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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038544
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:3726364-3728751[-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence CTCAAGGGCACATATGTCATCATCTTGGTTAACCAATGTCAGAAGGCCTGTAATATAATCAAATGACAAAAATGATCTTCATGAGTTTGATAAACAGAAAGCCTCCCTACATGCATCGTCCAACAATCGGACAACTTGCAGCAAATCCTTGTCATTGGCCATATTTGGATCATCGATCTTTTCAACAAGTGGGCTAATGT
Tissues root
Exon boundary No-Yes
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTCAAGGGCACATATGTCATCATCTTGGTTAACCAATGTCAGAAGGCCTGTAATATAATCAAATGACAAAAATGATCTTCATGAGTTTGATAAACAGAAATACAGAAAACACGTGAAACTTTTTACAATGCATCAAAGCACCTTATGTATGTGTTGTCCATATATAAAAGTCTATTTCGAAAGGAACTTCTGAAAGATATGTACTAAGTACTAACCATAGTCTGTGTGAGCTCCACTGAATTGATCGCAGAACGGATGTGACATAAGAGAAAAACGGTGTCAGATGAATCTAGTAAGTACATTCTAGCACAATATACTACCAAATAAATACATAGATACATTTTGCTTACCAGCCAGTGTCAGTGCGATGCTCTTCTAGAATATCGGTTGATACAGGATAACCAATCAACCTGCAAACCCAAAAAGGATCTCCTGCGGTTCTACCTTCAAAAGCATCAACTGGCCCACCCAATGCCAAGGCTATACCTTGCATGATCTTTCTGGAAAGATCTATAAGTAAAATTTCCATCAGAAAAAAAAAAGGATAAATAACATAGATGCATAGCTAAGATCTAAACTAAGTTCAAAAGTGAACCTCTTAGAAGGCTGATATAGTTTTTTAGTAGTGCATCAAAATTTGATGGATATTTTGGCCTGCATCAAAGTAAATGATATGGTTAATTGAATTTGAAATATTTCTAACCAAAAGTACTCAAGGGAAGGGTACCAAATTAAGTTCAGAACAGCTCTTCAGTAATAGCAAAGTAATTCAACTAGTAGTATCAAAATATATAACATGGAATGCTATAATTCAACTATTCAAAATGCTTCTAGTAACAACAATACATTATATTGAAGCAACATATGCAACAACAAATAATTCACAATTGTAGCCATATTGCATAACATGATACATATTGTTATTATTAATATATTGTAAATTAGAAATTCATTTCCTTCATTCTTCCAAATAGAGGTGTGCTATAAGCTAAATTAATTATATTATCATAATTATTATCAATGCATAGTAAGTGATCAATAAGTAGAATTGTGGTACCATTTTATATGAAAGTCAAGCAAGCAATATCTCTCACATATGTTAAATAACATGAGCTTTTGTTATAGTACTCCCGGATTATTTTAGGCCATTCATTTCATATTGATATTTCTCTTTCCTCATTTAGAGGTAATAGATCTTGAAGTATGAAGAAAAAAGTATTTTTCACTTGCTACTCCACCCGTTTTGATAATAATCGTCACTAGACACTATTCACTTTCAAACTTTCAATCATTTGTTATGTAATTTTAAGTAATTCTTTAAACATATGAACCACTTCAAATTTTAAGATTTTCTTTTGAGTTTTGAAAACAATGGTGCTAGTATATTTCAAGTAAAATTTCTATTATAGACACTTTTCATGGTTGCCTGAATTAATTTTGTTTCTTCTAGTGGATGTATGGCAATAATAATTTCTATATATTGTCATTAATGTTTTCCTCTTTACTGTCATTTTATTACTAAAGATAAGCAAATATATATTTTATAACACAAAACATAACCTAAATAACAGTACCTCTTACCTCCATAAAGGGCTCCAAATAATATAGCGCCAAGGTATAAAATGAAAACAAACAAAGATGAAAGGTTGGAAACATACCACAAATTAGTTCCTTCCATTGGTTTGGCAAGATCTCCATATTTACCAGGTTCAATAGGCGCATAATACTGTGACGTTTTTTCTTCTCAGCGATTAACTAGTAACAAGTTAATGGGTCACTAAAAATAAAGAAAGAAAAATAAACTTACATCAATTGCTTCCTGCATGTCAGGTTTACCGTTGGTAATATTTTCGCCCAGTCTTTGGTATCCTCTGATGATCAAGAGAACAAAGTTACTCATAGAGAAAGGACGCTTTGAACGACCCAAAACGGAGCACGGAAAAATCAATGTTGGAACTTAAAATGGTACTATAAGAAATCACACCTATATCCATTCTGAGGTGTCATTTTAATCTTTAGTTTTTCTTCATAAGGAAGTTGGAAGAACTTGTGTGTGACGTCCCTAACTTCCTTCATTAGCGACTCAGCAATCCCATGGCCTTTCTGTTAATAATAATAACATACAGATGAACATTTGCATTACTTAGCTTCGGTAGTAATATAAAAATCATAGCTTGCAACGCAAGGACACAGCTACATCAAAATATTCTTGTTGATCTGTACCCATTGTACTATAAAGTGATGCTAAAAAGGTAAGTAAACGTGTAATTACCACATAAAAGAATCCAGCCTCCCTACATGCATCGTCCAACAATCGGACAACTTGCAGCAAATCCTTGTCATTGGCCATATTTGGATCATCGATCTTTTCAACAAGTGGGCTAATGT