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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038920
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:10907785-10917337[-/-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ/NA
Type exonic
Splice junction sequence CAGATATTGGTAGCAATGAACAGAGAAATGCCAGAACCCAAACCATAGCCTTTCTGGAGAAGTTCATCAAGGCAGATAACAATGATGCCAGCAAAGAAAAAATCAACAAATGGAACAATGCAATGACAGCTCCTTCAAATTCAGCACCACGCCCACTGTTGATGGTTGTGGGGCTAAACGCCTTCCAGATGATATTCTCA
Tissues root/shoot, anther, seed, pistil
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CAGATATTGGTAGCAATGAACAGAGAAATGCCAGAACCCAAACCATAGCCTTTCTGGAGAAGTTCATCAAGGCAGATAACAATGATGCCAGCAAAGAAAAGTTGTAGGATGATGAGAATGGCATTGCCAGTTCCAAGTTGGCTCACACTACCATACATTCCAGACAGCACATATGCCACAGCTTCCCCAATAGCAATCAAGATACCCAGCAGCTTTTGTGCGCCATTCCTGAGTCACATCACAAGATTACCACCAGGCAAAAAAAAAAAACTTTCATTCACTAAATCACTAGGTGCAGGACAGGCTAGCAGTACATGCACATTAGACTCTGAACACATTACCACCAATATATAAGACAATATAAAATAGGATATTGCGCTATTTCTATAAATACTTACAGAAGTGCACGGTCCTCTCTCACACTGTTGTCAACTTCAATAATCTTTGATCCCACTAGAAGTTGCATTACCATTCCAGATGTCACAATTGGGGTAATACCCAGCTCCATAACAGTGCCACGGTTTGATGCAAGAATAACACGCATCCAGTAGAAAGGATCTGCTCCAGTAGTTGAATGAATTCCATAGAGTGGGAGCTGACTGCACACCAGGAAAATGAAGAGAGAGATAACGGTATAGATCACTTTTTCTCTGAATGGTATTTTCCTATCAGCACTCTGTACTTCTGGCAGGAAAGCCAGAAAGGGCCTGACAAGATGCAGTACTCGAAAACCACCAGCCATCTTTCTGTGTCCAGGAAAAGAAAACAGATCAGCCTTTGACACAATGCACATGAAAAATGTTAAAACATAATATCACCCAGTAAACTGCAAAATTTCCCAGCTTGGTGTGTTATGCAGTCAGTTATGGTTCAGATCAACAAGATGCATTTATTATCCATTTGACTGTAATTGAAGTAAACCAACCCAAATATCGTAATGCTAAAACAGGAACCCAGTATTTCAAATAAAATGAAAGTCGAATGTGAACCCTCATGCGTTTCTTTGACGAAAAATGGGCAGAAAGGAATTTAATTCACTTGCACCAAGTTTACAGCAGGACGAAATAATCACATTTACTGAGAGATGGAAAACATTTTTATTTCCTTAAGAAGATTTAATTAATTCAAATAAAAGTGGGAAAGTGAGGAGGAGCTATATAAAGAAGCTATGCCTAAGATTGCAATAGGAAGCAGGTGATTTATAAGCAGAAGAAAATTAAAGTTTGACATGTCCATCTAGCAAGAATGGTAACTTTCGCAACGCAAAAGAAAAGGAAAAAAAAGAAGGCCAATTCTCAATTCCTATCAAAATTGGTACGTTGACTTGGATTCGGAGTCAAATTTAGCATATATCTACACCTAATCTGCATTCATTTATTATTATCATCATTATTATTATTTTTTCCTTCAAACCAAAGCATGTCAGCGAAACAAAAACTTGTCCCAGAATCCAAGCACAAATCCCCGCCAACCAACCAAAGCATCGCTCTCGATCACAATACTTAACTAGCATCGATCCGATACCCGCCGGCTAATCACAACTACCAACGAACACACCAACCCAACCCTGGATCTGGACGCCCCACCTATCCACCAAAAACCACCCGCATCATAAAACGAAAAAAAAAACGCGACACGGATCAGAGACACGCCCGCGGATCCAAGCATGAACACAGCAGGCAGACGGGCAACACAGATCTAGAGGAAAAACGCCGCAACAAATGGACCCGCCCGATCCGACGGCGAGAAGAAGGAAGGAACAAGGGGGAGAGGGCCGAGCTGCTGCCTCACCTGGCCGGCGCCGCCGCCGAGGCGAGTGGAAGCTTCTCGCCGCCGCCGCCGCGGGATCGGAGAGCGTGAAACCCTAGGCGAGGAGAGAGATGGTGGGGCAAGAGCACGAAACGGGAGGAGGGAGGGAGATAGTAGTAGCAGTTGAAGAAGAGAGGAGGTAGAATGGGTCGCTGCGGGTGGTGACCTGACGTGGCGCGCGGGGCCGGGGTCGTCCGATCCGGGACGAGCGGCGGATGGATCACGCAAAGCCGACAACGCTGGCTTCAAATCATCTATAGCTAATTAATAGTTTATTTATACAATAATTAACTATAAAAATATACTAAGCTATTAATATCCGGTCCCACCCCTCATACACACGTAACGTCTTATAATCCGTGTTACAGCCGGCTACAAATTTATAGTCCGTTTTCTTCTCTCTTTATCTTTTCTTCTCGATATGTGTTATAGCTGGCTTATAGCTTTCTATTGTACATGCTCTTAGGACATCACCAATGTATTTGGCAAAAATGATCTATATAGATGGGATCCACATAAAGAGACTATAATTATAGCGATCTCCACAATGCATATAGATACAAGGTAGTATTAAGAGATGAGAAAGAAAAAGAGATAGATATTATTATTTATTCTATATGGGTAGTCCATATGCTTACGGATACCTTTTGTTATTTTCTCCATATTGACTAGTTACACGATGGTAATATATAGCTGAATGGAATATAATATTGCCTATAGACTACTTTTGCTTCACATCGTGGATGCCCTCACGCGACCTTGGGTAACCACCTGTGTTACTTTTTTATCATGAGATAAATCGTTTCAATTAACAAAGTTTAAAATACTATGAACAGTTAGTTAAATTGTAAACAACTTTAACGTCATAATATTACTCCGTATAAGCTAATGCTGATCGGAAGGTTAAACATAATTTGCTATGTCCATAAACATAACTTGATGATGAACAGACCATCTTCCCCTGTTTAAAACAACTTACCAGTAGACAGTGCTTTGGTTGTAGCTCAACGATCCATTTGATGAGCGCTTGAGACGAAGATAGTAAATTTAATATCTGGTCTGAAAACAAACTACATACTCTCGTTTTTCGTGCGCACGTTTTTCAAATTACTAAACAGTACGTTTTTTACAAAAAGTTTATATACAAAAATTGTTTCAAAAATCATATTGATATAGCAAATACTTAATTAATTACGTGCTAATAGACCGCTCCGTTTTCTATACGTACTGTTTGGGTTGTGAACCCAAACTTACGAACAGAACCAAAGGGCCTGTTTAGATCCCTGGCAAGTTTTTTCACCATGGGGCCTGTTTAGATCCCTGACAAGTTTTTTCACCATGTCACATTGAATGTTTGGACATATGAATAAAATATTAAATATAGATTAAAAAAACTAATTACGCAGATTGCGTGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTGACAATGTGGTGCTACATTAAACATTTGCCAATGACGGATTAATTAGGATTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTATAAGCGGATTTTGTAATTTGTTTTGTTATTATATTACGTTTAATACTTCAAACGTGTGTCCATATATCCGATGTGACACGGCAAAAATTTTAACCCCATTATCTAAACACAGCATAAAACTGAAAGCTAGAGAAATTAAGAGCACGTTGAAGCTTTTCTATTGAGATGTTCTTCCTGCTGCTTCCATTTTTATTGTTACATCCAGTTTATTATGTCAACACCCCCTCCTTCTGTCTCTCTCTCTAGTGAAGCAACGTGTCTACTGGGTTAGGTTGGACATGCAGAGGACTGAAAAAAAGGTAAATGTAACCATGCTGAACTTAGCCAAAACTACCTTGATACTTCCCTGCTAATGGCAGTAGTTTCATTGATCAAGAAAAAGATACTGACTAGTAGAAAAAAAAAACTATATATACACATTCAACGTTACTTGTTAGCTGTCATTATACAGCAAGTCGTACTGTGCCAGCAGCAACCGCATTAGTAGATTTGCAGAACTAAACGGAAGTTACCCTAAAATGGAAAGTCAAGCAGAAAATAATCAAAGAAATGTGAGCATTGGACTTGCAAGTTGCAAAATATCTTCTTCCCTTACATGGAACGACATTTGAAGTAAAAAAACTACACTGTTGTAAGCTGATCGCTTGAATTTTTTTTTGGACATGTGTAATCAACCTTAGTCATCACCCATCACTGATGTTAAAATGCACAAACATTTGCATGCATGATTTATTAGTTGCAGAAGCTCATTTTCATAAATAGAATAGGAAGAGTTACCTTGCCTAGTGTCCATGCAAGCAATTTATCAAGCACCTAGTGGTCATGAGGAAGGAGCCAAGGAGGAAATTTGTGAACGGTGAGGTATGGGGAGGAGTAAGCGGTGAGGTCTTCGGCAATAAAAAAATTATTGGAGGTATGTCACGAGGGCCTTCGGCCTACCTGCCAAAACCGTCTAAACCATCAAACATTGGCTAAGTCCTAGATGGACACCAAAGGCGAAGCTGGATGATGACGACCAAGGGGTTCACCATCAGGCCTGGGCGTAGCCAGGTGACGAAGATCGAAGGGTTCGCCACCAAGCCCATCGACTGAAGATCCACCAAAGGCAAAGACCGTAAGGCGAAGCATAAGGCTGTTGTCCGAAGTAGAAGATGCCTTCGGCTAAGGGCTTGGGAGGCCCTGCGACCCATGGAGGCTTTTCACCAATGATGGGCCGGCCCAAGAAGGTCACCTTAGGGCCCATAAATACAAAAGACATTATATACCCATACTAATGTCCCTATCATAAAGGTAACTATGTAAATTCTCATGTACCAACTAAACCCTAGAGGGTATGAGCATGTACTAAGACTATATAAATAGCCCCCTGGGGCCATGGAGGATCCCAAAAATTTTTACCAATTAATATATCGCTTTATTATTCCAACAACTCATCGAGTTTACCACGTCCTTCGACGTGAAGCAGTTGTCATTCGACAACAAAAATTAATAAGCAAAACTTTTATGCCAATATCATTCACGATTTTAAAAGTCAGGGCTAGAACATAGTATGATGAAAAACCCAGAAAATGAGCTCGCTCTCAAAATTTAAATTTTCGGTAGTCCATCCAGAAGCCGGGGCAGATGTATGTAGGTCGGGCTGACCCATAGCTTCTCGAAA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