ncRNA ID |
osa_circ_038962 |
Species |
Oryza sativa |
Class |
circRNA |
Genome position |
9:11844148-11853237[+/+] |
Reference genome |
RGAPv7 |
Source |
PlantcircBase
|
Method |
find_circ/NA |
Type |
exonic |
Splice junction sequence |
GGGTTGGCGCCGACGGAGGTGTCGCTGTTCGAGGACGACGAGATCCTGGTGCTGGAGTTCGACGGGGAGCTGCCGCTCGGCGAGGGCGTGCTCGCCATGGCGGCGAGGCGTCCGTGGCCGTCGACGTCTCCGCGCCCACCCGCTTCCTCGTCCTCAACGCCGCCGACCTCGCCGTCGACCGCGCCTCCATCCGCTTCCAG |
Tissues |
root/shoot, anther, seed, pistil |
Exon boundary |
Yes-Yes |
Splicing signals |
AG-GT |
circRNA sequence |
NA |
Genomic sequence |
GGGTTGGCGCCGACGGAGGTGTCGCTGTTCGAGGACGACGAGATCCTGGTGCTGGAGTTCGACGGGGAGCTGCCGCTCGGCGAGGGCGTGCTCGCCATGGACTTCAACGGCACGCTCAACGATCAGATGAGGGGATTTTACCGAAGGTAATTTTTAATGCATTTAAATCACCAATGGCAGTGGCAAGTTCACAGCCTGAAAGCTGGCACTTTCGTTTGTTGAAATTTCTGCTTTATTCCGTGAACCTCTGTTGAAATGCTCGGAATCGTCAGTGCAAAATCGTGGAGTTGTAGGCAAAGGAGATAACTGATAAATATATAGTCTGATGGTCTGCCTACTTTGCACTTATATTGATTGTGATTCACAAATCAGTTGCAAGAATACTTTTCTATAGATGCTGAGGGCTTTTTATGCAAGCATGTGGTTGGAAAGTAGTTATGAATCTGTGCTTTGGGTCTATTTCGACAAGTTGTGTGTATCATCTACATTTTCATATGAGAAAATGCCATTCGTTGCAGTAAATATGAGTATAAAGGGGAGACAAAAAACATGGCGGTGACACAGTTTGAGGCTGTGGATGCTCGACGGTGCTTCCCCTGCTGGGATGAGCCTGCATTCAAGGTTAATTCTTATGATAGCACGACTTGTTCAATAATCATAATTTTCTTGTCCAGATGTTTGATGCAATATGTGTTGACATATCATATCTATTTTTTCTGTTGTTTCCCCTCTTCATATTTAATATTTTCAGGCAAAGTTCAAGTTAACACTTGAAGTTCCATCTGAGCTAGTAGCATTGTCCAACATGCCAGTAGCTTGTGAGACAATTGCTGGTCCTATCAAGACCATCCACTACGAAGAATCGCCGCTTATGTCAACTTATTTGGTGGCCATAGTTGTTGGTTTGTTTGATTATGTAGAAGGTGTAACATCGGAAGGTAACCATCTTTATTCTCGTCCCAGTAATTCAACATTGTTGATGGTTCATAGTTTCTCACATTGAAGGTGCTTTAGGAGCCATTTTTTCCCTTTTACATTCCATTTCATTAGTGTGTTTAATTGTGTTCAGGCAACAAAGTCCGTGTGTACACTCAAGTTGGTAAGAGTAGTCAAGGGAAGTTTGCACTAGATATTGGAGTGAAGTCATTGAATTTCTACAAAGAGTATGATCACAACCTGTACCTGTATTGCTTTCTAATTAGTTTCTAAACAACTATAATAATTCAGCTAATGCATATTCTATGTGCCCAAGGTTGTTGCTTGAATTAAATCATTAACCAATAGTTCATTCCTTCTGTGCTCTAGCTACTTTGATACTCCATATCCACTCCCTAAGTTGGACATGGTTGCTATTCCTGATTTCGCTGCTGGGGCCATGGAGAACTATGGATTGGTCACTTACCGGGAAGTTTCTTTGCTTTTTGATGAGCAGTCTTCATCAGCATCTTTCAAACAGAATGTATATATCATAACTCAGATTCTTTTTAGTTACATATTTCATCATTTATGGTTCACTTTGTAAATAGTGATGCATTATTATTTATTAGACATTTTCTTTGGGACGTCCAAATTCCTTCAGTGTAAGCAACTGTTCTTTTTAGGTTGCAATTACCGTGGCACATGAACTGGCTCATCAATGGTTTGGTAATCTTGTAACCATGGAATGGTGGACTCACTTGTGGCTAAACGAGGGTTTTGCTACATGGGTAATCAATTATACAACACTGAATTTTAGAAATTTAATATCAGGATACTACTGTATACTGAATGGTTGGACCTTTTATTTCGACAGATGAGCCATTTGTCAGTAGATTCTTTTTTCCCTCAATGGAATATCTGGACACAGTTTCTTGATAGTACAACCTCTGCTCTCAAATTGGATTCACAAGCTGAGTCCCATCCTATTGAGGTAATAGCTGTTTGATACATGCCATGGTCTGGTACTCTGGTTCAATGGTTCAAAACATTGATGCATTTCTTATGGTGTACACCAAATTTGTCTAAAACCGTAAATGCTATGCATTATATCGCTGTAGAAAGTAGAGAATATATTGTTGTGCAAATTTTGACCATGATAAGTGACGCTGATGCATAATATGCTGGTTACATTCTTAAATATCCACTAGCTAATTCACTGTTGAATCTTGACTTTTCTATGTGGTAATAAGATGGAAATGTTAATTTTGAGGTCAAATTAATAAGTGCACCAATACAATTACACTTCAGCTGGTGGCACTTTAACATTTTGTTTCAATGCTGACTAGTGATTTGTTTCAATATTTGTTGCTGTTTACTCAGGTTGAAATACACCATGCCAGTGAGGTAGATGAGATTTTCGATGCCATTAGCTATGACAAGGGTGCTTCTGTTATTCGTATGCTACAAAGTTACCTAGGTGCAGAGCGTTTTCAGGTTTCATACTGGCTCTCCTTGAAATTCTTCAGAATCGTGTTATTCTTATCTGTAGTGAGCACCTTTTGCTCAACTGTATTGCTTAGAAGCGTATGAAAATTACCCCAAACCATTTTCTTTCTTTGCTCTCGGAGGAAGCATTGACCCTTTAGTCTGTCCACTATTCATTTAGTTGAAAAACGTCAAGTGGACCTTTGGATATTCCAAGTTTCCAATATTTTAAATGCGTGAATGATCCTTAGGCGATACAATTGGTGTTAATGTTCTTTTGTTAGTGATTTTGTAAGTGAAATTCTTTTTTTAAAAGCTTCCTATATTTTTTAGGGCAAATATTACCATTTCCCCCCTAATCATCTTGCTTTTGTTTAACGAGTACCCTGTTATCGATGACGAGTCAACCATTAATACTTCATTGCACGTACTTGCATGGTACTTTTGGACATATACTCAAATGATATAAAGAAGCAAGATTCAACAGATGAAAATATTAATCCTGTAGAGAGAGGCACAACTTCAATAAGGGTTTGATGGCCATCTTGTGTACTTCTCTAGGGTGGGTAACAATTTACAACCTGTAACACCATGTACAAGTTACAGGAGTTGGAGCTATCTTTGCCCTTTTTTTGTTGATCATATCATAAATATGAACAAATTGTAAACCCACTAATATGATAAAGCTCCATTTTTGTTAATTACATATTTATCGAAGGTCAATTCTTGCTTACTTCTTTATCTTGTTTCTTCATTATTGCTGTGTGACTCCACAAATTCTCCTAATGCATCCTCTTGTACTAAACTTGTGGAACTGTTACTCTTTCAGAAAGCATTAACTTCATATATAAAAAAGTATGCCTACTCAAATGCTAAAACCGAGGACTTGTGGGCTGTTCTTGAAGAGGTATCTGGTGAACCTGTCAAGGATTTGATGACTACGTGGACGAAGCAACAAGGTTATCCTGTTATCAGCGTGAAGCTTAAAGGGCACGACTTGGAACTTGAACAGGTAATAAATTATCGAAAAGAGTAGCGTCATTCCAATGTACTGCACATTCATCTACTTCTGAACCACCTATATGTAAATTCATTATGCATATGGTTTGCTTTTCCTTTCTATTTTGCCGAGGTATGATTAGTGAGGTACAATTCCTAAATTAAAATCCTGTATGAAATGTTTATGACAAATATTACATAAAAAAATTATGACAGAACTTCATCTTAGTTTAATTTTTGTGCCTGCTATTTATGAAGATGTAATTGGCTGACTAGAATTTACGTTGCCCTTTCAGTGCAAGACAAGTTCCACAAGTAGTTCCCATAATATCAAAATTTCAACGGCACACGGGTCAAATTCTGTTTTGACGCATTTCTGACGCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTGTCACAGGACCAATTTTTGTTAAATGGAACCTCTGGTGCTGGCATCTGGATTGTCCCTATAACTTTAGGATGCTGTTCACATGATAAACAGAAAAGATTATTGTTGAAACATAAACATGATAACATAAAGGCCATTGTTTCGCAATGTGATAGCCGACAGAAGGGTGGAAACTTTTGGATTAAGTTGAACATTGATGAAACAGGATTTTATAGGGTTAAATATGATGATGAGCTTACAGCTGCACTTCGAAATGCATTGCAGGCCAAGAAGCTCTCTCTAATGGACGAAATTGGTAAACACAACCTGTGGCACTATTAAATTTCTATTGCAATGTTTTTTTTCCTGGGCGCTATTGCAGCGATTAAAGGTGTTATAACACTATATTACAGGCATTGTGGACGATGCACATGCCCTTTCTATTGCCTGCAAGCAAACATTGTCATCGTTGCTCCACTTGCTGTATGCGTTCCGTGACGAGGCTGATTACAGTGTTCTTTCACACATAAATTCTGTATGTGTATTTTATGTTGAATTAAATTCCAGGATATTCAGTTATTCGTTGGCAATGATTTGTATATATCTTTTACTTTGGCTTGTCAGGTAACTTCAAGTGTTGCGAAAATATCAATTGATGCTACTCCTGACCTGGCTGGTGACATCAAGCAACTTTTTATCAAGCTTCTTCTCCCGCCTGCTAAGTATGTTTACCATGTTTGCTGCTTTTTAGTTCTCAATATATTATTTCCCATTGTATGTTCATACTATGTGTATGTTTGTTAAACATGCCTTCCTTTGTGGCCATGCATACACGATGACATAAATTTTATTTGCAGAAAATTAGGTTGGGACCCTAAAGATGGTGAAAGCCACCTGAATGCAATGCTCAGACCAATGCTTTTGGTTGCCCTTGTTCAGCTTGGGCATGATAAGACTATAAATGAGGGATTCAGGCGTTTCCAAATCTTCTTTGATGATCGCAACACTTCCCTTCTTACTCCAGATACTAGAAAGGTCCTTCTTTTACCCCTACTTTACATGGTCCTCTTTCTTTTTTGACTCATCTGTATCTTTTTTTACAAAAATGAATTGATATCTGTATATCTTCTATTTGAAGACGAATTCATCTCTGTATATTTTGCATTTTTTTTTCAGGCTGCATACCTCTCTGTGATGCATAATGTTAGTAGCACAAACAGATCTGGTTATGATGCTCTTCTAAAGGTCTACAGGAAATCAGCTGAAGGGGAGGAAAAGTTACGTGTCTTAGGTTGATATCTTCTCAGCCATCTTGTGTTAACAATGCTTGCTGATATTTTGGGTTATCCAGACTTCCTGAGGGCTCTGTCTCCTTATCTGTAGGCACACTTTCTTCTTGCCAGGATAAGGATATTGTTCTTGAATCATTGAATTTAATTTTCACAGATGAGGTAAATTGCTAAATGGTTTTTTTCTTCCATGACTCCATTGGAAGGACCTGATTGAACTTATACTTTTACATTAGCTACCTGTAAGTTATATACAGGTCTCATTTGTTTCTCTTGCTTATAGGTTCGCAATCAAGATGCATATCGTGTGCTTGGAGGTGTCATAATAGAGGCACGTGAAACTGCATGGTCCTGGTTGAAGGTACAAAAAGTCCAGTTACCTCTATGCGTTACCGCAACATAAAATTTGTGATATCTGGACCTTTGAAGCATGTGATTCTCCTAGGATCTTTAAATATAATGAAATATCCACTTATTGGATGTTTTTTCTGCCCTAGAAAGCATCAAAATTATGCAAATTTTCTACATTCAAAATTATAAGTAAATAGCTAAATTTCGTGCTTTCTTCAAGTAGCATTTCCTTCAAGTAATCGAATTGTGTAGATACGTCAAATGGGGGTTATATTTGTAAGAGAAAAGGACAATTATAGTTTCCTTAGCTACTTTGCTGGACTATTTTACACTATATTATTTTCATGTTACCTTACCCATTGAATCCTTCTTTTAAAGTCACTTCACTCCCTGATGATATTGTCTTTTTTTGCCTCCTTGTACAAGTCATGTTTTACAAAGAAATTTTGTAGGATGGTAGATTACCGCATATGCTATATTACTAATTATTCTCGAAAATTTCCATGACTTTTGAAAATCAGTCTTTATTGCTATGAACCTATGCAAGTAGCCTCTCCGAAGAACACTTTGAATGATAAATCAAATGGGTTACCCTTGTTTGAGAATTAGTAACTTCCACTCTTGTTTATCTTGCTTCTATCCATTTCCTTACAAAATACCCCCTTCGTCCCCAAATATAAGAGATTCACACATTCAAAATTTGTCCTCGCAAACAAGGTGTCATAGAGTCCTGCTAATCCCTCCAACCACCCGTGATTCAAATTTCTCCCCATATTGCCCCAACCACCCTCCCACTCCCTACACACCCCTCATTATTTAATGATGGGCTCATAGTATTTTTCCTCTATCCTTAATTTCTCCGAAACAACCTAGACTCCCTTATATTTGGGGACGGAGGGAGTATTAAACATGCAATGAAGTAATAGAAAATGTTGAGCTTACAAATGTTGTTTCGTTCGGATGCAGGAAAACTGGGATCGTATCTCGGAGGCATTTTCAGGAAGTTCCCTCATATCGGATTTCATAAGATCTATTGTTACACTGGTATTACTCATCTGCATTCTCTGTTCAATTCCGCACGAGTTATCTCTCATCATGCCATTTGCTGAAACATGCTGCTTCTTTGTTTGCCGGTAGTTCACCTCGAAAGAGAAGGAAGCAGAGATCTCCCAGTTCTTCGCGACCCGCACTAAGCCCGGGTACGAGAGGACACTGAAGCAGAGCCTCGAGAGGGTGCTGATCAACGCCAGGTGGATCGAAGGCATCAGGGGTGAAGCTAAGCTTGCTCAGACTGTCCATGAGCTTCTTCACAAACCCTGATCTGTATCCGGTGTGATCCCTCCCCCCCGGGAGCTGCATTCCCTGCTATGAAGTGCCAACTTTAGGCGAAGCATTTGTCGTAGCAGCAGCATCCCAGCACATTGTTGCTCTCTGTTTATAAGTCATGAAGCATAGGCTGCATACGAGGCAAAGGGATATATAGTGCTTACCGTTTCTCTTCATAGGTTGTGTACAGCTTGTGCCCAGGAGCCATGCATATGATTCAAGAGTTGTCGCACAATTCTACTGTAGCTTTGAAGTGTCCGAGTGAATAAGATTTTACCTTTCAGCATTCTGTATCAGACCGAGCTCAACTATTTGTCGGGCGATTGTTCTCCTTGGCCATGATAACTTAGGCTGTGTTCTTCTCCCCCATTTTCCCAACCCACCTCTCGTTTTCCGCGCGCACGTTTTTCAAACTGCTAAACGGTGTGATTTATGTAAAAACTTTCTATATGAAAGTTGTTTAAAAAAACCATATTAATCTATTTTTTTTAAAAAAATACTTAATACTTAATTAATCATGCAATAAAACGAACTTCGTTTTGCGTACCGAACACGGCCTAAGTCAGATTTGCATGAACTAGCGGACTGATCACAAAGCGGTTAGTACCTCCAGGAAAAAAAATCGTGATAATTTAAGAGAGCTCTCCCCTTTCCCCTGTTTTTTTTTTCATTTCATTCTTAAAATAACCAAGCACGGTAAAAACGTACTCCATCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAGCATTTTCCACATTCATATTGATGTATGTCTAGATTCATTAACATCAATATGAATGTGGAAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGATGGAGTATCTTGTTTGTCACTTTATCATGCTATAAACAGAAAACAAGAAACCATTACAAGCAGTCTTAATTCTTAAACCCTCAATCTCCAAAATGGAACTGAAAACCTCCTGTTTAAATAATGAAACCGAGCAGAAAGATGAATATTCCTTGCTCATTAGTCATTATTAAAAGGGCACCTACTCCTCAATTTCTATTCTTTGTTATCCATATAAAACTTATCTGTAACAAACCCGAGAACGACAAGGGCTGATGCATCGTCACGTACACAAATTGGGCTCTACAAATTTCTTGGCTCCGTCACCGTGTCCGTATCATTAGAAATCTTACATAAATACTCGCTCCATTTTAAAAATATATTACATCATTGATTTTTTTATAACATATGATTGTTCATCTTACTAAAAGAATTATATAAATATTATTTATTTTGTTGTGACTTGTTTTATCATAAAATAAAATATAATCTTAACTTATACTTGTACATATTTATAATAAATTTTTGAATAACACGAATGATACGAAAAGTCAACGATGTACGAGGGAGGTCCTAGTATGTGTGTGTATCATTCTTTTAAAAAAAAACTCACTCATGTCTGAGAGACGCTCAATGATTATGATCATCCGGATATATGATCGAACCTTCCGATTACTGCTTGTTTAGGATATCATCATGGACTCGTCGGATCAAACCTCCCCTGAACAAATTCGGCCGGCCGGCGGCTAATGCCGGTCAAAAAATTATTATTTCTTCTTACCACTATTCGACTCGCCGCCGGCAATCACCGTCATTTTTTTTTGGTTCTTGCGACGTCAGCCATTAGCTACTTGGGCCTTCGCAAGTTCATACCGATCCAGATATATGGCTGCGTTTAGTTCCCTTCGAACTTCCAAAAATTCCACCACATCAAATATTTTGACATATATATGAAGCATTAACTGTGGACGAAAAAAAATTAATTACTCAGTTTGCATGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAATTACGTCATGATTTGACAATATGGTGCTACAGTAAACATTTGCTAATGACAGATTAATTAGGCTTAATAGATTCATCTCACAGTTTATTTTGTTATTAGTCTACGTTTAATATTTCAAATGTGTGTACGTATATTTAATTTTTATTTTTGAAAAGTAACTAAACAAGGCTATAAATAAACCCACCCCTCGCGGCTTCGCTTTTAATTTGCTCGGGTTCTTTTCGCGGCTAAATAATTTGTTCAAACCTTTTCGATCACGCGCGCGCGAATCTCAAAGCGGCGGAGGCGGAGGCGGTGATGGCGGCGGCGGCGGCGGAGTTCCGCGGGCAGGCGCGGCTGCCGCGGTTCGCGGCGCCGCGGCGGTACGAGCTCCGGCTCCGGCCGGACCTCGCCGCCTGCGTGTTCTCCGGCGAGGCGTCCGTGGCCGTCGACGTCTCCGCGCCCACCCGCTTCCTCGTCCTCAACGCCGCCGACCTCGCCGTCGACCGCGCCTCCATCCGCTTCCAG |