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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038936
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:11435140-11436303[-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence TACTCTCTCGTATCAGAATATAAACATCTTTAAAGTTGGATACGGTTATTAAAAAAGAGATATGTAGAATTGAATAGGGAGGGTTGTGATTGGATGAGAAAAACTAGAAGGATTAATGCATGATAATATTACTTTTTAAAATAAAAATTCCGCTGCAAACGCTCCGAAAATATATATAAGCTTGTAAAAATAAAAGAAAC
Tissues root
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence TACTCTCTCGTATCAGAATATAAACATCTTTAAAGTTGGATACGGTTATTAAAAAAGAGATATGTAGAATTGAATAGGGAGGGTTGTGATTGGATGAGAAATGAAGGTATGCGAGAAATTTGAATGATAGAGGATTATGATGGGTTGAAAAGAGAATGTTGGTGCAGAAGTTGTTATATTTTGAGATAAATCCTAGATGCTAGAAGTTATTATATTTTGGGACGGAGGGAATAAATGATACCCCTACATCCCAAATATAAGCATTAATTTTTAGAATAGTGACAGGTTAAATATTTTTAACTTGGGCTATAAATAGAAATAGAATAAAAAATAGCAATCATGTAAAATTAATGTTACTAGATTTATCATTGAACAAACTATCATAATATGCAACTTTTTTAATTTAAAATATCTTATTTATATAGATATTATTGCTCAAAGTAGCATCTCGTAGATTGTATCAATGTGTAAAAATACTTATATTTTAGGATGGAGGGAGTATATCCTTTTTTAAGATAATACTTGTAAGGGCAGTGGCTCTATAGTGGCGGAGTTACCGCCCGGTTAGCCCGGGCAGCGCTCGGGCTCGCCGGTGAAAACTTCATTAAATTTTAATATTGATGTTTAAATTGATAATGAATTTTTATAGCAAATACTCCTACTAGTATATTGAAATTTGTTCGGGCTCAAAAATATCTCTGTCTTCGCCACTGGGGTAAGGATATGCTTTGCAATTGCTTGGGGTAATAAGTGTTGTTCACTATTTTATTGATTATCCATGTAAATAGATAGGGGTTGAGAATGAAGATCAACAAGAAACCAAGTGATGATTTTTAACTAACTACTTGATTCTTTTAGTCGGTTCTTTCAGTTTATTCAGAAAACCAATCGATATTTTAAAAGAAGCTAGTGATACGGGTGAGTGGTGAATTTTGTCACCACTCCGCACCACTAACTCCTTGCTTCTTTTTGTCAAGAAAAAAAATATAGTTTGGGGGCAAAGGCCCACCAATCAGTTAAAGACTATATGTAGAAAAGAAATAAGAGATGGTATATACTGGTGTAAACTAGAAGGATTAATGCATGATAATATTACTTTTTAAAATAAAAATTCCGCTGCAAACGCTCCGAAAATATATATAAGCTTGTAAAAATAAAAGAAAC