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BaseInfo

ncRNA ID osa_circ_038486
Species Oryza sativa
Class circRNA
Genome position 9:2355272-2360478[-]
Reference genome RGAPv7
Source PlantcircBase
Method find_circ
Type exonic
Splice junction sequence CTGGCCGTGCTGACGGATATGGCGAAGGAGCCTAGCCAGAAAAGCATTGTTGCAGATTGTAGAACTATCACAGACAAGTGCGACATGACGGCGTGCCCTTCTCCTCCTCCTCCTTCCTTCCTTTCTTGTACCGTTATCAGTGATGCCATGAGGGAGAGAAGAACGGGAATCAGCCGGAAGTAATGTTTGTTCTCTAGGTC
Tissues root
Exon boundary No-No
Splicing signals AC-CT
circRNA sequence NA
Genomic sequence CTGGCCGTGCTGACGGATATGGCGAAGGAGCCTAGCCAGAAAAGCATTGTTGCAGATTGTAGAACTATCACAGACAAGTGCGACATGACGGCGTGCCCTTGTGATGGCCACATTCATGCGCCTGTTGTCGCCAAGGAATCCTACAGCTCCCAAAGTGTTTGAACGAACCTAACAGGATTGAATAGAAATATCTTAGAGCCTTCATAGAAGTATTAAAGTTGGGTTAAGAATGACCTGCAACTTTTATTGACATGAGATTATATGGTTCAACACGGCATTTGAAGTACCACGGTCACCTTACAGCAAACCAAGAAGGACTACCCTATAAAGACAGCAAAGGAAGTGTGTACCATTGATATGACCACGGCATCTGCCTCCCTCCCTTGGAAGCTATCTATAGTTGAAACCTCAACACCAGAAGCCTCTGGATAATCTTCTAGCCTGTCTCTTAATAGTTGTACTTGCGCAATGTAAGGTGACTGGACGGCAATCGCGGTTGGAGAGACACCTGCACAAATTGTTTTCAGCAGTCCATTCATCAATAATCTGTGCAGCATTAGGAATAAAACAACTACGGGCAAATAAAAAATTAGGATACAAAGTGTGCTGCAAGTTGAACACAAAATCTAAGTGTGGTGTAATTAATTAAAGGAAAACAGGCACATACCACATTGTACAAGGTTCAAAACATGCTGTGAAACTACATCTGCCTCGCCATTGTTATAAAAAGATCCTGTACCAGCAGGGTCTAAATGCTCCTCACAGTCAATATTCAAACTTCCGTACGGCATACGAGTGTCAAGTAAAAGAAAGGCACACCGAGTTATCCAAGTTTCCTGAAAGACGGTAATTTTAATCCATTATCAATATGATGCATACATTAATCAACCATAAAATATAATCAATCTTTTAAAACAAATGCAATTGTTTCTGGATAACAATTCGGACCTCCACACCTTTAATAGATGCATTTGTACCTACCTATTGCAATGGATCTCAAATACATAAAACTTAAGTTATAAGGTTAAAAATGCCAAAATAATCATCCCTGAATACAAAAAACTGCATACATGATTTGCATCAAATAAATCAGCCTCTGCATATACATTCATAGAGGTTGTGTTCCTGTACCAAATTATTCCTACAAACAACACATATGTATACGTAGATCCAGAGAGGAAACAACATTTGAGAGACTCCGTTATAAAGCAAGCCATGACCAACATCCATTTTAGTATAATTATTATGACCTAGAACATTTCGTAGTTACAGCCATGCAAAATTGTAATCAACATATGTCTCATATATCATCTCTTAGCTTCCATTTGGCAAGACTTATTTACACAAAAGGGGATTAAGCTCCAATTATATTGAAAGCAGTTCACATTATGTTGAATTCAAAACGGAGGAAGTCTTAGTATTGCCTACACTTTAAGTCATATAGCAACAGAAAATCTCCATACAATTTATACCCTTCATCTTCATGCAAACTTAATTGTGGTTCATGAAAATAAAATTGAAGTATGCTCATGAACAAGGGCATCACACAAACCATGTTCATTTAGGCATGAAATCAACATGAAAAATTATGTAAAAATGGAACCAAACCCCAATTTAAACTATCAACAAGACCAGATACATTTTATGTAGAATAAAAAAATGAAATCCCTAAGAAACTAATATTAAAACTCAAAAGGCATTGAAAATAAAAGGGCATTTCATCTTCATGCTTTTCGGCAACTGGCATGAGAAAAACTACCCCCTGCAAAATTCTGATAGGTTTATGGAAACAGGAACAGAGAGCATCAGTACCTTGATAAATGGGTAATCAGCAAGAAGATGAGAAGCAACGGATGGGGAGGATTTGAGAAAACCATCATACATCTCGTTAGATGCCCAACTGGCAATTGAATCATGCATTCTGTATTGTGTTGTTAATTTCGTTGTCAGTAGTTCATTATGCAACGATGAAGCTCTTTCGAGTAAAGACATTGCTAGTCCACCTTGCATAGCCTCTCTTGATAAAACAACAGGTGCAAGCTGCCGTTGATCACCAGCAAGAATGCATCTTTTTCCTTGTAAGATAGGGATCCAGCATGAGGGTTCGATTGCTTGTCCTGCTTCATCAATAATTACTAAGTCAAAGCAACCAATCCTCCTCACAAGTGGGTCAGCTGCCCCAATATTAGTTGATAGGACAACATCAGCATTTGAAAGGACCTCTCTGATTATTTCCTTTTCCTTCTTTTTAAAGTTCTTCCCAAGCTGCTTCAACAGTTGACGTATACCTGCGGCTAATGTATCATCCTGTATGCAATGCTTCAAGTCCTTTCTCAAGTCGGATTTTTTCCTCTCGAACTCTTCTGTGAACTTCTGAAGTCTTCTGTTCACAAGCTCTCCCAAGGACCTTGAAGCAACAGATGGAGATATCCTAGCAGGATTTCCAACTCGTACTGTGTCCAGTCCAGTATCTGACAACTTCTCCACCATGTTATCAACTGCTGCATTGCTTGGAGCAGTTACGAGAACGCGTTCACCCTTTCGGACAGCACATGCAATGAGATAACTAAGCAAACCAGTCTTGCCCGTGCCAGGAGGTCCTTGGATTATTAGGACAGGCCTTTTGTTGTTCAAGCCTAGTGTGATAGCTTTTAACTGGGAGGCATCAAAGTCATATTTGTTCTTTTTCAATAGCTCATCATCATGTATTGTTGATTCTCCCCAATCAGCCAGATTATTCTGCTCCATCATCATCATGTCTTCCTTGTCCCCAAACAGAGTGGCTACTACTCCAATGGAAGAATTCTTTTTCTGTAAACCTTTCCTTTGAAGAAGCATCAGTGCTTCACAATTTCGCTGCCAAATCATACACAAACCAATAGGCTAAACGTTCAAGCTTTGTTCATCCTTTTAGTAAAACTTGAAACAAAATCAACATATTTTCAACCTTGTAGGAAAGAATGAAATAATCTGTGATCACAGAACACCTAACATTAGCCAGTCCAGTTTTCAACAAAAAAGTCCTGTCCTGATCACTTCTTCCATGCAAATATTTATGTTAGAAGCCAGTGTTTAGTTTCATCAGATTATGCAAATTTCAAATTAAATTAAAAAATCCATAGTTTTCTACTCAGAAACTAGACCTAGCCCCAATTGCTAATAGACAATCATTTGTAACAAAATTCATTATACCACACCAACGTTAGCATGACACTCGCACAAGAAAATAAATACTGGATTGACACAAACAAAATTTAATTCAGACACAGCGGTAACCACTTACTTTTGGGGATACTGATTTTAATTTTTAAAACAGCAAGATCAGTAATAAACTAATTTATTTTTACATCTCAATTGTCTTCATACCTAGCATTCCTACATAACATATTTAGGTTTGATTTATCATATGCAGAAAGTTCGGAACTTTAAGAATCCTTACCACTCCTTTTATAAACATGTAAGTTAGGTACCTAGGTTGCATATCATATACATATGATATATACATATGTATATGATATGTTGCATACATATGGCTCAAATTTTCGAAAGGGTAATGTTGCATAGTATCAAGTATTAACAATTAAATGGTTTTGTTAGGCTAGGTGCCTAGGTGCCTAAATTGCATTACCTCTTGAAAAAAGATTACTAACAATTAAATGGTATTGTATGGGGAAGAAATTACTTTTAGCCTTTTAGGTCCAAACAGACTGATACTTCTGTGACATGGCTCAGAATGCTAACACCCATCTCATGCATCTAAAGGAAGGGATGCATGGGACTAGGGGTTACATCAACTAAATTGCATTACCTCATATGTAAGTGCGTCAGCCAATGCCTGAATCCTGTCAATCCGCACATTTTTCCCAAAAAGCTTGGAGAACGTAGGATCACCACGGCGGGATTTCAGTGTCACGGTAATGCTGCAACCATCCTCACCAAGATTATATATAAAGCCTTGCATGCAAGATGTGGTAATTTCCCCCCGGTTATCACATGTCCTGATACAAACCATATCCCCAGGAGAGAGTGTGGTTGGAGGCAATCTATGGTTATCTTTCACTCTAAATAGGACCAGATGCTGGCCATCCAACCCTGCACAAAACAAGATTTAAAACAAAGTAATAAATAGGAGAAACTTTAGTTCGTATAGCAAAATCGAGTATCAAACCTCAAGTTAGTCTTATCTGCATATGCATATTTGCATGCATAAATATAAGCAGCCATATCTTACTACGGTACTAACCAAAAAGAAGCAGATAAAAATCACTATCCTGGCAGCACATATTTAGAATTACTAACCAACGAACAATATAAAAAGAGTATAATGCACTGACCAGTTGAACTGCTGATAACATTCAAATTGCAAATGGTATCGCACTGCTCTTGCTGTGACTGCCCATGAGTGACTAAGTACTCTACTGGTTTGAGTGGCTTCTTTGAGTTCCCATCCATCACAGGGGTGGCATTCAGTTCTTCTTGTGTAAACTCCAGCTCCGCATCTCGTTCTATATGTAGAAGGTCTGACATTTTCTTGACAAAGTCTTCAATTTTGGTCTGCATCAACCTTGTCTTATCAAGACTTATGCCAAGAGTACTGTGCGTAGTAGGAGCTTTAGGTTTGCGGGCAGCTGCTCGATGCTGAGCTGAGTTAGCCAATTCTTTCAGAAGCATCCAAGATTGAGTGGTGCGCCAATCAGAAATAAGACCCTGGTTCTGTTGTTTCAACAGAACATCACGGAGTTCCCTTTGAAAGTGGTCAAAGAGGGTAGGATAGTGAGTAGAGGCCTTGAGGCAGAGCGCCTCCTGTCCCTTGGGCATGGGAATTGCTGATAGATAAGGCTGTGCAAGCATCACAAATCCGAGGTTGTCTTCAGATGATCCACCATCCAGTAAGAATGTTGCTCCATCGTTCTGCATTTCTGTGGAAGCATATTTTATAGCCATTGAGTGCATACCCTGCTTTAGCCATTGTACCACGCACCGGCCCAACTCCTTCTTCC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