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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038613
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:4560676-4562067[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method NA
Type intronic
Splice junction sequence GTACTTGTCATTCTGAACTTCTAAATTTGGGTCCAATCCTTTGCACGTCACTGAAGCAAATGATATGTTGATGTCACTGTGTAGATTTTTATGATTGTTATATTGTTATTCATCAATTATTAAGTTACTTATTTAAGTCAATTTTTTTTGGATCTGGATGGATTGTTCTTTCTACTTGAGAATATTGCCTCTGCTTTGCT
Tissues shoot
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GA
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTACTTGTCATTCTGAACTTCTAAATTTGGGTCCAATCCTTTGCACGTCACTGAAGCAAATGATATGTTGATGTCACTGTGTAGATTTTTATGATTGTTACCTTGCAATTGATGTTTGACCTTCCAAATGCGACACTAGGGCAAATGCATTATATCTGCTGCTGCTATTGAGCAGATAGCGGCTGCTACATGGCATTTAATATGTTAATATTCTGTGTTAGATTATTAATTGGACGTTTGGACATGTCATCAGGTTTTCACAATCATCAGTTCTAATGATTATAAAGTATAAAAGTTACCTTAGTAGACATTCAAAGCCTTCAAAACACGCATGGGGATTAGAGATGGCAATGGGAACCCATGACCCGACACCCGACGGGTTTTTACTCTATTATATGGGTATGGGTACCCGTTACCCGCACGGGTGTGGGCATGGGGACGATTTTGTACCCTCGACGGGTGTGGGTATTTAAGTGGGAATATTTAGCCATCATAGGTGTGGGTATGGGGCAAGGGAACCCGATGGGTATGCACCCGTTGCCATCTCTAATGGGGATGTACATAATTCAACCTGTTTGAATGCCATCATGCAGCAGGGAATACATGTGGCTGGCACATACTTACATCCATAATTCAAGCTGTTATGATCTGGCTCGCTCTATATTTAAGAGTAAATTGCATCGCCGGTACACGAACTAGAATCACAACTCTGTTGTCCATTGAGGATGCTTGCATGGTCATAGTTATTACAACATCTGTACTGGAAAAGAATAAAAGATTTGGTTCAGTATGGTACCTTGGTAGGATGTTTTTTTCTTTTGCTGATATTCCAGGGAGAATAAAATAGTTCATTCACATTGGTTCTAGGGAACTAAGGATTTGAATATTTGAATCCTGGTTCCTGTCTCGCACCCTTGCCAGATGACGATGAAAAACCAATTTTGCTGGCCCTTTTGTTGTACTAACTTATACATGAAATTGGCAACCTTCAACAGTGACGCTTAAACATTACTGGCTGTTCACTTGTTCATCCGTGAAATCTATATTGCTAAGTTATGTTATGAATTAATTACTATTTAATTCATGTATGGTAGATGCTACTATATACAGAATCTACAATGCTTTTTGGTAGATGTTCATACCATTTTACTACGAAAAATAAAAAAGTGTGACCAAAATTGTCATAAAAGAAGTAGCATTTCAACTCTCCATTTCATTCCACTTCAACACTTCCTGTGTCTAGTTTATACCACATGCTGTAAAGTTGTCAAATTCTTTATTGCCCAACAGATTATTGTTATTCATCAATTATTAAGTTACTTATTTAAGTCAATTTTTTTTGGATCTGGATGGATTGTTCTTTCTACTTGAGAATATTGCCTCTGCTTTGCT