ncRNA ID |
osa_circ_038920 |
Species |
Oryza sativa |
Class |
circRNA |
Genome position |
9:10907785-10917337[-/-] |
Reference genome |
RGAPv7 |
Source |
PlantcircBase
|
Method |
find_circ/NA |
Type |
exonic |
Splice junction sequence |
CAGATATTGGTAGCAATGAACAGAGAAATGCCAGAACCCAAACCATAGCCTTTCTGGAGAAGTTCATCAAGGCAGATAACAATGATGCCAGCAAAGAAAAAATCAACAAATGGAACAATGCAATGACAGCTCCTTCAAATTCAGCACCACGCCCACTGTTGATGGTTGTGGGGCTAAACGCCTTCCAGATGATATTCTCA |
Tissues |
root/shoot, anther, seed, pistil |
Exon boundary |
Yes-No |
Splicing signals |
AC-CT |
circRNA sequence |
NA |
Genomic sequence |
CAGATATTGGTAGCAATGAACAGAGAAATGCCAGAACCCAAACCATAGCCTTTCTGGAGAAGTTCATCAAGGCAGATAACAATGATGCCAGCAAAGAAAAGTTGTAGGATGATGAGAATGGCATTGCCAGTTCCAAGTTGGCTCACACTACCATACATTCCAGACAGCACATATGCCACAGCTTCCCCAATAGCAATCAAGATACCCAGCAGCTTTTGTGCGCCATTCCTGAGTCACATCACAAGATTACCACCAGGCAAAAAAAAAAAACTTTCATTCACTAAATCACTAGGTGCAGGACAGGCTAGCAGTACATGCACATTAGACTCTGAACACATTACCACCAATATATAAGACAATATAAAATAGGATATTGCGCTATTTCTATAAATACTTACAGAAGTGCACGGTCCTCTCTCACACTGTTGTCAACTTCAATAATCTTTGATCCCACTAGAAGTTGCATTACCATTCCAGATGTCACAATTGGGGTAATACCCAGCTCCATAACAGTGCCACGGTTTGATGCAAGAATAACACGCATCCAGTAGAAAGGATCTGCTCCAGTAGTTGAATGAATTCCATAGAGTGGGAGCTGACTGCACACCAGGAAAATGAAGAGAGAGATAACGGTATAGATCACTTTTTCTCTGAATGGTATTTTCCTATCAGCACTCTGTACTTCTGGCAGGAAAGCCAGAAAGGGCCTGACAAGATGCAGTACTCGAAAACCACCAGCCATCTTTCTGTGTCCAGGAAAAGAAAACAGATCAGCCTTTGACACAATGCACATGAAAAATGTTAAAACATAATATCACCCAGTAAACTGCAAAATTTCCCAGCTTGGTGTGTTATGCAGTCAGTTATGGTTCAGATCAACAAGATGCATTTATTATCCATTTGACTGTAATTGAAGTAAACCAACCCAAATATCGTAATGCTAAAACAGGAACCCAGTATTTCAAATAAAATGAAAGTCGAATGTGAACCCTCATGCGTTTCTTTGACGAAAAATGGGCAGAAAGGAATTTAATTCACTTGCACCAAGTTTACAGCAGGACGAAATAATCACATTTACTGAGAGATGGAAAACATTTTTATTTCCTTAAGAAGATTTAATTAATTCAAATAAAAGTGGGAAAGTGAGGAGGAGCTATATAAAGAAGCTATGCCTAAGATTGCAATAGGAAGCAGGTGATTTATAAGCAGAAGAAAATTAAAGTTTGACATGTCCATCTAGCAAGAATGGTAACTTTCGCAACGCAAAAGAAAAGGAAAAAAAAGAAGGCCAATTCTCAATTCCTATCAAAATTGGTACGTTGACTTGGATTCGGAGTCAAATTTAGCATATATCTACACCTAATCTGCATTCATTTATTATTATCATCATTATTATTATTTTTTCCTTCAAACCAAAGCATGTCAGCGAAACAAAAACTTGTCCCAGAATCCAAGCACAAATCCCCGCCAACCAACCAAAGCATCGCTCTCGATCACAATACTTAACTAGCATCGATCCGATACCCGCCGGCTAATCACAACTACCAACGAACACACCAACCCAACCCTGGATCTGGACGCCCCACCTATCCACCAAAAACCACCCGCATCATAAAACGAAAAAAAAAACGCGACACGGATCAGAGACACGCCCGCGGATCCAAGCATGAACACAGCAGGCAGACGGGCAACACAGATCTAGAGGAAAAACGCCGCAACAAATGGACCCGCCCGATCCGACGGCGAGAAGAAGGAAGGAACAAGGGGGAGAGGGCCGAGCTGCTGCCTCACCTGGCCGGCGCCGCCGCCGAGGCGAGTGGAAGCTTCTCGCCGCCGCCGCCGCGGGATCGGAGAGCGTGAAACCCTAGGCGAGGAGAGAGATGGTGGGGCAAGAGCACGAAACGGGAGGAGGGAGGGAGATAGTAGTAGCAGTTGAAGAAGAGAGGAGGTAGAATGGGTCGCTGCGGGTGGTGACCTGACGTGGCGCGCGGGGCCGGGGTCGTCCGATCCGGGACGAGCGGCGGATGGATCACGCAAAGCCGACAACGCTGGCTTCAAATCATCTATAGCTAATTAATAGTTTATTTATACAATAATTAACTATAAAAATATACTAAGCTATTAATATCCGGTCCCACCCCTCATACACACGTAACGTCTTATAATCCGTGTTACAGCCGGCTACAAATTTATAGTCCGTTTTCTTCTCTCTTTATCTTTTCTTCTCGATATGTGTTATAGCTGGCTTATAGCTTTCTATTGTACATGCTCTTAGGACATCACCAATGTATTTGGCAAAAATGATCTATATAGATGGGATCCACATAAAGAGACTATAATTATAGCGATCTCCACAATGCATATAGATACAAGGTAGTATTAAGAGATGAGAAAGAAAAAGAGATAGATATTATTATTTATTCTATATGGGTAGTCCATATGCTTACGGATACCTTTTGTTATTTTCTCCATATTGACTAGTTACACGATGGTAATATATAGCTGAATGGAATATAATATTGCCTATAGACTACTTTTGCTTCACATCGTGGATGCCCTCACGCGACCTTGGGTAACCACCTGTGTTACTTTTTTATCATGAGATAAATCGTTTCAATTAACAAAGTTTAAAATACTATGAACAGTTAGTTAAATTGTAAACAACTTTAACGTCATAATATTACTCCGTATAAGCTAATGCTGATCGGAAGGTTAAACATAATTTGCTATGTCCATAAACATAACTTGATGATGAACAGACCATCTTCCCCTGTTTAAAACAACTTACCAGTAGACAGTGCTTTGGTTGTAGCTCAACGATCCATTTGATGAGCGCTTGAGACGAAGATAGTAAATTTAATATCTGGTCTGAAAACAAACTACATACTCTCGTTTTTCGTGCGCACGTTTTTCAAATTACTAAACAGTACGTTTTTTACAAAAAGTTTATATACAAAAATTGTTTCAAAAATCATATTGATATAGCAAATACTTAATTAATTACGTGCTAATAGACCGCTCCGTTTTCTATACGTACTGTTTGGGTTGTGAACCCAAACTTACGAACAGAACCAAAGGGCCTGTTTAGATCCCTGGCAAGTTTTTTCACCATGGGGCCTGTTTAGATCCCTGACAAGTTTTTTCACCATGTCACATTGAATGTTTGGACATATGAATAAAATATTAAATATAGATTAAAAAAACTAATTACGCAGATTGCGTGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTGACAATGTGGTGCTACATTAAACATTTGCCAATGACGGATTAATTAGGATTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTATAAGCGGATTTTGTAATTTGTTTTGTTATTATATTACGTTTAATACTTCAAACGTGTGTCCATATATCCGATGTGACACGGCAAAAATTTTAACCCCATTATCTAAACACAGCATAAAACTGAAAGCTAGAGAAATTAAGAGCACGTTGAAGCTTTTCTATTGAGATGTTCTTCCTGCTGCTTCCATTTTTATTGTTACATCCAGTTTATTATGTCAACACCCCCTCCTTCTGTCTCTCTCTCTAGTGAAGCAACGTGTCTACTGGGTTAGGTTGGACATGCAGAGGACTGAAAAAAAGGTAAATGTAACCATGCTGAACTTAGCCAAAACTACCTTGATACTTCCCTGCTAATGGCAGTAGTTTCATTGATCAAGAAAAAGATACTGACTAGTAGAAAAAAAAAACTATATATACACATTCAACGTTACTTGTTAGCTGTCATTATACAGCAAGTCGTACTGTGCCAGCAGCAACCGCATTAGTAGATTTGCAGAACTAAACGGAAGTTACCCTAAAATGGAAAGTCAAGCAGAAAATAATCAAAGAAATGTGAGCATTGGACTTGCAAGTTGCAAAATATCTTCTTCCCTTACATGGAACGACATTTGAAGTAAAAAAACTACACTGTTGTAAGCTGATCGCTTGAATTTTTTTTTGGACATGTGTAATCAACCTTAGTCATCACCCATCACTGATGTTAAAATGCACAAACATTTGCATGCATGATTTATTAGTTGCAGAAGCTCATTTTCATAAATAGAATAGGAAGAGTTACCTTGCCTAGTGTCCATGCAAGCAATTTATCAAGCACCTAGTGGTCATGAGGAAGGAGCCAAGGAGGAAATTTGTGAACGGTGAGGTATGGGGAGGAGTAAGCGGTGAGGTCTTCGGCAATAAAAAAATTATTGGAGGTATGTCACGAGGGCCTTCGGCCTACCTGCCAAAACCGTCTAAACCATCAAACATTGGCTAAGTCCTAGATGGACACCAAAGGCGAAGCTGGATGATGACGACCAAGGGGTTCACCATCAGGCCTGGGCGTAGCCAGGTGACGAAGATCGAAGGGTTCGCCACCAAGCCCATCGACTGAAGATCCACCAAAGGCAAAGACCGTAAGGCGAAGCATAAGGCTGTTGTCCGAAGTAGAAGATGCCTTCGGCTAAGGGCTTGGGAGGCCCTGCGACCCATGGAGGCTTTTCACCAATGATGGGCCGGCCCAAGAAGGTCACCTTAGGGCCCATAAATACAAAAGACATTATATACCCATACTAATGTCCCTATCATAAAGGTAACTATGTAAATTCTCATGTACCAACTAAACCCTAGAGGGTATGAGCATGTACTAAGACTATATAAATAGCCCCCTGGGGCCATGGAGGATCCCAAAAATTTTTACCAATTAATATATCGCTTTATTATTCCAACAACTCATCGAGTTTACCACGTCCTTCGACGTGAAGCAGTTGTCATTCGACAACAAAAATTAATAAGCAAAACTTTTATGCCAATATCATTCACGATTTTAAAAGTCAGGGCTAGAACATAGTATGATGAAAAACCCAGAAAATGAGCTCGCTCTCAAAATTTAAATTTTCGGTAGTCCATCCAGAAGCCGGGGCAGATGTATGTAGGTCGGGCTGACCCATAGCTTCTCGAAA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