Search result

BaseInfo

ncRNA ID	osa_circ_038964
Species	Oryza sativa
Class	circRNA
Genome position	9:11845071-11854918[+/+]
Reference genome	RGAPv7
Source	PlantcircBase
Method	find_circ
Type	exonic
Splice junction sequence	GTGTAACATCGGAAGGTAACCATCTTTATTCTCGTCCCAGTAATTCAACATTGTTGATGGTTCATAGTTTCTCACATTGAAGGTGCTTTAGGAGCCATTTAAAATTGCTGGTCCTATCAAGACTGTCGAGTATGAGGAATCACCCGTTATGTCAACTTATTTAGTGGCAATAGTTGTTGGTTTGTTTGATTATATAGAAG
Tissues	root
Exon boundary	No-No
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	GTGTAACATCGGAAGGTAACCATCTTTATTCTCGTCCCAGTAATTCAACATTGTTGATGGTTCATAGTTTCTCACATTGAAGGTGCTTTAGGAGCCATTTTTTCCCTTTTACATTCCATTTCATTAGTGTGTTTAATTGTGTTCAGGCAACAAAGTCCGTGTGTACACTCAAGTTGGTAAGAGTAGTCAAGGGAAGTTTGCACTAGATATTGGAGTGAAGTCATTGAATTTCTACAAAGAGTATGATCACAACCTGTACCTGTATTGCTTTCTAATTAGTTTCTAAACAACTATAATAATTCAGCTAATGCATATTCTATGTGCCCAAGGTTGTTGCTTGAATTAAATCATTAACCAATAGTTCATTCCTTCTGTGCTCTAGCTACTTTGATACTCCATATCCACTCCCTAAGTTGGACATGGTTGCTATTCCTGATTTCGCTGCTGGGGCCATGGAGAACTATGGATTGGTCACTTACCGGGAAGTTTCTTTGCTTTTTGATGAGCAGTCTTCATCAGCATCTTTCAAACAGAATGTATATATCATAACTCAGATTCTTTTTAGTTACATATTTCATCATTTATGGTTCACTTTGTAAATAGTGATGCATTATTATTTATTAGACATTTTCTTTGGGACGTCCAAATTCCTTCAGTGTAAGCAACTGTTCTTTTTAGGTTGCAATTACCGTGGCACATGAACTGGCTCATCAATGGTTTGGTAATCTTGTAACCATGGAATGGTGGACTCACTTGTGGCTAAACGAGGGTTTTGCTACATGGGTAATCAATTATACAACACTGAATTTTAGAAATTTAATATCAGGATACTACTGTATACTGAATGGTTGGACCTTTTATTTCGACAGATGAGCCATTTGTCAGTAGATTCTTTTTTCCCTCAATGGAATATCTGGACACAGTTTCTTGATAGTACAACCTCTGCTCTCAAATTGGATTCACAAGCTGAGTCCCATCCTATTGAGGTAATAGCTGTTTGATACATGCCATGGTCTGGTACTCTGGTTCAATGGTTCAAAACATTGATGCATTTCTTATGGTGTACACCAAATTTGTCTAAAACCGTAAATGCTATGCATTATATCGCTGTAGAAAGTAGAGAATATATTGTTGTGCAAATTTTGACCATGATAAGTGACGCTGATGCATAATATGCTGGTTACATTCTTAAATATCCACTAGCTAATTCACTGTTGAATCTTGACTTTTCTATGTGGTAATAAGATGGAAATGTTAATTTTGAGGTCAAATTAATAAGTGCACCAATACAATTACACTTCAGCTGGTGGCACTTTAACATTTTGTTTCAATGCTGACTAGTGATTTGTTTCAATATTTGTTGCTGTTTACTCAGGTTGAAATACACCATGCCAGTGAGGTAGATGAGATTTTCGATGCCATTAGCTATGACAAGGGTGCTTCTGTTATTCGTATGCTACAAAGTTACCTAGGTGCAGAGCGTTTTCAGGTTTCATACTGGCTCTCCTTGAAATTCTTCAGAATCGTGTTATTCTTATCTGTAGTGAGCACCTTTTGCTCAACTGTATTGCTTAGAAGCGTATGAAAATTACCCCAAACCATTTTCTTTCTTTGCTCTCGGAGGAAGCATTGACCCTTTAGTCTGTCCACTATTCATTTAGTTGAAAAACGTCAAGTGGACCTTTGGATATTCCAAGTTTCCAATATTTTAAATGCGTGAATGATCCTTAGGCGATACAATTGGTGTTAATGTTCTTTTGTTAGTGATTTTGTAAGTGAAATTCTTTTTTTAAAAGCTTCCTATATTTTTTAGGGCAAATATTACCATTTCCCCCCTAATCATCTTGCTTTTGTTTAACGAGTACCCTGTTATCGATGACGAGTCAACCATTAATACTTCATTGCACGTACTTGCATGGTACTTTTGGACATATACTCAAATGATATAAAGAAGCAAGATTCAACAGATGAAAATATTAATCCTGTAGAGAGAGGCACAACTTCAATAAGGGTTTGATGGCCATCTTGTGTACTTCTCTAGGGTGGGTAACAATTTACAACCTGTAACACCATGTACAAGTTACAGGAGTTGGAGCTATCTTTGCCCTTTTTTTGTTGATCATATCATAAATATGAACAAATTGTAAACCCACTAATATGATAAAGCTCCATTTTTGTTAATTACATATTTATCGAAGGTCAATTCTTGCTTACTTCTTTATCTTGTTTCTTCATTATTGCTGTGTGACTCCACAAATTCTCCTAATGCATCCTCTTGTACTAAACTTGTGGAACTGTTACTCTTTCAGAAAGCATTAACTTCATATATAAAAAAGTATGCCTACTCAAATGCTAAAACCGAGGACTTGTGGGCTGTTCTTGAAGAGGTATCTGGTGAACCTGTCAAGGATTTGATGACTACGTGGACGAAGCAACAAGGTTATCCTGTTATCAGCGTGAAGCTTAAAGGGCACGACTTGGAACTTGAACAGGTAATAAATTATCGAAAAGAGTAGCGTCATTCCAATGTACTGCACATTCATCTACTTCTGAACCACCTATATGTAAATTCATTATGCATATGGTTTGCTTTTCCTTTCTATTTTGCCGAGGTATGATTAGTGAGGTACAATTCCTAAATTAAAATCCTGTATGAAATGTTTATGACAAATATTACATAAAAAAATTATGACAGAACTTCATCTTAGTTTAATTTTTGTGCCTGCTATTTATGAAGATGTAATTGGCTGACTAGAATTTACGTTGCCCTTTCAGTGCAAGACAAGTTCCACAAGTAGTTCCCATAATATCAAAATTTCAACGGCACACGGGTCAAATTCTGTTTTGACGCATTTCTGACGCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTGTCACAGGACCAATTTTTGTTAAATGGAACCTCTGGTGCTGGCATCTGGATTGTCCCTATAACTTTAGGATGCTGTTCACATGATAAACAGAAAAGATTATTGTTGAAACATAAACATGATAACATAAAGGCCATTGTTTCGCAATGTGATAGCCGACAGAAGGGTGGAAACTTTTGGATTAAGTTGAACATTGATGAAACAGGATTTTATAGGGTTAAATATGATGATGAGCTTACAGCTGCACTTCGAAATGCATTGCAGGCCAAGAAGCTCTCTCTAATGGACGAAATTGGTAAACACAACCTGTGGCACTATTAAATTTCTATTGCAATGTTTTTTTTCCTGGGCGCTATTGCAGCGATTAAAGGTGTTATAACACTATATTACAGGCATTGTGGACGATGCACATGCCCTTTCTATTGCCTGCAAGCAAACATTGTCATCGTTGCTCCACTTGCTGTATGCGTTCCGTGACGAGGCTGATTACAGTGTTCTTTCACACATAAATTCTGTATGTGTATTTTATGTTGAATTAAATTCCAGGATATTCAGTTATTCGTTGGCAATGATTTGTATATATCTTTTACTTTGGCTTGTCAGGTAACTTCAAGTGTTGCGAAAATATCAATTGATGCTACTCCTGACCTGGCTGGTGACATCAAGCAACTTTTTATCAAGCTTCTTCTCCCGCCTGCTAAGTATGTTTACCATGTTTGCTGCTTTTTAGTTCTCAATATATTATTTCCCATTGTATGTTCATACTATGTGTATGTTTGTTAAACATGCCTTCCTTTGTGGCCATGCATACACGATGACATAAATTTTATTTGCAGAAAATTAGGTTGGGACCCTAAAGATGGTGAAAGCCACCTGAATGCAATGCTCAGACCAATGCTTTTGGTTGCCCTTGTTCAGCTTGGGCATGATAAGACTATAAATGAGGGATTCAGGCGTTTCCAAATCTTCTTTGATGATCGCAACACTTCCCTTCTTACTCCAGATACTAGAAAGGTCCTTCTTTTACCCCTACTTTACATGGTCCTCTTTCTTTTTTGACTCATCTGTATCTTTTTTTACAAAAATGAATTGATATCTGTATATCTTCTATTTGAAGACGAATTCATCTCTGTATATTTTGCATTTTTTTTTCAGGCTGCATACCTCTCTGTGATGCATAATGTTAGTAGCACAAACAGATCTGGTTATGATGCTCTTCTAAAGGTCTACAGGAAATCAGCTGAAGGGGAGGAAAAGTTACGTGTCTTAGGTTGATATCTTCTCAGCCATCTTGTGTTAACAATGCTTGCTGATATTTTGGGTTATCCAGACTTCCTGAGGGCTCTGTCTCCTTATCTGTAGGCACACTTTCTTCTTGCCAGGATAAGGATATTGTTCTTGAATCATTGAATTTAATTTTCACAGATGAGGTAAATTGCTAAATGGTTTTTTTCTTCCATGACTCCATTGGAAGGACCTGATTGAACTTATACTTTTACATTAGCTACCTGTAAGTTATATACAGGTCTCATTTGTTTCTCTTGCTTATAGGTTCGCAATCAAGATGCATATCGTGTGCTTGGAGGTGTCATAATAGAGGCACGTGAAACTGCATGGTCCTGGTTGAAGGTACAAAAAGTCCAGTTACCTCTATGCGTTACCGCAACATAAAATTTGTGATATCTGGACCTTTGAAGCATGTGATTCTCCTAGGATCTTTAAATATAATGAAATATCCACTTATTGGATGTTTTTTCTGCCCTAGAAAGCATCAAAATTATGCAAATTTTCTACATTCAAAATTATAAGTAAATAGCTAAATTTCGTGCTTTCTTCAAGTAGCATTTCCTTCAAGTAATCGAATTGTGTAGATACGTCAAATGGGGGTTATATTTGTAAGAGAAAAGGACAATTATAGTTTCCTTAGCTACTTTGCTGGACTATTTTACACTATATTATTTTCATGTTACCTTACCCATTGAATCCTTCTTTTAAAGTCACTTCACTCCCTGATGATATTGTCTTTTTTTGCCTCCTTGTACAAGTCATGTTTTACAAAGAAATTTTGTAGGATGGTAGATTACCGCATATGCTATATTACTAATTATTCTCGAAAATTTCCATGACTTTTGAAAATCAGTCTTTATTGCTATGAACCTATGCAAGTAGCCTCTCCGAAGAACACTTTGAATGATAAATCAAATGGGTTACCCTTGTTTGAGAATTAGTAACTTCCACTCTTGTTTATCTTGCTTCTATCCATTTCCTTACAAAATACCCCCTTCGTCCCCAAATATAAGAGATTCACACATTCAAAATTTGTCCTCGCAAACAAGGTGTCATAGAGTCCTGCTAATCCCTCCAACCACCCGTGATTCAAATTTCTCCCCATATTGCCCCAACCACCCTCCCACTCCCTACACACCCCTCATTATTTAATGATGGGCTCATAGTATTTTTCCTCTATCCTTAATTTCTCCGAAACAACCTAGACTCCCTTATATTTGGGGACGGAGGGAGTATTAAACATGCAATGAAGTAATAGAAAATGTTGAGCTTACAAATGTTGTTTCGTTCGGATGCAGGAAAACTGGGATCGTATCTCGGAGGCATTTTCAGGAAGTTCCCTCATATCGGATTTCATAAGATCTATTGTTACACTGGTATTACTCATCTGCATTCTCTGTTCAATTCCGCACGAGTTATCTCTCATCATGCCATTTGCTGAAACATGCTGCTTCTTTGTTTGCCGGTAGTTCACCTCGAAAGAGAAGGAAGCAGAGATCTCCCAGTTCTTCGCGACCCGCACTAAGCCCGGGTACGAGAGGACACTGAAGCAGAGCCTCGAGAGGGTGCTGATCAACGCCAGGTGGATCGAAGGCATCAGGGGTGAAGCTAAGCTTGCTCAGACTGTCCATGAGCTTCTTCACAAACCCTGATCTGTATCCGGTGTGATCCCTCCCCCCCGGGAGCTGCATTCCCTGCTATGAAGTGCCAACTTTAGGCGAAGCATTTGTCGTAGCAGCAGCATCCCAGCACATTGTTGCTCTCTGTTTATAAGTCATGAAGCATAGGCTGCATACGAGGCAAAGGGATATATAGTGCTTACCGTTTCTCTTCATAGGTTGTGTACAGCTTGTGCCCAGGAGCCATGCATATGATTCAAGAGTTGTCGCACAATTCTACTGTAGCTTTGAAGTGTCCGAGTGAATAAGATTTTACCTTTCAGCATTCTGTATCAGACCGAGCTCAACTATTTGTCGGGCGATTGTTCTCCTTGGCCATGATAACTTAGGCTGTGTTCTTCTCCCCCATTTTCCCAACCCACCTCTCGTTTTCCGCGCGCACGTTTTTCAAACTGCTAAACGGTGTGATTTATGTAAAAACTTTCTATATGAAAGTTGTTTAAAAAAACCATATTAATCTATTTTTTTTAAAAAAATACTTAATACTTAATTAATCATGCAATAAAACGAACTTCGTTTTGCGTACCGAACACGGCCTAAGTCAGATTTGCATGAACTAGCGGACTGATCACAAAGCGGTTAGTACCTCCAGGAAAAAAAATCGTGATAATTTAAGAGAGCTCTCCCCTTTCCCCTGTTTTTTTTTTCATTTCATTCTTAAAATAACCAAGCACGGTAAAAACGTACTCCATCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTTCCACATTCATATTGATGTATGTCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGAAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGATGGAGTATCTTGTTTGTCACTTTATCATGCTATAAACAGAAAACAAGAAACCATTACAAGCAGTCTTAATTCTTAAACCCTCAATCTCCAAAATGGAACTGAAAACCTCCTGTTTAAATAATGAAACCGAGCAGAAAGATGAATATTCCTTGCTCATTAGTCATTATTAAAAGGGCACCTACTCCTCAATTTCTATTCTTTGTTATCCATATAAAACTTATCTGTAACAAACCCGAGAACGACAAGGGCTGATGCATCGTCACGTACACAAATTGGGCTCTACAAATTTCTTGGCTCCGTCACCGTGTCCGTATCATTAGAAATCTTACATAAATACTCGCTCCATTTTAAAAATATATTACATCATTGATTTTTTTATAACATATGATTGTTCATCTTACTAAAAGAATTATATAAATATTATTTATTTTGTTGTGACTTGTTTTATCATAAAATAAAATATAATCTTAACTTATACTTGTACATATTTATAATAAATTTTTGAATAACACGAATGATACGAAAAGTCAACGATGTACGAGGGAGGTCCTAGTATGTGTGTGTATCATTCTTTTAAAAAAAAACTCACTCATGTCTGAGAGACGCTCAATGATTATGATCATCCGGATATATGATCGAACCTTCCGATTACTGCTTGTTTAGGATATCATCATGGACTCGTCGGATCAAACCTCCCCTGAACAAATTCGGCCGGCCGGCGGCTAATGCCGGTCAAAAAATTATTATTTCTTCTTACCACTATTCGACTCGCCGCCGGCAATCACCGTCATTTTTTTTTGGTTCTTGCGACGTCAGCCATTAGCTACTTGGGCCTTCGCAAGTTCATACCGATCCAGATATATGGCTGCGTTTAGTTCCCTTCGAACTTCCAAAAATTCCACCACATCAAATATTTTGACATATATATGAAGCATTAACTGTGGACGAAAAAAAATTAATTACTCAGTTTGCATGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAATTACGTCATGATTTGACAATATGGTGCTACAGTAAACATTTGCTAATGACAGATTAATTAGGCTTAATAGATTCATCTCACAGTTTATTTTGTTATTAGTCTACGTTTAATATTTCAAATGTGTGTACGTATATTTAATTTTTATTTTTGAAAAGTAACTAAACAAGGCTATAAATAAACCCACCCCTCGCGGCTTCGCTTTTAATTTGCTCGGGTTCTTTTCGCGGCTAAATAATTTGTTCAAACCTTTTCGATCACGCGCGCGCGAATCTCAAAGCGGCGGAGGCGGAGGCGGTGATGGCGGCGGCGGCGGCGGAGTTCCGCGGGCAGGCGCGGCTGCCGCGGTTCGCGGCGCCGCGGCGGTACGAGCTCCGGCTCCGGCCGGACCTCGCCGCCTGCGTGTTCTCCGGCGAGGCGTCCGTGGCCGTCGACGTCTCCGCGCCCACCCGCTTCCTCGTCCTCAACGCCGCCGACCTCGCCGTCGACCGCGCCTCCATCCGCTTCCAGGTAAGTAGACCGACCTGACCTTCTCCTCCTCCTCCTCGCTCGCCGTCGATCGATCGATCTCGCCGTGGTTGGTTGCAGGGCTTGGCGCCGGCGGAGGTGTCGGTGTTCGAGGAGGACGAGATCCTGGTGCTGGAGTTCGCCGGGGAGCTGCCGCTCGGCGAGGGCGTGCTCGCCATGAGGTTCAACGGCACGCTCAACGATCAGATGAGGGGATTCTACAGAAGGTAAACTTTGCATTTGAAAAAAAATTCGTGGTGATCGTAGCCTCGCAGAGGCTAAATTTGCGCTTTAATCTCTTGGGAATTCTATATTTTCAAAGATAAATTGGTCTAAACCCCTCAAGGAGATGTGCCCTCGTTTGTTCAAACTTCATCCAAATAGTTGTTATAAATTCTAAATTTGTTTTGACAATGTTCATACCTTATATATGAACTAATCAAGTCAAAACTAAGTTCACATAGTACTAGCCAAATACCTGTGCTTTGCCACGAATCAAAACAAACCAATAGTGAGGTTTTTGGGACAATTTTGTACCTATAGATGATATATTGTACAGATGAATTATGATAGAATCATATATTTAGAGGGATTATCTTATAACATTAAAATACATGGTTGGTACAAAACATGATGACGTAGGTAGTAAATAAAAAAAATACTATACTTGGTAAGGTGGTTGCCTTTTTTGAGTATAAATTGCTACTATTCGTATGTGACTTGTTTTTTTCGTTTCTCAACGTGTAGATCGAATTTGAATATGATTTTTGGCGGAGTATTAGATGTTACTCTATATTTGCTAATTTGTTTTGCAAATTTTCACAACCACTTGCATTGAATTTGAGAGAAAAAAGTTATGTTAGGGGACATCCCCTCGAGAACTCATGATCATCGTTACAAATTTGAACTGATCATCAGTTGATTGATGTGGTTGGGAAGTTCTTATGAACCTGTGGACTAGGATTTACCCTCTCCAGCAATGAATAGTTGTCGCTGGATATTATTCGCATCCAAAGTTTGACCGCTCACATTTTAGCAACAAATTTATAAATATTTTCGAAATATACTATATTATGAAAGCTCGATGCATGCTAAATAAGTTCATACCCTTTTTTCATCAAAACATTGAAATTTAAAAATTAAATTATTATGGTCAAAGTTGAAACAGCAGCGGTCAACAGTGACACTTAAATGGAAACGGAGAGAGTATTTTGATGATTTCTGGGTACGACTCATGTGACCTTTTCATATGAGAAACTGCCATTTTATTGCAGTAAATATGAATACAAGGGGGAGACAAAAAACATGGCAGTGACACAGTTTGAGTCCGTGGATGCTCGACGGTGCTTCCCTTGCTGGGATGAGCCTTCTTTCAAGGTTAATTAATTATTACGGTAGCAAAACCTGTTCACCAATCAGAATTTTCTCATCCAGAGGTTTGATGCACTATGTGTTAGAACATCGCCGGATCTATCTCTCTAATGTTTCCCCTCTTCATATTTAAAATTTCAGGCGAAGTTCAAGTTAACACTTGAAGTTCCATCTGAGCTGGTAGCTTTGTCGAACATGCCTATAGTTAATGAGAAAATTGCTGGTCCTATCAAGACTGTCGAGTATGAGGAATCACCCGTTATGTCAACTTATTTAGTGGCAATAGTTGTTGGTTTGTTTGATTATATAGAAG