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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038717
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:6022596-6025090[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence CCTCCACATCGACGCCCGCACCGTCAAGGCCCAGATCTGGGACACCGCCGGCCAGGAAAGGTATAGCTGCCACTGCCAGCCTTTTTTTTTTTTTTTGTTTGATAATAGGTACCGAGCAGTAACAAGTGCATACTACCGTGGTGCAGTGGGAGCTATGTTAGTATATGACATAACAAAGCGTCAGTCATTTGATCATGTAG
Tissues root
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CCTCCACATCGACGCCCGCACCGTCAAGGCCCAGATCTGGGACACCGCCGGCCAGGAAAGGTATAGCTGCCACTGCCAGCCTTTTTTTTTTTTTTTGTTTCAGTTTGTTCAGCATAATGAGATGATAAATAAATAAAAAAAGTTAACCCTTGATCCAACAAGAACAACAACTGATGCTACTGTGCTGTTTTATGAGCTTAATGGTTTTTTTGGCTAAGGTAGTATGGGTAGTATGCACTCAATAGTTTCATTTCATTAATAGGAGTAGGCCATGTTCTTTCTAGTGCACTTATGCCATTTATGAAGTTAGTAGGTTACTCTCTTTGTAGTCCCTTGAAGTTAGTAGGTTACTCTCTTTGTAGTCCCTTTTTAATTGCTTAATGAGGATGTTTTTGTGGGATACATGAAGAGAAGAGGTCATGAGCTTACTAAGTTCTTGGAAGGCCTTTGTGTGCTGCTTCTGGAATCTGATTTGTCCATAATGTTCAACAAAACGAAATAGCGATACAATATTCACTTTGTCAGCTGGAGGAGCTGTATTTTGTTGTGCCCCGGCATGATGAAATGGGGACACTATCTTCTCGGAAAGAAGTTCGGAAGCTTGAATGCTAGGATTGGCTCGAGTTTTGCACCTCTTTTTTAATGAATGCTAGAGCCCCTGCCTAAAGTCCAGTGTTCATTGTTCAGATGGCTGCAGCAGCTAGAGGAGACCAGCCTAAAAAGCAACATCACGGTGTCGCCTCCAAACAAATCTTAGATTAGAAAAAAAATTTCAAAGAATCAGAATTATTGAAAGTATTGATCCACTCAGTTTGCTGCAATTAGTAATTGATGCTCAACCTGAATACATGCGCAAACCCCGATCGAATGAGAATTTTACCCCAAAAGCCAAAACCTAGCACAAATCCCCACACAGAACACATAAGAGGAGGCTTCAATGAAATGCATACTGAAATTGGAGTTCTACTATACAGATCAGATATTTACAACATGTAAGATGTTTGTTCTGCTGTACACATCAGATTGTTTTGACTTGCAAGATCATTAACAATATGTTTATATTCAGTACAGAATCATATAATTTGCACTTTCAATAAGAAATAAGATATATTGACAAGCAGCATGGCAAGCATCCTCAAAAAATTAAAGTCCTCAAAAAAGTGAAATATGTCTATTACTTGCATACATGAATATGTCCTTTTGAGCTATTATTTGCTATTAGCACCATAGCAAGGAACAATGAATATGGTGCCATACAATAACGTTGAATTGAATAATGTGCATATCCTTTGGGCCAGGGTTTCAATCCCCTTTTGGGAAGTGTTTCTTTGGACCTGATTACTTATCTAATCCCAGATAAAATTCAAAATATATTTGTAAAATTATTCTGCAATTCAAGTTTCCAATAGCACGTAACAAGAAGTGGAGTTTTTTTTTTAAAAAAATAGCTAAAATTGGCCAAAACAACTTATGAACCTCATGTTACAGAGTTACCACAGGGAACTGGCAGATTCCTGCCATTTTTTGCAGCCCTGTATGGACCATCAATATGTTCTTATCCCATGAACCAGGTGGAATAAGGGAGTAATAATTGATCAGTGTACTCAAGACAAACTCATATTTGACATCTACATCTTTTGACTTATCCCTATGTAGATATTTAACAATTCAGTTAGTGAATATTACAGTTATTTCTCGTTTTACTGAACACATGTAGTAGATGCTTGTATCGAGCAAAGCAGATGCCACATGTAAACACAACTAGATGCATTTTTCTTGAGAAAATAATAAAACATGTCAAGGTAAATATCACTTTAAACAACTTCTTAGGCAATATATTTTTCAGAGAAATTAAATATTTTACTCAAATAAAAATTATCTATATTCTTGCTGCAGTTGGTAAAACAGGATGTTATCTAGTAATACTCTCTTACTGCATACTGCTTTTACGACAAATGTTTGGATTTTAAATTCATGTAATTAAATATTACAAGCAACTATTTCAGGGAAATTAGATATATATCTGAAGCCAGAATTTGCTATTCTAATCCCAGTGGCAGTGATGACTTTTGGCACCCCAATAGTAATATGTTTAGCAATTTACATCTGAAGTATTCATAGATGTTTCCTATTGCATATTTTATTAAATTGTAAGAAATGATAAATAAGATACTTGTTGGAAAGAACTAAAAGAAGTACTAGAGTGACATTTTTAATGATTACTCCCTTGAACAAAGTACAGATGATTTATTGTAAGATCTGCTATAGTTGAATGGTTTGTTGTATCACTAACATTTCCATTTTGGAATGCATGCTCCAATATTGGCATTTGGTTTTTTGTTTCTGGTGCATTTCATCTAAAATTATTCACTGGCTAAGTAACCTCTCTGAATGTGATAATAGGTACCGAGCAGTAACAAGTGCATACTACCGTGGTGCAGTGGGAGCTATGTTAGTATATGACATAACAAAGCGTCAGTCATTTGATCATGTAG