Search result

BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038917
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:10907136-10916639[-/-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence CTTGATGGAGCAGTTACATAGTAAGCGAGACCACCAACAGGAACCGAATGGCCAGAGTACTCAGATTCCTTCCATTTCCCAAGAAGGTTAACCAGAAAATAGATACTTCAATCCATGTCTTTGAGAAGAGAGCACAAGCTGACAGCATGAATACCACATAGAACAGCGCATGGAACGGATTCGCAAGAACATCAGCCAAA
Tissues seed
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTTGATGGAGCAGTTACATAGTAAGCGAGACCACCAACAGGAACCGAATGGCCAGAGTACTCAGATTCCTTCCATTTCCCAAGAAGGTTAACCAGAAAATTTCCACTGTACCTCCTGTAGAGAAGCTGCAACAAAATAAAAACATGTTAAAAACTTGATCAGTAATGTAAATATTACTGCGGCACTACAATACCGCACGCACCTGTGATATGAAGTAGAGGTTGGTAATCAGTGCAGAGTGCAGAATGATGGGCATGTTTGAAGTGTAGAACAACTTAATTGGATATGAGCCTTGCTGCCCCCTAGCATTCTTTGATCTCACTGGAAGCACAACACGGAAGCCTTGGAAGTAGATGACTATGAGGAAGACCAATACAGTTGCAAGTAAATTTGTCACATTCGGAAGGTTCTGACGGTAGAAAGCTTCACGCAAGGCACGGACTTTGTCAGTTCTAGTAATCAACAAATGGAACAATGCAATGACAGCTCCTTCAAATTCAGCACCACGCCCACTGTTGATGGTTGTGGGGCTAAACGCCTTCCAGATGATATTCTCACTGTGCAACAGCAAGTTCACCAATAATAAGCTAAATTGTAACAAAATGTCACATCAGTAAGAATGTAAGATAAAGAAATTTAAGATGCTTACCAGATATTGGTAGCAATGAACAGAGAAATGCCAGAACCCAAACCATAGCCTTTCTGGAGAAGTTCATCAAGGCAGATAACAATGATGCCAGCAAAGAAAAGTTGTAGGATGATGAGAATGGCATTGCCAGTTCCAAGTTGGCTCACACTACCATACATTCCAGACAGCACATATGCCACAGCTTCCCCAATAGCAATCAAGATACCCAGCAGCTTTTGTGCGCCATTCCTGAGTCACATCACAAGATTACCACCAGGCAAAAAAAAAAAACTTTCATTCACTAAATCACTAGGTGCAGGACAGGCTAGCAGTACATGCACATTAGACTCTGAACACATTACCACCAATATATAAGACAATATAAAATAGGATATTGCGCTATTTCTATAAATACTTACAGAAGTGCACGGTCCTCTCTCACACTGTTGTCAACTTCAATAATCTTTGATCCCACTAGAAGTTGCATTACCATTCCAGATGTCACAATTGGGGTAATACCCAGCTCCATAACAGTGCCACGGTTTGATGCAAGAATAACACGCATCCAGTAGAAAGGATCTGCTCCAGTAGTTGAATGAATTCCATAGAGTGGGAGCTGACTGCACACCAGGAAAATGAAGAGAGAGATAACGGTATAGATCACTTTTTCTCTGAATGGTATTTTCCTATCAGCACTCTGTACTTCTGGCAGGAAAGCCAGAAAGGGCCTGACAAGATGCAGTACTCGAAAACCACCAGCCATCTTTCTGTGTCCAGGAAAAGAAAACAGATCAGCCTTTGACACAATGCACATGAAAAATGTTAAAACATAATATCACCCAGTAAACTGCAAAATTTCCCAGCTTGGTGTGTTATGCAGTCAGTTATGGTTCAGATCAACAAGATGCATTTATTATCCATTTGACTGTAATTGAAGTAAACCAACCCAAATATCGTAATGCTAAAACAGGAACCCAGTATTTCAAATAAAATGAAAGTCGAATGTGAACCCTCATGCGTTTCTTTGACGAAAAATGGGCAGAAAGGAATTTAATTCACTTGCACCAAGTTTACAGCAGGACGAAATAATCACATTTACTGAGAGATGGAAAACATTTTTATTTCCTTAAGAAGATTTAATTAATTCAAATAAAAGTGGGAAAGTGAGGAGGAGCTATATAAAGAAGCTATGCCTAAGATTGCAATAGGAAGCAGGTGATTTATAAGCAGAAGAAAATTAAAGTTTGACATGTCCATCTAGCAAGAATGGTAACTTTCGCAACGCAAAAGAAAAGGAAAAAAAAGAAGGCCAATTCTCAATTCCTATCAAAATTGGTACGTTGACTTGGATTCGGAGTCAAATTTAGCATATATCTACACCTAATCTGCATTCATTTATTATTATCATCATTATTATTATTTTTTCCTTCAAACCAAAGCATGTCAGCGAAACAAAAACTTGTCCCAGAATCCAAGCACAAATCCCCGCCAACCAACCAAAGCATCGCTCTCGATCACAATACTTAACTAGCATCGATCCGATACCCGCCGGCTAATCACAACTACCAACGAACACACCAACCCAACCCTGGATCTGGACGCCCCACCTATCCACCAAAAACCACCCGCATCATAAAACGAAAAAAAAAACGCGACACGGATCAGAGACACGCCCGCGGATCCAAGCATGAACACAGCAGGCAGACGGGCAACACAGATCTAGAGGAAAAACGCCGCAACAAATGGACCCGCCCGATCCGACGGCGAGAAGAAGGAAGGAACAAGGGGGAGAGGGCCGAGCTGCTGCCTCACCTGGCCGGCGCCGCCGCCGAGGCGAGTGGAAGCTTCTCGCCGCCGCCGCCGCGGGATCGGAGAGCGTGAAACCCTAGGCGAGGAGAGAGATGGTGGGGCAAGAGCACGAAACGGGAGGAGGGAGGGAGATAGTAGTAGCAGTTGAAGAAGAGAGGAGGTAGAATGGGTCGCTGCGGGTGGTGACCTGACGTGGCGCGCGGGGCCGGGGTCGTCCGATCCGGGACGAGCGGCGGATGGATCACGCAAAGCCGACAACGCTGGCTTCAAATCATCTATAGCTAATTAATAGTTTATTTATACAATAATTAACTATAAAAATATACTAAGCTATTAATATCCGGTCCCACCCCTCATACACACGTAACGTCTTATAATCCGTGTTACAGCCGGCTACAAATTTATAGTCCGTTTTCTTCTCTCTTTATCTTTTCTTCTCGATATGTGTTATAGCTGGCTTATAGCTTTCTATTGTACATGCTCTTAGGACATCACCAATGTATTTGGCAAAAATGATCTATATAGATGGGATCCACATAAAGAGACTATAATTATAGCGATCTCCACAATGCATATAGATACAAGGTAGTATTAAGAGATGAGAAAGAAAAAGAGATAGATATTATTATTTATTCTATATGGGTAGTCCATATGCTTACGGATACCTTTTGTTATTTTCTCCATATTGACTAGTTACACGATGGTAATATATAGCTGAATGGAATATAATATTGCCTATAGACTACTTTTGCTTCACATCGTGGATGCCCTCACGCGACCTTGGGTAACCACCTGTGTTACTTTTTTATCATGAGATAAATCGTTTCAATTAACAAAGTTTAAAATACTATGAACAGTTAGTTAAATTGTAAACAACTTTAACGTCATAATATTACTCCGTATAAGCTAATGCTGATCGGAAGGTTAAACATAATTTGCTATGTCCATAAACATAACTTGATGATGAACAGACCATCTTCCCCTGTTTAAAACAACTTACCAGTAGACAGTGCTTTGGTTGTAGCTCAACGATCCATTTGATGAGCGCTTGAGACGAAGATAGTAAATTTAATATCTGGTCTGAAAACAAACTACATACTCTCGTTTTTCGTGCGCACGTTTTTCAAATTACTAAACAGTACGTTTTTTACAAAAAGTTTATATACAAAAATTGTTTCAAAAATCATATTGATATAGCAAATACTTAATTAATTACGTGCTAATAGACCGCTCCGTTTTCTATACGTACTGTTTGGGTTGTGAACCCAAACTTACGAACAGAACCAAAGGGCCTGTTTAGATCCCTGGCAAGTTTTTTCACCATGGGGCCTGTTTAGATCCCTGACAAGTTTTTTCACCATGTCACATTGAATGTTTGGACATATGAATAAAATATTAAATATAGATTAAAAAAACTAATTACGCAGATTGCGTGTAAATTGCGAGACGAATCTTTTAAGCCTAATTGCTCCATGATTTGACAATGTGGTGCTACATTAAACATTTGCCAATGACGGATTAATTAGGATTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTATAAGCGGATTTTGTAATTTGTTTTGTTATTATATTACGTTTAATACTTCAAACGTGTGTCCATATATCCGATGTGACACGGCAAAAATTTTAACCCCATTATCTAAACACAGCATAAAACTGAAAGCTAGAGAAATTAAGAGCACGTTGAAGCTTTTCTATTGAGATGTTCTTCCTGCTGCTTCCATTTTTATTGTTACATCCAGTTTATTATGTCAACACCCCCTCCTTCTGTCTCTCTCTCTAGTGAAGCAACGTGTCTACTGGGTTAGGTTGGACATGCAGAGGACTGAAAAAAAGGTAAATGTAACCATGCTGAACTTAGCCAAAACTACCTTGATACTTCCCTGCTAATGGCAGTAGTTTCATTGATCAAGAAAAAGATACTGACTAGTAGAAAAAAAAAACTATATATACACATTCAACGTTACTTGTTAGCTGTCATTATACAGCAAGTCGTACTGTGCCAGCAGCAACCGCATTAGTAGATTTGCAGAACTAAACGGAAGTTACCCTAAAATGGAAAGTCAAGCAGAAAATAATCAAAGAAATGTGAGCATTGGACTTGCAAGTTGCAAAATATCTTCTTCCCTTACATGGAACGACATTTGAAGTAAAAAAACTACACTGTTGTAAGCTGATCGCTTGAATTTTTTTTTGGACATGTGTAATCAACCTTAGTCATCACCCATCACTGATGTTAAAATGCACAAACATTTGCATGCATGATTTATTAGTTGCAGAAGCTCATTTTCATAAATAGAATAGGAAGAGTTACCTTGCCTAGTGTCCATGCAAGCAATTTATCAAGCACCTAGTGGTCATGAGGAAGGAGCCAAGGAGGAAATTTGTGAACGGTGAGGTATGGGGAGGAGTAAGCGGTGAGGTCTTCGGCAATAAAAAAATTATTGGAGGTATGTCACGAGGGCCTTCGGCCTACCTGCCAAAACCGTCTAAACCATCAAACATTGGCTAAGTCCTAGATGGACACCAAAGGCGAAGCTGGATGATGACGACCAAGGGGTTCACCATCAGGCCTGGGCGTAGCCAGGTGACGAAGATCGAAGGGTTCGCCACCAAGCCCATCGACTGAAGATCCACCAAAGGCAAAGACCGTAAGGCGAAGCATAAGGCTGTTGTCCGAAGTAGAAGATGCCTTCGGCTAAGGGCTTGGGAGGCCCTGCGACCCATGGAGGCTTTTCACCAATGATGGGCCGGCCCAAGAAGGTCACCTTAGGGCCCATAAATACAAAAGACATTATATACCCATACTAATGTCCCTATCATAAAGGTAACTATGTAAATTCTCATGTACCAACTAAACCCTAGAGGGTATGAGCATGTACTAAGACTATATAAATAGCCCCCTGGGGCCATGGAGGATCCCAAAAATTTTTACCAATTAATATATCGCTTTATTATTCCAACAACTCATCGAGTTTACCACGTCCTTCGACGTGAAGCAGTTGTCATTCGACAACAAAAATTAATAAGCAAAACTTTTATGCCAATATCATTCACGATTTTAAAAGTCAGGGCTAGAACATAGTATGATGAAAAACCCAGAAAATGAGCTCGCTCTCAAAATTTAAATTTTCGGTAGTCCATCCAGAAGCCGGGGCAGATGTATGTAGGTCGGGCTGACCCATAGCTTCTCGAAAAACAATCCTATAGACTTTGATTTTCATATATAAATAAAAAAAGATAAATGACCTCATTTAAATATAAACTGGTAGAAATTGATTCGACATGGTTAAATTCAGAAATATAGTAAAACGGTAATTGTGTTGACACGTTTCAATCTGCGTACTCCATCGAGTTTACCCAAGAGATAGCATGCAGGAGCACATCTCATCCAAAGCATTTTCCCCGGAAGTGACAACGTTTTATGATACATAGAGTGATAGAGGCACAAACATGTACCAGTCTCTGCAAGTTTACAGGAAGCGGTTAAATAAGCAAGTGTGCTGCTCATCAACAGGGGCGGGGATAGCTCAGTTGGGAGAGCGTCAGACTGAAGATCTGAAGGTCGCGTGTTCGATCCACGCTCACCGCATTTAATTTCATAGCTTTTTAAAATTTCTGTTGAACTGTTCAATATTTAAAGTTTCGTTTGGTTGGTATCAATATTAAATTGTTTCCAAGTTTCTAAAGTTTTTTTTTCAGTTAAATTATTTTCCTAGGTTTTTTAAAAACTACTATTTAAGTTAAATTATTTTCCTAGGTTTTTTAAAATTTCTCTTCAACAGGGTTCAATATTTAAAGTTTCTTTTCATTGTAGCAATATTAAATTGTTTTCCTAAGTTTCTAAAGTTTTGTTTCTTCAGGGTCTATGGTATTTTTCAACTTCATTTTGTCTTTTAAGGACGGTTGTGTTTGAGTGTTTCTTGCTTCATATGAGTGGTAACTTGAAAAAACCGAATGCTGCATTGTAGTCACAAGGGTTGAAACTGTTACGGATAGTTTCCGTCCATCCGGACCATTTTTCGGATTCGGATAGGTTCCATCGGAACTATCTGGAAATTCTCGAATTCGGAAACGAATTCAGAATTTTTTTTCTTGGAAACGAAAACGACTATAGTAAGGGTACTATCCGTCGAAATTGAAAAAAGATCAGAAACTATCTGGAAATTTTGTTCGAATATCCGCAGACATAGATCAAATTTTAGAAAAAACATGTATATATACATAACTTTATTATACGGAGTCAGATGAAGACAAACTTTATATCAAAATTGTAGAGCTCGATAAGATCTACAATTTTCTTGTTGACTATTTTATTATTTGAGATCATTTAAGGGTCTAAATATTTATTATAAAATACCATATATGTTTTTACAAACATTTGTATTTCAAAATGTTTAAAGTATAAAATAAACACTACATGTTTTTAAGATGTGAAATAAAATAAATAACATCTCCAATTTATACAATAAGAACTTGATAAGTGATATGGTAAGTAAGATATATATGTAGTAAAAGGTCTTAGGATTAGAAAATGAATAATCATATTTATATGTGGGTCTCTTATGGGAACGGCCATAAAAAACTATTGTCACATACGGTTATGGGATCGCCTACAAAATTGATGATATAAAGGTTGAAGACGTTGATAAAAAAAACAAGGGATATCTCTTCCTTGATTAAGAAAAGGCTGCCTTAAGAAAACTCAATTTGTAGGGATTTTTATATATTGGTAGGGGTGGAAAAAAAAGCACGGGCTCATGAGCTCAGCTCAGGCTTTGGCTCGAGCTCGCTTGGTTCAGCTCGGCACTATTGCCAAACGAGCCAAGTCCAAGCCTCCTTTTCAGCTTGTTGCTAAAATGAGCTGAGCCCAAGCTATTTCGCGAGCCACTTGTTTGGCCCGTGAGCCTAGGCCATTAGGTAAATATATGGATATTTTATTTTCTAGTGGAGTTAGTATTAGTCAATATACGATTTATTATCTAGATTTCGAAGAATTGAATATATGAACTTGTTTGAATTTTACATGCTGATGATTTGTTCTTACTTTTCTTAATGATTACAAATTATATATGAAGATATGCTTTAGTGGGAAGGCTCGCAAGCTAGCTCGATCTGGCTCATGTTTTAGTTTATTTCCCTAACCGAACCGAGCCAAGCCTAGTTTGTTGCAGCTTGTTTCCACCCCCAATATACCGGCAAATATTCGAATATTGCCGCATTCGTTCCGTTTCGTATTATTCGATTTCATTTCCATATCCAGGTTTTCGATTTCGAAAAAGAAAATATGAAAACGAATATGATAAAGCAATTTCTGTCCGTTTCTGGTCCATTTTCATCCCAAGTAGCCACAGCCTTAAAGATGAGAGTGTCAATTGCCACAGCCTTAAAGATGAGAGTGGCAAATACTTAATTGACACTTGTAGGAGTGTCAGTTAGTTCTTGAAGCATCGGGAAGGCAATCGAGTTAATTCTTTTTTCAAAAAGTTTGACTTGTATGAATGTTCATTTCATGTTAATATATTCTCTATTCAACTTAATAGATCACTTTATAATCAAGCACGTCACCTTTGCTGCTAGTAGAAGAAAACAGGCATAGTTGTATGAGCCGGAAAAAGGCAAACGAGCTCGCATATTAGCCTTTAAGGTAGTTTTAACATGCAACGTTGCATGCTTACACGCTTGCTGAGTTAAACCTCTTGCCATAGCTTAAATGGTTAATACAATGTATTCAAGGGAACACGAATATAACAATTAACATTGTGAAAAAAAAAAACATGGTGCTCTTCGCACATACAAATACAATGCAAGATATTAGACTGCCAAATTTCAAAATTCTAAAGCAAAGAACAAAAGAGGAATTAGTGCATTACTCCATAATTTCTAGGAATCAGAAAGAGGGATTAGTAGAGATGATTGTCGCAAAAAAAAGGGATAATATATTCAGTTCCAAATGACTAAAACTGATCCCAAATTATGGTTACTACATAGTCGAAAAACAGAAGGCTGCGGAAGACGGATCGATGATGGCCATGGCTGTACTTGAAACAGGGCATATACCACCATACAGGCCTGAAATCACACGCAGAACCTTAAACGAGTACCTCATTTTCAAATAAGTCGGGCAACCTAAACTGACTTTAAGCTCTCCAATTACATCCATAAACAGCCGGCCAAGAAGTACTTTCATTTGAAAGAAGATCCAACTATTGGTATAACAATGTCCTCAAGCAACGGTATCAAAAACCAAAGAAACCAAGCTCGGTTGCCCTCTCTTTCTCGAATGTCTCGAAGTACTGGTAAATGATGGTAACAGCAAGCAGAATACCAGTTCCTGAACCAATCGCACCCATGAAATCAGCTAGAACAGTCAATGCACCAATGCACACTCCACCAAATGCAGCAGCAGTGGGGATGTATCTGTTCAATTCCTTCTGCAAGTTTGACTCACGATGGCCAGGCATCACCATTTGTTGTTCCTGTTATATTGGCAAAGAAATGGAGTTCATAGATGGACTTAGTAACATTTCTGTATGTAAACAAATATAGACTAATTAGATCACCTCAACACTAAATATCCCACTATATATAGATTCCCCAGTACAAAGTCGGAGTTTCTAAATATCCACTAAAAGGCTCCAGCAGTTTCAGATAAGATAATAATGGCTAAGAAACTTTGGATAAGGCCTCATGGAAAACATTGAACACCACTTGAAAAATTCATGTGCCTGAATGACTCTAATGTCTAGAGTTTCATGTATACAGAATCCAGAGCTGCACAATGGGCTAGCATACATCAAAACATGTGCAGGTGTGATATCATACATAAGACATCACCACACACGAAATGTTATGAGCTGGACTATAGGTAAACAGGAACAATAACTAGATAGAAAATATGTATCTACATCTTTACCTTCAACTGTTTAGCAACATCCTTTGCAGATGAGCCAGATACTTCAATCCATGTCTTTGAGAAGAGAGCACAAGCTGACAGCATGAATACCACATAGAACAGCGCATGGAACGGATTCGCAAGAACATCAGCCAAA