Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038962
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:11844148-11853237[+/+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence GGGTTGGCGCCGACGGAGGTGTCGCTGTTCGAGGACGACGAGATCCTGGTGCTGGAGTTCGACGGGGAGCTGCCGCTCGGCGAGGGCGTGCTCGCCATGGCGGCGAGGCGTCCGTGGCCGTCGACGTCTCCGCGCCCACCCGCTTCCTCGTCCTCAACGCCGCCGACCTCGCCGTCGACCGCGCCTCCATCCGCTTCCAG
Tissues root/shoot, anther, seed, pistil
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GGGTTGGCGCCGACGGAGGTGTCGCTGTTCGAGGACGACGAGATCCTGGTGCTGGAGTTCGACGGGGAGCTGCCGCTCGGCGAGGGCGTGCTCGCCATGGACTTCAACGGCACGCTCAACGATCAGATGAGGGGATTTTACCGAAGGTAATTTTTAATGCATTTAAATCACCAATGGCAGTGGCAAGTTCACAGCCTGAAAGCTGGCACTTTCGTTTGTTGAAATTTCTGCTTTATTCCGTGAACCTCTGTTGAAATGCTCGGAATCGTCAGTGCAAAATCGTGGAGTTGTAGGCAAAGGAGATAACTGATAAATATATAGTCTGATGGTCTGCCTACTTTGCACTTATATTGATTGTGATTCACAAATCAGTTGCAAGAATACTTTTCTATAGATGCTGAGGGCTTTTTATGCAAGCATGTGGTTGGAAAGTAGTTATGAATCTGTGCTTTGGGTCTATTTCGACAAGTTGTGTGTATCATCTACATTTTCATATGAGAAAATGCCATTCGTTGCAGTAAATATGAGTATAAAGGGGAGACAAAAAACATGGCGGTGACACAGTTTGAGGCTGTGGATGCTCGACGGTGCTTCCCCTGCTGGGATGAGCCTGCATTCAAGGTTAATTCTTATGATAGCACGACTTGTTCAATAATCATAATTTTCTTGTCCAGATGTTTGATGCAATATGTGTTGACATATCATATCTATTTTTTCTGTTGTTTCCCCTCTTCATATTTAATATTTTCAGGCAAAGTTCAAGTTAACACTTGAAGTTCCATCTGAGCTAGTAGCATTGTCCAACATGCCAGTAGCTTGTGAGACAATTGCTGGTCCTATCAAGACCATCCACTACGAAGAATCGCCGCTTATGTCAACTTATTTGGTGGCCATAGTTGTTGGTTTGTTTGATTATGTAGAAGGTGTAACATCGGAAGGTAACCATCTTTATTCTCGTCCCAGTAATTCAACATTGTTGATGGTTCATAGTTTCTCACATTGAAGGTGCTTTAGGAGCCATTTTTTCCCTTTTACATTCCATTTCATTAGTGTGTTTAATTGTGTTCAGGCAACAAAGTCCGTGTGTACACTCAAGTTGGTAAGAGTAGTCAAGGGAAGTTTGCACTAGATATTGGAGTGAAGTCATTGAATTTCTACAAAGAGTATGATCACAACCTGTACCTGTATTGCTTTCTAATTAGTTTCTAAACAACTATAATAATTCAGCTAATGCATATTCTATGTGCCCAAGGTTGTTGCTTGAATTAAATCATTAACCAATAGTTCATTCCTTCTGTGCTCTAGCTACTTTGATACTCCATATCCACTCCCTAAGTTGGACATGGTTGCTATTCCTGATTTCGCTGCTGGGGCCATGGAGAACTATGGATTGGTCACTTACCGGGAAGTTTCTTTGCTTTTTGATGAGCAGTCTTCATCAGCATCTTTCAAACAGAATGTATATATCATAACTCAGATTCTTTTTAGTTACATATTTCATCATTTATGGTTCACTTTGTAAATAGTGATGCATTATTATTTATTAGACATTTTCTTTGGGACGTCCAAATTCCTTCAGTGTAAGCAACTGTTCTTTTTAGGTTGCAATTACCGTGGCACATGAACTGGCTCATCAATGGTTTGGTAATCTTGTAACCATGGAATGGTGGACTCACTTGTGGCTAAACGAGGGTTTTGCTACATGGGTAATCAATTATACAACACTGAATTTTAGAAATTTAATATCAGGATACTACTGTATACTGAATGGTTGGACCTTTTATTTCGACAGATGAGCCATTTGTCAGTAGATTCTTTTTTCCCTCAATGGAATATCTGGACACAGTTTCTTGATAGTACAACCTCTGCTCTCAAATTGGATTCACAAGCTGAGTCCCATCCTATTGAGGTAATAGCTGTTTGATACATGCCATGGTCTGGTACTCTGGTTCAATGGTTCAAAACATTGATGCATTTCTTATGGTGTACACCAAATTTGTCTAAAACCGTAAATGCTATGCATTATATCGCTGTAGAAAGTAGAGAATATATTGTTGTGCAAATTTTGACCATGATAAGTGACGCTGATGCATAATATGCTGGTTACATTCTTAAATATCCACTAGCTAATTCACTGTTGAATCTTGACTTTTCTATGTGGTAATAAGATGGAAATGTTAATTTTGAGGTCAAATTAATAAGTGCACCAATACAATTACACTTCAGCTGGTGGCACTTTAACATTTTGTTTCAATGCTGACTAGTGATTTGTTTCAATATTTGTTGCTGTTTACTCAGGTTGAAATACACCATGCCAGTGAGGTAGATGAGATTTTCGATGCCATTAGCTATGACAAGGGTGCTTCTGTTATTCGTATGCTACAAAGTTACCTAGGTGCAGAGCGTTTTCAGGTTTCATACTGGCTCTCCTTGAAATTCTTCAGAATCGTGTTATTCTTATCTGTAGTGAGCACCTTTTGCTCAACTGTATTGCTTAGAAGCGTATGAAAATTACCCCAAACCATTTTCTTTCTTTGCTCTCGGAGGAAGCATTGACCCTTTAGTCTGTCCACTATTCATTTAGTTGAAAAACGTCAAGTGGACCTTTGGATATTCCAAGTTTCCAATATTTTAAATGCGTGAATGATCCTTAGGCGATACAATTGGTGTTAATGTTCTTTTGTTAGTGATTTTGTAAGTGAAATTCTTTTTTTAAAAGCTTCCTATATTTTTTAGGGCAAATATTACCATTTCCCCCCTAATCATCTTGCTTTTGTTTAACGAGTACCCTGTTATCGATGACGAGTCAACCATTAATACTTCATTGCACGTACTTGCATGGTACTTTTGGACATATACTCAAATGATATAAAGAAGCAAGATTCAACAGATGAAAATATTAATCCTGTAGAGAGAGGCACAACTTCAATAAGGGTTTGATGGCCATCTTGTGTACTTCTCTAGGGTGGGTAACAATTTACAACCTGTAACACCATGTACAAGTTACAGGAGTTGGAGCTATCTTTGCCCTTTTTTTGTTGATCATATCATAAATATGAACAAATTGTAAACCCACTAATATGATAAAGCTCCATTTTTGTTAATTACATATTTATCGAAGGTCAATTCTTGCTTACTTCTTTATCTTGTTTCTTCATTATTGCTGTGTGACTCCACAAATTCTCCTAATGCATCCTCTTGTACTAAACTTGTGGAACTGTTACTCTTTCAGAAAGCATTAACTTCATATATAAAAAAGTATGCCTACTCAAATGCTAAAACCGAGGACTTGTGGGCTGTTCTTGAAGAGGTATCTGGTGAACCTGTCAAGGATTTGATGACTACGTGGACGAAGCAACAAGGTTATCCTGTTATCAGCGTGAAGCTTAAAGGGCACGACTTGGAACTTGAACAGGTAATAAATTATCGAAAAGAGTAGCGTCATTCCAATGTACTGCACATTCATCTACTTCTGAACCACCTATATGTAAATTCATTATGCATATGGTTTGCTTTTCCTTTCTATTTTGCCGAGGTATGATTAGTGAGGTACAATTCCTAAATTAAAATCCTGTATGAAATGTTTATGACAAATATTACATAAAAAAATTATGACAGAACTTCATCTTAGTTTAATTTTTGTGCCTGCTATTTATGAAGATGTAATTGGCTGACTAGAATTTACGTTGCCCTTTCAGTGCAAGACAAGTTCCACAAGTAGTTCCCATAATATCAAAATTTCAACGGCACACGGGTCAAATTCTGTTTTGACGCATTTCTGACGCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTGTCACAGGACCAATTTTTGTTAAATGGAACCTCTGGTGCTGGCATCTGGATTGTCCCTATAACTTTAGGATGCTGTTCACATGATAAACAGAAAAGATTATTGTTGAAACATAAACATGATAACATAAAGGCCATTGTTTCGCAATGTGATAGCCGACAGAAGGGTGGAAACTTTTGGATTAAGTTGAACATTGATGAAACAGGATTTTATAGGGTTAAATATGATGATGAGCTTACAGCTGCACTTCGAAATGCATTGCAGGCCAAGAAGCTCTCTCTAATGGACGAAATTGGTAAACACAACCTGTGGCACTATTAAATTTCTATTGCAATGTTTTTTTTCCTGGGCGCTATTGCAGCGATTAAAGGTGTTATAACACTATATTACAGGCATTGTGGACGATGCACATGCCCTTTCTATTGCCTGCAAGCAAACATTGTCATCGTTGCTCCACTTGCTGTATGCGTTCCGTGACGAGGCTGATTACAGTGTTCTTTCACACATAAATTCTGTATGTGTATTTTATGTTGAATTAAATTCCAGGATATTCAGTTATTCGTTGGCAATGATTTGTATATATCTTTTACTTTGGCTTGTCAGGTAACTTCAAGTGTTGCGAAAATATCAATTGATGCTACTCCTGACCTGGCTGGTGACATCAAGCAACTTTTTATCAAGCTTCTTCTCCCGCCTGCTAAGTATGTTTACCATGTTTGCTGCTTTTTAGTTCTCAATATATTATTTCCCATTGTATGTTCATACTATGTGTATGTTTGTTAAACATGCCTTCCTTTGTGGCCATGCATACACGATGACATAAATTTTATTTGCAGAAAATTAGGTTGGGACCCTAAAGATGGTGAAAGCCACCTGAATGCAATGCTCAGACCAATGCTTTTGGTTGCCCTTGTTCAGCTTGGGCATGATAAGACTATAAATGAGGGATTCAGGCGTTTCCAAATCTTCTTTGATGATCGCAACACTTCCCTTCTTACTCCAGATACTAGAAAGGTCCTTCTTTTACCCCTACTTTACATGGTCCTCTTTCTTTTTTGACTCATCTGTATCTTTTTTTACAAAAATGAATTGATATCTGTATATCTTCTATTTGAAGACGAATTCATCTCTGTATATTTTGCATTTTTTTTTCAGGCTGCATACCTCTCTGTGATGCATAATGTTAGTAGCACAAACAGATCTGGTTATGATGCTCTTCTAAAGGTCTACAGGAAATCAGCTGAAGGGGAGGAAAAGTTACGTGTCTTAGGTTGATATCTTCTCAGCCATCTTGTGTTAACAATGCTTGCTGATATTTTGGGTTATCCAGACTTCCTGAGGGCTCTGTCTCCTTATCTGTAGGCACACTTTCTTCTTGCCAGGATAAGGATATTGTTCTTGAATCATTGAATTTAATTTTCACAGATGAGGTAAATTGCTAAATGGTTTTTTTCTTCCATGACTCCATTGGAAGGACCTGATTGAACTTATACTTTTACATTAGCTACCTGTAAGTTATATACAGGTCTCATTTGTTTCTCTTGCTTATAGGTTCGCAATCAAGATGCATATCGTGTGCTTGGAGGTGTCATAATAGAGGCACGTGAAACTGCATGGTCCTGGTTGAAGGTACAAAAAGTCCAGTTACCTCTATGCGTTACCGCAACATAAAATTTGTGATATCTGGACCTTTGAAGCATGTGATTCTCCTAGGATCTTTAAATATAATGAAATATCCACTTATTGGATGTTTTTTCTGCCCTAGAAAGCATCAAAATTATGCAAATTTTCTACATTCAAAATTATAAGTAAATAGCTAAATTTCGTGCTTTCTTCAAGTAGCATTTCCTTCAAGTAATCGAATTGTGTAGATACGTCAAATGGGGGTTATATTTGTAAGAGAAAAGGACAATTATAGTTTCCTTAGCTACTTTGCTGGACTATTTTACACTATATTATTTTCATGTTACCTTACCCATTGAATCCTTCTTTTAAAGTCACTTCACTCCCTGATGATATTGTCTTTTTTTGCCTCCTTGTACAAGTCATGTTTTACAAAGAAATTTTGTAGGATGGTAGATTACCGCATATGCTATATTACTAATTATTCTCGAAAATTTCCATGACTTTTGAAAATCAGTCTTTATTGCTATGAACCTATGCAAGTAGCCTCTCCGAAGAACACTTTGAATGATAAATCAAATGGGTTACCCTTGTTTGAGAATTAGTAACTTCCACTCTTGTTTATCTTGCTTCTATCCATTTCCTTACAAAATACCCCCTTCGTCCCCAAATATAAGAGATTCACACATTCAAAATTTGTCCTCGCAAACAAGGTGTCATAGAGTCCTGCTAATCCCTCCAACCACCCGTGATTCAAATTTCTCCCCATATTGCCCCAACCACCCTCCCACTCCCTACACACCCCTCATTATTTAATGATGGGCTCATAGTATTTTTCCTCTATCCTTAATTTCTCCGAAACAACCTAGACTCCCTTATATTTGGGGACGGAGGGAGTATTAAACATGCAATGAAGTAATAGAAAATGTTGAGCTTACAAATGTTGTTTCGTTCGGATGCAGGAAAACTGGGATCGTATCTCGGAGGCATTTTCAGGAAGTTCCCTCATATCGGATTTCATAAGATCTATTGTTACACTGGTATTACTCATCTGCATTCTCTGTTCAATTCCGCACGAGTTATCTCTCATCATGCCATTTGCTGAAACATGCTGCTTCTTTGTTTGCCGGTAGTTCACCTCGAAAGAGAAGGAAGCAGAGATCTCCCAGTTCTTCGCGACCCGCACTAAGCCCGGGTACGAGAGGACACTGAAGCAGAGCCTCGAGAGGGTGCTGATCAACGCCAGGTGGATCGAAGGCATCAGGGGTGAAGCTAAGCTTGCTCAGACTGTCCATGAGCTTCTTCACAAACCCTGATCTGTATCCGGTGTGATCCCTCCCCCCCGGGAGCTGCATTCCCTGCTATGAAGTGCCAACTTTAGGCGAAGCATTTGTCGTAGCAGCAGCATCCCAGCACATTGTTGCTCTCTGTTTATAAGTCATGAAGCATAGGCTGCATACGAGGCAAAGGGATATATAGTGCTTACCGTTTCTCTTCATAGGTTGTGTACAGCTTGTGCCCAGGAGCCATGCATATGATTCAAGAGTTGTCGCACAATTCTACTGTAGCTTTGAAGTGTCCGAGTGAATAAGATTTTACCTTTCAGCATTCTGTATCAGACCGAGCTCAACTATTTGTCGGGCGATTGTTCTCCTTGGCCATGATAACTTAGGCTGTGTTCTTCTCCCCCATTTTCCCAACCCACCTCTCGTTTTCCGCGCGCACGTTTTTCAAACTGCTAAACGGTGTGATTTATGTAAAAACTTTCTATATGAAAGTTGTTTAAAAAAACCATATTAATCTATTTTTTTTAAAAAAATACTTAATACTTAATTAATCATGCAATAAAACGAACTTCGTTTTGCGTACCGAACACGGCCTAAGTCAGATTTGCATGAACTAGCGGACTGATCACAAAGCGGTTAGTACCTCCAGGAAAAAAAATCGTGATAATTTAAGAGAGCTCTCCCCTTTCCCCTGTTTTTTTTTTCATTTCATTCTTAAAATAACCAAGCACGGTAAAAACGTACTCCATCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTTCCACATTCATATTGATGTATGTCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGAAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGATGGAGTATCTTGTTTGTCACTTTATCATGCTATAAACAGAAAACAAGAAACCATTACAAGCAGTCTTAATTCTTAAACCCTCAATCTCCAAAATGGAACTGAAAACCTCCTGTTTAAATAATGAAACCGAGCAGAAAGATGAATATTCCTTGCTCATTAGTCATTATTAAAAGGGCACCTACTCCTCAATTTCTATTCTTTGTTATCCATATAAAACTTATCTGTAACAAACCCGAGAACGACAAGGGCTGATGCATCGTCACGTACACAAATTGGGCTCTACAAATTTCTTGGCTCCGTCACCGTGTCCGTATCATTAGAAATCTTACATAAATACTCGCTCCATTTTAAAAATATATTACATCATTGATTTTTTTATAACATATGATTGTTCATCTTACTAAAAGAATTATATAAATATTATTTATTTTGTTGTGACTTGTTTTATCATAAAATAAAATATAATCTTAACTTATACTTGTACATATTTATAATAAATTTTTGAATAACACGAATGATACGAAAAGTCAACGATGTACGAGGGAGGTCCTAGTATGTGTGTGTATCATTCTTTTAAAAAAAAACTCACTCATGTCTGAGAGACGCTCAATGATTATGATCATCCGGATATATGATCGAACCTTCCGATTACTGCTTGTTTAGGATATCATCATGGACTCGTCGGATCAAACCTCCCCTGAACAAATTCGGCCGGCCGGCGGCTAATGCCGGTCAAAAAATTATTATTTCTTCTTACCACTATTCGACTCGCCGCCGGCAATCACCGTCATTTTTTTTTGGTTCTTGCGACGTCAGCCATTAGCTACTTGGGCCTTCGCAAGTTCATACCGATCCAGATATATGGCTGCGTTTAGTTCCCTTCGAACTTCCAAAAATTCCACCACATCAAATATTTTGACATATATATGAAGCATTAACTGTGGACGAAAAAAAATTAATTACTCAGTTTGCATGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAATTACGTCATGATTTGACAATATGGTGCTACAGTAAACATTTGCTAATGACAGATTAATTAGGCTTAATAGATTCATCTCACAGTTTATTTTGTTATTAGTCTACGTTTAATATTTCAAATGTGTGTACGTATATTTAATTTTTATTTTTGAAAAGTAACTAAACAAGGCTATAAATAAACCCACCCCTCGCGGCTTCGCTTTTAATTTGCTCGGGTTCTTTTCGCGGCTAAATAATTTGTTCAAACCTTTTCGATCACGCGCGCGCGAATCTCAAAGCGGCGGAGGCGGAGGCGGTGATGGCGGCGGCGGCGGCGGAGTTCCGCGGGCAGGCGCGGCTGCCGCGGTTCGCGGCGCCGCGGCGGTACGAGCTCCGGCTCCGGCCGGACCTCGCCGCCTGCGTGTTCTCCGGCGAGGCGTCCGTGGCCGTCGACGTCTCCGCGCCCACCCGCTTCCTCGTCCTCAACGCCGCCGACCTCGCCGTCGACCGCGCCTCCATCCGCTTCCAG