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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038918
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:10907338-10916881[-/-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTGTGATATGAAGTAGAGGTTGGTAATCAGTGCAGAGTGCAGAATGATGGGCATGTTTGAAGTGTAGAACAACTTAATTGGATATGAGCCTTGCTGCCCCCGAGACCACCAACAGGAACCGAATGGCCAGAGTACTCAGATTCCTTCCATTTCCCAAGAAGGTTAACCAGAAAATTTCCACTGTACCTCCTGTAGAGAAG
Tissues shoot
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTGTGATATGAAGTAGAGGTTGGTAATCAGTGCAGAGTGCAGAATGATGGGCATGTTTGAAGTGTAGAACAACTTAATTGGATATGAGCCTTGCTGCCCCCTAGCATTCTTTGATCTCACTGGAAGCACAACACGGAAGCCTTGGAAGTAGATGACTATGAGGAAGACCAATACAGTTGCAAGTAAATTTGTCACATTCGGAAGGTTCTGACGGTAGAAAGCTTCACGCAAGGCACGGACTTTGTCAGTTCTAGTAATCAACAAATGGAACAATGCAATGACAGCTCCTTCAAATTCAGCACCACGCCCACTGTTGATGGTTGTGGGGCTAAACGCCTTCCAGATGATATTCTCACTGTGCAACAGCAAGTTCACCAATAATAAGCTAAATTGTAACAAAATGTCACATCAGTAAGAATGTAAGATAAAGAAATTTAAGATGCTTACCAGATATTGGTAGCAATGAACAGAGAAATGCCAGAACCCAAACCATAGCCTTTCTGGAGAAGTTCATCAAGGCAGATAACAATGATGCCAGCAAAGAAAAGTTGTAGGATGATGAGAATGGCATTGCCAGTTCCAAGTTGGCTCACACTACCATACATTCCAGACAGCACATATGCCACAGCTTCCCCAATAGCAATCAAGATACCCAGCAGCTTTTGTGCGCCATTCCTGAGTCACATCACAAGATTACCACCAGGCAAAAAAAAAAAACTTTCATTCACTAAATCACTAGGTGCAGGACAGGCTAGCAGTACATGCACATTAGACTCTGAACACATTACCACCAATATATAAGACAATATAAAATAGGATATTGCGCTATTTCTATAAATACTTACAGAAGTGCACGGTCCTCTCTCACACTGTTGTCAACTTCAATAATCTTTGATCCCACTAGAAGTTGCATTACCATTCCAGATGTCACAATTGGGGTAATACCCAGCTCCATAACAGTGCCACGGTTTGATGCAAGAATAACACGCATCCAGTAGAAAGGATCTGCTCCAGTAGTTGAATGAATTCCATAGAGTGGGAGCTGACTGCACACCAGGAAAATGAAGAGAGAGATAACGGTATAGATCACTTTTTCTCTGAATGGTATTTTCCTATCAGCACTCTGTACTTCTGGCAGGAAAGCCAGAAAGGGCCTGACAAGATGCAGTACTCGAAAACCACCAGCCATCTTTCTGTGTCCAGGAAAAGAAAACAGATCAGCCTTTGACACAATGCACATGAAAAATGTTAAAACATAATATCACCCAGTAAACTGCAAAATTTCCCAGCTTGGTGTGTTATGCAGTCAGTTATGGTTCAGATCAACAAGATGCATTTATTATCCATTTGACTGTAATTGAAGTAAACCAACCCAAATATCGTAATGCTAAAACAGGAACCCAGTATTTCAAATAAAATGAAAGTCGAATGTGAACCCTCATGCGTTTCTTTGACGAAAAATGGGCAGAAAGGAATTTAATTCACTTGCACCAAGTTTACAGCAGGACGAAATAATCACATTTACTGAGAGATGGAAAACATTTTTATTTCCTTAAGAAGATTTAATTAATTCAAATAAAAGTGGGAAAGTGAGGAGGAGCTATATAAAGAAGCTATGCCTAAGATTGCAATAGGAAGCAGGTGATTTATAAGCAGAAGAAAATTAAAGTTTGACATGTCCATCTAGCAAGAATGGTAACTTTCGCAACGCAAAAGAAAAGGAAAAAAAAGAAGGCCAATTCTCAATTCCTATCAAAATTGGTACGTTGACTTGGATTCGGAGTCAAATTTAGCATATATCTACACCTAATCTGCATTCATTTATTATTATCATCATTATTATTATTTTTTCCTTCAAACCAAAGCATGTCAGCGAAACAAAAACTTGTCCCAGAATCCAAGCACAAATCCCCGCCAACCAACCAAAGCATCGCTCTCGATCACAATACTTAACTAGCATCGATCCGATACCCGCCGGCTAATCACAACTACCAACGAACACACCAACCCAACCCTGGATCTGGACGCCCCACCTATCCACCAAAAACCACCCGCATCATAAAACGAAAAAAAAAACGCGACACGGATCAGAGACACGCCCGCGGATCCAAGCATGAACACAGCAGGCAGACGGGCAACACAGATCTAGAGGAAAAACGCCGCAACAAATGGACCCGCCCGATCCGACGGCGAGAAGAAGGAAGGAACAAGGGGGAGAGGGCCGAGCTGCTGCCTCACCTGGCCGGCGCCGCCGCCGAGGCGAGTGGAAGCTTCTCGCCGCCGCCGCCGCGGGATCGGAGAGCGTGAAACCCTAGGCGAGGAGAGAGATGGTGGGGCAAGAGCACGAAACGGGAGGAGGGAGGGAGATAGTAGTAGCAGTTGAAGAAGAGAGGAGGTAGAATGGGTCGCTGCGGGTGGTGACCTGACGTGGCGCGCGGGGCCGGGGTCGTCCGATCCGGGACGAGCGGCGGATGGATCACGCAAAGCCGACAACGCTGGCTTCAAATCATCTATAGCTAATTAATAGTTTATTTATACAATAATTAACTATAAAAATATACTAAGCTATTAATATCCGGTCCCACCCCTCATACACACGTAACGTCTTATAATCCGTGTTACAGCCGGCTACAAATTTATAGTCCGTTTTCTTCTCTCTTTATCTTTTCTTCTCGATATGTGTTATAGCTGGCTTATAGCTTTCTATTGTACATGCTCTTAGGACATCACCAATGTATTTGGCAAAAATGATCTATATAGATGGGATCCACATAAAGAGACTATAATTATAGCGATCTCCACAATGCATATAGATACAAGGTAGTATTAAGAGATGAGAAAGAAAAAGAGATAGATATTATTATTTATTCTATATGGGTAGTCCATATGCTTACGGATACCTTTTGTTATTTTCTCCATATTGACTAGTTACACGATGGTAATATATAGCTGAATGGAATATAATATTGCCTATAGACTACTTTTGCTTCACATCGTGGATGCCCTCACGCGACCTTGGGTAACCACCTGTGTTACTTTTTTATCATGAGATAAATCGTTTCAATTAACAAAGTTTAAAATACTATGAACAGTTAGTTAAATTGTAAACAACTTTAACGTCATAATATTACTCCGTATAAGCTAATGCTGATCGGAAGGTTAAACATAATTTGCTATGTCCATAAACATAACTTGATGATGAACAGACCATCTTCCCCTGTTTAAAACAACTTACCAGTAGACAGTGCTTTGGTTGTAGCTCAACGATCCATTTGATGAGCGCTTGAGACGAAGATAGTAAATTTAATATCTGGTCTGAAAACAAACTACATACTCTCGTTTTTCGTGCGCACGTTTTTCAAATTACTAAACAGTACGTTTTTTACAAAAAGTTTATATACAAAAATTGTTTCAAAAATCATATTGATATAGCAAATACTTAATTAATTACGTGCTAATAGACCGCTCCGTTTTCTATACGTACTGTTTGGGTTGTGAACCCAAACTTACGAACAGAACCAAAGGGCCTGTTTAGATCCCTGGCAAGTTTTTTCACCATGGGGCCTGTTTAGATCCCTGACAAGTTTTTTCACCATGTCACATTGAATGTTTGGACATATGAATAAAATATTAAATATAGATTAAAAAAACTAATTACGCAGATTGCGTGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTGACAATGTGGTGCTACATTAAACATTTGCCAATGACGGATTAATTAGGATTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTATAAGCGGATTTTGTAATTTGTTTTGTTATTATATTACGTTTAATACTTCAAACGTGTGTCCATATATCCGATGTGACACGGCAAAAATTTTAACCCCATTATCTAAACACAGCATAAAACTGAAAGCTAGAGAAATTAAGAGCACGTTGAAGCTTTTCTATTGAGATGTTCTTCCTGCTGCTTCCATTTTTATTGTTACATCCAGTTTATTATGTCAACACCCCCTCCTTCTGTCTCTCTCTCTAGTGAAGCAACGTGTCTACTGGGTTAGGTTGGACATGCAGAGGACTGAAAAAAAGGTAAATGTAACCATGCTGAACTTAGCCAAAACTACCTTGATACTTCCCTGCTAATGGCAGTAGTTTCATTGATCAAGAAAAAGATACTGACTAGTAGAAAAAAAAAACTATATATACACATTCAACGTTACTTGTTAGCTGTCATTATACAGCAAGTCGTACTGTGCCAGCAGCAACCGCATTAGTAGATTTGCAGAACTAAACGGAAGTTACCCTAAAATGGAAAGTCAAGCAGAAAATAATCAAAGAAATGTGAGCATTGGACTTGCAAGTTGCAAAATATCTTCTTCCCTTACATGGAACGACATTTGAAGTAAAAAAACTACACTGTTGTAAGCTGATCGCTTGAATTTTTTTTTGGACATGTGTAATCAACCTTAGTCATCACCCATCACTGATGTTAAAATGCACAAACATTTGCATGCATGATTTATTAGTTGCAGAAGCTCATTTTCATAAATAGAATAGGAAGAGTTACCTTGCCTAGTGTCCATGCAAGCAATTTATCAAGCACCTAGTGGTCATGAGGAAGGAGCCAAGGAGGAAATTTGTGAACGGTGAGGTATGGGGAGGAGTAAGCGGTGAGGTCTTCGGCAATAAAAAAATTATTGGAGGTATGTCACGAGGGCCTTCGGCCTACCTGCCAAAACCGTCTAAACCATCAAACATTGGCTAAGTCCTAGATGGACACCAAAGGCGAAGCTGGATGATGACGACCAAGGGGTTCACCATCAGGCCTGGGCGTAGCCAGGTGACGAAGATCGAAGGGTTCGCCACCAAGCCCATCGACTGAAGATCCACCAAAGGCAAAGACCGTAAGGCGAAGCATAAGGCTGTTGTCCGAAGTAGAAGATGCCTTCGGCTAAGGGCTTGGGAGGCCCTGCGACCCATGGAGGCTTTTCACCAATGATGGG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