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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038585
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:3973487-3974087[+]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type intronic
Splice junction sequence GTGCTTGCTTTGACACTTATTTTAATTTATTTTTAAGATTTGTGAGGTATTTCTGTAGTACATGGTTTTAGGACTACCTATGTTAGCAGAACAGTTGTATTCCCCATTAATGCCACTTTTCAACTCTATGCTTTGTTCATTGACTGTTCTTATCCAATTGGTGCGTAAAATCCCCAGATGTGTTTGTTTATCCAGTGAGA
Tissues root
Exon boundary Yes-No
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence GTGCTTGCTTTGACACTTATTTTAATTTATTTTTAAGATTTGTGAGGTATTTCTGTAGTACATGGTTTTAGGACTACCTATGTTAGCAGAACAGTTGTATCATCATATTAATTTACACAAGTATGTGTAAATATGCTGAAAGACTTGTTATTCCACTGCAGAGTTTTGAAGTTTTCTTCTTTTACTAGGTGATGCATTTGATTTGTTTTCCCTGTTATCCTGTGTAACCAAATTCAACTGTTGTTCTTCTAAATTGCCACCCCTGTAATGTTTTTTATTTTCTTAGTACTGCTAGTCCTATTAAAATGAAAATGGAGATTCCTTATGAATAACTAAATTTCACCTCTCCCTTAAATGCCACTTTTGTCCCACGTCATTGAGACATCAGTGGCATCTGAGGGATGGATGAGGTAAACTTTTCAGTGGTATACAAGAAACCATCCTAAAAAATAAAATGTCGAGGTCTGTATAAAGTTTATACTTGCTTAAGGTAAATTGAGTTCCCCATTAATGCCACTTTTCAACTCTATGCTTTGTTCATTGACTGTTCTTATCCAATTGGTGCGTAAAATCCCCAGATGTGTTTGTTTATCCAGTGAGA