Search result

BaseInfo

ncRNA ID	osa_circ_038770
Species	Oryza sativa
Class	circRNA
Genome position	9:7202309-7203528[+]
Reference genome	RGAPv7
Source	PlantcircBase
Method	SMALT and Segemehl
Type	exonic
Splice junction sequence	GGAGGATTCATATTTTGCTGGATTGCCAATTTCCATTATCGAATCATGGTACCAACGTGACGGTTATGTGAAATCAATGGCTGACTTAATTGAAAAGGAACATCTAGAAAATTTTGTACTAGTGTGTTTTATTCCTTTGCTTTACTGGTTAACACATCATTAACCTTTGTGTGCACACATGGCAGAGTCGAGTGGGGCCA
Tissues	leaf
Exon boundary	Yes-No
Splicing signals	AG-GT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	GGAGGATTCATATTTTGCTGGATTGCCAATTTCCATTATCGAATCATGGTACCAACGTGACGGTTATGTGAAATCAATGGCTGACTTAATTGAAAAGGAACTGTCAATTTTTTCCAATCCTGAAGAGGTTTGACCATTCCCTTTTCCTTCTATTTTTCTCCCTACAGTTTCCCACCTTTGGATTGCAGACTGTGAACACAATCATAGTATACCTTTTTTGGTAGAAATTTCCTTAGGGATACAGTTTGACATAGTTCTTGTATTTACCTGTGGACAAAATTCGACATTAGATACATCCTTAATCTTGTCTACAACTAATTTTCAGTATCACTGTTTATTCAATTATGTATGAGTACGTTGTGACAACCACATCAGAGAAACTAAATTATTTAATGCCAACTACTTTTAAGAAAATGCACTGTCCATTTTCAGCTAACTTTTTGTACTAGACTGTGGATATAGGGAGTATACCATGAAACTTGAACCACAAAAATGCATTTTCTGAAATGCTACATTGTAGTGCTTACCTGCCTACTGTATATTTGACTATCCAGTTATCCACTCTAGTTACGTCAATTGATGAAGGGAAATTAACACTATAATTTTGTAAATGAGTATTAATGTATGATTCAGGGTGATTCAATAGACAGTGCAAGTATCTAGTTACTTTGTTGTTTACTCAGTCTGTTATAGGTACATGTCATTTTAGAATGATACACGTAAACGTAAGTCTGACCAGAATTATACAAAAAGTTGGAAATTGAATAGATAGAATAAGTCTGATATACTAATCATGATTGCAAATTTGTAATCTTTAGGTTATGATATTCTTCAGTGCACATGGAGTACCACTTACCTATGTTACGGATGCTGGAGATCCTTACAGAGATCAGATGGAGGACTGCATTGCTTTGATCATGGGAGAGTTAAAATCCAGAGGAATCTTAAACAGCCATACTCTGGCTTACCAGGTATAAGACAAATTAATACTTATTTTTATGAGGCCATCTTGTTTAGAATGAGGAAAGCATCTTAGGATATTTCTAGGATATATAAAGTGTTCGTTTCATCTCTTTTTAAATGGCTATTTTTACTTTGAATGTATCAACTGAACTTTCACCATCTAGAAAATTTTGTACTAGTGTGTTTTATTCCTTTGCTTTACTGGTTAACACATCATTAACCTTTGTGTGCACACATGGCAGAGTCGAGTGGGGCCA