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BaseInfo

ncRNA ID	osa_circ_038540
Species	Oryza sativa
Class	circRNA
Genome position	9:3663842-3672282[-/-]
Reference genome	RGAPv7
Source	PlantcircBase
Method	find_circ/NA
Type	exonic
Splice junction sequence	CTGGCATGTTCTGGGACAATCCAAGTATTCTACAAAGCTCAGGTGTCTGACGACGACGACTGACTGAGGGAAGTAGCTTACACAGCTCATCTTGTGCAAAAGTAATTCGACTGGTTCAAACTGATCAGTCAGCTCAAATGCATAAGCCAAATTAATTGCATCAATAGTTCTCCCATTTTCAATCAAAACTCCAATGACAC
Tissues	root/shoot, seed, pistil
Exon boundary	Yes-Yes
Splicing signals	AC-CT
circRNA sequence	NA
Genomic sequence	CTGGCATGTTCTGGGACAATCCAAGTATTCTACAAAGCTCAGGTGTCTGACGACGACGACTGACTGAGGGAAGTAGCTTACACAGCTCATCTTGTGCAAATTCAGCAAATATACCAAAGGTAGCCAGGAGTTGAAGAAACGCATGTGCTTCCAGGCAGTTCCCATTGCTAGCATCAAAGTCAAGGCTATCCAACTTGGATTTCCACTCAAGAGCAATCTTTTTTGCACGCTCCTTGATACTTGCAGTAAGCACTTGACCTTCCGATATGAAACCAGTAGTAGCATCAGTTTGCAGCTGAGCAAGTGATTCCATCAACATGAGGCACGTCCTCCGTACACCCAGAAGGTTTCCATCCTTTTTGCCATCCAATATAAGATTGTCTCCAAAATAGAAGTCTTCTAGAGAAGCTAACACCAAGCCATATGGATCAGTTGCTCCCCTAAGTGCAACGGGGATTTCCTCACGGATGGATGTTAAGTCTTTGCGATTGTCTGATATGAACTTATGAAGCCCGTTAACATTCATCTCTTCACAGAGGACAACAAGTTGAGAACGAGGCTTCACAGCAGTGTTTTCATCTTGCAGGTATGCACCATGCGCAGTTGCAGGTTTGGGCCACTTAACAGAAAGACTACCACCGATGTTTCCATTAAACACAGCATTGTTATTCACGGATTTGCTGATTGGGTTGATAAGAGGCGTAGACAAGTTCAGCTTGGACTTGCCAAAGATCACAGCCAACGCGGCATCCCTTTTCTGCTGCAGTTTTTCAAGAGAAGTCAGTTCCTTTGCCACGACAACAGCCTCTTGTTGCTCCAGCATCTGCTCTGACTTTGCAACCGTCTCCTCGAACTCCTCTTCCTGCCTTTTCAGATCATCAAACTTTTTCTTGAGCGACTGCTCAAGCCCATGGAAATGGTCCTCCAGTTGCTTCCACTTTAAGTTCAAGGAAACAGCGCTCTGGCTCTCGAGCTCTGCAAATGCACGCTGAAGCTGCTGCAGCTTGGAGCCTGTGGACTCCATAAGTGTAGCCATGGACTCCATGTCGGACATGGTGGCAGATTTCTGCAAAAGGTGAAAACAACGAAAGCTGTTGGTACCCATACCACAAACAACAATACCGCACATAAAACCAGGGGCGGATCTAACGTGGGACATGGGGATTCATCCCAAACTTTTTTTGGGGAACAAACGAAACTGTTATTCGTATTAAGAATAGCAAATTGAAAGAAAAGCAGCAGCTTTCAGATCTAGAAGAGAAGCTAGGGTTGACGCGAATTCGAGGGGAAAAAGTGGGTGGGTAGAGAGGGATGAGAAAGAGGATATGCGAAACGGATGGATGCTCACCAGGAAGCAGCAGTGACGATGTGCGTTGACGGACGGATGCTAGCTCCCCCGCCCCCGCCACCACCTATGGCGGCTCGGGGAGGAGATCGAGGGGGGTCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGGAGGAGCGGCGGAACCCTAGACGTGGTGGTGGGTTGTGGGCGTCTGTCTGCTTTTCGCGGGAGGGATGGGGAAAGTGACGGATTGGAGAAGCTGCGGTGCGAGGGGAGAGAGTGAGAGACAATGGTTGGTGGGTCCCATCTGTCAGTGATAGTCTTTTTACTCCTCGGTCTGCAGAAAAGCGGTTTGCCATGTGCTCTAAAAACAGTGTTTTTACAACTTAGTAATTTTTTATTTAAACATTAGAAGGAAAATGTGCACAAGAGATACACAATTGTCTTTCCAAGGAGTAGCTTGCATAAGTTGCTTTGTAGGACAAGTATTATTATTACAAGCATGACTAATATTTTGGTAATTTAGAGCTGCTAACTCATATTTAGATTCTCTGGCTTTTTTAGACTAGTAGTCAGCTATTTGATACCCTTTTATTTATATCTCTGGGGATCCATTTGACGTTGAAAGAAGCTCCACCTGAAAAGTTATGTAATTGTGCAAGCAAAGGCAAAAGGCTCTAGTGATGGTTATGATTGATATTATTAGAGTTTTGAAGTAAGAGCACCAGTTCTTGATTGTCTTGAAAAAATAGGGAGGATTTGTAATTTGAAGGAAATCACAGATGAAGGTATCAAGCTTAAAAGTTGCAAGTTCCGCCTGAATTGGCGACACATAAAGAGTTGATTTGGCCTACACAAAGATGATATGATGATTTATAGAGTCATGTAGAAAAAAGACCAAACCTTGTTATATTATCCTTCCCAGAAGCGTCAAGGAAACATCCAGTTACTGGCAACAAATTAACAGAAGCAACAGAATTCATCTATGATTGGAATAGTTTCATTATCATTCTCATTAGACAAGGCTGAAATATAATTCTTTGACATAGCGCTTGCTACATTACAAACTTGCAAAGGCTCCCATTCTTTTTTCTTGAAATAATGATCATTTCTAGCTTTCCAAATAAACCAAAGAAGGATTGGAACTTTTTGAAGGCTGTTTTCAGAATTATTAGTTGCAAGCAAATATGCTATAATATTAGAAACATTTTGCATTGAGTCAATAATGAGATTGTGAAAAGAGAGTTCTTAAAGTTTCCAGGTAAGTCTTGCAAAAGCACAGCGGAAGAAAAGATGAACATTTTCAGCATCATTGCAACGGGAGCAAAAATCAGGAATATCCAAAATTTTTGAGTGAAGATTTGCAGCCGTTGGAAGAGCTTGTCTAATTAGTCTCCAAATAAAAGTTTTAACTTTAGAAGGAATGTATTTAGTGGACCAAGTTTTCAAAAGGAGATTACTCTGTAAAGAGGTGATGTTAGAGGAGACAAGATAAAGATAAAGATTAAGTGCTTCACACAAAACAAGGTGGTAATAACGTGTGATTAATTGAGTTTTAATTATTACAAACTTGAAAATAGATTAATCTGATATTTTAGAACAACTTTCATACAGAAAGTTTTTGCACGAAACACACTGTTTAGTAGTTTGAAAAGCGTGCCGAGAATATCCAAAATTTTATCCGCTCCTTGCAGTGGAAACGAACTGGAAGTGAGAAATATTAGAAACCTGCTTATAATTGCTTTTTGAAGTAATGCTCTTGAAGAAGTAGGAATCCAATAGAGTTTGTCCTCATTATCCTGAGGAACAATCTGAACCTTTGATATGATTTGCACCATTTCCTAGTCAAAAATTTGATTGAGCTTGTTTTTAGACCAAGATCTAAAACAGTTTGTAACGTATGATTTCCGGACAAAAAACCCATCATTCTACTCACGGATAACACATCAGCTTCTTTACCAGCTAATCATGACACTTACGGGCTTAGAGCATTCCTAGCTGCTTGCTTATCTATTTCGTCCCTCATCAACAGCAATAACATCAGCAGCTAATCTAGTAGATGCACCAACCCTATCTTTAAATTTAGCATGTGTGCTATCTTGGAAAGAGAAACAACAACTTTGGTGTTGCTCTCTTCTTACCGAGCTCCCGCCCCATCCGGATCGACCGAGCAACGCCTCGTCCATCATTGTCATCATTACTAGCCAGCGTAGGTGAGTCCCTATATTCCCTTTACTTTTTTTTCAGCGATGGTGGTAGTGGCAGGGCTTCAAAGGGTAGAGCCATGGCGGAATGAGGGTGGAGCCATGGCGGAATGGTGGTAGTGGAGAGGAAGGGTGCACCAATCTAGAGGTGGCAATGGATTCTAGGGTGGTGGATGTGGTCATCGACCTGCTACGTATGCAAAAGCACTGCTCGCATTGATGGCTCTCTTAATTAATATTTGATAGATTCACAATGTAATATATTTGTATCCTTCAACATGTTTTACCACTTGTATGCTGCTATGATTTTTCTTGCTAGATGAATTGATGGACACCTACGTTGGTTTGTTGGGTTCAGACATTGATGTAGCAAATTAGAATCTAAGTCAAAAAAAATTCCCCAAAATGGAGCCGCCACAACCACCGTTTTTTTAACAAATTAGTCTTTTTTAAAAACTTATTTCGAAACTAGTCCCTGCAAAAAACTTCAACCAAAAATAGGCCGTGAACTCAGCGCCATGGACCTTGGCGCTGAGCTATAACGTCTCAGCGCCAACTTTTGTTGGCGCTAAGCTCAAATCCGAGGTGGCATGAATTTGTTGAGTCATCATATTTGGCGCTGAGGTCTTGATGATTTAAATTTCTACGGAGGCATTCATCTTCATCAACTCAACGATAGCATAGTGGTAGTAGGATTCTACTCTAACCCTATGGAGCAGGGTTCGATCCCCCATTTCATCCATTTTTCTTCTTTTCTCCGTTTTTTCTTCTTTCGACCCCCCATCTCTCCCTTTTTTTTTTCTGTTTCTTCTTCTTTTTTTCTTCTTTTTCTTCTCTCTCACACTCTTTAAATTTACAAACGAAACTGTCATTTTGTAAAGAATAAGAGTGAATAGTCGAGAGAAAAAAAAAACCATTTTTTTCTTTTTCTTCTTCTTTTTCTTCTCTCTCTCACTCTTTATTTTTTTTCTTTTCTGTTTGTCTCTGATACTATCTTCAAAAGATATGTTTAAATTGCAATTTTTTTGAATTTGGAAAAAAATATTAAAGTGGTATATTATATGGCAATTGAGAACTTAAACTGAAATTTCAAATCAAATTCAAAATAAAACAAATTTACAAACGAAACTGTCATTTTGTAAAGAATAAGAGTGAGTAGTTGAGAGAACAAAAAAGAGAAAAGGAAAAAACCCAAAATACAAAAAAAAATGTTGAGGTGGGATACCAGGATTCGGACCTAGAACCCTATGCCCTCACAGCTTGAGACATCAACCACTAGGCTATAACTGTTTTGCTACACTAAGATGCTTGCGCTTCTATTTGAATCGTCAGGACCTCTGACTCAGCAACACCTCGGATTAGATGTTAGCGCAATAACGTTGGCGCTGAGATGTTATAGGTCAGCGCCAAGGTCTATGGCGCTGAGACCACGGTCTATTTTTTGTTGAAGTTTTTTATAGGACTAGTTTCGAAATAAGTTTTTGAA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