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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038798
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:7918145-7919033[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence GTAATTTCGTTATTTTGTTTTGCTAAATTCTGTAAGCCACAAGCCATCTTTAATAATCTTCTCCTGGTATTTTACTTGTTCATTGATGGTATGATAGTTGTAGTTTAATACAAGCATTTTTTAACTTACATGATATAAATTTTATCTTCTGCAAGACCTTCGACAGTTTGTACTGATGAATAATTTGCACCAGGTGCTGA
Tissues root
Exon boundary Yes-No
Splicing signals CG-TG
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTAATTTCGTTATTTTGTTTTGCTAAATTCTGTAAGCCACAAGCCATCTTTAATAATCTTCTCCTGGTATTTTACTTGTTCATTGATGGTATGATAGTTGCATCTTGATTTACAGAGGGTTGAAAAACTCACTTAAGAATATATCTTTTAAAATAAATTATAAGCATGAACTTGCAGAACTGGCCGCTCCACTATTACATATGTTCTTGTACTTGTACACAGTACTAAACTTCATATTTTCATTACCATTGAAATAAAAAGAGTAAATTTTATCAAACACCACCTATTATGGTCCAAGTTGCACAAAACCACAGGGATTTTGGCACATGACACATAACCCCATGTATTATGGCCCTAAGGTTTAACAAGACCACACCGTTAACCAATTTTACATACTCCTATATCAAAGTTTTAAAAGTTTTAGTTACATTCATGTAACATTTATATGATGGATAAAAAACTCATAAATTTGTGATGTGATTTTATAAATGATCAATAGTGTGGTTGTGTGAAACTTTATAGCTATAATACCTGGTGGTTAAGTGTCACGTGCCAAAACCCATGTGGTTTTGTGCAACTTAGACCACAACACCTAAAGGTTAAGTGAAATTTACTCAAATAAAAATGAACTCAGTTTGGATTGTACTGTCATTGTATCTTATTTGTGGATAAGAAAAATATCCATTTATTTCATTTTTTTAATTAGTTAGTATCCTGCCTGAACTTGCTAGCTAGTCTTTGTATGGTTTACAGACTATAAATCTATGAATTGGCATCCTTATCTATCATTAGTTTAATACAAGCATTTTTTAACTTACATGATATAAATTTTATCTTCTGCAAGACCTTCGACAGTTTGTACTGATGAATAATTTGCACCAGGTGCTGA