Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038922
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:10909576-10918174[NA]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type intergenic
Splice junction sequence CTGGCCGGCGCCGCCGCCGAGGCGAGTGGAAGCTTCTCGCCGCCGCCGCCGCGGGATCGGAGAGCGTGAAACCCTAGGCGAGGAGAGAGATGGTGGGGCATTCTCTGAATGGTATTTTCCTATCAGCGCTCTGTACTTCTGGCAAGAAAGCCAGAAAGGGCCTGACAAGATGCAGTACTCGAAAACCGCCAGCCATCTTT
Tissues root/seed, pistil
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTGGCCGGCGCCGCCGCCGAGGCGAGTGGAAGCTTCTCGCCGCCGCCGCCGCGGGATCGGAGAGCGTGAAACCCTAGGCGAGGAGAGAGATGGTGGGGCAAGAGCACGAAACGGGAGGAGGGAGGGAGATAGTAGTAGCAGTTGAAGAAGAGAGGAGGTAGAATGGGTCGCTGCGGGTGGTGACCTGACGTGGCGCGCGGGGCCGGGGTCGTCCGATCCGGGACGAGCGGCGGATGGATCACGCAAAGCCGACAACGCTGGCTTCAAATCATCTATAGCTAATTAATAGTTTATTTATACAATAATTAACTATAAAAATATACTAAGCTATTAATATCCGGTCCCACCCCTCATACACACGTAACGTCTTATAATCCGTGTTACAGCCGGCTACAAATTTATAGTCCGTTTTCTTCTCTCTTTATCTTTTCTTCTCGATATGTGTTATAGCTGGCTTATAGCTTTCTATTGTACATGCTCTTAGGACATCACCAATGTATTTGGCAAAAATGATCTATATAGATGGGATCCACATAAAGAGACTATAATTATAGCGATCTCCACAATGCATATAGATACAAGGTAGTATTAAGAGATGAGAAAGAAAAAGAGATAGATATTATTATTTATTCTATATGGGTAGTCCATATGCTTACGGATACCTTTTGTTATTTTCTCCATATTGACTAGTTACACGATGGTAATATATAGCTGAATGGAATATAATATTGCCTATAGACTACTTTTGCTTCACATCGTGGATGCCCTCACGCGACCTTGGGTAACCACCTGTGTTACTTTTTTATCATGAGATAAATCGTTTCAATTAACAAAGTTTAAAATACTATGAACAGTTAGTTAAATTGTAAACAACTTTAACGTCATAATATTACTCCGTATAAGCTAATGCTGATCGGAAGGTTAAACATAATTTGCTATGTCCATAAACATAACTTGATGATGAACAGACCATCTTCCCCTGTTTAAAACAACTTACCAGTAGACAGTGCTTTGGTTGTAGCTCAACGATCCATTTGATGAGCGCTTGAGACGAAGATAGTAAATTTAATATCTGGTCTGAAAACAAACTACATACTCTCGTTTTTCGTGCGCACGTTTTTCAAATTACTAAACAGTACGTTTTTTACAAAAAGTTTATATACAAAAATTGTTTCAAAAATCATATTGATATAGCAAATACTTAATTAATTACGTGCTAATAGACCGCTCCGTTTTCTATACGTACTGTTTGGGTTGTGAACCCAAACTTACGAACAGAACCAAAGGGCCTGTTTAGATCCCTGGCAAGTTTTTTCACCATGGGGCCTGTTTAGATCCCTGACAAGTTTTTTCACCATGTCACATTGAATGTTTGGACATATGAATAAAATATTAAATATAGATTAAAAAAACTAATTACGCAGATTGCGTGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTGACAATGTGGTGCTACATTAAACATTTGCCAATGACGGATTAATTAGGATTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTATAAGCGGATTTTGTAATTTGTTTTGTTATTATATTACGTTTAATACTTCAAACGTGTGTCCATATATCCGATGTGACACGGCAAAAATTTTAACCCCATTATCTAAACACAGCATAAAACTGAAAGCTAGAGAAATTAAGAGCACGTTGAAGCTTTTCTATTGAGATGTTCTTCCTGCTGCTTCCATTTTTATTGTTACATCCAGTTTATTATGTCAACACCCCCTCCTTCTGTCTCTCTCTCTAGTGAAGCAACGTGTCTACTGGGTTAGGTTGGACATGCAGAGGACTGAAAAAAAGGTAAATGTAACCATGCTGAACTTAGCCAAAACTACCTTGATACTTCCCTGCTAATGGCAGTAGTTTCATTGATCAAGAAAAAGATACTGACTAGTAGAAAAAAAAAACTATATATACACATTCAACGTTACTTGTTAGCTGTCATTATACAGCAAGTCGTACTGTGCCAGCAGCAACCGCATTAGTAGATTTGCAGAACTAAACGGAAGTTACCCTAAAATGGAAAGTCAAGCAGAAAATAATCAAAGAAATGTGAGCATTGGACTTGCAAGTTGCAAAATATCTTCTTCCCTTACATGGAACGACATTTGAAGTAAAAAAACTACACTGTTGTAAGCTGATCGCTTGAATTTTTTTTTGGACATGTGTAATCAACCTTAGTCATCACCCATCACTGATGTTAAAATGCACAAACATTTGCATGCATGATTTATTAGTTGCAGAAGCTCATTTTCATAAATAGAATAGGAAGAGTTACCTTGCCTAGTGTCCATGCAAGCAATTTATCAAGCACCTAGTGGTCATGAGGAAGGAGCCAAGGAGGAAATTTGTGAACGGTGAGGTATGGGGAGGAGTAAGCGGTGAGGTCTTCGGCAATAAAAAAATTATTGGAGGTATGTCACGAGGGCCTTCGGCCTACCTGCCAAAACCGTCTAAACCATCAAACATTGGCTAAGTCCTAGATGGACACCAAAGGCGAAGCTGGATGATGACGACCAAGGGGTTCACCATCAGGCCTGGGCGTAGCCAGGTGACGAAGATCGAAGGGTTCGCCACCAAGCCCATCGACTGAAGATCCACCAAAGGCAAAGACCGTAAGGCGAAGCATAAGGCTGTTGTCCGAAGTAGAAGATGCCTTCGGCTAAGGGCTTGGGAGGCCCTGCGACCCATGGAGGCTTTTCACCAATGATGGGCCGGCCCAAGAAGGTCACCTTAGGGCCCATAAATACAAAAGACATTATATACCCATACTAATGTCCCTATCATAAAGGTAACTATGTAAATTCTCATGTACCAACTAAACCCTAGAGGGTATGAGCATGTACTAAGACTATATAAATAGCCCCCTGGGGCCATGGAGGATCCCAAAAATTTTTACCAATTAATATATCGCTTTATTATTCCAACAACTCATCGAGTTTACCACGTCCTTCGACGTGAAGCAGTTGTCATTCGACAACAAAAATTAATAAGCAAAACTTTTATGCCAATATCATTCACGATTTTAAAAGTCAGGGCTAGAACATAGTATGATGAAAAACCCAGAAAATGAGCTCGCTCTCAAAATTTAAATTTTCGGTAGTCCATCCAGAAGCCGGGGCAGATGTATGTAGGTCGGGCTGACCCATAGCTTCTCGAAAAACAATCCTATAGACTTTGATTTTCATATATAAATAAAAAAAGATAAATGACCTCATTTAAATATAAACTGGTAGAAATTGATTCGACATGGTTAAATTCAGAAATATAGTAAAACGGTAATTGTGTTGACACGTTTCAATCTGCGTACTCCATCGAGTTTACCCAAGAGATAGCATGCAGGAGCACATCTCATCCAAAGCATTTTCCCCGGAAGTGACAACGTTTTATGATACATAGAGTGATAGAGGCACAAACATGTACCAGTCTCTGCAAGTTTACAGGAAGCGGTTAAATAAGCAAGTGTGCTGCTCATCAACAGGGGCGGGGATAGCTCAGTTGGGAGAGCGTCAGACTGAAGATCTGAAGGTCGCGTGTTCGATCCACGCTCACCGCATTTAATTTCATAGCTTTTTAAAATTTCTGTTGAACTGTTCAATATTTAAAGTTTCGTTTGGTTGGTATCAATATTAAATTGTTTCCAAGTTTCTAAAGTTTTTTTTTCAGTTAAATTATTTTCCTAGGTTTTTTAAAAACTACTATTTAAGTTAAATTATTTTCCTAGGTTTTTTAAAATTTCTCTTCAACAGGGTTCAATATTTAAAGTTTCTTTTCATTGTAGCAATATTAAATTGTTTTCCTAAGTTTCTAAAGTTTTGTTTCTTCAGGGTCTATGGTATTTTTCAACTTCATTTTGTCTTTTAAGGACGGTTGTGTTTGAGTGTTTCTTGCTTCATATGAGTGGTAACTTGAAAAAACCGAATGCTGCATTGTAGTCACAAGGGTTGAAACTGTTACGGATAGTTTCCGTCCATCCGGACCATTTTTCGGATTCGGATAGGTTCCATCGGAACTATCTGGAAATTCTCGAATTCGGAAACGAATTCAGAATTTTTTTTCTTGGAAACGAAAACGACTATAGTAAGGGTACTATCCGTCGAAATTGAAAAAAGATCAGAAACTATCTGGAAATTTTGTTCGAATATCCGCAGACATAGATCAAATTTTAGAAAAAACATGTATATATACATAACTTTATTATACGGAGTCAGATGAAGACAAACTTTATATCAAAATTGTAGAGCTCGATAAGATCTACAATTTTCTTGTTGACTATTTTATTATTTGAGATCATTTAAGGGTCTAAATATTTATTATAAAATACCATATATGTTTTTACAAACATTTGTATTTCAAAATGTTTAAAGTATAAAATAAACACTACATGTTTTTAAGATGTGAAATAAAATAAATAACATCTCCAATTTATACAATAAGAACTTGATAAGTGATATGGTAAGTAAGATATATATGTAGTAAAAGGTCTTAGGATTAGAAAATGAATAATCATATTTATATGTGGGTCTCTTATGGGAACGGCCATAAAAAACTATTGTCACATACGGTTATGGGATCGCCTACAAAATTGATGATATAAAGGTTGAAGACGTTGATAAAAAAAACAAGGGATATCTCTTCCTTGATTAAGAAAAGGCTGCCTTAAGAAAACTCAATTTGTAGGGATTTTTATATATTGGTAGGGGTGGAAAAAAAAGCACGGGCTCATGAGCTCAGCTCAGGCTTTGGCTCGAGCTCGCTTGGTTCAGCTCGGCACTATTGCCAAACGAGCCAAGTCCAAGCCTCCTTTTCAGCTTGTTGCTAAAATGAGCTGAGCCCAAGCTATTTCGCGAGCCACTTGTTTGGCCCGTGAGCCTAGGCCATTAGGTAAATATATGGATATTTTATTTTCTAGTGGAGTTAGTATTAGTCAATATACGATTTATTATCTAGATTTCGAAGAATTGAATATATGAACTTGTTTGAATTTTACATGCTGATGATTTGTTCTTACTTTTCTTAATGATTACAAATTATATATGAAGATATGCTTTAGTGGGAAGGCTCGCAAGCTAGCTCGATCTGGCTCATGTTTTAGTTTATTTCCCTAACCGAACCGAGCCAAGCCTAGTTTGTTGCAGCTTGTTTCCACCCCCAATATACCGGCAAATATTCGAATATTGCCGCATTCGTTCCGTTTCGTATTATTCGATTTCATTTCCATATCCAGGTTTTCGATTTCGAAAAAGAAAATATGAAAACGAATATGATAAAGCAATTTCTGTCCGTTTCTGGTCCATTTTCATCCCAAGTAGCCACAGCCTTAAAGATGAGAGTGTCAATTGCCACAGCCTTAAAGATGAGAGTGGCAAATACTTAATTGACACTTGTAGGAGTGTCAGTTAGTTCTTGAAGCATCGGGAAGGCAATCGAGTTAATTCTTTTTTCAAAAAGTTTGACTTGTATGAATGTTCATTTCATGTTAATATATTCTCTATTCAACTTAATAGATCACTTTATAATCAAGCACGTCACCTTTGCTGCTAGTAGAAGAAAACAGGCATAGTTGTATGAGCCGGAAAAAGGCAAACGAGCTCGCATATTAGCCTTTAAGGTAGTTTTAACATGCAACGTTGCATGCTTACACGCTTGCTGAGTTAAACCTCTTGCCATAGCTTAAATGGTTAATACAATGTATTCAAGGGAACACGAATATAACAATTAACATTGTGAAAAAAAAAAACATGGTGCTCTTCGCACATACAAATACAATGCAAGATATTAGACTGCCAAATTTCAAAATTCTAAAGCAAAGAACAAAAGAGGAATTAGTGCATTACTCCATAATTTCTAGGAATCAGAAAGAGGGATTAGTAGAGATGATTGTCGCAAAAAAAAGGGATAATATATTCAGTTCCAAATGACTAAAACTGATCCCAAATTATGGTTACTACATAGTCGAAAAACAGAAGGCTGCGGAAGACGGATCGATGATGGCCATGGCTGTACTTGAAACAGGGCATATACCACCATACAGGCCTGAAATCACACGCAGAACCTTAAACGAGTACCTCATTTTCAAATAAGTCGGGCAACCTAAACTGACTTTAAGCTCTCCAATTACATCCATAAACAGCCGGCCAAGAAGTACTTTCATTTGAAAGAAGATCCAACTATTGGTATAACAATGTCCTCAAGCAACGGTATCAAAAACCAAAGAAACCAAGCTCGGTTGCCCTCTCTTTCTCGAATGTCTCGAAGTACTGGTAAATGATGGTAACAGCAAGCAGAATACCAGTTCCTGAACCAATCGCACCCATGAAATCAGCTAGAACAGTCAATGCACCAATGCACACTCCACCAAATGCAGCAGCAGTGGGGATGTATCTGTTCAATTCCTTCTGCAAGTTTGACTCACGATGGCCAGGCATCACCATTTGTTGTTCCTGTTATATTGGCAAAGAAATGGAGTTCATAGATGGACTTAGTAACATTTCTGTATGTAAACAAATATAGACTAATTAGATCACCTCAACACTAAATATCCCACTATATATAGATTCCCCAGTACAAAGTCGGAGTTTCTAAATATCCACTAAAAGGCTCCAGCAGTTTCAGATAAGATAATAATGGCTAAGAAACTTTGGATAAGGCCTCATGGAAAACATTGAACACCACTTGAAAAATTCATGTGCCTGAATGACTCTAATGTCTAGAGTTTCATGTATACAGAATCCAGAGCTGCACAATGGGCTAGCATACATCAAAACATGTGCAGGTGTGATATCATACATAAGACATCACCACACACGAAATGTTATGAGCTGGACTATAGGTAAACAGGAACAATAACTAGATAGAAAATATGTATCTACATCTTTACCTTCAACTGTTTAGCAACATCCTTTGCAGATGAGCCAGATACTTCAATCCATGTCTTTGAGAAGAGAGCACAAGCTGACAGCATGAATACCACATAGAACAGCGCATGGAACGGATTCGCAAGAACATCAGCCAAACTGCATGGTTTCCAAACATGAAAGGTAAGAACAAAAACAGAAACATAAAATGGAGACAAAAACAAAAAGCAAGGCCATAAGGATACAATGATGACATCAAACATAACGATTATTCACCTTGATGGAGCAGTTACATAGTAAGCGAGACCACCAACAGGAACCGAATGGCCAGAGTACTCAGATTCCTTCCATTTCCCAAGAAGGTTAACCAGAAAATTTCCACTGTACCTCCTGTAGAGAAGCTGCAACAAAATAAATATATGTTAAAACTTGCTCAGTTATCATGTTAAAACTTGCTCAGTCATGTAAATATTACTAAAGCCACTACAATTACAGCACGCACCTGTGATATGAAGTAGAGGTTGGTAATCAGTGCAGAGTGCAGAATGATGGGCATGTTTGAAGTGTAGAACAACTTAATTGGATATGAGCCTTGCTGCCCCCTAGCATTCTTTGATCTCACTGGAAGCACAACACGGAAGCCTTGGAAGTAGATGACTATGAGGAAGACCAATACAGTTGCAAGTAAATTTGTCACATTCGGAAGGTTCTGACGGTAGAAAGCTTCACGCAAGGCACGGACTTTGTCAGTTCTAGTAATCAACAAATGGAACAATGCAATGACAGCTCCTTCAAATTCAGCACCACGCCCACTGTTGATGGTTGTGGGGCTAAACGCCTTCCAGATGATATTCTCACTGTGCAACAGCAAGTTCACCAATAATAAGCTAAATTGCGACAAAATGTCACATCAGCAAGAGAAAGAAGTTTAGGATGCTTACCAGATATTGGTAGCAATAAACAATGAAATGCCAGAACCCAAACCATAGCCTTTCTGGAGAAGTTCATCAAGACAGATGACAATGATGCCAGCAAAGAAAAGCTGGAGGATGATGAGAATGGCATTCCCAGTTCCAAGTTGGCTTACACTGCCATACATTCCAGACAGCACATATGCCACAGCTTCCCCAATAGCAATCAAGATGCCCAGCAATTTTTGTGCGCCATTCCTAAGTCACATCAAAAGATTACCACCAGGAGAAAGAAAAAGAATAAGGAAGCTCTGCAATTTTCTGATGTTAGCTAAAACACTAGGTAGAAGACTGGCTAGCAGTACATGCACACTAGACTCTGAACATGTTATCCACCAATAAATAGGAGATTGTGTTATTTCTATAAATACTTACAGAAGTGCACGGTCCTCTCTCACACTGTTGTCAACTTCAATAATCTTTGATCCCACTAGAAGTTGCATTACCATTCCAGATGTCACAATTGGGGTAATACCCAGCTCCATAACAGTACCACGGTTTGAAGCAAGAATAACACGCATCCAGTAGAAAGGATCTGCTCCAGTAGTTGAGTGAATTCCATAGAGTGGTAGCTGACTGCACACCAGGAAAATGAAGAGAGAGATAACGGTATAGATCACTTTTTCTCTGAATGGTATTTTCCTATCAGCGCTCTGTACTTCTGGCAAGAAAGCCAGAAAGGGCCTGACAAGATGCAGTACTCGAAAACCGCCAGCCATCTTT