTTAAAAAAACCATATTAATCTATTTTTTTTAAAAAAATACTTAATACTTAATTAATCATGCAATAAAACGAACTTCGTTTTGCGTACCGAACACGGCCTAAGTCAGATTTGCATGAACTAGCGGACTGATCACAAAGCGGTTAGTACCTCCAGGAAAAAAAATCGTGATAATTTAAGAGAGCTCTCCCCTTTCCCCTGTTTTTTTTTTCATTTCATTCTTAAAATAACCAAGCACGGTAAAAACGTACTCCATCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTTCCACATTCATATTGATGTATGTCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGAAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGATGGAGTATCTTGTTTGTCACTTTATCATGCTATAAACAGAAAACAAGAAACCATTACAAGCAGTCTTAATTCTTAAACCCTCAATCTCCAAAATGGAACTGAAAACCTCCTGTTTAAATAATGAAACCGAGCAGAAAGATGAATATTCCTTGCTCATTAGTCATTATTAAAAGGGCACCTACTCCTCAATTTCTATTCTTTGTTATCCATATAAAACTTATCTGTAACAAACCCGAGAACGACAAGGGCTGATGCATCGTCACGTACACAAATTGGGCTCTACAAATTTCTTGGCTCCGTCACCGTGTCCGTATCATTAGAAATCTTACATAAATACTCGCTCCATTTTAAAAATATATTACATCATTGATTTTTTTATAACATATGATTGTTCATCTTACTAAAAGAATTATATAAATATTATTTATTTTGTTGTGACTTGTTTTATCATAAAATAAAATATAATCTTAACTTATACTTGTACATATTTATAATAAATTTTTGAATAACACGAATGATACGAAAAGTCAACGATGTACGAGGGAGGTCCTAGTATGTGTGTGTATCATTCTTTTAAAAAAAAACTCACTCATGTCTGAGAGACGCTCAATGATTATGATCATCCGGATATATGATCGAACCTTCCGATTACTGCTTGTTTAGGATATCATCATGGACTCGTCGGATCAAACCTCCCCTGAACAAATTCGGCCGGCCGGCGGCTAATGCCGGTCAAAAAATTATTATTTCTTCTTACCACTATTCGACTCGCCGCCGGCAATCACCGTCATTTTTTTTTGGTTCTTGCGACGTCAGCCATTAGCTACTTGGGCCTTCGCAAGTTCATACCGATCCAGATATATGGCTGCGTTTAGTTCCCTTCGAACTTCCAAAAATTCCACCACATCAAATATTTTGACATATATATGAAGCATTAACTGTGGACGAAAAAAAATTAATTACTCAGTTTGCATGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAATTACGTCATGATTTGACAATATGGTGCTACAGTAAACATTTGCTAATGACAGATTAATTAGGCTTAATAGATTCATCTCACAGTTTATTTTGTTATTAGTCTACGTTTAATATTTCAAATGTGTGTACGTATATTTAATTTTTATTTTTGAAAAGTAACTAAACAAGGCTATAAATAAACCCACCCCTCGCGGCTTCGCTTTTAATTTGCTCGGGTTCTTTTCGCGGCTAAATAATTTGTTCAAACCTTTTCGATCACGCGCGCGCGAATCTCAAAGCGGCGGAGGCGGAGGCGGTGATGGCGGCGGCGGCGGCGGAGTTCCGCGGGCAGGCGCGGCTGCCGCGGTTCGCGGCGCCGCGGCGGTACGAGCTCCGGCTCCGGCCGGACCTCGCCGCCTGCGTGTTCTCCGGCGAGGCGTCCGTGGCCGTCGACGTCTCCGCGCCCACCCGCTTCCTCGTCCTCAACGCCGCCGACCTCGCCGTCGACCGCGCCTCCATCCGCTTCCAGGTAAGTAGACCGACCTGACCTTCTCCTCCTCCTCCTCGCTCGCCGTCGATCGATCGATCTCGCCGTGGTTGGTTGCAGGGCTTGGCGCCGGCGGAGGTGTCGGTGTTCGAGGAGGACGAGATCCTGGTGCTGGAGTTCGCCGGGGAGCTGCCGCTCGGCGAGGGCGTGCTCGCCATGAGGTTCAACGGCACGCTCAACGATCAGATGAGGGGATTCTACAGAAGGTAAACTTTGCATTTGAAAAAAAATTCGTGGTGATCGTAGCCTCGCAGAGGCTAAATTTGCGCTTTAATCTCTTGGGAATTCTATATTTTCAAAGATAAATTGGTCTAAACCCCTCAAGGAGATGTGCCCTCGTTTGTTCAAACTTCATCCAAATAGTTGTTATAAATTCTAAATTTGTTTTGACAATGTTCATACCTTATATATGAACTAATCAAGTCAAAACTAAGTTCACATAGTACTAGCCAAATACCTGTGCTTTGCCACGAATCAAAACAAACCAATAGTGAGGTTTTTGGGACAATTTTGTACCTATAGATGATATATTGTACAGATGAATTATGATAGAATCATATATTTAGAGGGATTATCTTATAACATTAAAATACATGGTTGGTACAAAACATGATGACGTAGGTAGTAAATAAAAAAAATACTATACTTGGTAAGGTGGTTGCCTTTTTTGAGTATAAATTGCTACTATTCGTATGTGACTTGTTTTTTTCGTTTCTCAACGTGTAGATCGAATTTGAATATGATTTTTGGCGGAGTATTAGATGTTACTCTATATTTGCTAATTTGTTTTGCAAATTTTCACAACCACTTGCATTGAATTTGAGAGAAAAAAGTTATGTTAGGGGACATCCCCTCGAGAACTCATGATCATCGTTACAAATTTGAACTGATCATCAGTTGATTGATGTGGTTGGGAAGTTCTTATGAACCTGTGGACTAGGATTTACCCTCTCCAGCAATGAATAGTTGTCGCTGGATATTATTCGCATCCAAAGTTTGACCGCTCACATTTTAGCAACAAATTTATAAATATTTTCGAAATATACTATATTATGAAAGCTCGATGCATGCTAAATAAGTTCATACCCTTTTTTCATCAAAACATTGAAATTTAAAAATTAAATTATTATGGTCAAAGTTGAAACAGCAGCGGTCAACAGTGACACTTAAATGGAAACGGAGAGAGTATTTTGATGATTTCTGGGTACGACTCATGTGACCTTTTCATATGAGAAACTGCCATTTTATTGCAGTAAATATGAATACAAGGGGGAGACAAAAAACATGGCAGTGACACAGTTTGAGTCCGTGGATGCTCGACGGTGCTTCCCTTGCTGGGATGAGCCTTCTTTCAAGGTTAATTAATTATTACGGTAGCAAAACCTGTTCACCAATCAGAATTTTCTCATCCAGAGGTTTGATGCACTATGTGTTAGAACATCGCCGGATCTATCTCTCTAATGTTTCCCCTCTTCATATTTAAAATTTCAGGCGAAGTTCAAGTTAACACTTGAAGTTCCATCTGAGCTGGTAGCTTTGTCGAACATGCCTATAGTTAATGAGAAAATTGCTGGTCCTATCAAGACTGTCGAGTATGAGGAATCACCCGTTATGTCAACTTATTTAGTGGCAATAGTTGTTGGTTTGTTTGATTATATAGAAGGTGTAACATCGGAAGGTACGTACCAGTAATCCAGCATACTTCATAGTTTCTCACATTGAAGTAGTTCTGTAGGTGCCATTCTTTTCCTTTTACTTTCCATTGTTTTTTTTATTGTTTTTAATTGTATTCAGGCAACAAAGTTCGTGTGTACACTCAAGTTGGTAAGAGTAATCAAGGGAAGTTTGCATTAGATGTTGGAGTGAAGTCATTGAATCTCTATAAAGAGTATGCGCGCGACCTATCATTTCTTCTAAATTGGTTTCTAAAGAAAAAAAATGATTCATGTTAATATATATCCTATTTACCCAAGGTTGTTGCTTGAAAGAGTCATTGACCAAAATTTCATTCTTTGAATGCTGTAGATTCTTTGATACCCCTTATCCACTACCTAAGTTGGATATGGTTGCTATCCCCGATTTTACAAATGGAGCCATGGAGAACTATGGATTGGTCACTTACCGGGAAATATATTTGCTTTTTGATGAGCAGTCTTCATCAGCATCCACCAAACAGAATGTATATATCATAACACTGAGAATATTCAGCTACATGTTTTTTTTTCATTATTTACAGTTCAGTTCTTAAACAGTGATGCATTACTTATAGTTCAGTTCTTA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