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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038797
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:7902819-7903685[-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence AGCCTACTTTTTGTACAATGACTAAAAATGGTGTAAAACAAAGAACATCACTTATAAGCTGTAAACAAATCTCATCGAAACGTATTTCGTATTTTATTTGGAGTAGATTACCCAGCTTCTTTTCACAGATTAAGCCTTTTGGGTAGAATTGTTTGGCACGTATATGTTAACAAATAAATAATTCTTGCAAGCTCTACTAC
Tissues shoot
Exon boundary No-Yes
Splicing signals TC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence AGCCTACTTTTTGTACAATGACTAAAAATGGTGTAAAACAAAGAACATCACTTATAAGCTGTAAACAAATCTCATCGAAACGTATTTCGTATTTTATTTGTCAGTAGCACACAAGAAATTGTGCTTCCTAGTTGTATATGATGGCCTGTATTGAAGTGGCTAGTATCATGCAGACAGTACAGCAGTTAGATAGTAAAAGTTCCACTAATAACTGATACGCAAATAGCAACGTAGAGTCTTAATCAAAATGGCAACACTTACAGCCAGCACATCTTTTATAAGGAAAAAAAAAAGCGATTACACCTTCCACATACCATCGAATGGTCACAATGTATTGTCTAGTGACTAGTGAATAGTGATAATTATTGTACCCAGGCACTCAGAATATGTAACATCAGATTAATCCAAGTTACAGATTAACATAAACAGTGCAGCATATTAGGCCCTGTTTGATTCAGCTTAGGATTATTATAATCTGGATTATTAGGAGTAAGCTGAAACAAACAAGTAGATTATTATGCTAGATTATTATAATCTATAAGCCAGATTACTATAATCCAATAATCTCCTCTAGAGGAGCTTTTTCCAGATTATTGAGTGGCTAAAGACCCACTACCCTCAGATGCCTCTAATAATCCAGAGAAACAAATAACTCGTAGATTATTTTATGTCAGCTTATTATAATCCAGCTTAGAGTAATCTGATTTAATAATCTAGATTACAACAATCTTAAGCTGAAACAAACAGGGCCTTAATTGTCAAGTATTGAGTAGATTACCCAGCTTCTTTTCACAGATTAAGCCTTTTGGGTAGAATTGTTTGGCACGTATATGTTAACAAATAAATAATTCTTGCAAGCTCTACTAC